MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015152	ATG	2	6	652964	652969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970447
11502	NC_015152	TCT	2	6	652986	652991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970447
11503	NC_015152	TCA	2	6	653025	653030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970447
11504	NC_015152	TGG	2	6	653034	653039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970447
11505	NC_015152	ATC	2	6	653288	653293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970447
11506	NC_015152	CAA	2	6	653308	653313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970447
11507	NC_015152	GCGG	2	8	653335	653342	0 %	0 %	75 %	25 %	325970447
11508	NC_015152	ATCAAC	2	12	653378	653389	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	325970447
11509	NC_015152	TCCT	2	8	653420	653427	0 %	50 %	0 %	50 %	325970447
11510	NC_015152	ACCG	2	8	653456	653463	25 %	0 %	25 %	50 %	325970447
11511	NC_015152	CGG	2	6	653527	653532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970447
11512	NC_015152	TGG	2	6	653556	653561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970447
11513	NC_015152	CTT	2	6	653566	653571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970447
11514	NC_015152	TCG	2	6	653580	653585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970447
11515	NC_015152	CTT	2	6	653635	653640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970447
11516	NC_015152	CGAC	2	8	653666	653673	25 %	0 %	25 %	50 %	325970447
11517	NC_015152	A	6	6	653688	653693	100 %	0 %	0 %	0 %	325970447
11518	NC_015152	GATCAA	2	12	653709	653720	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325970447
11519	NC_015152	ACA	2	6	653726	653731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970448
11520	NC_015152	GCA	2	6	653796	653801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970448
11521	NC_015152	TGG	2	6	653846	653851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970448
11522	NC_015152	ACC	2	6	653932	653937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970448
11523	NC_015152	CTA	2	6	653976	653981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970448
11524	NC_015152	TCG	2	6	654065	654070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970448
11525	NC_015152	CGG	2	6	654081	654086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970448
11526	NC_015152	TGC	3	9	654102	654110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970448
11527	NC_015152	TCC	2	6	654199	654204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970448
11528	NC_015152	CCCA	2	8	654261	654268	25 %	0 %	0 %	75 %	325970448
11529	NC_015152	TC	3	6	654289	654294	0 %	50 %	0 %	50 %	325970448
11530	NC_015152	CTC	2	6	654340	654345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970448
11531	NC_015152	TTC	2	6	654460	654465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970448
11532	NC_015152	GGA	2	6	654568	654573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970448
11533	NC_015152	GTG	2	6	654630	654635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970448
11534	NC_015152	CTT	2	6	654642	654647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970448
11535	NC_015152	TGA	2	6	654728	654733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970448
11536	NC_015152	TCG	2	6	654734	654739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970448
11537	NC_015152	GGATA	2	10	654786	654795	40 %	20 %	40 %	0 %	325970448
11538	NC_015152	AAG	2	6	654820	654825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970448
11539	NC_015152	AGG	2	6	654831	654836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970448
11540	NC_015152	TCC	2	6	654853	654858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970449
11541	NC_015152	CGG	2	6	654887	654892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970449
11542	NC_015152	GAT	2	6	654906	654911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970449
11543	NC_015152	ACT	2	6	654975	654980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970449
11544	NC_015152	GAA	2	6	655076	655081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970449
11545	NC_015152	GTC	2	6	655122	655127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970449
11546	NC_015152	GAG	2	6	655281	655286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970449
11547	NC_015152	TCC	2	6	655362	655367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970449
11548	NC_015152	AGC	2	6	655381	655386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970449
11549	NC_015152	TTGCTT	2	12	655428	655439	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325970449
11550	NC_015152	GCA	2	6	655449	655454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970449
11551	NC_015152	TTA	2	6	655492	655497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970449
11552	NC_015152	TCA	2	6	655648	655653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970449
11553	NC_015152	GGT	2	6	655718	655723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970450
11554	NC_015152	TGA	2	6	655756	655761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970450
11555	NC_015152	AATGG	2	10	655880	655889	40 %	20 %	40 %	0 %	325970450
11556	NC_015152	AGC	2	6	656010	656015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970450
11557	NC_015152	GGC	2	6	656090	656095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970450
11558	NC_015152	CAA	2	6	656099	656104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970450
11559	NC_015152	GAT	2	6	656143	656148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970450
11560	NC_015152	ATG	2	6	656150	656155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970450
11561	NC_015152	GGCT	2	8	656172	656179	0 %	25 %	50 %	25 %	325970450
11562	NC_015152	TGG	2	6	656184	656189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970450
11563	NC_015152	CAT	2	6	656206	656211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970450
11564	NC_015152	GGGAA	2	10	656332	656341	40 %	0 %	60 %	0 %	325970450
11565	NC_015152	GCA	2	6	657573	657578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970451
11566	NC_015152	TCA	2	6	657595	657600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970451
11567	NC_015152	CGG	2	6	657641	657646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970451
11568	NC_015152	GCT	2	6	657706	657711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970451
11569	NC_015152	TGC	2	6	657735	657740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970451
11570	NC_015152	GAT	2	6	657761	657766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970451
11571	NC_015152	GAT	2	6	657785	657790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970451
11572	NC_015152	CGC	2	6	657881	657886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970451
11573	NC_015152	CTT	2	6	658088	658093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970451
11574	NC_015152	CTTC	2	8	658147	658154	0 %	50 %	0 %	50 %	325970451
11575	NC_015152	CG	3	6	658174	658179	0 %	0 %	50 %	50 %	325970451
11576	NC_015152	CTG	2	6	658299	658304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970451
11577	NC_015152	ATC	2	6	658431	658436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970451
11578	NC_015152	TCA	2	6	658443	658448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970451
11579	NC_015152	CTTGC	2	10	658470	658479	0 %	40 %	20 %	40 %	325970451
11580	NC_015152	GCA	2	6	658513	658518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970451
11581	NC_015152	CGG	2	6	658540	658545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970451
11582	NC_015152	GAAA	2	8	658577	658584	75 %	0 %	25 %	0 %	325970451
11583	NC_015152	CCG	2	6	658605	658610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970451
11584	NC_015152	TCA	2	6	659356	659361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970452
11585	NC_015152	A	6	6	659361	659366	100 %	0 %	0 %	0 %	325970452
11586	NC_015152	CTG	2	6	659481	659486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970452
11587	NC_015152	A	6	6	659504	659509	100 %	0 %	0 %	0 %	325970452
11588	NC_015152	CAT	2	6	659510	659515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970452
11589	NC_015152	ACA	2	6	659545	659550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970452
11590	NC_015152	CT	3	6	659566	659571	0 %	50 %	0 %	50 %	325970452
11591	NC_015152	CTT	2	6	659573	659578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970452
11592	NC_015152	CAG	2	6	659631	659636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970452
11593	NC_015152	TGG	2	6	659671	659676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970452
11594	NC_015152	GATATC	2	12	659682	659693	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325970452
11595	NC_015152	TCT	2	6	659724	659729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970452
11596	NC_015152	CGGT	2	8	659750	659757	0 %	25 %	50 %	25 %	325970452
11597	NC_015152	CAG	2	6	659832	659837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970452
11598	NC_015152	GTG	2	6	659973	659978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970452
11599	NC_015152	TCC	2	6	660042	660047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970452
11600	NC_015152	AAG	2	6	660048	660053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970452
11601	NC_015152	TTAT	2	8	660139	660146	25 %	75 %	0 %	0 %	325970452
11602	NC_015152	AGCAG	2	10	660149	660158	40 %	0 %	40 %	20 %	325970452
11603	NC_015152	AAG	2	6	660168	660173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970452
11604	NC_015152	TAT	2	6	660201	660206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970452
11605	NC_015152	TTG	2	6	660208	660213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970452
11606	NC_015152	ACC	2	6	660255	660260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970452
11607	NC_015152	TTGA	2	8	660267	660274	25 %	50 %	25 %	0 %	325970452
11608	NC_015152	TTG	2	6	660294	660299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970452
11609	NC_015152	ATGT	2	8	660378	660385	25 %	50 %	25 %	0 %	325970452
11610	NC_015152	CTT	2	6	660417	660422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970452
11611	NC_015152	GAAG	2	8	660443	660450	50 %	0 %	50 %	0 %	325970452
11612	NC_015152	CCCT	2	8	660496	660503	0 %	25 %	0 %	75 %	325970452
11613	NC_015152	AGT	3	9	660515	660523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970452
11614	NC_015152	TTC	2	6	660621	660626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970453
11615	NC_015152	TC	3	6	660625	660630	0 %	50 %	0 %	50 %	325970453
11616	NC_015152	ACT	2	6	660631	660636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970453
11617	NC_015152	CA	3	6	660647	660652	50 %	0 %	0 %	50 %	325970453
11618	NC_015152	CTA	2	6	660697	660702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970453
11619	NC_015152	CTG	2	6	660734	660739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970453
11620	NC_015152	CGT	2	6	660757	660762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970453
11621	NC_015152	AGC	2	6	660835	660840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970453
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11976	NC_015152	A	6	6	682816	682821	100 %	0 %	0 %	0 %	325970475
11977	NC_015152	GGCCAA	2	12	682831	682842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970475
11978	NC_015152	AT	3	6	682880	682885	50 %	50 %	0 %	0 %	325970475
11979	NC_015152	GT	4	8	682902	682909	0 %	50 %	50 %	0 %	325970476
11980	NC_015152	GAC	2	6	682963	682968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970476
11981	NC_015152	GTTGC	2	10	683002	683011	0 %	40 %	40 %	20 %	325970476
11982	NC_015152	C	6	6	683041	683046	0 %	0 %	0 %	100 %	325970476
11983	NC_015152	TGC	2	6	683185	683190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970476
11984	NC_015152	GAT	2	6	683194	683199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970476
11985	NC_015152	GAT	2	6	683239	683244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970476
11986	NC_015152	ATC	2	6	683306	683311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970476
11987	NC_015152	AGG	2	6	683312	683317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970476
11988	NC_015152	GATGG	2	10	683333	683342	20 %	20 %	60 %	0 %	325970476
11989	NC_015152	TGA	3	9	683364	683372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970476
11990	NC_015152	GAT	2	6	683422	683427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970476
11991	NC_015152	CTA	2	6	683451	683456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970476
11992	NC_015152	TGCA	2	8	683476	683483	25 %	25 %	25 %	25 %	325970476
11993	NC_015152	TTCA	2	8	683488	683495	25 %	50 %	0 %	25 %	325970476
11994	NC_015152	TCC	2	6	683501	683506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970477
11995	NC_015152	GTAG	2	8	683613	683620	25 %	25 %	50 %	0 %	325970477
11996	NC_015152	GCCC	2	8	683648	683655	0 %	0 %	25 %	75 %	325970477
11997	NC_015152	CTG	2	6	683699	683704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970477
11998	NC_015152	GCGAGG	2	12	683965	683976	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	325970477
11999	NC_015152	GCT	2	6	683986	683991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970477
12000	NC_015152	GGCT	2	8	684083	684090	0 %	25 %	50 %	25 %	325970477

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