MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 chromosome

Total Repeats: 45912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014925	TG	3	6	643698	643703	0 %	50 %	50 %	0 %	319891917
11002	NC_014925	TCT	2	6	644752	644757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891918
11003	NC_014925	GCT	2	6	644809	644814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891918
11004	NC_014925	TAA	2	6	644846	644851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891918
11005	NC_014925	TAAT	2	8	644870	644877	50 %	50 %	0 %	0 %	319891918
11006	NC_014925	CTT	2	6	644894	644899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891918
11007	NC_014925	AAAT	3	12	644908	644919	75 %	25 %	0 %	0 %	319891918
11008	NC_014925	TAA	2	6	644928	644933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891918
11009	NC_014925	GCA	2	6	644965	644970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891918
11010	NC_014925	CAT	2	6	644987	644992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891918
11011	NC_014925	CGA	2	6	645038	645043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891918
11012	NC_014925	AAT	2	6	645193	645198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891919
11013	NC_014925	CACGA	2	10	645250	645259	40 %	0 %	20 %	40 %	319891919
11014	NC_014925	ACG	2	6	645314	645319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891919
11015	NC_014925	AAT	2	6	645331	645336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891919
11016	NC_014925	CT	3	6	645372	645377	0 %	50 %	0 %	50 %	319891920
11017	NC_014925	AG	3	6	645391	645396	50 %	0 %	50 %	0 %	319891920
11018	NC_014925	CTT	4	12	645413	645424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891920
11019	NC_014925	AT	3	6	645448	645453	50 %	50 %	0 %	0 %	319891920
11020	NC_014925	ATC	2	6	645465	645470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891920
11021	NC_014925	GAC	2	6	645483	645488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891920
11022	NC_014925	ATA	2	6	645518	645523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891920
11023	NC_014925	A	6	6	645565	645570	100 %	0 %	0 %	0 %	319891920
11024	NC_014925	ATA	2	6	645601	645606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891920
11025	NC_014925	TGA	2	6	645629	645634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891920
11026	NC_014925	TAA	2	6	645729	645734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891920
11027	NC_014925	TGA	2	6	645815	645820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891920
11028	NC_014925	CTG	2	6	645924	645929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891921
11029	NC_014925	ACC	2	6	645941	645946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319891921
11030	NC_014925	TAA	2	6	645976	645981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891921
11031	NC_014925	CTT	2	6	646116	646121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891921
11032	NC_014925	TAA	2	6	646216	646221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891921
11033	NC_014925	ATG	2	6	646228	646233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891921
11034	NC_014925	ACC	2	6	646240	646245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319891921
11035	NC_014925	GTT	2	6	646262	646267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891921
11036	NC_014925	TTAA	2	8	646313	646320	50 %	50 %	0 %	0 %	319891921
11037	NC_014925	GTA	2	6	646336	646341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891921
11038	NC_014925	TGT	2	6	646413	646418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891921
11039	NC_014925	ATA	2	6	646424	646429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891921
11040	NC_014925	AAT	2	6	646471	646476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891921
11041	NC_014925	GAA	2	6	646531	646536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891921
11042	NC_014925	AAT	2	6	646600	646605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891921
11043	NC_014925	TGG	2	6	646612	646617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319891921
11044	NC_014925	ACAT	2	8	646643	646650	50 %	25 %	0 %	25 %	319891921
11045	NC_014925	AATAA	2	10	646688	646697	80 %	20 %	0 %	0 %	319891921
11046	NC_014925	GAT	2	6	646719	646724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891921
11047	NC_014925	CGA	2	6	646776	646781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891921
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11049	NC_014925	GAC	2	6	646825	646830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891921
11050	NC_014925	CCA	2	6	646877	646882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319891921
11051	NC_014925	TAA	2	6	646953	646958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891921
11052	NC_014925	CAT	3	9	646981	646989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891921
11053	NC_014925	TAA	2	6	647003	647008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891921
11054	NC_014925	AAAAT	2	10	647043	647052	80 %	20 %	0 %	0 %	319891921
11055	NC_014925	TAA	3	9	647064	647072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891921
11056	NC_014925	TAAA	2	8	647097	647104	75 %	25 %	0 %	0 %	319891921
11057	NC_014925	TAA	2	6	647247	647252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891921
11058	NC_014925	TCAT	2	8	647327	647334	25 %	50 %	0 %	25 %	319891921
11059	NC_014925	TCT	2	6	647337	647342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319891921
11060	NC_014925	TTCT	2	8	647359	647366	0 %	75 %	0 %	25 %	319891922
11061	NC_014925	GGATC	2	10	647470	647479	20 %	20 %	40 %	20 %	319891922
11062	NC_014925	ATAA	2	8	647547	647554	75 %	25 %	0 %	0 %	319891922
11063	NC_014925	ATA	2	6	647569	647574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891922
11064	NC_014925	TGT	2	6	647576	647581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891922
11065	NC_014925	ATA	2	6	647586	647591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891922
11066	NC_014925	AGAA	2	8	647609	647616	75 %	0 %	25 %	0 %	319891922
11067	NC_014925	AC	3	6	647623	647628	50 %	0 %	0 %	50 %	319891922
11068	NC_014925	ACG	2	6	647652	647657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891922
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11070	NC_014925	AAT	2	6	647698	647703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891923
11071	NC_014925	TG	3	6	647810	647815	0 %	50 %	50 %	0 %	319891923
11072	NC_014925	AAG	2	6	647816	647821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891923
11073	NC_014925	ACC	2	6	647974	647979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319891923
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11075	NC_014925	CAT	2	6	648034	648039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891923
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11077	NC_014925	TCTG	2	8	648090	648097	0 %	50 %	25 %	25 %	319891923
11078	NC_014925	TAATT	2	10	648143	648152	40 %	60 %	0 %	0 %	319891924
11079	NC_014925	GAT	2	6	648189	648194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891924
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11081	NC_014925	CACC	2	8	648349	648356	25 %	0 %	0 %	75 %	319891924
11082	NC_014925	ACG	2	6	648468	648473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891924
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11084	NC_014925	AATCGT	2	12	648599	648610	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319891924
11085	NC_014925	ATC	2	6	648705	648710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891924
11086	NC_014925	TTG	2	6	648732	648737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891924
11087	NC_014925	GTA	2	6	648779	648784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891924
11088	NC_014925	CACT	2	8	648958	648965	25 %	25 %	0 %	50 %	319891924
11089	NC_014925	GTG	2	6	649006	649011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319891924
11090	NC_014925	AAT	2	6	649029	649034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891924
11091	NC_014925	TCA	2	6	649078	649083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891924
11092	NC_014925	CGA	2	6	649198	649203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891924
11093	NC_014925	GT	3	6	649247	649252	0 %	50 %	50 %	0 %	319891924
11094	NC_014925	GATA	2	8	649337	649344	50 %	25 %	25 %	0 %	319891924
11095	NC_014925	TGAA	2	8	649348	649355	50 %	25 %	25 %	0 %	319891924
11096	NC_014925	ATC	2	6	649566	649571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891924
11097	NC_014925	GA	3	6	649579	649584	50 %	0 %	50 %	0 %	319891924
11098	NC_014925	TTG	2	6	649616	649621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891924
11099	NC_014925	TCG	2	6	649624	649629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319891924
11100	NC_014925	ATCC	2	8	649683	649690	25 %	25 %	0 %	50 %	319891924
11101	NC_014925	AGAT	2	8	649728	649735	50 %	25 %	25 %	0 %	319891924
11102	NC_014925	TTG	2	6	649750	649755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891924
11103	NC_014925	ACTG	2	8	649772	649779	25 %	25 %	25 %	25 %	319891924
11104	NC_014925	CATCG	2	10	649793	649802	20 %	20 %	20 %	40 %	319891924
11105	NC_014925	AAT	2	6	649850	649855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319891924
11106	NC_014925	GTAAA	2	10	649949	649958	60 %	20 %	20 %	0 %	319891924
11107	NC_014925	ACC	2	6	649964	649969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319891924
11108	NC_014925	AGT	2	6	649971	649976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891924
11109	NC_014925	ACC	2	6	649982	649987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319891924
11110	NC_014925	ATC	3	9	649998	650006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319891924
11111	NC_014925	ATG	2	6	650074	650079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891924
11112	NC_014925	AGA	2	6	650089	650094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319891924
11113	NC_014925	AG	3	6	650117	650122	50 %	0 %	50 %	0 %	319891924
11114	NC_014925	GAC	2	6	650123	650128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891924
11115	NC_014925	GTT	2	6	650179	650184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891924
11116	NC_014925	ACA	2	6	650217	650222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319891924
11117	NC_014925	AGC	2	6	650312	650317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319891924
11118	NC_014925	TTG	2	6	650344	650349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319891924
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11120	NC_014925	AAAC	2	8	650398	650405	75 %	0 %	0 %	25 %	319891924
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11122	NC_014925	GTA	2	6	650426	650431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891924
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11126	NC_014925	GTA	2	6	650739	650744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319891925
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11130	NC_014925	ACTA	2	8	651084	651091	50 %	25 %	0 %	25 %	319891926
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