MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56501	NC_015152	CCCT	2	8	3259039	3259046	0 %	25 %	0 %	75 %	325972819
56502	NC_015152	CAG	2	6	3259068	3259073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972819
56503	NC_015152	A	9	9	3259112	3259120	100 %	0 %	0 %	0 %	325972819
56504	NC_015152	AAGAA	2	10	3259193	3259202	80 %	0 %	20 %	0 %	325972819
56505	NC_015152	TTC	2	6	3259207	3259212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972819
56506	NC_015152	CTTC	2	8	3259229	3259236	0 %	50 %	0 %	50 %	325972819
56507	NC_015152	CGTT	2	8	3259240	3259247	0 %	50 %	25 %	25 %	325972819
56508	NC_015152	GAT	2	6	3259253	3259258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972819
56509	NC_015152	AAG	2	6	3259389	3259394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972819
56510	NC_015152	GAG	2	6	3259401	3259406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972819
56511	NC_015152	CGA	2	6	3259454	3259459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972819
56512	NC_015152	AT	3	6	3259469	3259474	50 %	50 %	0 %	0 %	325972819
56513	NC_015152	ACC	2	6	3259518	3259523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972819
56514	NC_015152	GCC	2	6	3259568	3259573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972819
56515	NC_015152	TTCC	2	8	3259577	3259584	0 %	50 %	0 %	50 %	325972819
56516	NC_015152	GAA	2	6	3259697	3259702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972819
56517	NC_015152	GAA	2	6	3259737	3259742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972819
56518	NC_015152	CAC	2	6	3259748	3259753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972819
56519	NC_015152	CGA	2	6	3259760	3259765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972819
56520	NC_015152	AGCCGA	2	12	3259820	3259831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972819
56521	NC_015152	CCT	2	6	3259865	3259870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972819
56522	NC_015152	CAG	2	6	3259876	3259881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972819
56523	NC_015152	CAA	2	6	3259943	3259948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972819
56524	NC_015152	CGA	2	6	3259973	3259978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972819
56525	NC_015152	CAGG	2	8	3260052	3260059	25 %	0 %	50 %	25 %	325972819
56526	NC_015152	ATTGC	2	10	3260077	3260086	20 %	40 %	20 %	20 %	325972819
56527	NC_015152	GAG	2	6	3260130	3260135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972819
56528	NC_015152	ATC	2	6	3260136	3260141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972819
56529	NC_015152	GATG	2	8	3260147	3260154	25 %	25 %	50 %	0 %	325972819
56530	NC_015152	GCA	2	6	3260181	3260186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972819
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56532	NC_015152	CCTT	2	8	3260280	3260287	0 %	50 %	0 %	50 %	325972819
56533	NC_015152	CAAG	2	8	3260303	3260310	50 %	0 %	25 %	25 %	325972819
56534	NC_015152	TC	4	8	3260337	3260344	0 %	50 %	0 %	50 %	325972819
56535	NC_015152	GCC	2	6	3260448	3260453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972819
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56537	NC_015152	GCTGT	2	10	3260514	3260523	0 %	40 %	40 %	20 %	325972819
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56539	NC_015152	TC	3	6	3260634	3260639	0 %	50 %	0 %	50 %	325972819
56540	NC_015152	TGG	2	6	3260741	3260746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972820
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56544	NC_015152	AAG	2	6	3260992	3260997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972820
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56549	NC_015152	GCT	2	6	3261194	3261199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972820
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56552	NC_015152	GT	3	6	3261272	3261277	0 %	50 %	50 %	0 %	325972820
56553	NC_015152	CT	4	8	3261283	3261290	0 %	50 %	0 %	50 %	325972820
56554	NC_015152	AAC	2	6	3261301	3261306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972820
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56967	NC_015152	GAA	2	6	3283922	3283927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972840
56968	NC_015152	GTT	2	6	3283936	3283941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972840
56969	NC_015152	CTT	2	6	3283980	3283985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972840
56970	NC_015152	GGT	2	6	3284007	3284012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972840
56971	NC_015152	GAA	2	6	3284057	3284062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972841
56972	NC_015152	CATCGC	2	12	3284072	3284083	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325972841
56973	NC_015152	TGC	2	6	3284168	3284173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972841
56974	NC_015152	GAT	2	6	3284211	3284216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972841
56975	NC_015152	GAA	2	6	3284225	3284230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972841
56976	NC_015152	TGGTTA	2	12	3284287	3284298	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	325972841
56977	NC_015152	CGG	2	6	3284309	3284314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972841
56978	NC_015152	ATC	2	6	3284379	3284384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972841
56979	NC_015152	ATC	2	6	3284434	3284439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972841
56980	NC_015152	A	7	7	3284453	3284459	100 %	0 %	0 %	0 %	325972841
56981	NC_015152	AACT	2	8	3284461	3284468	50 %	25 %	0 %	25 %	325972841
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56985	NC_015152	GAC	2	6	3284773	3284778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972842
56986	NC_015152	GGTAT	2	10	3284788	3284797	20 %	40 %	40 %	0 %	325972842
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56988	NC_015152	TCCC	2	8	3284883	3284890	0 %	25 %	0 %	75 %	325972842
56989	NC_015152	TCAC	2	8	3284909	3284916	25 %	25 %	0 %	50 %	325972842
56990	NC_015152	CGT	2	6	3284954	3284959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972842
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56993	NC_015152	TGC	2	6	3285077	3285082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972842
56994	NC_015152	CT	3	6	3285113	3285118	0 %	50 %	0 %	50 %	325972842
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56996	NC_015152	AGAT	2	8	3285223	3285230	50 %	25 %	25 %	0 %	325972842
56997	NC_015152	CTC	2	6	3285253	3285258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972842
56998	NC_015152	TGC	2	6	3285295	3285300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972842
56999	NC_015152	GGA	2	6	3285335	3285340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972842
57000	NC_015152	TGA	2	6	3285378	3285383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972842

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