MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_015152	GCA	2	6	2308349	2308354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971952
40002	NC_015152	ACG	2	6	2308400	2308405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971952
40003	NC_015152	CGG	2	6	2308559	2308564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325971952
40004	NC_015152	CTG	2	6	2308585	2308590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971952
40005	NC_015152	CAA	2	6	2308632	2308637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325971952
40006	NC_015152	GCT	2	6	2308674	2308679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971952
40007	NC_015152	T	6	6	2308697	2308702	0 %	100 %	0 %	0 %	325971952
40008	NC_015152	TCA	2	6	2308718	2308723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971952
40009	NC_015152	CAT	2	6	2308746	2308751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971952
40010	NC_015152	CCAT	2	8	2308901	2308908	25 %	25 %	0 %	50 %	325971952
40011	NC_015152	CA	3	6	2308914	2308919	50 %	0 %	0 %	50 %	325971952
40012	NC_015152	A	6	6	2308924	2308929	100 %	0 %	0 %	0 %	325971952
40013	NC_015152	AAC	2	6	2309011	2309016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325971952
40014	NC_015152	CTG	2	6	2309020	2309025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971952
40015	NC_015152	TCA	2	6	2309069	2309074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971952
40016	NC_015152	AAC	2	6	2309138	2309143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325971952
40017	NC_015152	GAAG	2	8	2309169	2309176	50 %	0 %	50 %	0 %	325971952
40018	NC_015152	ATTT	2	8	2309192	2309199	25 %	75 %	0 %	0 %	325971953
40019	NC_015152	TCT	2	6	2309229	2309234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325971953
40020	NC_015152	ACC	2	6	2309247	2309252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325971953
40021	NC_015152	GAA	2	6	2309315	2309320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325971953
40022	NC_015152	GA	3	6	2309365	2309370	50 %	0 %	50 %	0 %	325971953
40023	NC_015152	CTG	2	6	2309373	2309378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971953
40024	NC_015152	TGA	2	6	2309393	2309398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325971953
40025	NC_015152	ATG	2	6	2309439	2309444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325971953
40026	NC_015152	GAAG	2	8	2309570	2309577	50 %	0 %	50 %	0 %	325971953
40027	NC_015152	TAT	2	6	2309601	2309606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325971953
40028	NC_015152	TCA	2	6	2309635	2309640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971953
40029	NC_015152	GCG	2	6	2309641	2309646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325971953
40030	NC_015152	GAA	2	6	2309658	2309663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325971953
40031	NC_015152	AAGG	2	8	2309703	2309710	50 %	0 %	50 %	0 %	325971953
40032	NC_015152	TGC	2	6	2309723	2309728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971953
40033	NC_015152	AGC	2	6	2309928	2309933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971953
40034	NC_015152	TGG	2	6	2309978	2309983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325971953
40035	NC_015152	TA	3	6	2310041	2310046	50 %	50 %	0 %	0 %	325971954
40036	NC_015152	ACG	2	6	2310049	2310054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971954
40037	NC_015152	ATG	2	6	2310062	2310067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325971954
40038	NC_015152	TTC	2	6	2310101	2310106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325971954
40039	NC_015152	CGG	2	6	2310132	2310137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325971954
40040	NC_015152	CAT	2	6	2310139	2310144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971954
40041	NC_015152	A	6	6	2310395	2310400	100 %	0 %	0 %	0 %	325971954
40042	NC_015152	TTG	2	6	2310476	2310481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325971954
40043	NC_015152	GGT	2	6	2310510	2310515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325971954
40044	NC_015152	TGC	2	6	2310598	2310603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971954
40045	NC_015152	GGT	2	6	2310607	2310612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325971954
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40047	NC_015152	TAAC	2	8	2310699	2310706	50 %	25 %	0 %	25 %	325971954
40048	NC_015152	CAGC	2	8	2310981	2310988	25 %	0 %	25 %	50 %	325971954
40049	NC_015152	AGAA	2	8	2311066	2311073	75 %	0 %	25 %	0 %	325971955
40050	NC_015152	TGAC	2	8	2311151	2311158	25 %	25 %	25 %	25 %	325971955
40051	NC_015152	ACA	2	6	2311169	2311174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325971955
40052	NC_015152	ACC	2	6	2311330	2311335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325971955
40053	NC_015152	CTA	2	6	2311365	2311370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971955
40054	NC_015152	TCA	2	6	2311391	2311396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971955
40055	NC_015152	TTGC	2	8	2311414	2311421	0 %	50 %	25 %	25 %	325971955
40056	NC_015152	TGC	2	6	2311433	2311438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971955
40057	NC_015152	CCGT	2	8	2311529	2311536	0 %	25 %	25 %	50 %	325971955
40058	NC_015152	GCC	2	6	2311576	2311581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325971955
40059	NC_015152	CTC	2	6	2311758	2311763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325971955
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40061	NC_015152	AGCA	2	8	2311898	2311905	50 %	0 %	25 %	25 %	325971956
40062	NC_015152	AGA	2	6	2311916	2311921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325971956
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40065	NC_015152	TCCCC	2	10	2312086	2312095	0 %	20 %	0 %	80 %	325971956
40066	NC_015152	TTC	2	6	2312124	2312129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325971956
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40070	NC_015152	ATC	2	6	2312403	2312408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971956
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40072	NC_015152	TCA	2	6	2312542	2312547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971956
40073	NC_015152	ATC	2	6	2312592	2312597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971956
40074	NC_015152	GGTCA	2	10	2312604	2312613	20 %	20 %	40 %	20 %	325971956
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40082	NC_015152	CGA	2	6	2312961	2312966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971957
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40084	NC_015152	T	6	6	2313085	2313090	0 %	100 %	0 %	0 %	325971957
40085	NC_015152	GGAAA	2	10	2313094	2313103	60 %	0 %	40 %	0 %	325971957
40086	NC_015152	GAAA	2	8	2313129	2313136	75 %	0 %	25 %	0 %	325971957
40087	NC_015152	ATC	2	6	2313154	2313159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971957
40088	NC_015152	CAGT	2	8	2313197	2313204	25 %	25 %	25 %	25 %	325971957
40089	NC_015152	AAGC	2	8	2313250	2313257	50 %	0 %	25 %	25 %	325971957
40090	NC_015152	G	6	6	2313346	2313351	0 %	0 %	100 %	0 %	325971957
40091	NC_015152	AGA	2	6	2313352	2313357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325971957
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40100	NC_015152	GCAGC	2	10	2313927	2313936	20 %	0 %	40 %	40 %	325971958
40101	NC_015152	ACCA	2	8	2314073	2314080	50 %	0 %	0 %	50 %	325971958
40102	NC_015152	TGG	2	6	2314095	2314100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325971958
40103	NC_015152	GTA	2	6	2314154	2314159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325971958
40104	NC_015152	TTC	2	6	2314178	2314183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325971958
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40106	NC_015152	TCA	2	6	2314293	2314298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971958
40107	NC_015152	ACC	2	6	2314337	2314342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325971958
40108	NC_015152	TTCGT	2	10	2314469	2314478	0 %	60 %	20 %	20 %	325971958
40109	NC_015152	TAC	2	6	2314520	2314525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971958
40110	NC_015152	ATCG	2	8	2314775	2314782	25 %	25 %	25 %	25 %	325971958
40111	NC_015152	GCT	2	6	2314786	2314791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971958
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40116	NC_015152	AAC	3	9	2314958	2314966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325971958
40117	NC_015152	TCA	2	6	2315058	2315063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971958
40118	NC_015152	CCG	2	6	2315073	2315078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325971958
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40220	NC_015152	CTCATC	2	12	2321837	2321848	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	325971964
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40225	NC_015152	GA	3	6	2321987	2321992	50 %	0 %	50 %	0 %	325971964
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40231	NC_015152	AGGCA	2	10	2322204	2322213	40 %	0 %	40 %	20 %	325971964
40232	NC_015152	GCCC	2	8	2322224	2322231	0 %	0 %	25 %	75 %	325971964
40233	NC_015152	AAG	2	6	2322397	2322402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325971965
40234	NC_015152	TGC	2	6	2322424	2322429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971965
40235	NC_015152	ACG	2	6	2322636	2322641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971965
40236	NC_015152	CTA	2	6	2322731	2322736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971965
40237	NC_015152	GCT	2	6	2322797	2322802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971965
40238	NC_015152	TG	3	6	2322850	2322855	0 %	50 %	50 %	0 %	325971965
40239	NC_015152	CAT	2	6	2322908	2322913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971966
40240	NC_015152	GAG	2	6	2323047	2323052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325971966
40241	NC_015152	ATCCC	2	10	2323104	2323113	20 %	20 %	0 %	60 %	325971966
40242	NC_015152	GTC	2	6	2323194	2323199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971966
40243	NC_015152	ACG	2	6	2323211	2323216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971966
40244	NC_015152	AG	3	6	2323251	2323256	50 %	0 %	50 %	0 %	325971966
40245	NC_015152	AT	3	6	2323261	2323266	50 %	50 %	0 %	0 %	325971966
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40247	NC_015152	CCCA	2	8	2323418	2323425	25 %	0 %	0 %	75 %	325971966
40248	NC_015152	CAGAG	2	10	2323436	2323445	40 %	0 %	40 %	20 %	325971967
40249	NC_015152	TGC	2	6	2323466	2323471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971967
40250	NC_015152	GCA	2	6	2323506	2323511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971967
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40253	NC_015152	CAA	2	6	2323654	2323659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325971967
40254	NC_015152	CGT	2	6	2323713	2323718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971967
40255	NC_015152	CCCTT	2	10	2323771	2323780	0 %	40 %	0 %	60 %	325971967
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40257	NC_015152	CGGG	2	8	2323863	2323870	0 %	0 %	75 %	25 %	325971967
40258	NC_015152	CGG	2	6	2323887	2323892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325971967
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40260	NC_015152	TG	3	6	2323981	2323986	0 %	50 %	50 %	0 %	325971967
40261	NC_015152	TCA	2	6	2324029	2324034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971967
40262	NC_015152	CCAA	2	8	2324187	2324194	50 %	0 %	0 %	50 %	325971967
40263	NC_015152	TCT	2	6	2324254	2324259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325971967
40264	NC_015152	CCA	2	6	2324298	2324303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325971967
40265	NC_015152	ACT	2	6	2324328	2324333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971967
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40268	NC_015152	CGAT	2	8	2324488	2324495	25 %	25 %	25 %	25 %	325971967
40269	NC_015152	AC	4	8	2324564	2324571	50 %	0 %	0 %	50 %	325971967
40270	NC_015152	ACT	2	6	2324594	2324599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971967
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40272	NC_015152	TTC	2	6	2324778	2324783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325971967
40273	NC_015152	TTTCT	2	10	2324852	2324861	0 %	80 %	0 %	20 %	325971967
40274	NC_015152	CAA	2	6	2324873	2324878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325971967
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40291	NC_015152	TC	3	6	2325567	2325572	0 %	50 %	0 %	50 %	325971968
40292	NC_015152	ATCGGC	2	12	2325613	2325624	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325971968
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40310	NC_015152	CTTC	2	8	2326402	2326409	0 %	50 %	0 %	50 %	325971970
40311	NC_015152	TTCT	2	8	2326533	2326540	0 %	75 %	0 %	25 %	325971970
40312	NC_015152	TTG	2	6	2326566	2326571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325971970
40313	NC_015152	GCA	2	6	2327068	2327073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971971
40314	NC_015152	GATA	2	8	2327114	2327121	50 %	25 %	25 %	0 %	325971971
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40316	NC_015152	TGGA	2	8	2327218	2327225	25 %	25 %	50 %	0 %	325971971
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40319	NC_015152	GCA	2	6	2327342	2327347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971971
40320	NC_015152	CACC	2	8	2327357	2327364	25 %	0 %	0 %	75 %	325971971
40321	NC_015152	GCA	2	6	2327419	2327424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971971
40322	NC_015152	CAG	2	6	2327565	2327570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971971
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40325	NC_015152	TCG	2	6	2327641	2327646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971971
40326	NC_015152	CTCG	2	8	2327729	2327736	0 %	25 %	25 %	50 %	325971971
40327	NC_015152	CAT	2	6	2327798	2327803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971971
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40329	NC_015152	GA	3	6	2327904	2327909	50 %	0 %	50 %	0 %	325971971
40330	NC_015152	CTG	2	6	2327979	2327984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971971
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40332	NC_015152	AGGA	2	8	2328043	2328050	50 %	0 %	50 %	0 %	325971971
40333	NC_015152	CCA	2	6	2328077	2328082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325971971
40334	NC_015152	CAG	2	6	2328199	2328204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971971
40335	NC_015152	GA	3	6	2328205	2328210	50 %	0 %	50 %	0 %	325971971
40336	NC_015152	CAAA	2	8	2328245	2328252	75 %	0 %	0 %	25 %	325971971
40337	NC_015152	TCA	2	6	2328268	2328273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971971
40338	NC_015152	GCA	3	9	2328281	2328289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971971
40339	NC_015152	GCC	2	6	2328427	2328432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325971971
40340	NC_015152	A	6	6	2328437	2328442	100 %	0 %	0 %	0 %	325971971
40341	NC_015152	TGC	2	6	2328471	2328476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971971
40342	NC_015152	TCC	2	6	2328502	2328507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325971971
40343	NC_015152	GGC	2	6	2328702	2328707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325971971
40344	NC_015152	CCA	2	6	2328739	2328744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325971971
40345	NC_015152	AGC	2	6	2328754	2328759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971971
40346	NC_015152	ACG	2	6	2329003	2329008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971971
40347	NC_015152	AAG	2	6	2329042	2329047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325971971
40348	NC_015152	CAT	2	6	2329055	2329060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971971
40349	NC_015152	TGG	2	6	2329136	2329141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325971971
40350	NC_015152	CCG	2	6	2329201	2329206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325971971
40351	NC_015152	AAGCG	2	10	2329323	2329332	40 %	0 %	40 %	20 %	325971971
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40353	NC_015152	CCGG	2	8	2329377	2329384	0 %	0 %	50 %	50 %	325971971
40354	NC_015152	CGA	2	6	2329394	2329399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971971
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40459	NC_015152	GCA	2	6	2335145	2335150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971975
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40465	NC_015152	GCTC	2	8	2335446	2335453	0 %	25 %	25 %	50 %	325971976
40466	NC_015152	CAT	2	6	2335581	2335586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971976
40467	NC_015152	GAG	2	6	2335667	2335672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325971976
40468	NC_015152	GTC	2	6	2335758	2335763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971976
40469	NC_015152	CAC	2	6	2335770	2335775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325971976
40470	NC_015152	TGA	2	6	2335883	2335888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325971976
40471	NC_015152	AGC	2	6	2335932	2335937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971976
40472	NC_015152	CATC	2	8	2336348	2336355	25 %	25 %	0 %	50 %	325971976
40473	NC_015152	CAGAT	2	10	2336404	2336413	40 %	20 %	20 %	20 %	325971976
40474	NC_015152	TGG	2	6	2336435	2336440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325971976
40475	NC_015152	AAAC	2	8	2336445	2336452	75 %	0 %	0 %	25 %	325971976
40476	NC_015152	CTT	2	6	2336456	2336461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325971976
40477	NC_015152	ATG	2	6	2336532	2336537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325971976
40478	NC_015152	GT	3	6	2336617	2336622	0 %	50 %	50 %	0 %	325971976
40479	NC_015152	CCT	2	6	2336723	2336728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325971976
40480	NC_015152	TGC	2	6	2336737	2336742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971976
40481	NC_015152	GGCA	2	8	2336762	2336769	25 %	0 %	50 %	25 %	325971976
40482	NC_015152	TG	3	6	2336786	2336791	0 %	50 %	50 %	0 %	325971976
40483	NC_015152	CCT	2	6	2336819	2336824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325971976
40484	NC_015152	CGG	2	6	2336904	2336909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325971977
40485	NC_015152	T	7	7	2336927	2336933	0 %	100 %	0 %	0 %	325971977
40486	NC_015152	CTG	2	6	2336967	2336972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971977
40487	NC_015152	TCG	2	6	2336976	2336981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971977
40488	NC_015152	ATCA	2	8	2337029	2337036	50 %	25 %	0 %	25 %	325971977
40489	NC_015152	CCA	2	6	2337052	2337057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325971977
40490	NC_015152	TGA	2	6	2337100	2337105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325971977
40491	NC_015152	GCT	3	9	2337112	2337120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971977
40492	NC_015152	TGT	2	6	2337151	2337156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325971977
40493	NC_015152	TCA	2	6	2337177	2337182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325971977
40494	NC_015152	TGC	2	6	2337268	2337273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325971977
40495	NC_015152	CCG	2	6	2337313	2337318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325971977
40496	NC_015152	GTGG	2	8	2337347	2337354	0 %	25 %	75 %	0 %	325971977
40497	NC_015152	CCTT	2	8	2337360	2337367	0 %	50 %	0 %	50 %	325971977
40498	NC_015152	AGC	2	6	2337372	2337377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325971977
40499	NC_015152	GAT	2	6	2337385	2337390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325971977
40500	NC_015152	GTT	2	6	2337401	2337406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325971977

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