MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_015152	CTG	2	6	3230557	3230562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972794
56002	NC_015152	GTC	2	6	3230650	3230655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972794
56003	NC_015152	AGA	2	6	3230745	3230750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972794
56004	NC_015152	AGA	2	6	3230764	3230769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972794
56005	NC_015152	AGA	2	6	3230793	3230798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972794
56006	NC_015152	TCG	2	6	3230849	3230854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972794
56007	NC_015152	TGC	2	6	3230868	3230873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972794
56008	NC_015152	GAG	2	6	3230888	3230893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972794
56009	NC_015152	CTT	3	9	3230950	3230958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972794
56010	NC_015152	TGGTC	2	10	3230970	3230979	0 %	40 %	40 %	20 %	325972794
56011	NC_015152	CTT	2	6	3231019	3231024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972794
56012	NC_015152	TCG	2	6	3231068	3231073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972794
56013	NC_015152	TGG	2	6	3231090	3231095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972794
56014	NC_015152	CTT	2	6	3231117	3231122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972794
56015	NC_015152	TGC	2	6	3231147	3231152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972794
56016	NC_015152	TTC	2	6	3231169	3231174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972794
56017	NC_015152	CTT	2	6	3231265	3231270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972794
56018	NC_015152	ATC	2	6	3231274	3231279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972794
56019	NC_015152	GAG	2	6	3231287	3231292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972794
56020	NC_015152	CTT	2	6	3231298	3231303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972794
56021	NC_015152	GTC	2	6	3231343	3231348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972794
56022	NC_015152	ATTC	2	8	3231352	3231359	25 %	50 %	0 %	25 %	325972794
56023	NC_015152	TCT	2	6	3231387	3231392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972794
56024	NC_015152	CTT	2	6	3231399	3231404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972794
56025	NC_015152	TG	3	6	3231534	3231539	0 %	50 %	50 %	0 %	325972794
56026	NC_015152	ATG	2	6	3231554	3231559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972794
56027	NC_015152	AGC	2	6	3231566	3231571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972794
56028	NC_015152	CTT	2	6	3231592	3231597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972794
56029	NC_015152	CAA	2	6	3231775	3231780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972795
56030	NC_015152	CCA	2	6	3231833	3231838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972795
56031	NC_015152	GCTC	2	8	3231858	3231865	0 %	25 %	25 %	50 %	325972795
56032	NC_015152	AGC	2	6	3231866	3231871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972795
56033	NC_015152	TTG	2	6	3231872	3231877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972795
56034	NC_015152	TAC	2	6	3231894	3231899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972795
56035	NC_015152	ACG	2	6	3231982	3231987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972795
56036	NC_015152	GCG	2	6	3232160	3232165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972795
56037	NC_015152	CTT	2	6	3232255	3232260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972795
56038	NC_015152	CAT	2	6	3232264	3232269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972795
56039	NC_015152	T	6	6	3232323	3232328	0 %	100 %	0 %	0 %	325972795
56040	NC_015152	TGG	2	6	3232443	3232448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972795
56041	NC_015152	TGC	2	6	3232596	3232601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972795
56042	NC_015152	AGA	2	6	3232622	3232627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972795
56043	NC_015152	GGC	2	6	3232639	3232644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972795
56044	NC_015152	CGA	2	6	3232656	3232661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972795
56045	NC_015152	TTC	2	6	3232680	3232685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972795
56046	NC_015152	TG	3	6	3232771	3232776	0 %	50 %	50 %	0 %	325972795
56047	NC_015152	TAAT	2	8	3233093	3233100	50 %	50 %	0 %	0 %	325972796
56048	NC_015152	CAG	2	6	3233124	3233129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972796
56049	NC_015152	AT	3	6	3233133	3233138	50 %	50 %	0 %	0 %	325972796
56050	NC_015152	TGT	2	6	3233209	3233214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972796
56051	NC_015152	CAA	2	6	3233235	3233240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972796
56052	NC_015152	CAT	2	6	3233292	3233297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972796
56053	NC_015152	GA	5	10	3233299	3233308	50 %	0 %	50 %	0 %	325972796
56054	NC_015152	TGCT	2	8	3233342	3233349	0 %	50 %	25 %	25 %	325972796
56055	NC_015152	TGAC	3	12	3233377	3233388	25 %	25 %	25 %	25 %	325972796
56056	NC_015152	TTC	2	6	3233395	3233400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972796
56057	NC_015152	ACCA	2	8	3233500	3233507	50 %	0 %	0 %	50 %	325972796
56058	NC_015152	AGC	2	6	3233518	3233523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972796
56059	NC_015152	AGC	2	6	3233561	3233566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972796
56060	NC_015152	AAT	2	6	3233573	3233578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972796
56061	NC_015152	TTC	2	6	3233594	3233599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972796
56062	NC_015152	AT	3	6	3233789	3233794	50 %	50 %	0 %	0 %	325972797
56063	NC_015152	GTTGCA	2	12	3233834	3233845	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325972797
56064	NC_015152	AAT	2	6	3233848	3233853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972797
56065	NC_015152	ATC	2	6	3233881	3233886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972797
56066	NC_015152	TCA	2	6	3233888	3233893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972797
56067	NC_015152	AATATT	2	12	3233902	3233913	50 %	50 %	0 %	0 %	325972797
56068	NC_015152	TAT	2	6	3233928	3233933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972797
56069	NC_015152	GTA	2	6	3233951	3233956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972797
56070	NC_015152	TAG	2	6	3233961	3233966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972797
56071	NC_015152	ACCT	2	8	3233968	3233975	25 %	25 %	0 %	50 %	325972797
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56073	NC_015152	A	7	7	3234041	3234047	100 %	0 %	0 %	0 %	325972797
56074	NC_015152	CATA	2	8	3234075	3234082	50 %	25 %	0 %	25 %	325972797
56075	NC_015152	CAT	2	6	3234144	3234149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972797
56076	NC_015152	ATC	2	6	3234157	3234162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972797
56077	NC_015152	AAC	2	6	3234239	3234244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972797
56078	NC_015152	AACT	2	8	3234280	3234287	50 %	25 %	0 %	25 %	325972797
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56080	NC_015152	GAG	2	6	3235763	3235768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972798
56081	NC_015152	A	6	6	3235781	3235786	100 %	0 %	0 %	0 %	325972798
56082	NC_015152	CAGC	2	8	3235810	3235817	25 %	0 %	25 %	50 %	325972798
56083	NC_015152	CAG	2	6	3235846	3235851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972798
56084	NC_015152	GCAAG	2	10	3235906	3235915	40 %	0 %	40 %	20 %	325972798
56085	NC_015152	GAT	2	6	3235972	3235977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972798
56086	NC_015152	AAGC	2	8	3235982	3235989	50 %	0 %	25 %	25 %	325972798
56087	NC_015152	AAG	2	6	3235997	3236002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972798
56088	NC_015152	AG	3	6	3236054	3236059	50 %	0 %	50 %	0 %	325972798
56089	NC_015152	TC	3	6	3236096	3236101	0 %	50 %	0 %	50 %	325972798
56090	NC_015152	CTG	2	6	3236129	3236134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972798
56091	NC_015152	TGAGTT	2	12	3236188	3236199	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	325972798
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56098	NC_015152	GTA	2	6	3236440	3236445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972798
56099	NC_015152	GGA	2	6	3236861	3236866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972799
56100	NC_015152	GAT	2	6	3236867	3236872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972799
56101	NC_015152	CTTC	2	8	3236904	3236911	0 %	50 %	0 %	50 %	325972799
56102	NC_015152	ACA	2	6	3236912	3236917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972799
56103	NC_015152	TCAAT	2	10	3236930	3236939	40 %	40 %	0 %	20 %	325972799
56104	NC_015152	TCA	2	6	3236995	3237000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972799
56105	NC_015152	GAA	2	6	3237010	3237015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972799
56106	NC_015152	CAA	2	6	3237032	3237037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972799
56107	NC_015152	CCA	3	9	3237064	3237072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972799
56108	NC_015152	TCAG	2	8	3237088	3237095	25 %	25 %	25 %	25 %	325972799
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56112	NC_015152	TG	3	6	3237439	3237444	0 %	50 %	50 %	0 %	325972799
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56345	NC_015152	TTG	2	6	3250255	3250260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972812
56346	NC_015152	GGAA	2	8	3250305	3250312	50 %	0 %	50 %	0 %	325972812
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56348	NC_015152	GA	4	8	3250479	3250486	50 %	0 %	50 %	0 %	325972812
56349	NC_015152	GA	3	6	3250488	3250493	50 %	0 %	50 %	0 %	325972812
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56353	NC_015152	GCA	2	6	3250783	3250788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972813
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56463	NC_015152	AAC	2	6	3256513	3256518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972818
56464	NC_015152	GTA	2	6	3256519	3256524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972818
56465	NC_015152	ACC	2	6	3256528	3256533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972818
56466	NC_015152	TGGT	2	8	3256545	3256552	0 %	50 %	50 %	0 %	325972818
56467	NC_015152	AC	3	6	3256580	3256585	50 %	0 %	0 %	50 %	325972818
56468	NC_015152	GGA	2	6	3256612	3256617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972818
56469	NC_015152	AGC	2	6	3256618	3256623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972818
56470	NC_015152	CTG	2	6	3256641	3256646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972818
56471	NC_015152	CGT	2	6	3256667	3256672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972818
56472	NC_015152	TCG	2	6	3256696	3256701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972818
56473	NC_015152	CCAAG	2	10	3256730	3256739	40 %	0 %	20 %	40 %	325972818
56474	NC_015152	CAA	2	6	3256758	3256763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972818
56475	NC_015152	GAG	2	6	3256774	3256779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972818
56476	NC_015152	AGGCAT	2	12	3256841	3256852	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325972818
56477	NC_015152	A	7	7	3256882	3256888	100 %	0 %	0 %	0 %	325972818
56478	NC_015152	GAA	2	6	3256935	3256940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972818
56479	NC_015152	AGG	2	6	3256969	3256974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972818
56480	NC_015152	TCG	2	6	3257041	3257046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972818
56481	NC_015152	TCG	2	6	3257087	3257092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972818
56482	NC_015152	ATC	2	6	3257253	3257258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972818
56483	NC_015152	TGCG	2	8	3257315	3257322	0 %	25 %	50 %	25 %	325972818
56484	NC_015152	GTG	2	6	3257323	3257328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972818
56485	NC_015152	GCT	2	6	3257417	3257422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972818
56486	NC_015152	CGG	2	6	3257426	3257431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972818
56487	NC_015152	CAT	3	9	3257436	3257444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972818
56488	NC_015152	CAAC	2	8	3257501	3257508	50 %	0 %	0 %	50 %	325972818
56489	NC_015152	AAT	2	6	3257627	3257632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972818
56490	NC_015152	TGCAG	2	10	3257684	3257693	20 %	20 %	40 %	20 %	325972818
56491	NC_015152	GCT	2	6	3258224	3258229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972819
56492	NC_015152	GGA	2	6	3258327	3258332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972819
56493	NC_015152	TTC	2	6	3258354	3258359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972819
56494	NC_015152	ATG	2	6	3258663	3258668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972819
56495	NC_015152	TGG	2	6	3258685	3258690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972819
56496	NC_015152	CAA	2	6	3258719	3258724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972819
56497	NC_015152	ATT	3	9	3258798	3258806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972819
56498	NC_015152	AG	3	6	3258950	3258955	50 %	0 %	50 %	0 %	325972819
56499	NC_015152	CAT	2	6	3258973	3258978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972819
56500	NC_015152	CCG	2	6	3259027	3259032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972819

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