MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_015152	ATG	2	6	3114707	3114712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972691
54002	NC_015152	TCA	2	6	3114714	3114719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972691
54003	NC_015152	CTT	2	6	3114721	3114726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972691
54004	NC_015152	TCT	2	6	3114735	3114740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972691
54005	NC_015152	ATC	2	6	3114761	3114766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972691
54006	NC_015152	CGT	2	6	3114793	3114798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972691
54007	NC_015152	ACC	2	6	3114859	3114864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972691
54008	NC_015152	CTG	2	6	3114886	3114891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972691
54009	NC_015152	GTT	2	6	3114928	3114933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972691
54010	NC_015152	ATC	2	6	3114950	3114955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972691
54011	NC_015152	GA	4	8	3115038	3115045	50 %	0 %	50 %	0 %	325972691
54012	NC_015152	GGC	2	6	3115135	3115140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972691
54013	NC_015152	AG	3	6	3115210	3115215	50 %	0 %	50 %	0 %	325972691
54014	NC_015152	AAG	2	6	3115271	3115276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972691
54015	NC_015152	CCG	2	6	3115283	3115288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972691
54016	NC_015152	CAAA	2	8	3115295	3115302	75 %	0 %	0 %	25 %	325972691
54017	NC_015152	TTG	2	6	3115322	3115327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972691
54018	NC_015152	GCA	2	6	3115331	3115336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972691
54019	NC_015152	ATG	2	6	3115415	3115420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972691
54020	NC_015152	TGC	2	6	3115459	3115464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972691
54021	NC_015152	GCG	2	6	3115496	3115501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972691
54022	NC_015152	GCA	2	6	3115740	3115745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972692
54023	NC_015152	CTG	2	6	3115746	3115751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972692
54024	NC_015152	GAAG	2	8	3115794	3115801	50 %	0 %	50 %	0 %	325972692
54025	NC_015152	CTG	2	6	3115880	3115885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972692
54026	NC_015152	GCT	2	6	3115926	3115931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972692
54027	NC_015152	AGA	2	6	3115945	3115950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972692
54028	NC_015152	GAAG	2	8	3115966	3115973	50 %	0 %	50 %	0 %	325972692
54029	NC_015152	AAG	2	6	3116015	3116020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972692
54030	NC_015152	TGC	2	6	3116033	3116038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972692
54031	NC_015152	TA	3	6	3116045	3116050	50 %	50 %	0 %	0 %	325972692
54032	NC_015152	GCA	2	6	3116073	3116078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972692
54033	NC_015152	CGCC	2	8	3116100	3116107	0 %	0 %	25 %	75 %	325972692
54034	NC_015152	GCA	2	6	3116148	3116153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972692
54035	NC_015152	CGT	2	6	3116161	3116166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972692
54036	NC_015152	TCA	2	6	3116169	3116174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972692
54037	NC_015152	AAG	2	6	3116275	3116280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972692
54038	NC_015152	TGA	2	6	3116292	3116297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972692
54039	NC_015152	AAGC	2	8	3116339	3116346	50 %	0 %	25 %	25 %	325972692
54040	NC_015152	AAC	2	6	3116361	3116366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972692
54041	NC_015152	AAC	2	6	3116508	3116513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972692
54042	NC_015152	TCC	2	6	3116520	3116525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972692
54043	NC_015152	AGA	2	6	3116578	3116583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972692
54044	NC_015152	GGAT	2	8	3116588	3116595	25 %	25 %	50 %	0 %	325972692
54045	NC_015152	TGC	2	6	3116597	3116602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972692
54046	NC_015152	A	6	6	3116605	3116610	100 %	0 %	0 %	0 %	325972692
54047	NC_015152	AGCA	2	8	3116628	3116635	50 %	0 %	25 %	25 %	325972692
54048	NC_015152	GAG	2	6	3116639	3116644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972692
54049	NC_015152	ACC	2	6	3116703	3116708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972692
54050	NC_015152	A	6	6	3116730	3116735	100 %	0 %	0 %	0 %	325972692
54051	NC_015152	CTG	2	6	3116758	3116763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972692
54052	NC_015152	GGT	2	6	3116840	3116845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972692
54053	NC_015152	TGC	2	6	3116881	3116886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972693
54054	NC_015152	TGA	2	6	3116936	3116941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972693
54055	NC_015152	ATG	2	6	3117022	3117027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972693
54056	NC_015152	TCA	2	6	3117124	3117129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972693
54057	NC_015152	ACC	2	6	3117190	3117195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972693
54058	NC_015152	CGG	2	6	3117196	3117201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972693
54059	NC_015152	CCAT	2	8	3117277	3117284	25 %	25 %	0 %	50 %	325972693
54060	NC_015152	GATGCC	2	12	3117357	3117368	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325972693
54061	NC_015152	GAAC	2	8	3123224	3123231	50 %	0 %	25 %	25 %	325972694
54062	NC_015152	ATC	2	6	3123326	3123331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972694
54063	NC_015152	TTC	2	6	3123334	3123339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972694
54064	NC_015152	A	6	6	3123361	3123366	100 %	0 %	0 %	0 %	325972694
54065	NC_015152	CAA	2	6	3123462	3123467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972694
54066	NC_015152	TGT	2	6	3123479	3123484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972694
54067	NC_015152	TCAA	2	8	3123590	3123597	50 %	25 %	0 %	25 %	325972694
54068	NC_015152	CTCA	2	8	3123694	3123701	25 %	25 %	0 %	50 %	325972694
54069	NC_015152	AGGT	2	8	3123728	3123735	25 %	25 %	50 %	0 %	325972694
54070	NC_015152	CACCC	2	10	3123738	3123747	20 %	0 %	0 %	80 %	325972694
54071	NC_015152	TGCC	2	8	3123780	3123787	0 %	25 %	25 %	50 %	325972694
54072	NC_015152	GTA	2	6	3123839	3123844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972694
54073	NC_015152	ATC	2	6	3123850	3123855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972694
54074	NC_015152	TCG	2	6	3123943	3123948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972695
54075	NC_015152	AGGA	2	8	3123987	3123994	50 %	0 %	50 %	0 %	325972695
54076	NC_015152	GCC	2	6	3124011	3124016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972695
54077	NC_015152	CAATG	2	10	3124085	3124094	40 %	20 %	20 %	20 %	325972695
54078	NC_015152	CAT	2	6	3124181	3124186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972695
54079	NC_015152	AGTC	2	8	3124330	3124337	25 %	25 %	25 %	25 %	325972695
54080	NC_015152	GAA	2	6	3124419	3124424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972695
54081	NC_015152	AAATG	2	10	3124458	3124467	60 %	20 %	20 %	0 %	325972695
54082	NC_015152	AAC	2	6	3124548	3124553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972696
54083	NC_015152	GCC	2	6	3124630	3124635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972696
54084	NC_015152	GAC	2	6	3124665	3124670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972696
54085	NC_015152	CAT	2	6	3124696	3124701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972696
54086	NC_015152	CAC	2	6	3124792	3124797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972696
54087	NC_015152	ATC	2	6	3124892	3124897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972696
54088	NC_015152	CGAAG	2	10	3124936	3124945	40 %	0 %	40 %	20 %	325972696
54089	NC_015152	TCA	2	6	3124971	3124976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972696
54090	NC_015152	TTG	2	6	3125007	3125012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972696
54091	NC_015152	CCA	2	6	3125166	3125171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972696
54092	NC_015152	C	7	7	3125228	3125234	0 %	0 %	0 %	100 %	325972696
54093	NC_015152	GGA	2	6	3125243	3125248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972696
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54096	NC_015152	GTG	2	6	3125319	3125324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972696
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54098	NC_015152	CTT	2	6	3125489	3125494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972696
54099	NC_015152	GGA	2	6	3125510	3125515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972696
54100	NC_015152	CAG	2	6	3125521	3125526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972696
54101	NC_015152	CTC	2	6	3125537	3125542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972696
54102	NC_015152	AGA	2	6	3125553	3125558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972696
54103	NC_015152	CAGG	2	8	3125588	3125595	25 %	0 %	50 %	25 %	325972696
54104	NC_015152	CCA	2	6	3125617	3125622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972696
54105	NC_015152	TGG	2	6	3125623	3125628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972696
54106	NC_015152	GAC	2	6	3125697	3125702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972696
54107	NC_015152	GCAC	2	8	3125715	3125722	25 %	0 %	25 %	50 %	325972696
54108	NC_015152	TTTC	2	8	3125745	3125752	0 %	75 %	0 %	25 %	325972696
54109	NC_015152	CCG	2	6	3125800	3125805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972696
54110	NC_015152	CAGAG	2	10	3125816	3125825	40 %	0 %	40 %	20 %	325972696
54111	NC_015152	CTG	2	6	3125867	3125872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972696
54112	NC_015152	TTC	2	6	3125900	3125905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972696
54113	NC_015152	TTG	3	9	3126011	3126019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972696
54114	NC_015152	GCT	2	6	3126229	3126234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972697
54115	NC_015152	CCTT	2	8	3126294	3126301	0 %	50 %	0 %	50 %	325972697
54116	NC_015152	GAA	2	6	3126335	3126340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972697
54117	NC_015152	CGG	2	6	3126386	3126391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972697
54118	NC_015152	GAA	2	6	3126425	3126430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972697
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54121	NC_015152	GCA	2	6	3126681	3126686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972697
54122	NC_015152	TGG	2	6	3126724	3126729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972697
54123	NC_015152	GAAT	2	8	3126758	3126765	50 %	25 %	25 %	0 %	325972697
54124	NC_015152	TCA	2	6	3126804	3126809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972697
54125	NC_015152	CAT	2	6	3126841	3126846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972697
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54134	NC_015152	TGC	2	6	3127293	3127298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972697
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54152	NC_015152	CCTTG	2	10	3128444	3128453	0 %	40 %	20 %	40 %	325972698
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54225	NC_015152	GCCC	2	8	3131952	3131959	0 %	0 %	25 %	75 %	325972702
54226	NC_015152	TTG	2	6	3132023	3132028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972702
54227	NC_015152	CGA	2	6	3132033	3132038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972702
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54230	NC_015152	AC	3	6	3132131	3132136	50 %	0 %	0 %	50 %	325972702
54231	NC_015152	TGT	2	6	3132189	3132194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972702
54232	NC_015152	CTC	2	6	3132217	3132222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972702
54233	NC_015152	TCAA	2	8	3132332	3132339	50 %	25 %	0 %	25 %	325972702
54234	NC_015152	AAAC	2	8	3132366	3132373	75 %	0 %	0 %	25 %	325972702
54235	NC_015152	CAT	2	6	3132399	3132404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972702
54236	NC_015152	GGA	2	6	3132430	3132435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972702
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54242	NC_015152	TCTGC	2	10	3132723	3132732	0 %	40 %	20 %	40 %	325972702
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54244	NC_015152	TCA	2	6	3132818	3132823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972702
54245	NC_015152	CTTT	2	8	3132831	3132838	0 %	75 %	0 %	25 %	325972702
54246	NC_015152	CGA	2	6	3132852	3132857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972702
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54248	NC_015152	AGGG	2	8	3132947	3132954	25 %	0 %	75 %	0 %	325972702
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54465	NC_015152	GTT	2	6	3144028	3144033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972714
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54469	NC_015152	CTC	2	6	3144152	3144157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972714
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54492	NC_015152	GCT	2	6	3145826	3145831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972716
54493	NC_015152	CT	3	6	3145875	3145880	0 %	50 %	0 %	50 %	325972716
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