MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_015152	GT	3	6	1094902	1094907	0 %	50 %	50 %	0 %	325970850
19003	NC_015152	TCCT	2	8	1095077	1095084	0 %	50 %	0 %	50 %	325970851
19004	NC_015152	TGGA	2	8	1095190	1095197	25 %	25 %	50 %	0 %	325970851
19005	NC_015152	TGC	2	6	1095275	1095280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970851
19006	NC_015152	TTCC	2	8	1095681	1095688	0 %	50 %	0 %	50 %	325970851
19007	NC_015152	GGA	2	6	1095809	1095814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970851
19008	NC_015152	GAA	2	6	1095863	1095868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970851
19009	NC_015152	TAG	2	6	1095878	1095883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970851
19010	NC_015152	AGA	2	6	1096056	1096061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970852
19011	NC_015152	ATTG	2	8	1096064	1096071	25 %	50 %	25 %	0 %	325970852
19012	NC_015152	ACC	2	6	1096241	1096246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970852
19013	NC_015152	TCC	2	6	1096393	1096398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970852
19014	NC_015152	GCA	2	6	1096682	1096687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970852
19015	NC_015152	GAG	2	6	1096703	1096708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970852
19016	NC_015152	ACA	2	6	1096743	1096748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970852
19017	NC_015152	GGT	2	6	1096750	1096755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970852
19018	NC_015152	CCAT	2	8	1096781	1096788	25 %	25 %	0 %	50 %	325970852
19019	NC_015152	CGT	2	6	1096793	1096798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970852
19020	NC_015152	ATGT	2	8	1096805	1096812	25 %	50 %	25 %	0 %	325970852
19021	NC_015152	GAG	2	6	1096841	1096846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970852
19022	NC_015152	TGA	2	6	1096861	1096866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970852
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19024	NC_015152	CTG	2	6	1096902	1096907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970852
19025	NC_015152	TC	3	6	1096914	1096919	0 %	50 %	0 %	50 %	325970852
19026	NC_015152	ACC	2	6	1096934	1096939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970852
19027	NC_015152	CTAC	2	8	1096954	1096961	25 %	25 %	0 %	50 %	325970852
19028	NC_015152	CTT	2	6	1097255	1097260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970853
19029	NC_015152	CTT	2	6	1097283	1097288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970853
19030	NC_015152	CAG	2	6	1097294	1097299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970853
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19032	NC_015152	ATC	2	6	1097321	1097326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970853
19033	NC_015152	AGC	2	6	1097362	1097367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970853
19034	NC_015152	TGA	2	6	1097374	1097379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970853
19035	NC_015152	GAA	2	6	1097387	1097392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970853
19036	NC_015152	TGTA	2	8	1097502	1097509	25 %	50 %	25 %	0 %	325970853
19037	NC_015152	GAC	2	6	1097519	1097524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970853
19038	NC_015152	TTCA	2	8	1097567	1097574	25 %	50 %	0 %	25 %	325970853
19039	NC_015152	TGG	2	6	1097681	1097686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970853
19040	NC_015152	CAC	2	6	1097698	1097703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970853
19041	NC_015152	TCAC	2	8	1097801	1097808	25 %	25 %	0 %	50 %	325970853
19042	NC_015152	TGA	2	6	1097868	1097873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970853
19043	NC_015152	CTT	2	6	1097944	1097949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970853
19044	NC_015152	TCT	2	6	1098000	1098005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970853
19045	NC_015152	TTGCA	2	10	1098009	1098018	20 %	40 %	20 %	20 %	325970853
19046	NC_015152	TTCC	2	8	1098083	1098090	0 %	50 %	0 %	50 %	325970853
19047	NC_015152	CGA	2	6	1098133	1098138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970853
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19050	NC_015152	CATC	2	8	1098272	1098279	25 %	25 %	0 %	50 %	325970853
19051	NC_015152	GGC	2	6	1098348	1098353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970853
19052	NC_015152	TTG	2	6	1098408	1098413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970853
19053	NC_015152	CAG	2	6	1098415	1098420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970853
19054	NC_015152	ATG	2	6	1098528	1098533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970853
19055	NC_015152	TGT	2	6	1098541	1098546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970853
19056	NC_015152	AGG	2	6	1098591	1098596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970853
19057	NC_015152	GAAA	2	8	1098597	1098604	75 %	0 %	25 %	0 %	325970853
19058	NC_015152	TGC	2	6	1098609	1098614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970853
19059	NC_015152	CTG	2	6	1098627	1098632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970853
19060	NC_015152	CCT	2	6	1098768	1098773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970853
19061	NC_015152	AAG	2	6	1098827	1098832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970853
19062	NC_015152	GCC	2	6	1098923	1098928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970853
19063	NC_015152	TAT	2	6	1098929	1098934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970853
19064	NC_015152	TAC	2	6	1099012	1099017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970853
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19066	NC_015152	GGT	2	6	1099056	1099061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970853
19067	NC_015152	ACCTAT	2	12	1099094	1099105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970853
19068	NC_015152	TGAAC	2	10	1099138	1099147	40 %	20 %	20 %	20 %	325970853
19069	NC_015152	TC	3	6	1099153	1099158	0 %	50 %	0 %	50 %	325970853
19070	NC_015152	TAC	2	6	1099219	1099224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970853
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19074	NC_015152	CCTT	2	8	1099367	1099374	0 %	50 %	0 %	50 %	325970853
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19082	NC_015152	TGGA	2	8	1099839	1099846	25 %	25 %	50 %	0 %	325970853
19083	NC_015152	CAC	2	6	1100041	1100046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970854
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19088	NC_015152	CGC	2	6	1100360	1100365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970854
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19101	NC_015152	CAT	2	6	1101035	1101040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970854
19102	NC_015152	AG	4	8	1101105	1101112	50 %	0 %	50 %	0 %	325970854
19103	NC_015152	AGGC	2	8	1101116	1101123	25 %	0 %	50 %	25 %	325970854
19104	NC_015152	TGA	2	6	1101134	1101139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970854
19105	NC_015152	AGG	3	9	1101148	1101156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970854
19106	NC_015152	T	6	6	1101165	1101170	0 %	100 %	0 %	0 %	325970854
19107	NC_015152	AGCG	2	8	1101244	1101251	25 %	0 %	50 %	25 %	325970855
19108	NC_015152	TGGT	2	8	1101261	1101268	0 %	50 %	50 %	0 %	325970855
19109	NC_015152	TAG	2	6	1101324	1101329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970855
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19112	NC_015152	GGC	2	6	1101421	1101426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970855
19113	NC_015152	CAT	2	6	1101495	1101500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970855
19114	NC_015152	AT	3	6	1101587	1101592	50 %	50 %	0 %	0 %	325970855
19115	NC_015152	TTGGA	2	10	1101657	1101666	20 %	40 %	40 %	0 %	325970855
19116	NC_015152	TC	3	6	1101699	1101704	0 %	50 %	0 %	50 %	325970855
19117	NC_015152	TTGG	2	8	1101787	1101794	0 %	50 %	50 %	0 %	325970855
19118	NC_015152	GCC	2	6	1101865	1101870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970855
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19121	NC_015152	CTTC	2	8	1101914	1101921	0 %	50 %	0 %	50 %	325970855
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19128	NC_015152	TCCT	2	8	1102175	1102182	0 %	50 %	0 %	50 %	325970855
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19152	NC_015152	TCA	2	6	1103608	1103613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970856
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19205	NC_015152	CATT	2	8	1105505	1105512	25 %	50 %	0 %	25 %	325970857
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19209	NC_015152	TAC	2	6	1105733	1105738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970857
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19212	NC_015152	ATG	2	6	1105822	1105827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970857
19213	NC_015152	ATC	2	6	1105831	1105836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970857
19214	NC_015152	TGG	2	6	1105880	1105885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970857
19215	NC_015152	GCT	2	6	1105947	1105952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970857
19216	NC_015152	GAT	3	9	1105989	1105997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970857
19217	NC_015152	GCTCAT	2	12	1106037	1106048	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325970857
19218	NC_015152	CAT	3	9	1106076	1106084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970857
19219	NC_015152	GAA	2	6	1106091	1106096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970857
19220	NC_015152	CAGC	2	8	1106171	1106178	25 %	0 %	25 %	50 %	325970857
19221	NC_015152	GGA	2	6	1106220	1106225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970857
19222	NC_015152	CTG	2	6	1106244	1106249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970857
19223	NC_015152	GGC	2	6	1106325	1106330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970857
19224	NC_015152	ACA	2	6	1106365	1106370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970857
19225	NC_015152	ATC	2	6	1106433	1106438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970857
19226	NC_015152	GTC	2	6	1106488	1106493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970857
19227	NC_015152	AGT	2	6	1106525	1106530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970857
19228	NC_015152	GGTCA	2	10	1106607	1106616	20 %	20 %	40 %	20 %	325970857
19229	NC_015152	AAC	2	6	1106707	1106712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970857
19230	NC_015152	GA	3	6	1106717	1106722	50 %	0 %	50 %	0 %	325970857
19231	NC_015152	GTT	2	6	1106738	1106743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970857
19232	NC_015152	GAG	3	9	1106794	1106802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970857
19233	NC_015152	GCT	2	6	1106883	1106888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970857
19234	NC_015152	CTGG	2	8	1106955	1106962	0 %	25 %	50 %	25 %	325970857
19235	NC_015152	TTG	2	6	1107018	1107023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970857
19236	NC_015152	CCT	2	6	1107029	1107034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970857
19237	NC_015152	CCA	2	6	1107056	1107061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970857
19238	NC_015152	GA	3	6	1107067	1107072	50 %	0 %	50 %	0 %	325970857
19239	NC_015152	CTC	2	6	1107209	1107214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970858
19240	NC_015152	TAA	2	6	1107256	1107261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970858
19241	NC_015152	TCC	2	6	1107269	1107274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970858
19242	NC_015152	CTT	2	6	1107349	1107354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970858
19243	NC_015152	TA	3	6	1107359	1107364	50 %	50 %	0 %	0 %	325970858
19244	NC_015152	ACC	2	6	1107366	1107371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970858
19245	NC_015152	GGT	2	6	1107386	1107391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970858
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19248	NC_015152	G	6	6	1107490	1107495	0 %	0 %	100 %	0 %	325970858
19249	NC_015152	TTCGA	2	10	1107514	1107523	20 %	40 %	20 %	20 %	325970858
19250	NC_015152	GCA	2	6	1107582	1107587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970858
19251	NC_015152	GTG	2	6	1107588	1107593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970858
19252	NC_015152	TGG	2	6	1107679	1107684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970858
19253	NC_015152	CTG	2	6	1107707	1107712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970858
19254	NC_015152	TCCA	2	8	1107743	1107750	25 %	25 %	0 %	50 %	325970858
19255	NC_015152	TGG	2	6	1107763	1107768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970858
19256	NC_015152	TGC	2	6	1107781	1107786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970858
19257	NC_015152	CTG	2	6	1107787	1107792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970858
19258	NC_015152	CTT	2	6	1107841	1107846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970858
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19261	NC_015152	CAT	2	6	1108007	1108012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970858
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19263	NC_015152	GGT	2	6	1108106	1108111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970858
19264	NC_015152	TGA	2	6	1108161	1108166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970859
19265	NC_015152	CTG	3	9	1108258	1108266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970859
19266	NC_015152	CT	3	6	1108274	1108279	0 %	50 %	0 %	50 %	325970859
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19272	NC_015152	AGCTG	2	10	1108695	1108704	20 %	20 %	40 %	20 %	325970859
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19302	NC_015152	CCCA	2	8	1110111	1110118	25 %	0 %	0 %	75 %	325970860
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19325	NC_015152	CGC	2	6	1111468	1111473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970861
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19332	NC_015152	TC	3	6	1111912	1111917	0 %	50 %	0 %	50 %	325970862
19333	NC_015152	AGA	2	6	1111942	1111947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970862
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19335	NC_015152	GTCA	2	8	1111987	1111994	25 %	25 %	25 %	25 %	325970862
19336	NC_015152	GTA	2	6	1112011	1112016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970862
19337	NC_015152	TAC	2	6	1112063	1112068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970862
19338	NC_015152	ATGC	2	8	1112097	1112104	25 %	25 %	25 %	25 %	325970862
19339	NC_015152	TGG	2	6	1112129	1112134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970862
19340	NC_015152	AAG	2	6	1112141	1112146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970862
19341	NC_015152	TGC	2	6	1112222	1112227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970862
19342	NC_015152	GAT	2	6	1112291	1112296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970862
19343	NC_015152	TGG	2	6	1112323	1112328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970862
19344	NC_015152	ATT	2	6	1112427	1112432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970862
19345	NC_015152	TC	3	6	1112495	1112500	0 %	50 %	0 %	50 %	325970863
19346	NC_015152	TCT	2	6	1112510	1112515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970863
19347	NC_015152	GCA	2	6	1112528	1112533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970863
19348	NC_015152	TAT	2	6	1112558	1112563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970863
19349	NC_015152	AGCA	2	8	1112582	1112589	50 %	0 %	25 %	25 %	325970863
19350	NC_015152	TGCT	2	8	1112613	1112620	0 %	50 %	25 %	25 %	325970863
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19352	NC_015152	TTG	2	6	1112644	1112649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970863
19353	NC_015152	ATG	2	6	1112712	1112717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970863
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