MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 chromosome

Total Repeats: 45912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_014925	GCT	2	6	2010883	2010888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893229
35502	NC_014925	CTC	2	6	2011007	2011012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319893229
35503	NC_014925	GAC	2	6	2011131	2011136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319893229
35504	NC_014925	AAT	2	6	2011173	2011178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893229
35505	NC_014925	TGC	2	6	2011203	2011208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893229
35506	NC_014925	ATC	2	6	2011299	2011304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893230
35507	NC_014925	TGT	2	6	2011306	2011311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893230
35508	NC_014925	CGCTTT	2	12	2011329	2011340	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	319893230
35509	NC_014925	CAA	2	6	2011388	2011393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893230
35510	NC_014925	GCA	2	6	2011426	2011431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319893230
35511	NC_014925	CAC	2	6	2011481	2011486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319893230
35512	NC_014925	CAC	2	6	2011490	2011495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319893230
35513	NC_014925	AAT	2	6	2011505	2011510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893230
35514	NC_014925	ATC	2	6	2011590	2011595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893230
35515	NC_014925	TCA	2	6	2011612	2011617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893230
35516	NC_014925	ACA	2	6	2011642	2011647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893230
35517	NC_014925	GAT	3	9	2011667	2011675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893230
35518	NC_014925	GTAAC	2	10	2011719	2011728	40 %	20 %	20 %	20 %	319893230
35519	NC_014925	ACC	2	6	2011760	2011765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319893230
35520	NC_014925	CAT	2	6	2011767	2011772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893230
35521	NC_014925	T	6	6	2011772	2011777	0 %	100 %	0 %	0 %	319893230
35522	NC_014925	CAA	2	6	2011832	2011837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893230
35523	NC_014925	ATA	2	6	2011885	2011890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893230
35524	NC_014925	CAT	2	6	2011898	2011903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893230
35525	NC_014925	TTG	3	9	2011945	2011953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893230
35526	NC_014925	CGA	2	6	2012132	2012137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319893230
35527	NC_014925	CAT	2	6	2012144	2012149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893230
35528	NC_014925	CAC	2	6	2012198	2012203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319893230
35529	NC_014925	GTAC	2	8	2012254	2012261	25 %	25 %	25 %	25 %	319893231
35530	NC_014925	ACG	2	6	2012288	2012293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319893231
35531	NC_014925	AC	3	6	2012417	2012422	50 %	0 %	0 %	50 %	319893231
35532	NC_014925	TTG	2	6	2012430	2012435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893231
35533	NC_014925	ATC	2	6	2012481	2012486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893231
35534	NC_014925	T	7	7	2012562	2012568	0 %	100 %	0 %	0 %	319893231
35535	NC_014925	CG	3	6	2012598	2012603	0 %	0 %	50 %	50 %	319893231
35536	NC_014925	CAT	3	9	2012615	2012623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893231
35537	NC_014925	CGTT	2	8	2012731	2012738	0 %	50 %	25 %	25 %	319893231
35538	NC_014925	GTTT	2	8	2012765	2012772	0 %	75 %	25 %	0 %	319893231
35539	NC_014925	GTC	2	6	2012983	2012988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893231
35540	NC_014925	TAA	2	6	2013003	2013008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893231
35541	NC_014925	GAT	3	9	2013022	2013030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893231
35542	NC_014925	CAA	2	6	2013059	2013064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319893231
35543	NC_014925	CTG	2	6	2013191	2013196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893231
35544	NC_014925	GTC	2	6	2013231	2013236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893231
35545	NC_014925	TGC	2	6	2013273	2013278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893231
35546	NC_014925	CCA	2	6	2013292	2013297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319893231
35547	NC_014925	A	6	6	2013487	2013492	100 %	0 %	0 %	0 %	319893232
35548	NC_014925	CTC	2	6	2013594	2013599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319893232
35549	NC_014925	ATC	2	6	2013622	2013627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893232
35550	NC_014925	TTG	2	6	2013702	2013707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893232
35551	NC_014925	CAT	2	6	2013737	2013742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893232
35552	NC_014925	GAC	2	6	2013753	2013758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319893232
35553	NC_014925	GC	3	6	2013767	2013772	0 %	0 %	50 %	50 %	319893232
35554	NC_014925	ATA	2	6	2013831	2013836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893232
35555	NC_014925	TTC	2	6	2013840	2013845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319893232
35556	NC_014925	TTTG	2	8	2013850	2013857	0 %	75 %	25 %	0 %	319893232
35557	NC_014925	CAAT	2	8	2013865	2013872	50 %	25 %	0 %	25 %	319893232
35558	NC_014925	CCA	2	6	2013940	2013945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319893232
35559	NC_014925	AGA	2	6	2014017	2014022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319893232
35560	NC_014925	ATTA	2	8	2014056	2014063	50 %	50 %	0 %	0 %	319893232
35561	NC_014925	TTG	2	6	2014152	2014157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893232
35562	NC_014925	GTT	2	6	2014160	2014165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893232
35563	NC_014925	TTCG	2	8	2014183	2014190	0 %	50 %	25 %	25 %	319893232
35564	NC_014925	TTC	2	6	2014198	2014203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319893232
35565	NC_014925	CTT	2	6	2014226	2014231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319893232
35566	NC_014925	ATA	2	6	2014257	2014262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893232
35567	NC_014925	TTTCTT	2	12	2014274	2014285	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	319893232
35568	NC_014925	TTTTG	2	10	2014327	2014336	0 %	80 %	20 %	0 %	319893232
35569	NC_014925	TTG	2	6	2014382	2014387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893232
35570	NC_014925	TC	3	6	2014460	2014465	0 %	50 %	0 %	50 %	319893232
35571	NC_014925	CAT	2	6	2014476	2014481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319893232
35572	NC_014925	AACC	2	8	2014661	2014668	50 %	0 %	0 %	50 %	319893233
35573	NC_014925	AGA	2	6	2014705	2014710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319893233
35574	NC_014925	GAA	2	6	2014754	2014759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319893233
35575	NC_014925	CAAT	2	8	2014783	2014790	50 %	25 %	0 %	25 %	319893233
35576	NC_014925	GAA	2	6	2014793	2014798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319893233
35577	NC_014925	TGA	2	6	2014867	2014872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893233
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35581	NC_014925	GGC	2	6	2015163	2015168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319893233
35582	NC_014925	ATT	2	6	2015300	2015305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893233
35583	NC_014925	CGA	2	6	2015319	2015324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319893233
35584	NC_014925	CGTG	2	8	2015374	2015381	0 %	25 %	50 %	25 %	319893233
35585	NC_014925	A	6	6	2015436	2015441	100 %	0 %	0 %	0 %	319893233
35586	NC_014925	TC	3	6	2015597	2015602	0 %	50 %	0 %	50 %	319893234
35587	NC_014925	TCAGCA	2	12	2015612	2015623	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319893234
35588	NC_014925	CG	3	6	2015645	2015650	0 %	0 %	50 %	50 %	319893234
35589	NC_014925	C	6	6	2015654	2015659	0 %	0 %	0 %	100 %	319893234
35590	NC_014925	CCACG	2	10	2015682	2015691	20 %	0 %	20 %	60 %	319893234
35591	NC_014925	GCT	2	6	2015699	2015704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893234
35592	NC_014925	T	6	6	2015818	2015823	0 %	100 %	0 %	0 %	319893234
35593	NC_014925	CTTT	2	8	2015849	2015856	0 %	75 %	0 %	25 %	319893234
35594	NC_014925	AG	3	6	2015881	2015886	50 %	0 %	50 %	0 %	319893234
35595	NC_014925	CTG	2	6	2015973	2015978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893234
35596	NC_014925	AC	3	6	2016093	2016098	50 %	0 %	0 %	50 %	319893234
35597	NC_014925	TTG	2	6	2016118	2016123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893234
35598	NC_014925	TGA	2	6	2016164	2016169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319893234
35599	NC_014925	TTA	3	9	2016179	2016187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893234
35600	NC_014925	CGT	2	6	2016228	2016233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893234
35601	NC_014925	AATA	2	8	2016243	2016250	75 %	25 %	0 %	0 %	319893234
35602	NC_014925	TTG	2	6	2016323	2016328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319893235
35603	NC_014925	ATT	2	6	2016350	2016355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319893235
35604	NC_014925	GCT	2	6	2016387	2016392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319893235
35605	NC_014925	TAA	2	6	2016491	2016496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893235
35606	NC_014925	CAC	2	6	2016497	2016502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319893235
35607	NC_014925	AAT	2	6	2016515	2016520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893235
35608	NC_014925	CCAA	2	8	2016569	2016576	50 %	0 %	0 %	50 %	319893235
35609	NC_014925	GCG	2	6	2016585	2016590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319893235
35610	NC_014925	ACC	2	6	2016641	2016646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319893235
35611	NC_014925	TAA	2	6	2016686	2016691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893235
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35614	NC_014925	ATA	2	6	2017106	2017111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893236
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35616	NC_014925	TC	3	6	2017256	2017261	0 %	50 %	0 %	50 %	319893236
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35961	NC_014925	A	7	7	2037051	2037057	100 %	0 %	0 %	0 %	319893256
35962	NC_014925	TAA	2	6	2037061	2037066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319893256
35963	NC_014925	GACC	2	8	2037103	2037110	25 %	0 %	25 %	50 %	319893256
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35967	NC_014925	TGTA	2	8	2037366	2037373	25 %	50 %	25 %	0 %	319893256
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