MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20002	NC_015152	AAGA	2	8	1150232	1150239	75 %	0 %	25 %	0 %	325970896
20003	NC_015152	T	7	7	1150349	1150355	0 %	100 %	0 %	0 %	325970897
20004	NC_015152	CAT	2	6	1150398	1150403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970897
20005	NC_015152	GGC	2	6	1150515	1150520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970897
20006	NC_015152	GAT	2	6	1150554	1150559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970897
20007	NC_015152	CAA	2	6	1150581	1150586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970897
20008	NC_015152	AGC	2	6	1150591	1150596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970897
20009	NC_015152	GAC	2	6	1150614	1150619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970897
20010	NC_015152	AAGGA	2	10	1150699	1150708	60 %	0 %	40 %	0 %	325970897
20011	NC_015152	GAT	2	6	1150737	1150742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970897
20012	NC_015152	TCA	2	6	1150745	1150750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970897
20013	NC_015152	TTA	2	6	1151017	1151022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970898
20014	NC_015152	GC	3	6	1151083	1151088	0 %	0 %	50 %	50 %	325970898
20015	NC_015152	CT	3	6	1151127	1151132	0 %	50 %	0 %	50 %	325970898
20016	NC_015152	TGA	2	6	1151206	1151211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970898
20017	NC_015152	GAAA	2	8	1151544	1151551	75 %	0 %	25 %	0 %	325970899
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20019	NC_015152	TG	3	6	1151702	1151707	0 %	50 %	50 %	0 %	325970899
20020	NC_015152	AGA	2	6	1151870	1151875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970899
20021	NC_015152	TGA	2	6	1151880	1151885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970899
20022	NC_015152	TCT	2	6	1151898	1151903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970899
20023	NC_015152	GAT	2	6	1152022	1152027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970899
20024	NC_015152	GCT	2	6	1152049	1152054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970899
20025	NC_015152	CTA	2	6	1152106	1152111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970899
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20027	NC_015152	TGC	2	6	1152161	1152166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970899
20028	NC_015152	ATGG	2	8	1152175	1152182	25 %	25 %	50 %	0 %	325970899
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20031	NC_015152	TTG	2	6	1152494	1152499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970899
20032	NC_015152	TCC	2	6	1152522	1152527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970899
20033	NC_015152	TGG	2	6	1152554	1152559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970899
20034	NC_015152	TCATCC	2	12	1152620	1152631	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	325970899
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20038	NC_015152	GTT	2	6	1152793	1152798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970900
20039	NC_015152	TGA	2	6	1152808	1152813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970900
20040	NC_015152	TTC	2	6	1152852	1152857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970900
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20043	NC_015152	CTC	2	6	1153004	1153009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970900
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20045	NC_015152	TC	3	6	1153104	1153109	0 %	50 %	0 %	50 %	325970901
20046	NC_015152	CT	3	6	1153148	1153153	0 %	50 %	0 %	50 %	325970901
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20049	NC_015152	CTGC	2	8	1153384	1153391	0 %	25 %	25 %	50 %	325970901
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20053	NC_015152	GA	3	6	1153631	1153636	50 %	0 %	50 %	0 %	325970901
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20115	NC_015152	GTT	2	6	1157778	1157783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970903
20116	NC_015152	TCTCC	2	10	1157792	1157801	0 %	40 %	0 %	60 %	325970903
20117	NC_015152	AAG	2	6	1157814	1157819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970903
20118	NC_015152	CGA	2	6	1157849	1157854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970903
20119	NC_015152	AAG	2	6	1157925	1157930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970903
20120	NC_015152	TCA	2	6	1158074	1158079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970904
20121	NC_015152	CAG	2	6	1158108	1158113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970904
20122	NC_015152	TTC	2	6	1158160	1158165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970904
20123	NC_015152	TCT	2	6	1158182	1158187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970904
20124	NC_015152	GCT	2	6	1158205	1158210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970904
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20126	NC_015152	TCCT	2	8	1158250	1158257	0 %	50 %	0 %	50 %	325970904
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20128	NC_015152	TGA	2	6	1158485	1158490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970904
20129	NC_015152	GTT	3	9	1158588	1158596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970904
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20131	NC_015152	TGC	2	6	1158617	1158622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970904
20132	NC_015152	TCTGAG	2	12	1158632	1158643	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325970904
20133	NC_015152	AGGA	2	8	1159013	1159020	50 %	0 %	50 %	0 %	325970905
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20136	NC_015152	CTC	2	6	1159213	1159218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970905
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20139	NC_015152	ATC	2	6	1159321	1159326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970905
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20146	NC_015152	AGGG	2	8	1159832	1159839	25 %	0 %	75 %	0 %	325970905
20147	NC_015152	TGC	2	6	1159941	1159946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970905
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20218	NC_015152	GATCA	2	10	1163663	1163672	40 %	20 %	20 %	20 %	325970909
20219	NC_015152	CAT	2	6	1163678	1163683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970909
20220	NC_015152	CATGG	2	10	1163744	1163753	20 %	20 %	40 %	20 %	325970909
20221	NC_015152	CCA	2	6	1163799	1163804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970909
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20224	NC_015152	GCC	2	6	1164018	1164023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970909
20225	NC_015152	GGT	2	6	1164104	1164109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970909
20226	NC_015152	TACCGG	2	12	1164172	1164183	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325970909
20227	NC_015152	CAT	2	6	1164301	1164306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970909
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20229	NC_015152	TCA	2	6	1164438	1164443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970909
20230	NC_015152	TGA	2	6	1164466	1164471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970909
20231	NC_015152	CTT	2	6	1164481	1164486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970909
20232	NC_015152	AGAA	2	8	1164502	1164509	75 %	0 %	25 %	0 %	325970909
20233	NC_015152	CAT	2	6	1164579	1164584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970910
20234	NC_015152	GAA	2	6	1164595	1164600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970910
20235	NC_015152	GAT	2	6	1164655	1164660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970910
20236	NC_015152	TTC	2	6	1164674	1164679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970910
20237	NC_015152	ATGG	2	8	1164700	1164707	25 %	25 %	50 %	0 %	325970910
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20239	NC_015152	TGG	2	6	1164746	1164751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970910
20240	NC_015152	GCA	2	6	1164771	1164776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970910
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20341	NC_015152	ACC	2	6	1170342	1170347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970916
20342	NC_015152	TCT	2	6	1170359	1170364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970916
20343	NC_015152	AGAA	2	8	1170409	1170416	75 %	0 %	25 %	0 %	325970916
20344	NC_015152	TCG	2	6	1170451	1170456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970916
20345	NC_015152	CAG	2	6	1170467	1170472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970916
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20347	NC_015152	CAAT	2	8	1170687	1170694	50 %	25 %	0 %	25 %	325970916
20348	NC_015152	CTG	2	6	1170929	1170934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970917
20349	NC_015152	ATGA	2	8	1171011	1171018	50 %	25 %	25 %	0 %	325970917
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20447	NC_015152	GAA	2	6	1177082	1177087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970921
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20457	NC_015152	ACT	2	6	1177519	1177524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970921
20458	NC_015152	A	6	6	1177579	1177584	100 %	0 %	0 %	0 %	325970921
20459	NC_015152	TCA	2	6	1177585	1177590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970921
20460	NC_015152	GAG	2	6	1177623	1177628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970921
20461	NC_015152	CAT	2	6	1177646	1177651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970921
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20464	NC_015152	T	7	7	1177818	1177824	0 %	100 %	0 %	0 %	325970922
20465	NC_015152	CTT	3	9	1177865	1177873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970922
20466	NC_015152	GAT	2	6	1177920	1177925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970922
20467	NC_015152	GGAA	2	8	1177982	1177989	50 %	0 %	50 %	0 %	325970922
20468	NC_015152	TCC	2	6	1178066	1178071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970922
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20485	NC_015152	GCCCG	2	10	1179021	1179030	0 %	0 %	40 %	60 %	325970924
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20491	NC_015152	TTG	2	6	1179385	1179390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970924
20492	NC_015152	GTC	2	6	1179453	1179458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970924
20493	NC_015152	GTC	2	6	1179537	1179542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970924
20494	NC_015152	ATG	2	6	1179610	1179615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970924
20495	NC_015152	CGT	2	6	1179633	1179638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970924
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20497	NC_015152	GCT	2	6	1179925	1179930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970925
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