MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_015152	TGC	2	6	831553	831558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970615
14502	NC_015152	TCT	2	6	831686	831691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970615
14503	NC_015152	CAA	2	6	831786	831791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970615
14504	NC_015152	AAG	2	6	831817	831822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970615
14505	NC_015152	CAATCT	2	12	831867	831878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970616
14506	NC_015152	CT	3	6	831882	831887	0 %	50 %	0 %	50 %	325970616
14507	NC_015152	CTTC	2	8	831999	832006	0 %	50 %	0 %	50 %	325970616
14508	NC_015152	GTA	2	6	832031	832036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970616
14509	NC_015152	TGA	2	6	832072	832077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970616
14510	NC_015152	GATT	2	8	832118	832125	25 %	50 %	25 %	0 %	325970616
14511	NC_015152	ACAG	2	8	832137	832144	50 %	0 %	25 %	25 %	325970616
14512	NC_015152	TCC	2	6	832295	832300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970617
14513	NC_015152	CCA	2	6	832362	832367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970617
14514	NC_015152	GT	4	8	832553	832560	0 %	50 %	50 %	0 %	325970617
14515	NC_015152	CAG	2	6	832614	832619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970617
14516	NC_015152	TCT	2	6	832658	832663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970617
14517	NC_015152	TGA	2	6	832746	832751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970617
14518	NC_015152	C	6	6	832788	832793	0 %	0 %	0 %	100 %	325970617
14519	NC_015152	CTG	2	6	832804	832809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970617
14520	NC_015152	ATGG	2	8	832832	832839	25 %	25 %	50 %	0 %	325970617
14521	NC_015152	CCA	2	6	832857	832862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970617
14522	NC_015152	CAC	2	6	832887	832892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970617
14523	NC_015152	AGC	2	6	832919	832924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970617
14524	NC_015152	ATCT	2	8	832990	832997	25 %	50 %	0 %	25 %	325970617
14525	NC_015152	GCCC	2	8	833044	833051	0 %	0 %	25 %	75 %	325970617
14526	NC_015152	AG	3	6	833184	833189	50 %	0 %	50 %	0 %	325970618
14527	NC_015152	TGG	2	6	833217	833222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970618
14528	NC_015152	TTG	2	6	833313	833318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970618
14529	NC_015152	A	6	6	833337	833342	100 %	0 %	0 %	0 %	325970618
14530	NC_015152	CTG	2	6	833348	833353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970618
14531	NC_015152	GAA	2	6	833363	833368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970618
14532	NC_015152	GCC	2	6	833486	833491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970618
14533	NC_015152	GCT	2	6	833506	833511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970618
14534	NC_015152	GGTGTG	2	12	833555	833566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970618
14535	NC_015152	CTT	2	6	833567	833572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970618
14536	NC_015152	CAA	2	6	833725	833730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970618
14537	NC_015152	G	6	6	833910	833915	0 %	0 %	100 %	0 %	325970618
14538	NC_015152	TGG	2	6	833934	833939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970618
14539	NC_015152	TGT	3	9	834058	834066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970618
14540	NC_015152	TTC	2	6	834090	834095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970618
14541	NC_015152	TGC	2	6	834152	834157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970618
14542	NC_015152	AG	3	6	834172	834177	50 %	0 %	50 %	0 %	325970618
14543	NC_015152	GGC	2	6	834196	834201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970618
14544	NC_015152	GGC	2	6	834205	834210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970618
14545	NC_015152	GAA	2	6	834223	834228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970618
14546	NC_015152	CT	4	8	834246	834253	0 %	50 %	0 %	50 %	325970618
14547	NC_015152	G	6	6	834275	834280	0 %	0 %	100 %	0 %	325970618
14548	NC_015152	GGT	3	9	834305	834313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970618
14549	NC_015152	GAT	2	6	834319	834324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970618
14550	NC_015152	GCT	2	6	834382	834387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970618
14551	NC_015152	GTG	2	6	834446	834451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970618
14552	NC_015152	TGG	3	9	834453	834461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970618
14553	NC_015152	GAG	2	6	834476	834481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970618
14554	NC_015152	CGAC	2	8	834493	834500	25 %	0 %	25 %	50 %	325970618
14555	NC_015152	GTG	3	9	834569	834577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970618
14556	NC_015152	TGGAGA	2	12	834594	834605	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325970618
14557	NC_015152	AAG	2	6	834803	834808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970618
14558	NC_015152	TGG	2	6	834963	834968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970618
14559	NC_015152	GGT	2	6	835039	835044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970618
14560	NC_015152	AAG	2	6	835140	835145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970618
14561	NC_015152	TGG	2	6	835155	835160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970618
14562	NC_015152	GTTT	2	8	835201	835208	0 %	75 %	25 %	0 %	325970618
14563	NC_015152	CGA	2	6	835210	835215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970618
14564	NC_015152	AGC	2	6	835244	835249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970618
14565	NC_015152	AGT	2	6	835270	835275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970618
14566	NC_015152	AC	3	6	835617	835622	50 %	0 %	0 %	50 %	325970619
14567	NC_015152	GAA	2	6	835626	835631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970619
14568	NC_015152	GT	3	6	835676	835681	0 %	50 %	50 %	0 %	325970619
14569	NC_015152	CAA	2	6	835845	835850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970619
14570	NC_015152	TCCG	2	8	835877	835884	0 %	25 %	25 %	50 %	325970619
14571	NC_015152	GTG	2	6	836051	836056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970619
14572	NC_015152	AAT	2	6	836065	836070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970619
14573	NC_015152	TCA	2	6	836197	836202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970620
14574	NC_015152	TTCGTC	2	12	836211	836222	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325970620
14575	NC_015152	GTC	2	6	836271	836276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970620
14576	NC_015152	TTC	2	6	836289	836294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970620
14577	NC_015152	TTC	2	6	836301	836306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970620
14578	NC_015152	CTTG	2	8	836352	836359	0 %	50 %	25 %	25 %	325970620
14579	NC_015152	GAA	2	6	836412	836417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970620
14580	NC_015152	ATT	2	6	836481	836486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970620
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14582	NC_015152	ACGG	2	8	836978	836985	25 %	0 %	50 %	25 %	325970621
14583	NC_015152	GA	3	6	837025	837030	50 %	0 %	50 %	0 %	325970621
14584	NC_015152	GA	3	6	837191	837196	50 %	0 %	50 %	0 %	325970621
14585	NC_015152	AGA	2	6	837302	837307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970621
14586	NC_015152	ACA	2	6	837392	837397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970621
14587	NC_015152	AG	3	6	837402	837407	50 %	0 %	50 %	0 %	325970621
14588	NC_015152	TAT	2	6	837481	837486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970621
14589	NC_015152	TGT	2	6	837527	837532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970622
14590	NC_015152	AGC	2	6	837562	837567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970622
14591	NC_015152	TGT	2	6	837675	837680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970622
14592	NC_015152	ATG	2	6	837695	837700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970622
14593	NC_015152	TGA	3	9	837804	837812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970622
14594	NC_015152	AG	3	6	837841	837846	50 %	0 %	50 %	0 %	325970622
14595	NC_015152	TGG	2	6	837888	837893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970622
14596	NC_015152	A	6	6	837915	837920	100 %	0 %	0 %	0 %	325970622
14597	NC_015152	GCA	2	6	837932	837937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970622
14598	NC_015152	ATG	2	6	837938	837943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970622
14599	NC_015152	C	6	6	838021	838026	0 %	0 %	0 %	100 %	325970622
14600	NC_015152	TGA	2	6	838155	838160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970622
14601	NC_015152	GTGAA	2	10	838161	838170	40 %	20 %	40 %	0 %	325970622
14602	NC_015152	TTGC	2	8	838213	838220	0 %	50 %	25 %	25 %	325970622
14603	NC_015152	AG	3	6	838245	838250	50 %	0 %	50 %	0 %	325970622
14604	NC_015152	GA	3	6	838256	838261	50 %	0 %	50 %	0 %	325970622
14605	NC_015152	ATG	3	9	838304	838312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970622
14606	NC_015152	AGA	2	6	838404	838409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970622
14607	NC_015152	GAT	2	6	838419	838424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970622
14608	NC_015152	CAA	2	6	838554	838559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970623
14609	NC_015152	TGC	2	6	838564	838569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970623
14610	NC_015152	CTT	2	6	838593	838598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970623
14611	NC_015152	TGGTA	2	10	838668	838677	20 %	40 %	40 %	0 %	325970623
14612	NC_015152	CTC	2	6	838711	838716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970623
14613	NC_015152	CATG	2	8	838785	838792	25 %	25 %	25 %	25 %	325970623
14614	NC_015152	TTC	2	6	838813	838818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970623
14615	NC_015152	TCC	2	6	838879	838884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970623
14616	NC_015152	GCT	2	6	839020	839025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970623
14617	NC_015152	A	6	6	839031	839036	100 %	0 %	0 %	0 %	325970623
14618	NC_015152	GCT	2	6	839322	839327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970624
14619	NC_015152	GAC	2	6	839377	839382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970624
14620	NC_015152	CGT	2	6	839391	839396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970624
14621	NC_015152	TTC	2	6	839400	839405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970624
14622	NC_015152	CA	3	6	839447	839452	50 %	0 %	0 %	50 %	325970624
14623	NC_015152	ATG	2	6	839474	839479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970624
14624	NC_015152	GGT	2	6	839529	839534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970624
14625	NC_015152	GAA	2	6	839557	839562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970624
14626	NC_015152	TGT	2	6	839568	839573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970624
14627	NC_015152	GAA	2	6	839632	839637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970624
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14630	NC_015152	GTT	2	6	839686	839691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970624
14631	NC_015152	AGA	2	6	839694	839699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970624
14632	NC_015152	AGT	2	6	839721	839726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970624
14633	NC_015152	GGT	2	6	839763	839768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970624
14634	NC_015152	TGC	2	6	839784	839789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970624
14635	NC_015152	TGC	2	6	839856	839861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970624
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14640	NC_015152	CTT	2	6	840228	840233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970624
14641	NC_015152	GTCC	2	8	840242	840249	0 %	25 %	25 %	50 %	325970624
14642	NC_015152	CAA	2	6	840309	840314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970624
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14648	NC_015152	ACC	2	6	841021	841026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970625
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14651	NC_015152	GCA	2	6	841075	841080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970625
14652	NC_015152	TCA	2	6	841142	841147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970625
14653	NC_015152	AATG	2	8	841242	841249	50 %	25 %	25 %	0 %	325970625
14654	NC_015152	TC	3	6	841270	841275	0 %	50 %	0 %	50 %	325970625
14655	NC_015152	CTG	2	6	841291	841296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970625
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14658	NC_015152	GGTTT	2	10	841457	841466	0 %	60 %	40 %	0 %	325970626
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14664	NC_015152	TGG	2	6	842116	842121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970626
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14722	NC_015152	CTG	2	6	845269	845274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970628
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14729	NC_015152	TTC	2	6	845653	845658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970629
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14736	NC_015152	CAAT	2	8	846017	846024	50 %	25 %	0 %	25 %	325970629
14737	NC_015152	TACG	2	8	846097	846104	25 %	25 %	25 %	25 %	325970629
14738	NC_015152	TGAT	2	8	846140	846147	25 %	50 %	25 %	0 %	325970629
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14740	NC_015152	CAGG	2	8	846219	846226	25 %	0 %	50 %	25 %	325970629
14741	NC_015152	TCT	2	6	846254	846259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970629
14742	NC_015152	ATTA	2	8	846333	846340	50 %	50 %	0 %	0 %	325970630
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14844	NC_015152	TGAC	2	8	852123	852130	25 %	25 %	25 %	25 %	325970634
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14856	NC_015152	TC	3	6	852968	852973	0 %	50 %	0 %	50 %	325970635
14857	NC_015152	ATTC	2	8	852989	852996	25 %	50 %	0 %	25 %	325970635
14858	NC_015152	ACA	2	6	853000	853005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970635
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14860	NC_015152	TAT	2	6	853250	853255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970635
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14864	NC_015152	GGT	2	6	853516	853521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970635
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14982	NC_015152	TGC	2	6	861227	861232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970641
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