MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 chromosome

Total Repeats: 45912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014925	TCG	4	12	641	652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891291
2	NC_014925	A	8	8	875	882	100 %	0 %	0 %	0 %	319891292
3	NC_014925	GTC	2	6	938	943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891292
4	NC_014925	A	6	6	997	1002	100 %	0 %	0 %	0 %	319891292
5	NC_014925	AAG	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891292
6	NC_014925	AG	3	6	1046	1051	50 %	0 %	50 %	0 %	319891292
7	NC_014925	AGA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891292
8	NC_014925	ATT	2	6	1091	1096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891292
9	NC_014925	AAC	2	6	1379	1384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891293
10	NC_014925	ATG	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891293
11	NC_014925	TA	3	6	1481	1486	50 %	50 %	0 %	0 %	319891293
12	NC_014925	ATTA	2	8	1525	1532	50 %	50 %	0 %	0 %	319891293
13	NC_014925	ATT	2	6	1540	1545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891293
14	NC_014925	GAA	2	6	1558	1563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891293
15	NC_014925	CAC	2	6	1598	1603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319891293
16	NC_014925	TGG	2	6	1644	1649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319891293
17	NC_014925	TTAA	2	8	1852	1859	50 %	50 %	0 %	0 %	319891293
18	NC_014925	CGTCAA	2	12	1861	1872	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319891293
19	NC_014925	ATG	3	9	1925	1933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891293
20	NC_014925	AGA	2	6	1935	1940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891293
21	NC_014925	TTA	2	6	1957	1962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891293
22	NC_014925	TCG	2	6	2054	2059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891293
23	NC_014925	AGA	2	6	2223	2228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891293
24	NC_014925	GAT	2	6	2326	2331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891293
25	NC_014925	ATT	2	6	2374	2379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891293
26	NC_014925	AAC	2	6	2396	2401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891293
27	NC_014925	CAA	3	9	2467	2475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891293
28	NC_014925	AAATAC	2	12	2492	2503	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	319891293
29	NC_014925	TGG	2	6	2517	2522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319891293
30	NC_014925	ACGT	2	8	2545	2552	25 %	25 %	25 %	25 %	319891293
31	NC_014925	ATT	2	6	2574	2579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891293
32	NC_014925	AAGC	2	8	2581	2588	50 %	0 %	25 %	25 %	319891293
33	NC_014925	TGC	2	6	2616	2621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891293
34	NC_014925	GAA	2	6	2710	2715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891293
35	NC_014925	TTGA	2	8	2716	2723	25 %	50 %	25 %	0 %	319891293
36	NC_014925	AAT	2	6	2753	2758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891293
37	NC_014925	GTA	2	6	2800	2805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891294
38	NC_014925	CAAT	2	8	2876	2883	50 %	25 %	0 %	25 %	319891294
39	NC_014925	CAA	2	6	3082	3087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891294
40	NC_014925	AGA	2	6	3105	3110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891294
41	NC_014925	GTG	2	6	3248	3253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319891294
42	NC_014925	ATT	2	6	3256	3261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891294
43	NC_014925	ACC	2	6	3372	3377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319891294
44	NC_014925	TGA	2	6	3429	3434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891294
45	NC_014925	GTCG	2	8	3436	3443	0 %	25 %	50 %	25 %	319891294
46	NC_014925	AT	3	6	3468	3473	50 %	50 %	0 %	0 %	319891294
47	NC_014925	GTTG	2	8	3491	3498	0 %	50 %	50 %	0 %	319891294
48	NC_014925	AC	3	6	3517	3522	50 %	0 %	0 %	50 %	319891294
49	NC_014925	TGAT	2	8	3527	3534	25 %	50 %	25 %	0 %	319891294
50	NC_014925	CCAT	2	8	3598	3605	25 %	25 %	0 %	50 %	319891294
51	NC_014925	CAA	2	6	3704	3709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891294
52	NC_014925	GAA	2	6	3718	3723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891294
53	NC_014925	CGA	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891294
54	NC_014925	ATG	2	6	3772	3777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891294
55	NC_014925	CAG	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891294
56	NC_014925	GAA	2	6	3898	3903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891294
57	NC_014925	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891294
58	NC_014925	GT	3	6	3947	3952	0 %	50 %	50 %	0 %	319891294
59	NC_014925	AGA	2	6	3960	3965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891294
60	NC_014925	GT	3	6	3998	4003	0 %	50 %	50 %	0 %	319891294
61	NC_014925	TGA	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891294
62	NC_014925	TGA	2	6	4143	4148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891294
63	NC_014925	CAA	2	6	4177	4182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891294
64	NC_014925	TGA	2	6	4188	4193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891294
65	NC_014925	ACA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891294
66	NC_014925	GAA	2	6	4252	4257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891294
67	NC_014925	CGT	2	6	4306	4311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891294
68	NC_014925	ATT	2	6	4333	4338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891294
69	NC_014925	GAA	2	6	4378	4383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891294
70	NC_014925	CAA	2	6	4432	4437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891294
71	NC_014925	TTA	2	6	4606	4611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891294
72	NC_014925	AAAT	2	8	4645	4652	75 %	25 %	0 %	0 %	319891294
73	NC_014925	CAA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891295
74	NC_014925	GAATG	2	10	4750	4759	40 %	20 %	40 %	0 %	319891295
75	NC_014925	AATT	2	8	4764	4771	50 %	50 %	0 %	0 %	319891295
76	NC_014925	TG	3	6	4868	4873	0 %	50 %	50 %	0 %	319891295
77	NC_014925	GTGCAG	2	12	4880	4891	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319891295
78	NC_014925	TTG	2	6	4943	4948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891295
79	NC_014925	GAA	2	6	5046	5051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891295
80	NC_014925	GTC	2	6	5064	5069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891295
81	NC_014925	TGT	2	6	5076	5081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891295
82	NC_014925	T	7	7	5153	5159	0 %	100 %	0 %	0 %	319891295
83	NC_014925	AAG	2	6	5183	5188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891295
84	NC_014925	GAA	2	6	5194	5199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891295
85	NC_014925	AGG	2	6	5223	5228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319891295
86	NC_014925	A	6	6	5317	5322	100 %	0 %	0 %	0 %	319891295
87	NC_014925	CAAA	2	8	5345	5352	75 %	0 %	0 %	25 %	319891295
88	NC_014925	CAC	2	6	5354	5359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319891295
89	NC_014925	TTG	2	6	5360	5365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891295
90	NC_014925	GAA	2	6	5410	5415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891296
91	NC_014925	A	6	6	5440	5445	100 %	0 %	0 %	0 %	319891296
92	NC_014925	GAC	2	6	5450	5455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891296
93	NC_014925	A	6	6	5508	5513	100 %	0 %	0 %	0 %	319891296
94	NC_014925	GAA	2	6	5564	5569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891296
95	NC_014925	TTG	2	6	5610	5615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891296
96	NC_014925	GAA	2	6	5627	5632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891296
97	NC_014925	GAT	2	6	5723	5728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891296
98	NC_014925	TGT	2	6	5740	5745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891296
99	NC_014925	AGA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891296
100	NC_014925	A	6	6	5807	5812	100 %	0 %	0 %	0 %	319891296
101	NC_014925	TTG	2	6	5897	5902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891296
102	NC_014925	AAG	2	6	5994	5999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891296
103	NC_014925	AAAC	2	8	6038	6045	75 %	0 %	0 %	25 %	319891296
104	NC_014925	GAG	2	6	6047	6052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319891296
105	NC_014925	CAA	2	6	6063	6068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891296
106	NC_014925	TGG	2	6	6084	6089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319891296
107	NC_014925	TCC	2	6	6109	6114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319891296
108	NC_014925	ATT	2	6	6149	6154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891296
109	NC_014925	AAAAAG	2	12	6201	6212	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	319891296
110	NC_014925	ATT	2	6	6640	6645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891297
111	NC_014925	TGA	2	6	6671	6676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891297
112	NC_014925	A	6	6	6907	6912	100 %	0 %	0 %	0 %	319891298
113	NC_014925	TAT	2	6	6935	6940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891298
114	NC_014925	TGG	2	6	6950	6955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319891298
115	NC_014925	AGA	2	6	6993	6998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891298
116	NC_014925	TTA	2	6	6999	7004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891298
117	NC_014925	ATG	2	6	7172	7177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891298
118	NC_014925	AAC	2	6	7194	7199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891298
119	NC_014925	ATG	2	6	7557	7562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891299
120	NC_014925	GA	4	8	7617	7624	50 %	0 %	50 %	0 %	319891299
121	NC_014925	A	6	6	7642	7647	100 %	0 %	0 %	0 %	319891299
122	NC_014925	TAT	2	6	7684	7689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891299
123	NC_014925	TTA	2	6	7696	7701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891299
124	NC_014925	GAA	2	6	7799	7804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891299
125	NC_014925	TA	3	6	7813	7818	50 %	50 %	0 %	0 %	319891299
126	NC_014925	AAG	2	6	7819	7824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891299
127	NC_014925	GAA	2	6	7836	7841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891299
128	NC_014925	A	7	7	7860	7866	100 %	0 %	0 %	0 %	319891299
129	NC_014925	GT	3	6	7891	7896	0 %	50 %	50 %	0 %	319891299
130	NC_014925	GTT	2	6	7913	7918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891299
131	NC_014925	AT	3	6	7924	7929	50 %	50 %	0 %	0 %	319891299
132	NC_014925	TTTC	2	8	7938	7945	0 %	75 %	0 %	25 %	319891299
133	NC_014925	CTA	2	6	8021	8026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891299
134	NC_014925	TTTC	2	8	8132	8139	0 %	75 %	0 %	25 %	319891300
135	NC_014925	GCT	2	6	8140	8145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891300
136	NC_014925	CT	3	6	8236	8241	0 %	50 %	0 %	50 %	319891300
137	NC_014925	AG	3	6	8274	8279	50 %	0 %	50 %	0 %	319891300
138	NC_014925	GTG	2	6	8333	8338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319891300
139	NC_014925	AAT	2	6	8341	8346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891300
140	NC_014925	T	6	6	8352	8357	0 %	100 %	0 %	0 %	319891300
141	NC_014925	TCT	2	6	8371	8376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891300
142	NC_014925	TGC	2	6	8457	8462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891300
143	NC_014925	GTT	2	6	8488	8493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891300
144	NC_014925	TCT	2	6	8506	8511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891300
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148	NC_014925	TAA	2	6	8658	8663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891300
149	NC_014925	ATA	2	6	8710	8715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891300
150	NC_014925	TCTACA	2	12	8815	8826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891301
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152	NC_014925	TA	3	6	8859	8864	50 %	50 %	0 %	0 %	319891301
153	NC_014925	TAA	2	6	8883	8888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891301
154	NC_014925	TCGT	2	8	8893	8900	0 %	50 %	25 %	25 %	319891301
155	NC_014925	TTCA	2	8	8967	8974	25 %	50 %	0 %	25 %	319891301
156	NC_014925	TCA	2	6	9037	9042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891301
157	NC_014925	ATTCGC	2	12	9066	9077	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319891301
158	NC_014925	GAC	2	6	9093	9098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891301
159	NC_014925	CTT	2	6	9110	9115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891301
160	NC_014925	TCG	2	6	9116	9121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891301
161	NC_014925	GC	3	6	9132	9137	0 %	0 %	50 %	50 %	319891301
162	NC_014925	CTT	2	6	9155	9160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891301
163	NC_014925	GACT	2	8	9250	9257	25 %	25 %	25 %	25 %	319891301
164	NC_014925	TAAT	2	8	9260	9267	50 %	50 %	0 %	0 %	319891301
165	NC_014925	TTG	2	6	9312	9317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891301
166	NC_014925	TAC	2	6	9404	9409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891302
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168	NC_014925	TCT	2	6	9457	9462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891302
169	NC_014925	TGG	2	6	9468	9473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319891302
170	NC_014925	CTT	2	6	9610	9615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891302
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176	NC_014925	TCA	2	6	9844	9849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891302
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232	NC_014925	ATG	2	6	12302	12307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891305
233	NC_014925	TAG	2	6	13053	13058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891306
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236	NC_014925	ATT	2	6	13286	13291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891306
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239	NC_014925	A	6	6	13948	13953	100 %	0 %	0 %	0 %	319891307
240	NC_014925	ATT	2	6	13960	13965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891307
241	NC_014925	ACT	2	6	13966	13971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891307
242	NC_014925	TGCG	2	8	14005	14012	0 %	25 %	50 %	25 %	319891307
243	NC_014925	ACAA	2	8	14036	14043	75 %	0 %	0 %	25 %	319891307
244	NC_014925	ACA	2	6	14073	14078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891307
245	NC_014925	AGG	2	6	14188	14193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319891307
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248	NC_014925	AGA	2	6	14330	14335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891308
249	NC_014925	A	6	6	14338	14343	100 %	0 %	0 %	0 %	319891308
250	NC_014925	AGA	2	6	14369	14374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891308
251	NC_014925	TAT	2	6	14378	14383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891308
252	NC_014925	TGA	2	6	14453	14458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891308
253	NC_014925	TGG	2	6	14504	14509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319891308
254	NC_014925	AGC	2	6	14519	14524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891308
255	NC_014925	TAT	2	6	14561	14566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891308
256	NC_014925	GGT	2	6	14601	14606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319891308
257	NC_014925	ACT	2	6	14626	14631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891308
258	NC_014925	TAA	2	6	14639	14644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891308
259	NC_014925	GAT	2	6	14760	14765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891308
260	NC_014925	T	6	6	14793	14798	0 %	100 %	0 %	0 %	319891308
261	NC_014925	CGA	2	6	14949	14954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891309
262	NC_014925	GGA	2	6	14975	14980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319891309
263	NC_014925	TTA	2	6	15138	15143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891309
264	NC_014925	ATT	2	6	15152	15157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319891309
265	NC_014925	CAAT	2	8	15187	15194	50 %	25 %	0 %	25 %	319891309
266	NC_014925	AAG	2	6	15255	15260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891309
267	NC_014925	TTAC	2	8	15280	15287	25 %	50 %	0 %	25 %	319891309
268	NC_014925	CA	3	6	15394	15399	50 %	0 %	0 %	50 %	319891309
269	NC_014925	CTT	2	6	15405	15410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891309
270	NC_014925	AAG	2	6	15459	15464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891309
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282	NC_014925	CTT	2	6	16856	16861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891310
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284	NC_014925	TCT	2	6	17188	17193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891310
285	NC_014925	TCA	2	6	17245	17250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891310
286	NC_014925	TCG	2	6	17318	17323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891310
287	NC_014925	TA	3	6	17454	17459	50 %	50 %	0 %	0 %	319891310
288	NC_014925	TCT	2	6	17587	17592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891310
289	NC_014925	TAA	2	6	17610	17615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891310
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299	NC_014925	TGAT	2	8	18063	18070	25 %	50 %	25 %	0 %	319891310
300	NC_014925	TAA	2	6	18162	18167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891310
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371	NC_014925	TGAA	2	8	21572	21579	50 %	25 %	25 %	0 %	319891313
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378	NC_014925	AT	3	6	22055	22060	50 %	50 %	0 %	0 %	319891313
379	NC_014925	TCG	2	6	22062	22067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891313
380	NC_014925	TAA	2	6	22147	22152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891313
381	NC_014925	CTG	2	6	22161	22166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891313
382	NC_014925	ATA	2	6	22174	22179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891313
383	NC_014925	ATC	2	6	22199	22204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891313
384	NC_014925	AATA	2	8	22225	22232	75 %	25 %	0 %	0 %	319891313
385	NC_014925	AGTGAA	2	12	22293	22304	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	319891313
386	NC_014925	GCC	2	6	22345	22350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319891313
387	NC_014925	TCA	2	6	22376	22381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891313
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