MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 57504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_015152	TGG	2	6	3059200	3059205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972629
53002	NC_015152	TA	3	6	3059240	3059245	50 %	50 %	0 %	0 %	325972630
53003	NC_015152	GGT	2	6	3059246	3059251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972630
53004	NC_015152	GAA	2	6	3059323	3059328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972630
53005	NC_015152	GATC	2	8	3059480	3059487	25 %	25 %	25 %	25 %	325972630
53006	NC_015152	GCA	2	6	3059488	3059493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972630
53007	NC_015152	TCT	2	6	3059527	3059532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972630
53008	NC_015152	AAG	2	6	3059589	3059594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972630
53009	NC_015152	CTT	2	6	3059600	3059605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972630
53010	NC_015152	CA	3	6	3059620	3059625	50 %	0 %	0 %	50 %	325972630
53011	NC_015152	AGG	2	6	3059718	3059723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972630
53012	NC_015152	C	7	7	3059746	3059752	0 %	0 %	0 %	100 %	325972630
53013	NC_015152	GA	4	8	3059839	3059846	50 %	0 %	50 %	0 %	325972630
53014	NC_015152	ACC	2	6	3059907	3059912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972630
53015	NC_015152	TTC	2	6	3059999	3060004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972630
53016	NC_015152	GCC	2	6	3060081	3060086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972630
53017	NC_015152	CAG	2	6	3060119	3060124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972630
53018	NC_015152	TGC	2	6	3060189	3060194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972630
53019	NC_015152	TGA	2	6	3060244	3060249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972630
53020	NC_015152	ATC	2	6	3060276	3060281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972630
53021	NC_015152	TCG	2	6	3060282	3060287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972630
53022	NC_015152	GCA	2	6	3060318	3060323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972630
53023	NC_015152	TGGC	2	8	3060366	3060373	0 %	25 %	50 %	25 %	325972630
53024	NC_015152	CAA	2	6	3060454	3060459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972630
53025	NC_015152	CCTTTG	2	12	3060498	3060509	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325972630
53026	NC_015152	ATCA	2	8	3060515	3060522	50 %	25 %	0 %	25 %	325972630
53027	NC_015152	TCA	3	9	3060570	3060578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972630
53028	NC_015152	TGG	2	6	3060646	3060651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972630
53029	NC_015152	CTG	2	6	3060668	3060673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972630
53030	NC_015152	TCA	2	6	3060850	3060855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972630
53031	NC_015152	TGA	2	6	3060861	3060866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972630
53032	NC_015152	GCT	2	6	3060903	3060908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972630
53033	NC_015152	GTT	2	6	3061055	3061060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972631
53034	NC_015152	GCT	2	6	3061070	3061075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972631
53035	NC_015152	GTG	3	9	3061089	3061097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972631
53036	NC_015152	GTG	2	6	3061135	3061140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972631
53037	NC_015152	GCA	2	6	3061159	3061164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972631
53038	NC_015152	CAAA	3	12	3061182	3061193	75 %	0 %	0 %	25 %	325972631
53039	NC_015152	GTG	2	6	3061206	3061211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972631
53040	NC_015152	GGA	2	6	3061266	3061271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972631
53041	NC_015152	TACA	2	8	3061347	3061354	50 %	25 %	0 %	25 %	325972631
53042	NC_015152	TAC	2	6	3061361	3061366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972631
53043	NC_015152	GAG	2	6	3061372	3061377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972631
53044	NC_015152	CTC	2	6	3061430	3061435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972631
53045	NC_015152	TCG	2	6	3061510	3061515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972631
53046	NC_015152	GCTC	2	8	3061560	3061567	0 %	25 %	25 %	50 %	325972632
53047	NC_015152	GCTTCA	2	12	3061581	3061592	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325972632
53048	NC_015152	TCT	2	6	3061667	3061672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972632
53049	NC_015152	GCAA	2	8	3061673	3061680	50 %	0 %	25 %	25 %	325972632
53050	NC_015152	ACCA	2	8	3061787	3061794	50 %	0 %	0 %	50 %	325972632
53051	NC_015152	GA	3	6	3061811	3061816	50 %	0 %	50 %	0 %	325972632
53052	NC_015152	CA	4	8	3061857	3061864	50 %	0 %	0 %	50 %	325972632
53053	NC_015152	GCG	2	6	3061865	3061870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325972632
53054	NC_015152	ATG	2	6	3061901	3061906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972632
53055	NC_015152	GCC	2	6	3061947	3061952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325972632
53056	NC_015152	GCAG	2	8	3062010	3062017	25 %	0 %	50 %	25 %	325972632
53057	NC_015152	GAA	2	6	3062036	3062041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972632
53058	NC_015152	ACCCA	2	10	3062071	3062080	40 %	0 %	0 %	60 %	325972632
53059	NC_015152	CCA	2	6	3062111	3062116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972632
53060	NC_015152	CCA	2	6	3062199	3062204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972632
53061	NC_015152	TCA	2	6	3062301	3062306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972632
53062	NC_015152	TC	3	6	3062328	3062333	0 %	50 %	0 %	50 %	325972633
53063	NC_015152	ATAC	2	8	3062371	3062378	50 %	25 %	0 %	25 %	325972633
53064	NC_015152	GTT	2	6	3062435	3062440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972633
53065	NC_015152	TCA	2	6	3062539	3062544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972633
53066	NC_015152	GT	4	8	3062560	3062567	0 %	50 %	50 %	0 %	325972633
53067	NC_015152	CAC	2	6	3062571	3062576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972633
53068	NC_015152	CAGCA	2	10	3062748	3062757	40 %	0 %	20 %	40 %	325972633
53069	NC_015152	ACC	3	9	3062779	3062787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972633
53070	NC_015152	GGGT	2	8	3062808	3062815	0 %	25 %	75 %	0 %	325972633
53071	NC_015152	AGC	2	6	3063070	3063075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972633
53072	NC_015152	CGA	2	6	3063126	3063131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972634
53073	NC_015152	GAT	2	6	3063145	3063150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972634
53074	NC_015152	CGGC	2	8	3063194	3063201	0 %	0 %	50 %	50 %	325972634
53075	NC_015152	TCG	2	6	3063230	3063235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972634
53076	NC_015152	GTT	2	6	3063247	3063252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972634
53077	NC_015152	CCTG	2	8	3063275	3063282	0 %	25 %	25 %	50 %	325972634
53078	NC_015152	ACG	2	6	3063370	3063375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972634
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53080	NC_015152	TCG	2	6	3063770	3063775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972634
53081	NC_015152	TTC	2	6	3063783	3063788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972634
53082	NC_015152	GAC	2	6	3063811	3063816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972634
53083	NC_015152	TTC	2	6	3063817	3063822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972634
53084	NC_015152	ATC	2	6	3063931	3063936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972634
53085	NC_015152	GAT	2	6	3063937	3063942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972634
53086	NC_015152	TTC	2	6	3063981	3063986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972634
53087	NC_015152	AAT	2	6	3063997	3064002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972634
53088	NC_015152	TTCAT	2	10	3064010	3064019	20 %	60 %	0 %	20 %	325972634
53089	NC_015152	CGA	2	6	3064056	3064061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972634
53090	NC_015152	TAC	2	6	3064090	3064095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972634
53091	NC_015152	T	6	6	3064108	3064113	0 %	100 %	0 %	0 %	325972634
53092	NC_015152	TC	3	6	3064166	3064171	0 %	50 %	0 %	50 %	325972634
53093	NC_015152	ATG	3	9	3064196	3064204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972634
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53098	NC_015152	TCTCC	2	10	3064384	3064393	0 %	40 %	0 %	60 %	325972634
53099	NC_015152	CTG	2	6	3064435	3064440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972634
53100	NC_015152	TTG	2	6	3064441	3064446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972634
53101	NC_015152	CAA	2	6	3064453	3064458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972634
53102	NC_015152	CAAG	2	8	3064473	3064480	50 %	0 %	25 %	25 %	325972634
53103	NC_015152	GCTTCC	2	12	3064496	3064507	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325972634
53104	NC_015152	CT	3	6	3064536	3064541	0 %	50 %	0 %	50 %	325972634
53105	NC_015152	AACC	2	8	3064586	3064593	50 %	0 %	0 %	50 %	325972634
53106	NC_015152	GAT	2	6	3064597	3064602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972634
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53109	NC_015152	GGCT	2	8	3064892	3064899	0 %	25 %	50 %	25 %	325972635
53110	NC_015152	TCT	2	6	3064909	3064914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972635
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53112	NC_015152	CTT	2	6	3064940	3064945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972635
53113	NC_015152	TCT	2	6	3064960	3064965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972635
53114	NC_015152	ACAA	2	8	3065052	3065059	75 %	0 %	0 %	25 %	325972635
53115	NC_015152	ATC	2	6	3065160	3065165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972635
53116	NC_015152	TGG	2	6	3065203	3065208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972635
53117	NC_015152	CTA	2	6	3065280	3065285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972635
53118	NC_015152	AATCC	2	10	3065295	3065304	40 %	20 %	0 %	40 %	325972635
53119	NC_015152	TCT	2	6	3065317	3065322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972636
53120	NC_015152	CTT	2	6	3065427	3065432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972636
53121	NC_015152	TCT	2	6	3065468	3065473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972636
53122	NC_015152	TTC	2	6	3065506	3065511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972636
53123	NC_015152	CT	4	8	3065576	3065583	0 %	50 %	0 %	50 %	325972636
53124	NC_015152	TCG	2	6	3065623	3065628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972636
53125	NC_015152	TGA	2	6	3065633	3065638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972636
53126	NC_015152	GGGT	2	8	3065759	3065766	0 %	25 %	75 %	0 %	325972636
53127	NC_015152	CAT	2	6	3065909	3065914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972636
53128	NC_015152	CAT	2	6	3065916	3065921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972636
53129	NC_015152	TTG	2	6	3065941	3065946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972636
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53134	NC_015152	GAG	2	6	3066201	3066206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972636
53135	NC_015152	CCT	2	6	3066210	3066215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972636
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53137	NC_015152	CTT	2	6	3066321	3066326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972636
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53143	NC_015152	AGGA	2	8	3066590	3066597	50 %	0 %	50 %	0 %	325972637
53144	NC_015152	GGCT	2	8	3066662	3066669	0 %	25 %	50 %	25 %	325972637
53145	NC_015152	TGC	2	6	3066753	3066758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972637
53146	NC_015152	TCG	2	6	3066760	3066765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972637
53147	NC_015152	GCTTCT	2	12	3066812	3066823	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325972637
53148	NC_015152	GTCG	2	8	3066843	3066850	0 %	25 %	50 %	25 %	325972637
53149	NC_015152	CTT	2	6	3066852	3066857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972637
53150	NC_015152	AAC	2	6	3066949	3066954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972637
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53152	NC_015152	AGC	2	6	3067194	3067199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325972638
53153	NC_015152	TGC	2	6	3067227	3067232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972638
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53213	NC_015152	TC	3	6	3070421	3070426	0 %	50 %	0 %	50 %	325972644
53214	NC_015152	AC	3	6	3070527	3070532	50 %	0 %	0 %	50 %	325972645
53215	NC_015152	TTC	2	6	3070544	3070549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972645
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53219	NC_015152	TTCAG	2	10	3070616	3070625	20 %	40 %	20 %	20 %	325972645
53220	NC_015152	TCG	2	6	3070667	3070672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972645
53221	NC_015152	ACAT	2	8	3070682	3070689	50 %	25 %	0 %	25 %	325972645
53222	NC_015152	TGC	2	6	3070698	3070703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972645
53223	NC_015152	ATG	2	6	3070756	3070761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972645
53224	NC_015152	CTT	2	6	3070777	3070782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972645
53225	NC_015152	TCTT	2	8	3070806	3070813	0 %	75 %	0 %	25 %	325972645
53226	NC_015152	TACCCT	2	12	3070885	3070896	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	325972646
53227	NC_015152	GCT	2	6	3070951	3070956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972646
53228	NC_015152	TTG	2	6	3070980	3070985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972646
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53464	NC_015152	CCTT	2	8	3081820	3081827	0 %	50 %	0 %	50 %	325972667
53465	NC_015152	TAT	2	6	3081866	3081871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972667
53466	NC_015152	ACC	2	6	3081891	3081896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325972667
53467	NC_015152	TCT	3	9	3081992	3082000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972667
53468	NC_015152	TCAA	2	8	3082030	3082037	50 %	25 %	0 %	25 %	325972667
53469	NC_015152	CAAC	2	8	3082157	3082164	50 %	0 %	0 %	50 %	325972667
53470	NC_015152	TGG	2	6	3082193	3082198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325972667
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53472	NC_015152	CTT	2	6	3082272	3082277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972667
53473	NC_015152	ATCC	2	8	3082310	3082317	25 %	25 %	0 %	50 %	325972667
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53475	NC_015152	CTTC	2	8	3082339	3082346	0 %	50 %	0 %	50 %	325972667
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53484	NC_015152	GTC	2	6	3082884	3082889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325972667
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53490	NC_015152	GAA	2	6	3083004	3083009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972667
53491	NC_015152	GAT	2	6	3083013	3083018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972667
53492	NC_015152	TCCT	2	8	3083025	3083032	0 %	50 %	0 %	50 %	325972667
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53494	NC_015152	TGT	2	6	3083249	3083254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972667
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53497	NC_015152	GTT	2	6	3083313	3083318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972667
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53499	NC_015152	CAAT	2	8	3083474	3083481	50 %	25 %	0 %	25 %	325972667
53500	NC_015152	GGAAC	2	10	3083516	3083525	40 %	0 %	40 %	20 %	325972667

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