MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_015152	T	6	6	1120522	1120527	0 %	100 %	0 %	0 %	325970869
19502	NC_015152	ATC	2	6	1120621	1120626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970869
19503	NC_015152	TCA	2	6	1120643	1120648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970869
19504	NC_015152	AGG	2	6	1120649	1120654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970869
19505	NC_015152	AGC	2	6	1120673	1120678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970869
19506	NC_015152	TTG	2	6	1120685	1120690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970869
19507	NC_015152	GAA	2	6	1120696	1120701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970869
19508	NC_015152	ATT	2	6	1120709	1120714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970869
19509	NC_015152	GAC	2	6	1120738	1120743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970869
19510	NC_015152	TGC	2	6	1120758	1120763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970869
19511	NC_015152	GGC	2	6	1120809	1120814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970869
19512	NC_015152	TCT	2	6	1120889	1120894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970869
19513	NC_015152	TGAA	2	8	1120919	1120926	50 %	25 %	25 %	0 %	325970869
19514	NC_015152	GCA	2	6	1120982	1120987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970869
19515	NC_015152	CAG	2	6	1121124	1121129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970869
19516	NC_015152	GCAA	2	8	1121141	1121148	50 %	0 %	25 %	25 %	325970869
19517	NC_015152	CGAT	2	8	1121175	1121182	25 %	25 %	25 %	25 %	325970869
19518	NC_015152	GAAT	2	8	1121209	1121216	50 %	25 %	25 %	0 %	325970869
19519	NC_015152	AAG	2	6	1121466	1121471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970870
19520	NC_015152	G	6	6	1121506	1121511	0 %	0 %	100 %	0 %	325970870
19521	NC_015152	ATC	2	6	1121520	1121525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970870
19522	NC_015152	AGA	2	6	1121734	1121739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970870
19523	NC_015152	CGC	2	6	1121744	1121749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970870
19524	NC_015152	CATCGG	2	12	1121792	1121803	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325970870
19525	NC_015152	CGG	2	6	1121836	1121841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970870
19526	NC_015152	GGT	2	6	1121867	1121872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970870
19527	NC_015152	AGC	3	9	1121893	1121901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970870
19528	NC_015152	GCA	2	6	1121923	1121928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970870
19529	NC_015152	ACA	2	6	1122034	1122039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970870
19530	NC_015152	ATT	2	6	1122115	1122120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970870
19531	NC_015152	TTC	2	6	1122328	1122333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970871
19532	NC_015152	GGT	2	6	1122365	1122370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970871
19533	NC_015152	GCAG	2	8	1122431	1122438	25 %	0 %	50 %	25 %	325970871
19534	NC_015152	CAG	2	6	1122441	1122446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970871
19535	NC_015152	TCA	2	6	1122457	1122462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970871
19536	NC_015152	GAAT	2	8	1122527	1122534	50 %	25 %	25 %	0 %	325970871
19537	NC_015152	TC	3	6	1122535	1122540	0 %	50 %	0 %	50 %	325970871
19538	NC_015152	CT	3	6	1122568	1122573	0 %	50 %	0 %	50 %	325970871
19539	NC_015152	ACC	2	6	1122625	1122630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970871
19540	NC_015152	TGA	2	6	1122707	1122712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970871
19541	NC_015152	TA	3	6	1122780	1122785	50 %	50 %	0 %	0 %	325970871
19542	NC_015152	GT	3	6	1122808	1122813	0 %	50 %	50 %	0 %	325970871
19543	NC_015152	ATCAG	2	10	1123082	1123091	40 %	20 %	20 %	20 %	325970871
19544	NC_015152	ATT	2	6	1123101	1123106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970871
19545	NC_015152	TA	3	6	1123117	1123122	50 %	50 %	0 %	0 %	325970871
19546	NC_015152	TCA	2	6	1123124	1123129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970871
19547	NC_015152	AGCG	2	8	1123149	1123156	25 %	0 %	50 %	25 %	325970871
19548	NC_015152	TC	3	6	1123157	1123162	0 %	50 %	0 %	50 %	325970871
19549	NC_015152	GTT	2	6	1123311	1123316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970871
19550	NC_015152	AGC	2	6	1123342	1123347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970871
19551	NC_015152	CAAC	2	8	1123381	1123388	50 %	0 %	0 %	50 %	325970871
19552	NC_015152	TTG	2	6	1123393	1123398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970871
19553	NC_015152	CAG	2	6	1123461	1123466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970871
19554	NC_015152	ATCA	2	8	1123683	1123690	50 %	25 %	0 %	25 %	325970871
19555	NC_015152	T	6	6	1123738	1123743	0 %	100 %	0 %	0 %	325970871
19556	NC_015152	TCAA	2	8	1123819	1123826	50 %	25 %	0 %	25 %	325970871
19557	NC_015152	TCTT	2	8	1123927	1123934	0 %	75 %	0 %	25 %	325970871
19558	NC_015152	ATCC	2	8	1124047	1124054	25 %	25 %	0 %	50 %	325970871
19559	NC_015152	TCC	2	6	1124058	1124063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970871
19560	NC_015152	TGG	2	6	1124080	1124085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970871
19561	NC_015152	GA	3	6	1124110	1124115	50 %	0 %	50 %	0 %	325970871
19562	NC_015152	TCG	2	6	1124197	1124202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970871
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19570	NC_015152	GTA	2	6	1124796	1124801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970871
19571	NC_015152	CAAA	2	8	1124924	1124931	75 %	0 %	0 %	25 %	325970871
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19573	NC_015152	TTG	2	6	1124986	1124991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970872
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19575	NC_015152	GTATG	2	10	1125063	1125072	20 %	40 %	40 %	0 %	325970872
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19578	NC_015152	TGA	2	6	1125204	1125209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970872
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19583	NC_015152	TGA	2	6	1125453	1125458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970872
19584	NC_015152	CAT	2	6	1125465	1125470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970872
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19586	NC_015152	CTCC	2	8	1125573	1125580	0 %	25 %	0 %	75 %	325970872
19587	NC_015152	GTT	2	6	1125615	1125620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970872
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19589	NC_015152	GCTC	2	8	1125777	1125784	0 %	25 %	25 %	50 %	325970872
19590	NC_015152	TTC	2	6	1125794	1125799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970872
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19593	NC_015152	AAG	2	6	1126140	1126145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970872
19594	NC_015152	TGA	2	6	1126284	1126289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970872
19595	NC_015152	ATG	2	6	1126375	1126380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970872
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19598	NC_015152	GCA	2	6	1126488	1126493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970872
19599	NC_015152	TA	3	6	1126516	1126521	50 %	50 %	0 %	0 %	325970872
19600	NC_015152	AG	3	6	1126557	1126562	50 %	0 %	50 %	0 %	325970872
19601	NC_015152	GAA	2	6	1126606	1126611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970872
19602	NC_015152	A	6	6	1126620	1126625	100 %	0 %	0 %	0 %	325970872
19603	NC_015152	ATG	2	6	1126643	1126648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970872
19604	NC_015152	TGCGAT	2	12	1126656	1126667	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325970872
19605	NC_015152	TACA	2	8	1126676	1126683	50 %	25 %	0 %	25 %	325970872
19606	NC_015152	AGT	2	6	1126773	1126778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970872
19607	NC_015152	TACG	2	8	1126875	1126882	25 %	25 %	25 %	25 %	325970872
19608	NC_015152	GC	3	6	1127029	1127034	0 %	0 %	50 %	50 %	325970872
19609	NC_015152	GAAGG	2	10	1127148	1127157	40 %	0 %	60 %	0 %	325970872
19610	NC_015152	CAA	2	6	1127258	1127263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970872
19611	NC_015152	GTG	2	6	1127350	1127355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970872
19612	NC_015152	CCT	2	6	1127432	1127437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970872
19613	NC_015152	TGA	2	6	1127631	1127636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970872
19614	NC_015152	TAG	2	6	1127812	1127817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970873
19615	NC_015152	CGGG	2	8	1127829	1127836	0 %	0 %	75 %	25 %	325970873
19616	NC_015152	ACC	2	6	1127871	1127876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970873
19617	NC_015152	GCTG	2	8	1127894	1127901	0 %	25 %	50 %	25 %	325970873
19618	NC_015152	GCA	2	6	1127914	1127919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970873
19619	NC_015152	GCG	2	6	1127958	1127963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970873
19620	NC_015152	ATG	3	9	1127977	1127985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970873
19621	NC_015152	TTGA	2	8	1128441	1128448	25 %	50 %	25 %	0 %	325970874
19622	NC_015152	GCA	2	6	1128465	1128470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970874
19623	NC_015152	CGG	2	6	1128515	1128520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970874
19624	NC_015152	GTC	2	6	1128597	1128602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970874
19625	NC_015152	CATG	2	8	1128650	1128657	25 %	25 %	25 %	25 %	325970874
19626	NC_015152	TGGAA	2	10	1128856	1128865	40 %	20 %	40 %	0 %	325970875
19627	NC_015152	CTT	2	6	1128879	1128884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970875
19628	NC_015152	TTCT	2	8	1128893	1128900	0 %	75 %	0 %	25 %	325970875
19629	NC_015152	ATC	2	6	1128947	1128952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970875
19630	NC_015152	TGC	2	6	1128958	1128963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970875
19631	NC_015152	AAG	2	6	1128984	1128989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970875
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19633	NC_015152	CTTC	3	12	1129081	1129092	0 %	50 %	0 %	50 %	325970875
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19637	NC_015152	TCGC	2	8	1129522	1129529	0 %	25 %	25 %	50 %	325970875
19638	NC_015152	AAAGAG	2	12	1129679	1129690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970875
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19643	NC_015152	T	6	6	1130049	1130054	0 %	100 %	0 %	0 %	325970877
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19646	NC_015152	CGC	2	6	1130133	1130138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970877
19647	NC_015152	GCTC	2	8	1130243	1130250	0 %	25 %	25 %	50 %	325970877
19648	NC_015152	CTC	2	6	1130290	1130295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970877
19649	NC_015152	CTG	2	6	1130317	1130322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970877
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19651	NC_015152	TGGT	2	8	1130543	1130550	0 %	50 %	50 %	0 %	325970877
19652	NC_015152	ATAC	2	8	1130562	1130569	50 %	25 %	0 %	25 %	325970877
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19722	NC_015152	TGC	2	6	1134630	1134635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970882
19723	NC_015152	GAC	2	6	1134685	1134690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970882
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19725	NC_015152	ATC	2	6	1134778	1134783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970882
19726	NC_015152	CCA	2	6	1134813	1134818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970882
19727	NC_015152	GAA	2	6	1134848	1134853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970882
19728	NC_015152	TGCT	2	8	1134984	1134991	0 %	50 %	25 %	25 %	325970882
19729	NC_015152	AAG	2	6	1135025	1135030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970882
19730	NC_015152	TTGAAC	2	12	1135038	1135049	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325970882
19731	NC_015152	GAA	2	6	1135154	1135159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970882
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19733	NC_015152	CTG	2	6	1135297	1135302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970883
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19966	NC_015152	AAT	2	6	1148405	1148410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970894
19967	NC_015152	CCCG	2	8	1148416	1148423	0 %	0 %	25 %	75 %	325970894
19968	NC_015152	TGA	2	6	1148443	1148448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970894
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19972	NC_015152	CTA	2	6	1148644	1148649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970894
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19996	NC_015152	GCC	2	6	1150001	1150006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970896
19997	NC_015152	CTTC	2	8	1150046	1150053	0 %	50 %	0 %	50 %	325970896
19998	NC_015152	AT	3	6	1150058	1150063	50 %	50 %	0 %	0 %	325970896
19999	NC_015152	AGC	2	6	1150133	1150138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970896
20000	NC_015152	CAC	2	6	1150207	1150212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970896

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