MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015152	GGT	3	9	111961	111969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969944
2002	NC_015152	GT	3	6	111997	112002	0 %	50 %	50 %	0 %	325969944
2003	NC_015152	GAAG	2	8	112036	112043	50 %	0 %	50 %	0 %	325969944
2004	NC_015152	GGC	2	6	112079	112084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969944
2005	NC_015152	CT	3	6	112095	112100	0 %	50 %	0 %	50 %	325969944
2006	NC_015152	GAA	2	6	112139	112144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969944
2007	NC_015152	TAG	2	6	112233	112238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969944
2008	NC_015152	TGCAC	2	10	112251	112260	20 %	20 %	20 %	40 %	325969944
2009	NC_015152	GTC	3	9	112283	112291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969944
2010	NC_015152	CCA	2	6	112379	112384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969944
2011	NC_015152	AAG	2	6	112685	112690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969944
2012	NC_015152	GCA	2	6	112719	112724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969944
2013	NC_015152	GTA	2	6	112766	112771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969944
2014	NC_015152	CGA	2	6	113002	113007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969944
2015	NC_015152	GTTG	2	8	113041	113048	0 %	50 %	50 %	0 %	325969944
2016	NC_015152	CTT	2	6	113080	113085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969944
2017	NC_015152	AAGG	2	8	113101	113108	50 %	0 %	50 %	0 %	325969944
2018	NC_015152	TTGC	2	8	113135	113142	0 %	50 %	25 %	25 %	325969944
2019	NC_015152	GGT	2	6	113201	113206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969944
2020	NC_015152	CAA	2	6	113215	113220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969944
2021	NC_015152	TCA	2	6	113226	113231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969944
2022	NC_015152	AGGG	2	8	113340	113347	25 %	0 %	75 %	0 %	325969944
2023	NC_015152	TGT	2	6	113368	113373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969944
2024	NC_015152	AAC	2	6	113397	113402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969944
2025	NC_015152	CTC	2	6	113414	113419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969944
2026	NC_015152	AGG	2	6	113434	113439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969944
2027	NC_015152	CTT	2	6	113459	113464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969944
2028	NC_015152	TGC	2	6	113505	113510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969944
2029	NC_015152	GAGG	2	8	113576	113583	25 %	0 %	75 %	0 %	325969944
2030	NC_015152	TGA	2	6	113666	113671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969944
2031	NC_015152	GAT	2	6	113728	113733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969945
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2033	NC_015152	AG	3	6	113801	113806	50 %	0 %	50 %	0 %	325969945
2034	NC_015152	TGA	2	6	113874	113879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969945
2035	NC_015152	TGA	2	6	113913	113918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969945
2036	NC_015152	GAT	2	6	113926	113931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969945
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2038	NC_015152	TGC	2	6	114097	114102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969945
2039	NC_015152	GT	3	6	114108	114113	0 %	50 %	50 %	0 %	325969945
2040	NC_015152	CAT	2	6	114175	114180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969945
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2042	NC_015152	GAC	2	6	114292	114297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969945
2043	NC_015152	CCT	2	6	114402	114407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969945
2044	NC_015152	TGA	2	6	114426	114431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969945
2045	NC_015152	CAAG	2	8	114437	114444	50 %	0 %	25 %	25 %	325969945
2046	NC_015152	TGA	2	6	114486	114491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969945
2047	NC_015152	T	7	7	114495	114501	0 %	100 %	0 %	0 %	325969945
2048	NC_015152	TCCT	2	8	114517	114524	0 %	50 %	0 %	50 %	325969946
2049	NC_015152	GT	3	6	114533	114538	0 %	50 %	50 %	0 %	325969946
2050	NC_015152	GCA	2	6	114542	114547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969946
2051	NC_015152	GCA	2	6	114589	114594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969946
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2053	NC_015152	GTT	2	6	114655	114660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969946
2054	NC_015152	ACC	2	6	114669	114674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969946
2055	NC_015152	GTG	2	6	114745	114750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969946
2056	NC_015152	CCA	2	6	114885	114890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969946
2057	NC_015152	GGT	2	6	114894	114899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969946
2058	NC_015152	CAGC	2	8	114936	114943	25 %	0 %	25 %	50 %	325969946
2059	NC_015152	T	6	6	114953	114958	0 %	100 %	0 %	0 %	325969946
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2062	NC_015152	GAA	3	9	115053	115061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969946
2063	NC_015152	CCAA	2	8	115123	115130	50 %	0 %	0 %	50 %	325969946
2064	NC_015152	AGT	2	6	115143	115148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969946
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2067	NC_015152	GA	3	6	115246	115251	50 %	0 %	50 %	0 %	325969946
2068	NC_015152	ATA	2	6	115450	115455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325969947
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2106	NC_015152	T	6	6	117429	117434	0 %	100 %	0 %	0 %	325969948
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2111	NC_015152	TA	3	6	117600	117605	50 %	50 %	0 %	0 %	325969948
2112	NC_015152	CTTT	2	8	117620	117627	0 %	75 %	0 %	25 %	325969948
2113	NC_015152	GC	3	6	117667	117672	0 %	0 %	50 %	50 %	325969948
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2120	NC_015152	TCT	2	6	118027	118032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969949
2121	NC_015152	CGT	3	9	118093	118101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969949
2122	NC_015152	GAT	2	6	118124	118129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969949
2123	NC_015152	CTG	2	6	118146	118151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969949
2124	NC_015152	GA	3	6	118171	118176	50 %	0 %	50 %	0 %	325969949
2125	NC_015152	GTT	2	6	118214	118219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969949
2126	NC_015152	GAA	2	6	118223	118228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969949
2127	NC_015152	GTCA	2	8	118241	118248	25 %	25 %	25 %	25 %	325969949
2128	NC_015152	CAC	2	6	118367	118372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969949
2129	NC_015152	GGC	2	6	118373	118378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969949
2130	NC_015152	CACC	2	8	118399	118406	25 %	0 %	0 %	75 %	325969949
2131	NC_015152	CAG	2	6	118460	118465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969949
2132	NC_015152	CTG	2	6	118537	118542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969949
2133	NC_015152	GCC	2	6	118607	118612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325969949
2134	NC_015152	AGA	2	6	118621	118626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969949
2135	NC_015152	ATG	2	6	118710	118715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969949
2136	NC_015152	ATT	2	6	118772	118777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325969949
2137	NC_015152	AT	3	6	118786	118791	50 %	50 %	0 %	0 %	325969949
2138	NC_015152	AATG	2	8	119195	119202	50 %	25 %	25 %	0 %	325969950
2139	NC_015152	AAGGA	2	10	119269	119278	60 %	0 %	40 %	0 %	325969950
2140	NC_015152	TAT	2	6	119283	119288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325969950
2141	NC_015152	CAG	2	6	119298	119303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969950
2142	NC_015152	GA	3	6	119307	119312	50 %	0 %	50 %	0 %	325969950
2143	NC_015152	AGC	2	6	119313	119318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969950
2144	NC_015152	GA	3	6	119338	119343	50 %	0 %	50 %	0 %	325969950
2145	NC_015152	TTG	2	6	119384	119389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969950
2146	NC_015152	GGA	2	6	119390	119395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325969950
2147	NC_015152	CATTA	2	10	119592	119601	40 %	40 %	0 %	20 %	325969950
2148	NC_015152	ACC	2	6	119643	119648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969950
2149	NC_015152	AAGG	2	8	119679	119686	50 %	0 %	50 %	0 %	325969950
2150	NC_015152	TGAGGA	2	12	119687	119698	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325969950
2151	NC_015152	ATGA	2	8	119721	119728	50 %	25 %	25 %	0 %	325969950
2152	NC_015152	GAA	2	6	119737	119742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969950
2153	NC_015152	TTC	2	6	119764	119769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969950
2154	NC_015152	TGA	2	6	119801	119806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969950
2155	NC_015152	GCG	2	6	119858	119863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969950
2156	NC_015152	TAC	2	6	119868	119873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969950
2157	NC_015152	ACA	2	6	119885	119890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969950
2158	NC_015152	GTCG	2	8	119891	119898	0 %	25 %	50 %	25 %	325969950
2159	NC_015152	TA	3	6	119946	119951	50 %	50 %	0 %	0 %	325969950
2160	NC_015152	GAA	2	6	119969	119974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969950
2161	NC_015152	TGC	2	6	119980	119985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969950
2162	NC_015152	ATC	2	6	120042	120047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969950
2163	NC_015152	TCA	2	6	120091	120096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969950
2164	NC_015152	TCCT	2	8	120141	120148	0 %	50 %	0 %	50 %	325969950
2165	NC_015152	GTT	2	6	120169	120174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969950
2166	NC_015152	GCT	2	6	120179	120184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969950
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2169	NC_015152	TAG	2	6	120302	120307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969950
2170	NC_015152	TGAAC	2	10	120425	120434	40 %	20 %	20 %	20 %	325969950
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2179	NC_015152	G	6	6	120965	120970	0 %	0 %	100 %	0 %	325969950
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2182	NC_015152	CAA	2	6	121238	121243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325969950
2183	NC_015152	TACC	2	8	121259	121266	25 %	25 %	0 %	50 %	325969950
2184	NC_015152	CAT	2	6	121398	121403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325969951
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2190	NC_015152	GCT	2	6	121709	121714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969951
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2194	NC_015152	GTA	2	6	121894	121899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969951
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2196	NC_015152	TCG	2	6	121995	122000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969951
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2203	NC_015152	TC	3	6	122361	122366	0 %	50 %	0 %	50 %	325969952
2204	NC_015152	TGC	2	6	122404	122409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969952
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2210	NC_015152	TCAGT	2	10	122614	122623	20 %	40 %	20 %	20 %	325969952
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2212	NC_015152	GAATC	2	10	123134	123143	40 %	20 %	20 %	20 %	325969953
2213	NC_015152	GCA	2	6	123183	123188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969953
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2221	NC_015152	CTG	2	6	123454	123459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969953
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2223	NC_015152	CT	3	6	123596	123601	0 %	50 %	0 %	50 %	325969953
2224	NC_015152	GATG	2	8	123656	123663	25 %	25 %	50 %	0 %	325969953
2225	NC_015152	TC	3	6	123729	123734	0 %	50 %	0 %	50 %	325969953
2226	NC_015152	GTTT	2	8	123760	123767	0 %	75 %	25 %	0 %	325969953
2227	NC_015152	CAC	2	6	123794	123799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325969953
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2230	NC_015152	GCT	2	6	124128	124133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969953
2231	NC_015152	GAT	2	6	124146	124151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969953
2232	NC_015152	GAA	2	6	124365	124370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969954
2233	NC_015152	TGA	2	6	124507	124512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969954
2234	NC_015152	TTG	2	6	124548	124553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325969954
2235	NC_015152	GCGGTG	2	12	124562	124573	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325969954
2236	NC_015152	AAT	2	6	124583	124588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325969954
2237	NC_015152	AC	3	6	124635	124640	50 %	0 %	0 %	50 %	325969954
2238	NC_015152	C	6	6	124665	124670	0 %	0 %	0 %	100 %	325969954
2239	NC_015152	TGC	2	6	124768	124773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969954
2240	NC_015152	GCGG	2	8	124847	124854	0 %	0 %	75 %	25 %	325969954
2241	NC_015152	GCC	2	6	124889	124894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325969954
2242	NC_015152	AAG	2	6	124922	124927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325969954
2243	NC_015152	ATGC	2	8	125002	125009	25 %	25 %	25 %	25 %	325969954
2244	NC_015152	TTC	2	6	125186	125191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969954
2245	NC_015152	GCA	2	6	125194	125199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969954
2246	NC_015152	CT	3	6	125292	125297	0 %	50 %	0 %	50 %	325969954
2247	NC_015152	TGGG	2	8	125373	125380	0 %	25 %	75 %	0 %	325969954
2248	NC_015152	ATGA	2	8	125429	125436	50 %	25 %	25 %	0 %	325969954
2249	NC_015152	GGT	2	6	125513	125518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969954
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2251	NC_015152	CCT	2	6	125578	125583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969954
2252	NC_015152	GAT	2	6	125606	125611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969954
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2255	NC_015152	AACA	2	8	125768	125775	75 %	0 %	0 %	25 %	325969954
2256	NC_015152	AGC	2	6	125868	125873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969954
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2258	NC_015152	TTGG	2	8	126256	126263	0 %	50 %	50 %	0 %	325969955
2259	NC_015152	CCTGTT	2	12	126273	126284	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325969955
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2261	NC_015152	CTG	2	6	126328	126333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969955
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2272	NC_015152	TTC	2	6	126879	126884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325969956
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2274	NC_015152	AGCG	2	8	126920	126927	25 %	0 %	50 %	25 %	325969956
2275	NC_015152	AGC	2	6	126966	126971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969956
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2282	NC_015152	CTC	2	6	127411	127416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969956
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2317	NC_015152	GCCTC	2	10	128885	128894	0 %	20 %	20 %	60 %	325969958
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2324	NC_015152	ATGGC	2	10	129137	129146	20 %	20 %	40 %	20 %	325969958
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2326	NC_015152	AG	3	6	129156	129161	50 %	0 %	50 %	0 %	325969958
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2332	NC_015152	CTG	2	6	129683	129688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969958
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2348	NC_015152	TGA	2	6	130578	130583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969960
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2357	NC_015152	TCC	2	6	130967	130972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325969960
2358	NC_015152	C	6	6	131141	131146	0 %	0 %	0 %	100 %	325969960
2359	NC_015152	GGC	2	6	131179	131184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325969960
2360	NC_015152	TGA	2	6	131283	131288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969960
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2362	NC_015152	TGGC	2	8	131390	131397	0 %	25 %	50 %	25 %	325969960
2363	NC_015152	CCG	2	6	131465	131470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325969960
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2365	NC_015152	CA	4	8	131599	131606	50 %	0 %	0 %	50 %	325969960
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2487	NC_015152	C	6	6	139122	139127	0 %	0 %	0 %	100 %	325969965
2488	NC_015152	TGA	2	6	139168	139173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969965
2489	NC_015152	TGG	2	6	139213	139218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969965
2490	NC_015152	TGA	2	6	139220	139225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325969965
2491	NC_015152	TGC	2	6	139228	139233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969965
2492	NC_015152	GGT	2	6	139283	139288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969966
2493	NC_015152	CAGAG	2	10	139375	139384	40 %	0 %	40 %	20 %	325969966
2494	NC_015152	TGG	2	6	139452	139457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325969966
2495	NC_015152	TC	3	6	139492	139497	0 %	50 %	0 %	50 %	325969966
2496	NC_015152	CTG	2	6	139500	139505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969966
2497	NC_015152	GTTG	2	8	139522	139529	0 %	50 %	50 %	0 %	325969966
2498	NC_015152	TGC	2	6	139536	139541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969966
2499	NC_015152	GCA	2	6	139565	139570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325969966
2500	NC_015152	CTG	2	6	139604	139609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325969966

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