MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015152	CCA	2	6	563916	563921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970362
10002	NC_015152	CTT	2	6	563923	563928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970362
10003	NC_015152	TCTTCA	2	12	563949	563960	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	325970362
10004	NC_015152	AGG	2	6	564043	564048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970362
10005	NC_015152	GAG	2	6	564166	564171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970362
10006	NC_015152	AGG	2	6	564207	564212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970362
10007	NC_015152	TTC	2	6	564239	564244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970362
10008	NC_015152	CAT	2	6	564268	564273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970362
10009	NC_015152	CAA	2	6	564316	564321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970363
10010	NC_015152	CTG	2	6	564376	564381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970363
10011	NC_015152	AACC	2	8	564491	564498	50 %	0 %	0 %	50 %	325970363
10012	NC_015152	TTC	2	6	564536	564541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970363
10013	NC_015152	CCT	2	6	564579	564584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970363
10014	NC_015152	CAC	2	6	564616	564621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970363
10015	NC_015152	CAT	3	9	564634	564642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970363
10016	NC_015152	ATG	2	6	564668	564673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970363
10017	NC_015152	GAC	2	6	564739	564744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970363
10018	NC_015152	CTT	2	6	564787	564792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970363
10019	NC_015152	GTAC	2	8	564806	564813	25 %	25 %	25 %	25 %	325970363
10020	NC_015152	CAT	2	6	564826	564831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970363
10021	NC_015152	CAG	2	6	564841	564846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970363
10022	NC_015152	TTC	2	6	564884	564889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970363
10023	NC_015152	ATG	2	6	565016	565021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970363
10024	NC_015152	ACC	2	6	565025	565030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970363
10025	NC_015152	CAC	3	9	565042	565050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970363
10026	NC_015152	CTT	2	6	565129	565134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970363
10027	NC_015152	GAT	2	6	565174	565179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970363
10028	NC_015152	AAG	2	6	565184	565189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970363
10029	NC_015152	GAT	2	6	565288	565293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970363
10030	NC_015152	GCT	2	6	565340	565345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970363
10031	NC_015152	GCA	2	6	565359	565364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970363
10032	NC_015152	CCT	2	6	565425	565430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970363
10033	NC_015152	AGG	2	6	565434	565439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970363
10034	NC_015152	TGA	2	6	565470	565475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970363
10035	NC_015152	AGC	2	6	565604	565609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970363
10036	NC_015152	GAA	2	6	565672	565677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970363
10037	NC_015152	TTTC	2	8	565678	565685	0 %	75 %	0 %	25 %	325970363
10038	NC_015152	ACCA	2	8	565706	565713	50 %	0 %	0 %	50 %	325970363
10039	NC_015152	CGA	2	6	565764	565769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970363
10040	NC_015152	TA	3	6	565806	565811	50 %	50 %	0 %	0 %	325970363
10041	NC_015152	AG	3	6	565829	565834	50 %	0 %	50 %	0 %	325970363
10042	NC_015152	AAG	2	6	565850	565855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970363
10043	NC_015152	TTC	2	6	566109	566114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970364
10044	NC_015152	TGCC	2	8	566130	566137	0 %	25 %	25 %	50 %	325970364
10045	NC_015152	TTC	2	6	566155	566160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970364
10046	NC_015152	CAT	2	6	566183	566188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970364
10047	NC_015152	GAG	2	6	566192	566197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970364
10048	NC_015152	TCA	2	6	566254	566259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970364
10049	NC_015152	GGC	2	6	566286	566291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970364
10050	NC_015152	AAC	2	6	566346	566351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970364
10051	NC_015152	ATG	2	6	566434	566439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970364
10052	NC_015152	CCTT	2	8	566725	566732	0 %	50 %	0 %	50 %	325970364
10053	NC_015152	GTT	2	6	566760	566765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970364
10054	NC_015152	T	8	8	566792	566799	0 %	100 %	0 %	0 %	325970364
10055	NC_015152	AGG	2	6	566813	566818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970364
10056	NC_015152	CTG	2	6	566867	566872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970364
10057	NC_015152	CCA	2	6	566899	566904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970364
10058	NC_015152	AGA	2	6	566906	566911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970364
10059	NC_015152	TCA	2	6	566950	566955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970364
10060	NC_015152	CTG	2	6	567047	567052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970364
10061	NC_015152	T	7	7	567101	567107	0 %	100 %	0 %	0 %	325970364
10062	NC_015152	A	6	6	567348	567353	100 %	0 %	0 %	0 %	325970365
10063	NC_015152	TGG	2	6	567390	567395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970365
10064	NC_015152	CTG	2	6	567614	567619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970365
10065	NC_015152	CAG	2	6	567652	567657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970365
10066	NC_015152	CCTG	2	8	567661	567668	0 %	25 %	25 %	50 %	325970365
10067	NC_015152	GAA	2	6	567677	567682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970365
10068	NC_015152	GAG	2	6	567773	567778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970365
10069	NC_015152	G	6	6	567826	567831	0 %	0 %	100 %	0 %	325970365
10070	NC_015152	CAAA	2	8	567987	567994	75 %	0 %	0 %	25 %	325970365
10071	NC_015152	T	6	6	568007	568012	0 %	100 %	0 %	0 %	325970365
10072	NC_015152	CAT	2	6	568033	568038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970365
10073	NC_015152	TGC	2	6	568065	568070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970365
10074	NC_015152	GTA	2	6	568106	568111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970365
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10076	NC_015152	T	6	6	568205	568210	0 %	100 %	0 %	0 %	325970365
10077	NC_015152	ATC	2	6	568383	568388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970365
10078	NC_015152	AGT	2	6	568549	568554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970366
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10080	NC_015152	ATG	2	6	568592	568597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970366
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10082	NC_015152	TTGC	2	8	568657	568664	0 %	50 %	25 %	25 %	325970366
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10085	NC_015152	TCT	2	6	568901	568906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970366
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10087	NC_015152	ATT	2	6	568951	568956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970366
10088	NC_015152	GAA	2	6	569014	569019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970366
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10090	NC_015152	CCAT	3	12	569147	569158	25 %	25 %	0 %	50 %	325970366
10091	NC_015152	ATGGGA	2	12	569165	569176	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325970366
10092	NC_015152	CAT	2	6	569215	569220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970366
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10099	NC_015152	TTCC	2	8	569726	569733	0 %	50 %	0 %	50 %	325970367
10100	NC_015152	AAG	2	6	569800	569805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970367
10101	NC_015152	GATG	2	8	569820	569827	25 %	25 %	50 %	0 %	325970367
10102	NC_015152	CTG	2	6	569868	569873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970367
10103	NC_015152	CGG	2	6	569904	569909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325970367
10104	NC_015152	GTCT	2	8	569952	569959	0 %	50 %	25 %	25 %	325970367
10105	NC_015152	AGA	2	6	569979	569984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970367
10106	NC_015152	CATGGA	2	12	569987	569998	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325970367
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10108	NC_015152	TGA	2	6	570178	570183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970367
10109	NC_015152	CAC	2	6	570206	570211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970367
10110	NC_015152	GTA	2	6	570249	570254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970367
10111	NC_015152	CTC	2	6	570255	570260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970367
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10113	NC_015152	CTT	2	6	570314	570319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970367
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10117	NC_015152	CCA	2	6	570452	570457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970367
10118	NC_015152	TGC	2	6	570480	570485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970367
10119	NC_015152	G	6	6	570512	570517	0 %	0 %	100 %	0 %	325970367
10120	NC_015152	TGA	2	6	570521	570526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970367
10121	NC_015152	AAC	2	6	570773	570778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325970368
10122	NC_015152	T	6	6	570875	570880	0 %	100 %	0 %	0 %	325970368
10123	NC_015152	CAT	2	6	570887	570892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970368
10124	NC_015152	GCT	2	6	571055	571060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970368
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10128	NC_015152	GTT	2	6	571189	571194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325970368
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10130	NC_015152	GAT	2	6	571211	571216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970368
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10132	NC_015152	CTTG	2	8	571501	571508	0 %	50 %	25 %	25 %	325970368
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10151	NC_015152	CCG	2	6	572460	572465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970369
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10217	NC_015152	AT	3	6	576727	576732	50 %	50 %	0 %	0 %	325970373
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10221	NC_015152	GTG	2	6	577004	577009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970373
10222	NC_015152	GTTGCT	2	12	577015	577026	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	325970373
10223	NC_015152	TG	3	6	577060	577065	0 %	50 %	50 %	0 %	325970373
10224	NC_015152	GTGG	2	8	577134	577141	0 %	25 %	75 %	0 %	325970373
10225	NC_015152	ATT	2	6	577175	577180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325970373
10226	NC_015152	GAT	2	6	577204	577209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970373
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10228	NC_015152	GGCC	2	8	577225	577232	0 %	0 %	50 %	50 %	325970373
10229	NC_015152	TCC	2	6	577244	577249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970373
10230	NC_015152	TGG	2	6	577269	577274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970373
10231	NC_015152	CCA	2	6	577329	577334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970373
10232	NC_015152	CCG	2	6	577341	577346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325970373
10233	NC_015152	CAT	2	6	577384	577389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970373
10234	NC_015152	TCA	2	6	577509	577514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970373
10235	NC_015152	CCT	2	6	577531	577536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325970373
10236	NC_015152	GAAA	2	8	577584	577591	75 %	0 %	25 %	0 %	325970374
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10238	NC_015152	GTC	2	6	577618	577623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970374
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10360	NC_015152	ACC	2	6	584809	584814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325970381
10361	NC_015152	GGT	2	6	584866	584871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970381
10362	NC_015152	CTT	3	9	584934	584942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325970381
10363	NC_015152	A	6	6	585303	585308	100 %	0 %	0 %	0 %	325970382
10364	NC_015152	TGC	2	6	585340	585345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970382
10365	NC_015152	AGA	2	6	585382	585387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970382
10366	NC_015152	ATGCC	2	10	585508	585517	20 %	20 %	20 %	40 %	325970382
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10368	NC_015152	TCA	2	6	585646	585651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970382
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10372	NC_015152	TGC	2	6	586082	586087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970382
10373	NC_015152	ATGA	2	8	586089	586096	50 %	25 %	25 %	0 %	325970382
10374	NC_015152	GTC	2	6	586131	586136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970382
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10380	NC_015152	GA	3	6	586473	586478	50 %	0 %	50 %	0 %	325970383
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10383	NC_015152	GCA	2	6	586684	586689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970383
10384	NC_015152	GTTC	2	8	586716	586723	0 %	50 %	25 %	25 %	325970383
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10388	NC_015152	CT	3	6	586833	586838	0 %	50 %	0 %	50 %	325970384
10389	NC_015152	TCTG	2	8	586927	586934	0 %	50 %	25 %	25 %	325970384
10390	NC_015152	GTG	2	6	586940	586945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970384
10391	NC_015152	GGT	2	6	587031	587036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970384
10392	NC_015152	GGT	2	6	587103	587108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325970384
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10397	NC_015152	TAGA	2	8	587351	587358	50 %	25 %	25 %	0 %	325970384
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10464	NC_015152	TCA	2	6	591188	591193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325970387
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10467	NC_015152	CACC	2	8	591507	591514	25 %	0 %	0 %	75 %	325970387
10468	NC_015152	CTTG	2	8	591534	591541	0 %	50 %	25 %	25 %	325970387
10469	NC_015152	ATA	2	6	591551	591556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325970387
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10475	NC_015152	TGA	2	6	591942	591947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325970387
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10478	NC_015152	CGA	2	6	592107	592112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325970387
10479	NC_015152	CATC	2	8	592145	592152	25 %	25 %	0 %	50 %	325970387
10480	NC_015152	GAA	2	6	592182	592187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325970387
10481	NC_015152	GGA	2	6	592191	592196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325970387
10482	NC_015152	CATA	2	8	592248	592255	50 %	25 %	0 %	25 %	325970387
10483	NC_015152	CTG	2	6	592567	592572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325970388
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