MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014623	AGC	2	6	162051	162056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817401
3502	NC_014623	GTCCT	2	10	162122	162131	0 %	40 %	20 %	40 %	310817401
3503	NC_014623	CT	3	6	162130	162135	0 %	50 %	0 %	50 %	310817401
3504	NC_014623	AAG	2	6	162150	162155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817401
3505	NC_014623	TGG	2	6	162177	162182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817401
3506	NC_014623	GGT	2	6	162277	162282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817401
3507	NC_014623	T	8	8	162298	162305	0 %	100 %	0 %	0 %	310817401
3508	NC_014623	CGGA	2	8	162399	162406	25 %	0 %	50 %	25 %	310817402
3509	NC_014623	GGA	2	6	162424	162429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817402
3510	NC_014623	ACCCTC	2	12	162464	162475	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	310817402
3511	NC_014623	CTG	2	6	162491	162496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817402
3512	NC_014623	GGT	2	6	162501	162506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817402
3513	NC_014623	CGG	2	6	162507	162512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817402
3514	NC_014623	GCC	2	6	162542	162547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817402
3515	NC_014623	AGG	2	6	162576	162581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817402
3516	NC_014623	TGC	3	9	162582	162590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817402
3517	NC_014623	CTA	2	6	162610	162615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817402
3518	NC_014623	AGC	2	6	162657	162662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817402
3519	NC_014623	GCC	2	6	162683	162688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817402
3520	NC_014623	CGTC	2	8	162736	162743	0 %	25 %	25 %	50 %	310817402
3521	NC_014623	TGGG	2	8	163027	163034	0 %	25 %	75 %	0 %	310817403
3522	NC_014623	GAT	2	6	163068	163073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817403
3523	NC_014623	CTG	2	6	163084	163089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817403
3524	NC_014623	TC	3	6	163107	163112	0 %	50 %	0 %	50 %	310817403
3525	NC_014623	GAA	2	6	163113	163118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817403
3526	NC_014623	CGC	2	6	163137	163142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817403
3527	NC_014623	CCCT	2	8	163150	163157	0 %	25 %	0 %	75 %	310817403
3528	NC_014623	GGA	2	6	163252	163257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817404
3529	NC_014623	GAC	2	6	163268	163273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817404
3530	NC_014623	CAG	2	6	163279	163284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817404
3531	NC_014623	AGGC	2	8	163313	163320	25 %	0 %	50 %	25 %	310817404
3532	NC_014623	CG	3	6	163325	163330	0 %	0 %	50 %	50 %	310817404
3533	NC_014623	CTG	3	9	163352	163360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817404
3534	NC_014623	GCG	2	6	163393	163398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817404
3535	NC_014623	TG	3	6	163445	163450	0 %	50 %	50 %	0 %	310817404
3536	NC_014623	CTG	2	6	163529	163534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817404
3537	NC_014623	GTC	2	6	163567	163572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817404
3538	NC_014623	ACC	2	6	163595	163600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817404
3539	NC_014623	CACCC	2	10	163607	163616	20 %	0 %	0 %	80 %	310817404
3540	NC_014623	G	6	6	163708	163713	0 %	0 %	100 %	0 %	310817404
3541	NC_014623	C	6	6	163714	163719	0 %	0 %	0 %	100 %	310817404
3542	NC_014623	CA	3	6	163743	163748	50 %	0 %	0 %	50 %	310817404
3543	NC_014623	CTT	2	6	163754	163759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817404
3544	NC_014623	GCAG	2	8	163762	163769	25 %	0 %	50 %	25 %	310817404
3545	NC_014623	TCC	2	6	163781	163786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817404
3546	NC_014623	TGGA	2	8	163787	163794	25 %	25 %	50 %	0 %	310817404
3547	NC_014623	GAAC	2	8	163803	163810	50 %	0 %	25 %	25 %	310817404
3548	NC_014623	CCA	2	6	163891	163896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817404
3549	NC_014623	CGTC	2	8	163919	163926	0 %	25 %	25 %	50 %	310817404
3550	NC_014623	ACG	2	6	164218	164223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817404
3551	NC_014623	T	6	6	164234	164239	0 %	100 %	0 %	0 %	310817404
3552	NC_014623	AGG	2	6	164496	164501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817405
3553	NC_014623	CGA	2	6	164562	164567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817405
3554	NC_014623	C	6	6	164619	164624	0 %	0 %	0 %	100 %	310817405
3555	NC_014623	GGTTGT	2	12	164629	164640	0 %	50 %	50 %	0 %	310817405
3556	NC_014623	GCCA	2	8	164689	164696	25 %	0 %	25 %	50 %	310817405
3557	NC_014623	ACCAA	2	10	164732	164741	60 %	0 %	0 %	40 %	310817405
3558	NC_014623	TTC	2	6	164744	164749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817405
3559	NC_014623	ATG	2	6	164753	164758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817405
3560	NC_014623	C	6	6	164759	164764	0 %	0 %	0 %	100 %	310817405
3561	NC_014623	GTT	2	6	164887	164892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817405
3562	NC_014623	ATTG	2	8	164935	164942	25 %	50 %	25 %	0 %	310817405
3563	NC_014623	ACC	2	6	164953	164958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817405
3564	NC_014623	ATG	2	6	164964	164969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817405
3565	NC_014623	CGG	2	6	165408	165413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817406
3566	NC_014623	GGT	2	6	165417	165422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817406
3567	NC_014623	ACGGC	2	10	165462	165471	20 %	0 %	40 %	40 %	310817406
3568	NC_014623	TCC	2	6	165506	165511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817406
3569	NC_014623	CGAG	2	8	165525	165532	25 %	0 %	50 %	25 %	310817406
3570	NC_014623	GAAG	2	8	165588	165595	50 %	0 %	50 %	0 %	310817406
3571	NC_014623	GAG	2	6	165681	165686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817406
3572	NC_014623	CCGGC	2	10	165718	165727	0 %	0 %	40 %	60 %	310817406
3573	NC_014623	CGGG	2	8	165830	165837	0 %	0 %	75 %	25 %	310817406
3574	NC_014623	TCC	2	6	165850	165855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817406
3575	NC_014623	CG	3	6	165896	165901	0 %	0 %	50 %	50 %	310817406
3576	NC_014623	GGGC	3	12	165905	165916	0 %	0 %	75 %	25 %	310817406
3577	NC_014623	GGT	2	6	165934	165939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817406
3578	NC_014623	GAT	2	6	165952	165957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817406
3579	NC_014623	CCA	2	6	165996	166001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817406
3580	NC_014623	TCT	2	6	166023	166028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817406
3581	NC_014623	G	6	6	166092	166097	0 %	0 %	100 %	0 %	310817406
3582	NC_014623	GCT	2	6	166140	166145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817406
3583	NC_014623	TCC	2	6	166151	166156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817406
3584	NC_014623	CGA	2	6	166164	166169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817406
3585	NC_014623	TCC	2	6	166178	166183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817406
3586	NC_014623	CCA	2	6	166251	166256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817406
3587	NC_014623	GCTTCT	2	12	166272	166283	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	310817406
3588	NC_014623	CCT	2	6	166362	166367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817406
3589	NC_014623	TCT	2	6	166389	166394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817406
3590	NC_014623	G	6	6	166425	166430	0 %	0 %	100 %	0 %	310817406
3591	NC_014623	CAG	2	6	166435	166440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817406
3592	NC_014623	GCG	2	6	166484	166489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817406
3593	NC_014623	CGG	2	6	166497	166502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817406
3594	NC_014623	G	6	6	166536	166541	0 %	0 %	100 %	0 %	310817406
3595	NC_014623	CCTC	2	8	166741	166748	0 %	25 %	0 %	75 %	310817407
3596	NC_014623	GAG	2	6	166768	166773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817407
3597	NC_014623	C	6	6	166780	166785	0 %	0 %	0 %	100 %	310817407
3598	NC_014623	GAG	2	6	166861	166866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817407
3599	NC_014623	GCA	2	6	166908	166913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817407
3600	NC_014623	GC	3	6	166945	166950	0 %	0 %	50 %	50 %	310817407
3601	NC_014623	TCA	2	6	167018	167023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817407
3602	NC_014623	GCT	2	6	167094	167099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817407
3603	NC_014623	CTG	2	6	167231	167236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817408
3604	NC_014623	CGC	3	9	167266	167274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817408
3605	NC_014623	CCG	2	6	167283	167288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817408
3606	NC_014623	CG	3	6	167334	167339	0 %	0 %	50 %	50 %	310817408
3607	NC_014623	CGG	2	6	167361	167366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817408
3608	NC_014623	G	6	6	167405	167410	0 %	0 %	100 %	0 %	310817408
3609	NC_014623	GAC	2	6	167509	167514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817408
3610	NC_014623	ACGTGC	2	12	167655	167666	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310817408
3611	NC_014623	CTC	2	6	167713	167718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817408
3612	NC_014623	GGT	2	6	167755	167760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817408
3613	NC_014623	GACGC	2	10	167762	167771	20 %	0 %	40 %	40 %	310817408
3614	NC_014623	AGG	2	6	167868	167873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817408
3615	NC_014623	GCT	2	6	167875	167880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817408
3616	NC_014623	GC	3	6	167882	167887	0 %	0 %	50 %	50 %	310817408
3617	NC_014623	ACC	2	6	167889	167894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817408
3618	NC_014623	ACGGC	2	10	167991	168000	20 %	0 %	40 %	40 %	310817408
3619	NC_014623	GC	3	6	168018	168023	0 %	0 %	50 %	50 %	310817408
3620	NC_014623	CGG	2	6	168057	168062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817408
3621	NC_014623	CGG	2	6	168081	168086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817408
3622	NC_014623	GCTG	2	8	168102	168109	0 %	25 %	50 %	25 %	310817408
3623	NC_014623	CGA	2	6	168133	168138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817408
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3746	NC_014623	GCTGGA	2	12	172626	172637	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310817413
3747	NC_014623	GGC	2	6	172638	172643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817413
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3752	NC_014623	TGG	2	6	172727	172732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817413
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3850	NC_014623	GTC	2	6	176474	176479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817417
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3857	NC_014623	CCTG	2	8	176826	176833	0 %	25 %	25 %	50 %	310817417
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3864	NC_014623	TCG	2	6	177153	177158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817417
3865	NC_014623	TCA	2	6	177162	177167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817417
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3988	NC_014623	GGA	2	6	183014	183019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817423
3989	NC_014623	GGT	2	6	183066	183071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817423
3990	NC_014623	AGCGCC	2	12	183085	183096	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310817423
3991	NC_014623	GAC	2	6	183126	183131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817423
3992	NC_014623	TGCG	2	8	183169	183176	0 %	25 %	50 %	25 %	310817423
3993	NC_014623	GCCA	2	8	183288	183295	25 %	0 %	25 %	50 %	310817423
3994	NC_014623	GGT	2	6	183340	183345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817424
3995	NC_014623	G	6	6	183366	183371	0 %	0 %	100 %	0 %	310817424
3996	NC_014623	CTG	3	9	183394	183402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817424
3997	NC_014623	TCG	2	6	183461	183466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817424
3998	NC_014623	CGC	2	6	183472	183477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817424
3999	NC_014623	GGCG	2	8	183538	183545	0 %	0 %	75 %	25 %	310817424
4000	NC_014623	CGC	2	6	183559	183564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817424

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