MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014623	TGC	2	6	115009	115014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817362
2502	NC_014623	AGGA	2	8	115029	115036	50 %	0 %	50 %	0 %	310817362
2503	NC_014623	GAC	2	6	115091	115096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817362
2504	NC_014623	CGT	2	6	115108	115113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817362
2505	NC_014623	ACG	2	6	115155	115160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817362
2506	NC_014623	GTCT	2	8	115225	115232	0 %	50 %	25 %	25 %	310817362
2507	NC_014623	GAAGT	2	10	115276	115285	40 %	20 %	40 %	0 %	310817362
2508	NC_014623	AGG	2	6	115709	115714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817363
2509	NC_014623	ACG	2	6	115788	115793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817363
2510	NC_014623	GCT	2	6	115805	115810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817363
2511	NC_014623	CTG	2	6	115818	115823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817363
2512	NC_014623	GGC	2	6	115824	115829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817363
2513	NC_014623	GA	3	6	115837	115842	50 %	0 %	50 %	0 %	310817363
2514	NC_014623	C	6	6	115855	115860	0 %	0 %	0 %	100 %	310817363
2515	NC_014623	GGA	2	6	115952	115957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817363
2516	NC_014623	GT	3	6	116095	116100	0 %	50 %	50 %	0 %	310817363
2517	NC_014623	ACCTGG	2	12	116101	116112	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310817363
2518	NC_014623	CTT	2	6	116114	116119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817363
2519	NC_014623	TGG	2	6	116173	116178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817363
2520	NC_014623	GCCAAC	2	12	116256	116267	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310817363
2521	NC_014623	CAG	3	9	116331	116339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817363
2522	NC_014623	GGA	2	6	116366	116371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817363
2523	NC_014623	GAC	2	6	116400	116405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817363
2524	NC_014623	CGGG	2	8	116418	116425	0 %	0 %	75 %	25 %	310817363
2525	NC_014623	GTG	2	6	116433	116438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817363
2526	NC_014623	CCG	2	6	116486	116491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817363
2527	NC_014623	GCG	2	6	116556	116561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817364
2528	NC_014623	GGCC	2	8	116562	116569	0 %	0 %	50 %	50 %	310817364
2529	NC_014623	CTCC	2	8	116607	116614	0 %	25 %	0 %	75 %	310817364
2530	NC_014623	CCA	2	6	116625	116630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817364
2531	NC_014623	AGC	2	6	116634	116639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817364
2532	NC_014623	CGC	2	6	116640	116645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817364
2533	NC_014623	CAC	2	6	116668	116673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817364
2534	NC_014623	GGA	2	6	116718	116723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817364
2535	NC_014623	TGA	2	6	116738	116743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817364
2536	NC_014623	CCTT	2	8	116744	116751	0 %	50 %	0 %	50 %	310817364
2537	NC_014623	GCC	2	6	116757	116762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817364
2538	NC_014623	GCG	2	6	116773	116778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817364
2539	NC_014623	TTG	2	6	116792	116797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817364
2540	NC_014623	G	7	7	116839	116845	0 %	0 %	100 %	0 %	310817364
2541	NC_014623	CCCGTC	2	12	117005	117016	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	310817365
2542	NC_014623	AGGA	2	8	117017	117024	50 %	0 %	50 %	0 %	310817365
2543	NC_014623	CGA	2	6	117052	117057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817365
2544	NC_014623	G	6	6	117059	117064	0 %	0 %	100 %	0 %	310817365
2545	NC_014623	GAG	2	6	117108	117113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817365
2546	NC_014623	TCAA	2	8	117263	117270	50 %	25 %	0 %	25 %	310817366
2547	NC_014623	GC	3	6	117391	117396	0 %	0 %	50 %	50 %	310817366
2548	NC_014623	TCG	2	6	117426	117431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817366
2549	NC_014623	GCCATG	2	12	117448	117459	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310817366
2550	NC_014623	GGC	2	6	117469	117474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817366
2551	NC_014623	CGT	2	6	117487	117492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817366
2552	NC_014623	CGG	2	6	117504	117509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817366
2553	NC_014623	TCG	2	6	117525	117530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817366
2554	NC_014623	GAA	2	6	117532	117537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817366
2555	NC_014623	GTG	2	6	117542	117547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817366
2556	NC_014623	GCA	2	6	117561	117566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817366
2557	NC_014623	GC	3	6	117567	117572	0 %	0 %	50 %	50 %	310817366
2558	NC_014623	GGTG	2	8	117591	117598	0 %	25 %	75 %	0 %	310817366
2559	NC_014623	CGG	3	9	117615	117623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817366
2560	NC_014623	GTT	2	6	117796	117801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817366
2561	NC_014623	CGG	3	9	117843	117851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817366
2562	NC_014623	CAG	2	6	117856	117861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817366
2563	NC_014623	CAG	2	6	117880	117885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817366
2564	NC_014623	CAT	2	6	118428	118433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817367
2565	NC_014623	TCC	2	6	118478	118483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817367
2566	NC_014623	GGCG	2	8	118487	118494	0 %	0 %	75 %	25 %	310817367
2567	NC_014623	CGC	4	12	118509	118520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817367
2568	NC_014623	CCT	2	6	118524	118529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817367
2569	NC_014623	CCGTCG	2	12	118538	118549	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310817367
2570	NC_014623	ACA	2	6	118601	118606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817367
2571	NC_014623	CGCA	2	8	118719	118726	25 %	0 %	25 %	50 %	310817367
2572	NC_014623	ACC	3	9	118753	118761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817367
2573	NC_014623	GCGA	2	8	118807	118814	25 %	0 %	50 %	25 %	310817367
2574	NC_014623	ACG	2	6	118831	118836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817367
2575	NC_014623	GAGC	2	8	118848	118855	25 %	0 %	50 %	25 %	310817367
2576	NC_014623	CAA	2	6	118881	118886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817367
2577	NC_014623	CGAT	2	8	118892	118899	25 %	25 %	25 %	25 %	310817367
2578	NC_014623	GCG	2	6	119105	119110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817367
2579	NC_014623	GGT	2	6	119121	119126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817367
2580	NC_014623	ACA	2	6	119141	119146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817367
2581	NC_014623	CGAT	2	8	119162	119169	25 %	25 %	25 %	25 %	310817367
2582	NC_014623	TCG	2	6	119234	119239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817367
2583	NC_014623	CAT	3	9	119259	119267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817367
2584	NC_014623	AAC	2	6	119281	119286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817367
2585	NC_014623	AAC	2	6	119299	119304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817367
2586	NC_014623	ATC	2	6	119308	119313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817367
2587	NC_014623	CAT	2	6	119340	119345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817367
2588	NC_014623	CGC	2	6	119367	119372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817367
2589	NC_014623	ACA	2	6	119480	119485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817367
2590	NC_014623	GGC	2	6	119512	119517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817367
2591	NC_014623	ACA	2	6	119606	119611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817367
2592	NC_014623	TCG	2	6	119648	119653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817367
2593	NC_014623	AAC	2	6	119740	119745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817367
2594	NC_014623	GACATG	3	18	119749	119766	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310817367
2595	NC_014623	TGGG	2	8	120203	120210	0 %	25 %	75 %	0 %	310817368
2596	NC_014623	GAT	2	6	120244	120249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817368
2597	NC_014623	CTG	2	6	120260	120265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817368
2598	NC_014623	GGAT	2	8	120271	120278	25 %	25 %	50 %	0 %	310817368
2599	NC_014623	GCC	2	6	120356	120361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817368
2600	NC_014623	TTGA	2	8	120368	120375	25 %	50 %	25 %	0 %	310817368
2601	NC_014623	GCA	2	6	120376	120381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817368
2602	NC_014623	GCC	2	6	120387	120392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817368
2603	NC_014623	GTG	2	6	120443	120448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817368
2604	NC_014623	GA	3	6	120476	120481	50 %	0 %	50 %	0 %	310817368
2605	NC_014623	GCT	2	6	120487	120492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817368
2606	NC_014623	GA	3	6	120516	120521	50 %	0 %	50 %	0 %	310817368
2607	NC_014623	CTG	2	6	120533	120538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817368
2608	NC_014623	GCG	2	6	120539	120544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817368
2609	NC_014623	CAG	2	6	120551	120556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817368
2610	NC_014623	GGC	2	6	120610	120615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817368
2611	NC_014623	AGC	2	6	120673	120678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817368
2612	NC_014623	CG	3	6	120680	120685	0 %	0 %	50 %	50 %	310817368
2613	NC_014623	GCT	3	9	120706	120714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817368
2614	NC_014623	CGG	2	6	120749	120754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817368
2615	NC_014623	GCC	2	6	120818	120823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817368
2616	NC_014623	GCGA	2	8	120869	120876	25 %	0 %	50 %	25 %	310817368
2617	NC_014623	GTC	2	6	120922	120927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817368
2618	NC_014623	CACCC	2	10	120962	120971	20 %	0 %	0 %	80 %	310817368
2619	NC_014623	GCC	2	6	121054	121059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817368
2620	NC_014623	G	6	6	121063	121068	0 %	0 %	100 %	0 %	310817368
2621	NC_014623	C	6	6	121069	121074	0 %	0 %	0 %	100 %	310817368
2622	NC_014623	GCAG	2	8	121236	121243	25 %	0 %	50 %	25 %	310817368
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2987	NC_014623	GCC	2	6	138479	138484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817383
2988	NC_014623	GGA	2	6	138487	138492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817383
2989	NC_014623	C	6	6	138554	138559	0 %	0 %	0 %	100 %	310817383
2990	NC_014623	GGT	2	6	138574	138579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817383
2991	NC_014623	GGCG	2	8	140554	140561	0 %	0 %	75 %	25 %	310817384
2992	NC_014623	GCCCG	2	10	140680	140689	0 %	0 %	40 %	60 %	310817384
2993	NC_014623	CCG	2	6	140699	140704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817384
2994	NC_014623	CTC	2	6	140711	140716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817384
2995	NC_014623	CAT	2	6	140744	140749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817384
2996	NC_014623	GCC	2	6	140802	140807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817384
2997	NC_014623	CGT	2	6	140830	140835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817384
2998	NC_014623	CTC	2	6	140837	140842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817384
2999	NC_014623	TCG	2	6	140880	140885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817384
3000	NC_014623	CCA	3	9	140887	140895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817384

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