MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfuricurvum kujiense DSM 16994 chromosome

Total Repeats: 45581

< Previous12...80818283848586878889909192Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_014762	TCA	2	6	2569677	2569682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313683664
45502	NC_014762	TCTCT	2	10	2569777	2569786	0 %	60 %	0 %	40 %	313683664
45503	NC_014762	TCA	2	6	2569928	2569933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313683665
45504	NC_014762	AAC	2	6	2570065	2570070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313683665
45505	NC_014762	AT	3	6	2570076	2570081	50 %	50 %	0 %	0 %	313683665
45506	NC_014762	AGG	2	6	2570084	2570089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313683665
45507	NC_014762	TCT	2	6	2570184	2570189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313683665
45508	NC_014762	ATG	2	6	2570228	2570233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313683665
45509	NC_014762	GCG	2	6	2570308	2570313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313683665
45510	NC_014762	ATG	2	6	2570344	2570349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313683665
45511	NC_014762	GAA	2	6	2570353	2570358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313683665
45512	NC_014762	AT	3	6	2570376	2570381	50 %	50 %	0 %	0 %	313683665
45513	NC_014762	AG	3	6	2570440	2570445	50 %	0 %	50 %	0 %	313683665
45514	NC_014762	TCG	2	6	2570552	2570557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313683665
45515	NC_014762	ATC	2	6	2570623	2570628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313683665
45516	NC_014762	CCGT	2	8	2570663	2570670	0 %	25 %	25 %	50 %	313683665
45517	NC_014762	T	6	6	2570670	2570675	0 %	100 %	0 %	0 %	313683665
45518	NC_014762	AAT	2	6	2570707	2570712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313683665
45519	NC_014762	ATT	2	6	2570727	2570732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313683665
45520	NC_014762	AGA	2	6	2570793	2570798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313683665
45521	NC_014762	CGATG	2	10	2570817	2570826	20 %	20 %	40 %	20 %	313683665
45522	NC_014762	AAT	2	6	2570834	2570839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313683665
45523	NC_014762	TTA	2	6	2570852	2570857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313683666
45524	NC_014762	AATG	2	8	2570904	2570911	50 %	25 %	25 %	0 %	313683666
45525	NC_014762	CGAAG	2	10	2570926	2570935	40 %	0 %	40 %	20 %	313683666
45526	NC_014762	CGGTT	2	10	2570973	2570982	0 %	40 %	40 %	20 %	313683666
45527	NC_014762	AT	3	6	2571085	2571090	50 %	50 %	0 %	0 %	313683666
45528	NC_014762	ATG	2	6	2571149	2571154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313683666
45529	NC_014762	CT	3	6	2571350	2571355	0 %	50 %	0 %	50 %	313683666
45530	NC_014762	ATC	2	6	2571365	2571370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313683666
45531	NC_014762	TGG	2	6	2571389	2571394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313683666
45532	NC_014762	ATC	2	6	2571544	2571549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313683666
45533	NC_014762	AGA	2	6	2571573	2571578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313683666
45534	NC_014762	A	6	6	2571598	2571603	100 %	0 %	0 %	0 %	313683666
45535	NC_014762	GA	3	6	2571619	2571624	50 %	0 %	50 %	0 %	313683666
45536	NC_014762	G	6	6	2571634	2571639	0 %	0 %	100 %	0 %	313683666
45537	NC_014762	TTGAAT	2	12	2571671	2571682	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313683666
45538	NC_014762	AAT	2	6	2571758	2571763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313683666
45539	NC_014762	GTT	2	6	2572032	2572037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313683667
45540	NC_014762	AT	3	6	2572085	2572090	50 %	50 %	0 %	0 %	313683667
45541	NC_014762	TTA	2	6	2572105	2572110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313683667
45542	NC_014762	CAC	2	6	2572145	2572150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313683667
45543	NC_014762	CA	3	6	2572157	2572162	50 %	0 %	0 %	50 %	313683667
45544	NC_014762	CCGAA	2	10	2572334	2572343	40 %	0 %	20 %	40 %	313683667
45545	NC_014762	AAT	2	6	2572472	2572477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313683667
45546	NC_014762	TTCA	2	8	2572560	2572567	25 %	50 %	0 %	25 %	313683667
45547	NC_014762	CATA	2	8	2572569	2572576	50 %	25 %	0 %	25 %	313683667
45548	NC_014762	TCA	2	6	2572666	2572671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313683667
45549	NC_014762	GAT	2	6	2572685	2572690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313683667
45550	NC_014762	TAA	2	6	2572693	2572698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313683667
45551	NC_014762	TGA	2	6	2572784	2572789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313683667
45552	NC_014762	TTA	2	6	2572828	2572833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313683667
45553	NC_014762	T	6	6	2572932	2572937	0 %	100 %	0 %	0 %	313683667
45554	NC_014762	GAA	2	6	2572952	2572957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313683667
45555	NC_014762	AAT	2	6	2572969	2572974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313683667
45556	NC_014762	CAA	2	6	2573088	2573093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313683667
45557	NC_014762	GA	3	6	2573119	2573124	50 %	0 %	50 %	0 %	313683667
45558	NC_014762	A	6	6	2573129	2573134	100 %	0 %	0 %	0 %	313683667
45559	NC_014762	TA	3	6	2573154	2573159	50 %	50 %	0 %	0 %	313683667
45560	NC_014762	TAA	2	6	2573198	2573203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313683667
45561	NC_014762	CTT	2	6	2573222	2573227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313683667
45562	NC_014762	CTT	2	6	2573282	2573287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313683667
45563	NC_014762	CAAA	2	8	2573454	2573461	75 %	0 %	0 %	25 %	313683667
45564	NC_014762	GAT	2	6	2573483	2573488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313683667
45565	NC_014762	TAG	2	6	2573513	2573518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313683667
45566	NC_014762	T	7	7	2573599	2573605	0 %	100 %	0 %	0 %	313683667
45567	NC_014762	TGA	2	6	2573608	2573613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313683667
45568	NC_014762	AT	4	8	2573726	2573733	50 %	50 %	0 %	0 %	313683667
45569	NC_014762	T	6	6	2573757	2573762	0 %	100 %	0 %	0 %	313683667
45570	NC_014762	CATT	2	8	2573771	2573778	25 %	50 %	0 %	25 %	313683667
45571	NC_014762	T	6	6	2574300	2574305	0 %	100 %	0 %	0 %	313683668
45572	NC_014762	T	7	7	2574308	2574314	0 %	100 %	0 %	0 %	313683668
45573	NC_014762	CATCG	2	10	2574352	2574361	20 %	20 %	20 %	40 %	313683668
45574	NC_014762	CGCTTT	2	12	2574436	2574447	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	313683668
45575	NC_014762	T	6	6	2574460	2574465	0 %	100 %	0 %	0 %	313683668
45576	NC_014762	A	6	6	2574576	2574581	100 %	0 %	0 %	0 %	313683668
45577	NC_014762	ATCG	2	8	2574601	2574608	25 %	25 %	25 %	25 %	313683668
45578	NC_014762	AAC	2	6	2574620	2574625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313683668
45579	NC_014762	T	6	6	2574711	2574716	0 %	100 %	0 %	0 %	313683668
45580	NC_014762	GATC	2	8	2574762	2574769	25 %	25 %	25 %	25 %	313683668
45581	NC_014762	T	7	7	2574783	2574789	0 %	100 %	0 %	0 %	313683668

< Previous12...80818283848586878889909192Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.