MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_015152	AAGG	2	8	3174886	3174893	50 %	0 %	50 %	0 %	325972739
55002	NC_015152	TTC	2	6	3174898	3174903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972739
55003	NC_015152	CTG	2	6	3174940	3174945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972739
55004	NC_015152	TTC	2	6	3175076	3175081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972740
55005	NC_015152	GAA	2	6	3175089	3175094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972740
55006	NC_015152	A	6	6	3175198	3175203	100 %	0 %	0 %	0 %	325972740
55007	NC_015152	TGCCAG	2	12	3175216	3175227	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325972740
55008	NC_015152	CCG	2	6	3175347	3175352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972740
55009	NC_015152	ACA	3	9	3175365	3175373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972740
55010	NC_015152	CCA	2	6	3175422	3175427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972740
55011	NC_015152	GTAC	2	8	3175433	3175440	25 %	25 %	25 %	25 %	325972740
55012	NC_015152	GTG	2	6	3175562	3175567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972740
55013	NC_015152	GCA	2	6	3175577	3175582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972740
55014	NC_015152	GCA	2	6	3175641	3175646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972740
55015	NC_015152	CCA	2	6	3175696	3175701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972740
55016	NC_015152	CGGA	2	8	3175718	3175725	25 %	0 %	50 %	25 %	325972740
55017	NC_015152	TGC	2	6	3175737	3175742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972740
55018	NC_015152	A	6	6	3175751	3175756	100 %	0 %	0 %	0 %	325972740
55019	NC_015152	TGC	2	6	3175807	3175812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972740
55020	NC_015152	GCCGAA	2	12	3175828	3175839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972740
55021	NC_015152	CAG	2	6	3175867	3175872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972740
55022	NC_015152	GTT	3	9	3175927	3175935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972740
55023	NC_015152	CAAG	2	8	3176051	3176058	50 %	0 %	25 %	25 %	325972740
55024	NC_015152	T	6	6	3176138	3176143	0 %	100 %	0 %	0 %	325972740
55025	NC_015152	GAT	2	6	3176206	3176211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972740
55026	NC_015152	GCA	2	6	3176240	3176245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972740
55027	NC_015152	CTG	2	6	3176264	3176269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972740
55028	NC_015152	TGA	2	6	3176304	3176309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972740
55029	NC_015152	TGA	2	6	3176316	3176321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972740
55030	NC_015152	CCAT	2	8	3176433	3176440	25 %	25 %	0 %	50 %	325972741
55031	NC_015152	CAT	2	6	3176442	3176447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972741
55032	NC_015152	CTG	2	6	3176453	3176458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972741
55033	NC_015152	CGCA	2	8	3176525	3176532	25 %	0 %	25 %	50 %	325972741
55034	NC_015152	CTC	2	6	3176559	3176564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972741
55035	NC_015152	TCC	2	6	3176619	3176624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972741
55036	NC_015152	CGG	2	6	3176753	3176758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972741
55037	NC_015152	AGAT	2	8	3176773	3176780	50 %	25 %	25 %	0 %	325972741
55038	NC_015152	GCTG	2	8	3176879	3176886	0 %	25 %	50 %	25 %	325972741
55039	NC_015152	CTT	2	6	3176900	3176905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972741
55040	NC_015152	CA	3	6	3176972	3176977	50 %	0 %	0 %	50 %	325972741
55041	NC_015152	GGCG	2	8	3177032	3177039	0 %	0 %	75 %	25 %	325972741
55042	NC_015152	GAT	2	6	3177110	3177115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972741
55043	NC_015152	CTG	2	6	3177135	3177140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972741
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55045	NC_015152	ATC	2	6	3177217	3177222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972741
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55047	NC_015152	ACA	2	6	3177362	3177367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972742
55048	NC_015152	GCT	2	6	3177462	3177467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972742
55049	NC_015152	GGC	2	6	3177556	3177561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972742
55050	NC_015152	GCCT	2	8	3177598	3177605	0 %	25 %	25 %	50 %	325972742
55051	NC_015152	CAG	2	6	3177612	3177617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972742
55052	NC_015152	ACC	2	6	3177620	3177625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972742
55053	NC_015152	CCA	2	6	3177885	3177890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972742
55054	NC_015152	ATG	2	6	3178136	3178141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972743
55055	NC_015152	GAT	2	6	3178219	3178224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972743
55056	NC_015152	TGA	2	6	3178230	3178235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972743
55057	NC_015152	GGA	2	6	3178246	3178251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972743
55058	NC_015152	TTC	2	6	3178270	3178275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972743
55059	NC_015152	TCC	2	6	3178341	3178346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972743
55060	NC_015152	GAA	2	6	3178417	3178422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972743
55061	NC_015152	CGA	2	6	3178450	3178455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972743
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55063	NC_015152	GCCA	2	8	3178484	3178491	25 %	0 %	25 %	50 %	325972743
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55066	NC_015152	GAA	2	6	3178582	3178587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972743
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55075	NC_015152	TGC	2	6	3179234	3179239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972745
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55082	NC_015152	TCG	2	6	3179607	3179612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972745
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55089	NC_015152	GA	3	6	3179922	3179927	50 %	0 %	50 %	0 %	325972745
55090	NC_015152	GGC	2	6	3179942	3179947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972745
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55100	NC_015152	GCAGA	2	10	3180516	3180525	40 %	0 %	40 %	20 %	325972746
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55102	NC_015152	CAGTG	2	10	3180690	3180699	20 %	20 %	40 %	20 %	325972746
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55104	NC_015152	GAAGA	2	10	3180817	3180826	60 %	0 %	40 %	0 %	325972746
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55110	NC_015152	A	7	7	3181056	3181062	100 %	0 %	0 %	0 %	325972747
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55112	NC_015152	CTTC	2	8	3181168	3181175	0 %	50 %	0 %	50 %	325972747
55113	NC_015152	GAACT	2	10	3181201	3181210	40 %	20 %	20 %	20 %	325972747
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55115	NC_015152	GAT	2	6	3181224	3181229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972747
55116	NC_015152	CAG	2	6	3181233	3181238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972747
55117	NC_015152	AAT	2	6	3181259	3181264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972747
55118	NC_015152	AAC	2	6	3181266	3181271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972747
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55146	NC_015152	GCA	2	6	3182841	3182846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972750
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55221	NC_015152	CACC	2	8	3187776	3187783	25 %	0 %	0 %	75 %	325972752
55222	NC_015152	CA	3	6	3187791	3187796	50 %	0 %	0 %	50 %	325972752
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55227	NC_015152	TTC	2	6	3187973	3187978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972752
55228	NC_015152	TGA	2	6	3188033	3188038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972752
55229	NC_015152	GCT	2	6	3188064	3188069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972752
55230	NC_015152	AAGA	2	8	3188200	3188207	75 %	0 %	25 %	0 %	325972752
55231	NC_015152	GGC	2	6	3188209	3188214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972752
55232	NC_015152	CAA	2	6	3188388	3188393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972752
55233	NC_015152	GT	3	6	3188401	3188406	0 %	50 %	50 %	0 %	325972752
55234	NC_015152	CAA	2	6	3188427	3188432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972752
55235	NC_015152	CCA	2	6	3188498	3188503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972752
55236	NC_015152	CTG	2	6	3188510	3188515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972752
55237	NC_015152	CGA	2	6	3188655	3188660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972752
55238	NC_015152	GCA	2	6	3188669	3188674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972752
55239	NC_015152	ACC	2	6	3188707	3188712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972752
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55241	NC_015152	GTT	2	6	3188767	3188772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972752
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55245	NC_015152	TTG	2	6	3188935	3188940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972753
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55249	NC_015152	CGA	3	9	3189032	3189040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972753
55250	NC_015152	GCA	2	6	3189296	3189301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972753
55251	NC_015152	TTC	2	6	3189350	3189355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972753
55252	NC_015152	CGA	2	6	3189382	3189387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972753
55253	NC_015152	CGG	2	6	3189503	3189508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972753
55254	NC_015152	TCCTT	2	10	3189625	3189634	0 %	60 %	0 %	40 %	325972753
55255	NC_015152	TGA	2	6	3189670	3189675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972753
55256	NC_015152	GCCC	2	8	3189686	3189693	0 %	0 %	25 %	75 %	325972753
55257	NC_015152	AGA	2	6	3189699	3189704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972753
55258	NC_015152	AGA	2	6	3189796	3189801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972753
55259	NC_015152	TG	3	6	3189856	3189861	0 %	50 %	50 %	0 %	325972753
55260	NC_015152	CT	3	6	3189978	3189983	0 %	50 %	0 %	50 %	325972753
55261	NC_015152	GGT	2	6	3189984	3189989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972753
55262	NC_015152	AAGG	2	8	3190044	3190051	50 %	0 %	50 %	0 %	325972753
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55265	NC_015152	CTG	2	6	3190166	3190171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972753
55266	NC_015152	ATC	2	6	3190173	3190178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972753
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55284	NC_015152	TGG	2	6	3191072	3191077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972754
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55287	NC_015152	CAT	2	6	3191160	3191165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972754
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55291	NC_015152	CCA	2	6	3191267	3191272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972754
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55295	NC_015152	GATTG	2	10	3191472	3191481	20 %	40 %	40 %	0 %	325972754
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55299	NC_015152	TGC	2	6	3191785	3191790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972755
55300	NC_015152	ACT	2	6	3191811	3191816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972755
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55304	NC_015152	GCT	2	6	3192071	3192076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972755
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55310	NC_015152	ACC	2	6	3192424	3192429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972755
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55312	NC_015152	ATG	2	6	3192565	3192570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972755
55313	NC_015152	GC	3	6	3192639	3192644	0 %	0 %	50 %	50 %	325972755
55314	NC_015152	CGG	2	6	3192647	3192652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972755
55315	NC_015152	TGA	2	6	3192653	3192658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972755
55316	NC_015152	CTG	2	6	3192669	3192674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972755
55317	NC_015152	AGCA	2	8	3192734	3192741	50 %	0 %	25 %	25 %	325972755
55318	NC_015152	ATCA	2	8	3192742	3192749	50 %	25 %	0 %	25 %	325972755
55319	NC_015152	ACG	2	6	3192755	3192760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972755
55320	NC_015152	CACC	2	8	3192833	3192840	25 %	0 %	0 %	75 %	325972755
55321	NC_015152	CTA	2	6	3192847	3192852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972755
55322	NC_015152	AC	3	6	3192856	3192861	50 %	0 %	0 %	50 %	325972755
55323	NC_015152	GCA	2	6	3192868	3192873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972755
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55326	NC_015152	CT	3	6	3193087	3193092	0 %	50 %	0 %	50 %	325972756
55327	NC_015152	GAG	2	6	3193116	3193121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972756
55328	NC_015152	CAG	2	6	3193248	3193253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972756
55329	NC_015152	GCG	2	6	3193312	3193317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972756
55330	NC_015152	GGCA	2	8	3193360	3193367	25 %	0 %	50 %	25 %	325972757
55331	NC_015152	CCT	2	6	3193414	3193419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972757
55332	NC_015152	CATG	2	8	3193426	3193433	25 %	25 %	25 %	25 %	325972757
55333	NC_015152	AAGC	2	8	3193467	3193474	50 %	0 %	25 %	25 %	325972757
55334	NC_015152	CTT	2	6	3193555	3193560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972757
55335	NC_015152	AAG	2	6	3193596	3193601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972757
55336	NC_015152	AT	3	6	3193759	3193764	50 %	50 %	0 %	0 %	325972757
55337	NC_015152	TAC	2	6	3193799	3193804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972757
55338	NC_015152	AC	3	6	3193829	3193834	50 %	0 %	0 %	50 %	325972757
55339	NC_015152	TGA	2	6	3193867	3193872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972757
55340	NC_015152	AAG	2	6	3193916	3193921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972757
55341	NC_015152	GGC	2	6	3193949	3193954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972758
55342	NC_015152	CCT	2	6	3194189	3194194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972758
55343	NC_015152	GTG	2	6	3194239	3194244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972758
55344	NC_015152	GCT	2	6	3194264	3194269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972758
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55462	NC_015152	TCCC	2	8	3199902	3199909	0 %	25 %	0 %	75 %	325972764
55463	NC_015152	ATG	2	6	3200001	3200006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972764
55464	NC_015152	TATG	2	8	3200017	3200024	25 %	50 %	25 %	0 %	325972764
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55492	NC_015152	CAA	2	6	3201375	3201380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972765
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