MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_015152	TCT	2	6	2369666	2369671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972003
41002	NC_015152	CCT	2	6	2369745	2369750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972003
41003	NC_015152	TGT	2	6	2369765	2369770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972003
41004	NC_015152	ATA	2	6	2369774	2369779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972003
41005	NC_015152	CT	3	6	2369809	2369814	0 %	50 %	0 %	50 %	325972003
41006	NC_015152	ATTC	2	8	2369865	2369872	25 %	50 %	0 %	25 %	325972003
41007	NC_015152	TGA	2	6	2369900	2369905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972003
41008	NC_015152	ATA	2	6	2370052	2370057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972003
41009	NC_015152	CAA	2	6	2370061	2370066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972003
41010	NC_015152	TGC	2	6	2370071	2370076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972003
41011	NC_015152	CAA	2	6	2370234	2370239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972003
41012	NC_015152	GAA	2	6	2370255	2370260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972003
41013	NC_015152	TCA	2	6	2370267	2370272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972003
41014	NC_015152	A	6	6	2370320	2370325	100 %	0 %	0 %	0 %	325972003
41015	NC_015152	TTC	2	6	2370367	2370372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972003
41016	NC_015152	CCT	2	6	2370376	2370381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972003
41017	NC_015152	ATG	2	6	2370434	2370439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972003
41018	NC_015152	TCA	2	6	2370530	2370535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972003
41019	NC_015152	CTGA	2	8	2370546	2370553	25 %	25 %	25 %	25 %	325972003
41020	NC_015152	ATT	2	6	2370598	2370603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972003
41021	NC_015152	CTT	2	6	2370655	2370660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972003
41022	NC_015152	GCA	2	6	2370679	2370684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972003
41023	NC_015152	T	6	6	2370702	2370707	0 %	100 %	0 %	0 %	325972003
41024	NC_015152	CAAA	2	8	2370714	2370721	75 %	0 %	0 %	25 %	325972003
41025	NC_015152	TCA	2	6	2370749	2370754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972003
41026	NC_015152	GCT	2	6	2370945	2370950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972003
41027	NC_015152	TTG	2	6	2370961	2370966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972003
41028	NC_015152	CTT	2	6	2370976	2370981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972003
41029	NC_015152	ATC	2	6	2370982	2370987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972003
41030	NC_015152	GAA	2	6	2371022	2371027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972003
41031	NC_015152	TAC	2	6	2371129	2371134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972003
41032	NC_015152	AG	3	6	2371253	2371258	50 %	0 %	50 %	0 %	325972003
41033	NC_015152	GTC	2	6	2371278	2371283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972003
41034	NC_015152	CAGCTA	2	12	2371368	2371379	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325972003
41035	NC_015152	TGCT	2	8	2371453	2371460	0 %	50 %	25 %	25 %	325972003
41036	NC_015152	CTTT	2	8	2371479	2371486	0 %	75 %	0 %	25 %	325972003
41037	NC_015152	CTC	2	6	2371719	2371724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972004
41038	NC_015152	TC	3	6	2371740	2371745	0 %	50 %	0 %	50 %	325972004
41039	NC_015152	TA	3	6	2371750	2371755	50 %	50 %	0 %	0 %	325972004
41040	NC_015152	TCG	2	6	2371763	2371768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972004
41041	NC_015152	ACA	2	6	2371784	2371789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972004
41042	NC_015152	CTA	3	9	2371851	2371859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972004
41043	NC_015152	CCTG	2	8	2371886	2371893	0 %	25 %	25 %	50 %	325972004
41044	NC_015152	GCC	2	6	2372018	2372023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972004
41045	NC_015152	GGA	2	6	2372051	2372056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972004
41046	NC_015152	CTTG	2	8	2372103	2372110	0 %	50 %	25 %	25 %	325972004
41047	NC_015152	GAA	2	6	2372176	2372181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972004
41048	NC_015152	ATC	2	6	2372182	2372187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972004
41049	NC_015152	TCT	2	6	2372205	2372210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972004
41050	NC_015152	AAC	2	6	2372213	2372218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972004
41051	NC_015152	GTT	2	6	2372233	2372238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972004
41052	NC_015152	CTGT	2	8	2372286	2372293	0 %	50 %	25 %	25 %	325972004
41053	NC_015152	GCT	2	6	2372357	2372362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972004
41054	NC_015152	ACC	2	6	2372465	2372470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972004
41055	NC_015152	TCCT	2	8	2372596	2372603	0 %	50 %	0 %	50 %	325972005
41056	NC_015152	TGC	2	6	2372618	2372623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972005
41057	NC_015152	TTG	2	6	2372645	2372650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972005
41058	NC_015152	ATC	2	6	2372672	2372677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972005
41059	NC_015152	ACC	2	6	2372680	2372685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972005
41060	NC_015152	GAT	2	6	2372722	2372727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972005
41061	NC_015152	TTTG	2	8	2372784	2372791	0 %	75 %	25 %	0 %	325972005
41062	NC_015152	AAC	2	6	2372915	2372920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972005
41063	NC_015152	CTA	2	6	2372940	2372945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972005
41064	NC_015152	TGG	2	6	2372982	2372987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972005
41065	NC_015152	GGC	2	6	2373025	2373030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972005
41066	NC_015152	ATC	2	6	2373035	2373040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972005
41067	NC_015152	CAG	2	6	2373154	2373159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972005
41068	NC_015152	AAG	2	6	2373167	2373172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972005
41069	NC_015152	GGACGG	2	12	2373180	2373191	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	325972005
41070	NC_015152	TGC	2	6	2373214	2373219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972005
41071	NC_015152	GAA	2	6	2373244	2373249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972005
41072	NC_015152	AG	3	6	2373291	2373296	50 %	0 %	50 %	0 %	325972005
41073	NC_015152	CCAAT	2	10	2373333	2373342	40 %	20 %	0 %	40 %	325972005
41074	NC_015152	CAG	2	6	2373357	2373362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972005
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41076	NC_015152	GAT	2	6	2373497	2373502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972005
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41078	NC_015152	GCAAG	2	10	2373639	2373648	40 %	0 %	40 %	20 %	325972006
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41083	NC_015152	TGC	2	6	2373881	2373886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972006
41084	NC_015152	AAT	2	6	2373962	2373967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972006
41085	NC_015152	CTTC	2	8	2374049	2374056	0 %	50 %	0 %	50 %	325972006
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41087	NC_015152	GTT	2	6	2374107	2374112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972006
41088	NC_015152	TAA	2	6	2374164	2374169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972006
41089	NC_015152	AAT	2	6	2374198	2374203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972006
41090	NC_015152	CTT	2	6	2374218	2374223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972006
41091	NC_015152	CAT	2	6	2374278	2374283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972006
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41094	NC_015152	GTA	2	6	2374381	2374386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972007
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41100	NC_015152	GAA	2	6	2374737	2374742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972007
41101	NC_015152	TAG	2	6	2374940	2374945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972007
41102	NC_015152	AAT	2	6	2374968	2374973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972007
41103	NC_015152	AC	3	6	2375043	2375048	50 %	0 %	0 %	50 %	325972007
41104	NC_015152	TTG	2	6	2375078	2375083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972007
41105	NC_015152	AC	3	6	2375148	2375153	50 %	0 %	0 %	50 %	325972008
41106	NC_015152	GAA	2	6	2375178	2375183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972008
41107	NC_015152	TAA	2	6	2375260	2375265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972008
41108	NC_015152	AGA	2	6	2375270	2375275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972008
41109	NC_015152	GAA	2	6	2375317	2375322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972008
41110	NC_015152	CCAA	2	8	2375353	2375360	50 %	0 %	0 %	50 %	325972008
41111	NC_015152	CAGG	2	8	2375367	2375374	25 %	0 %	50 %	25 %	325972008
41112	NC_015152	AAGC	2	8	2375427	2375434	50 %	0 %	25 %	25 %	325972008
41113	NC_015152	ACAT	2	8	2375435	2375442	50 %	25 %	0 %	25 %	325972008
41114	NC_015152	GCA	2	6	2375483	2375488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972008
41115	NC_015152	GAT	2	6	2375595	2375600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972008
41116	NC_015152	TGG	2	6	2375661	2375666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972008
41117	NC_015152	ATC	2	6	2375672	2375677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972008
41118	NC_015152	TAAT	2	8	2375694	2375701	50 %	50 %	0 %	0 %	325972008
41119	NC_015152	CA	3	6	2375751	2375756	50 %	0 %	0 %	50 %	325972008
41120	NC_015152	TGC	2	6	2375854	2375859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972008
41121	NC_015152	GAT	2	6	2375917	2375922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972008
41122	NC_015152	ATAAC	2	10	2376051	2376060	60 %	20 %	0 %	20 %	325972009
41123	NC_015152	AAG	2	6	2376112	2376117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972009
41124	NC_015152	CAG	2	6	2376120	2376125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972009
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41128	NC_015152	CAG	2	6	2376232	2376237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972009
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41132	NC_015152	TATT	2	8	2376300	2376307	25 %	75 %	0 %	0 %	325972009
41133	NC_015152	ATC	2	6	2376386	2376391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972009
41134	NC_015152	ATCAAA	2	12	2376395	2376406	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	325972009
41135	NC_015152	ATC	2	6	2376422	2376427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972009
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41139	NC_015152	ATA	2	6	2376568	2376573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972009
41140	NC_015152	T	6	6	2376590	2376595	0 %	100 %	0 %	0 %	325972009
41141	NC_015152	A	8	8	2376707	2376714	100 %	0 %	0 %	0 %	325972009
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41143	NC_015152	ATC	2	6	2376737	2376742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972009
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41146	NC_015152	TCA	2	6	2376962	2376967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972010
41147	NC_015152	AATGGT	2	12	2377018	2377029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972010
41148	NC_015152	GCT	2	6	2377036	2377041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972010
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41152	NC_015152	CCAA	2	8	2377144	2377151	50 %	0 %	0 %	50 %	325972010
41153	NC_015152	TGCCG	2	10	2377174	2377183	0 %	20 %	40 %	40 %	325972010
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41174	NC_015152	ATC	2	6	2378201	2378206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972011
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41204	NC_015152	CTCG	2	8	2379763	2379770	0 %	25 %	25 %	50 %	325972012
41205	NC_015152	GATA	2	8	2379798	2379805	50 %	25 %	25 %	0 %	325972012
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41217	NC_015152	TGGT	2	8	2380037	2380044	0 %	50 %	50 %	0 %	325972012
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41219	NC_015152	TC	3	6	2380277	2380282	0 %	50 %	0 %	50 %	325972013
41220	NC_015152	GCAA	2	8	2380363	2380370	50 %	0 %	25 %	25 %	325972013
41221	NC_015152	TTG	2	6	2380451	2380456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972013
41222	NC_015152	TGAGC	2	10	2380472	2380481	20 %	20 %	40 %	20 %	325972013
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41224	NC_015152	TAACCT	2	12	2380622	2380633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972013
41225	NC_015152	CAT	2	6	2380641	2380646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972013
41226	NC_015152	AC	3	6	2380663	2380668	50 %	0 %	0 %	50 %	325972013
41227	NC_015152	CAA	2	6	2380673	2380678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972013
41228	NC_015152	CGTA	2	8	2380717	2380724	25 %	25 %	25 %	25 %	325972013
41229	NC_015152	TTC	3	9	2380803	2380811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972013
41230	NC_015152	TC	3	6	2380820	2380825	0 %	50 %	0 %	50 %	325972013
41231	NC_015152	CATT	2	8	2380832	2380839	25 %	50 %	0 %	25 %	325972013
41232	NC_015152	CTT	2	6	2380904	2380909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972013
41233	NC_015152	TGAA	2	8	2380992	2380999	50 %	25 %	25 %	0 %	325972013
41234	NC_015152	TCG	2	6	2381020	2381025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972013
41235	NC_015152	GATG	2	8	2381036	2381043	25 %	25 %	50 %	0 %	325972013
41236	NC_015152	GTT	2	6	2381159	2381164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972013
41237	NC_015152	GCA	2	6	2381191	2381196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972013
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41242	NC_015152	CTG	2	6	2381413	2381418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972013
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41250	NC_015152	TCTG	2	8	2381917	2381924	0 %	50 %	25 %	25 %	325972014
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41257	NC_015152	CTTG	2	8	2382149	2382156	0 %	50 %	25 %	25 %	325972014
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41339	NC_015152	T	6	6	2386729	2386734	0 %	100 %	0 %	0 %	325972020
41340	NC_015152	TGA	2	6	2386817	2386822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972020
41341	NC_015152	CAC	2	6	2386874	2386879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972020
41342	NC_015152	GTC	2	6	2386899	2386904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972020
41343	NC_015152	CTA	2	6	2386910	2386915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972020
41344	NC_015152	AAC	2	6	2386925	2386930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972020
41345	NC_015152	CTGCG	2	10	2386962	2386971	0 %	20 %	40 %	40 %	325972020
41346	NC_015152	TCA	2	6	2386987	2386992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972020
41347	NC_015152	AG	3	6	2387163	2387168	50 %	0 %	50 %	0 %	325972020
41348	NC_015152	AAGC	2	8	2387261	2387268	50 %	0 %	25 %	25 %	325972020
41349	NC_015152	ATC	2	6	2387280	2387285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972020
41350	NC_015152	TCA	2	6	2387287	2387292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972020
41351	NC_015152	AGC	2	6	2387341	2387346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972020
41352	NC_015152	TTTCA	2	10	2387427	2387436	20 %	60 %	0 %	20 %	325972020
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41354	NC_015152	TAA	2	6	2387522	2387527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972020
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41365	NC_015152	CTT	2	6	2388229	2388234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972021
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41380	NC_015152	AT	3	6	2389299	2389304	50 %	50 %	0 %	0 %	325972022
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41460	NC_015152	C	6	6	2394104	2394109	0 %	0 %	0 %	100 %	325972026
41461	NC_015152	ATCG	2	8	2394134	2394141	25 %	25 %	25 %	25 %	325972026
41462	NC_015152	TGGT	2	8	2394198	2394205	0 %	50 %	50 %	0 %	325972026
41463	NC_015152	CCT	2	6	2394210	2394215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972026
41464	NC_015152	GCT	2	6	2394220	2394225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972026
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41466	NC_015152	CAA	2	6	2394382	2394387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972026
41467	NC_015152	GAA	2	6	2394773	2394778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972027
41468	NC_015152	CT	3	6	2394817	2394822	0 %	50 %	0 %	50 %	325972027
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41474	NC_015152	TA	3	6	2395225	2395230	50 %	50 %	0 %	0 %	325972027
41475	NC_015152	GCTG	2	8	2395231	2395238	0 %	25 %	50 %	25 %	325972027
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41486	NC_015152	CAA	2	6	2395784	2395789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972027
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41488	NC_015152	GCT	3	9	2395968	2395976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972027
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41490	NC_015152	ATTC	2	8	2396054	2396061	25 %	50 %	0 %	25 %	325972027
41491	NC_015152	GAA	2	6	2396072	2396077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972027
41492	NC_015152	GTA	2	6	2396094	2396099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972027
41493	NC_015152	ACCT	2	8	2396121	2396128	25 %	25 %	0 %	50 %	325972027
41494	NC_015152	GGACC	2	10	2396301	2396310	20 %	0 %	40 %	40 %	325972027
41495	NC_015152	TGA	2	6	2396323	2396328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972027
41496	NC_015152	CTG	2	6	2396329	2396334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972027
41497	NC_015152	CAT	2	6	2396339	2396344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972027
41498	NC_015152	CT	3	6	2396371	2396376	0 %	50 %	0 %	50 %	325972027
41499	NC_015152	ACT	2	6	2396377	2396382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972027
41500	NC_015152	CAA	2	6	2396408	2396413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972027

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