MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_014623	GC	3	6	936090	936095	0 %	0 %	50 %	50 %	310818047
21002	NC_014623	CCG	2	6	936160	936165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818047
21003	NC_014623	CGAGC	2	10	936167	936176	20 %	0 %	40 %	40 %	310818047
21004	NC_014623	AGC	2	6	936189	936194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310818047
21005	NC_014623	GGCG	2	8	936211	936218	0 %	0 %	75 %	25 %	310818047
21006	NC_014623	CCT	2	6	936250	936255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310818047
21007	NC_014623	GAT	2	6	936341	936346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310818047
21008	NC_014623	GTT	2	6	936458	936463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310818047
21009	NC_014623	CCA	2	6	936484	936489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310818047
21010	NC_014623	GCA	2	6	936496	936501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310818047
21011	NC_014623	GCC	2	6	936504	936509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818047
21012	NC_014623	CCT	2	6	936535	936540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310818047
21013	NC_014623	GCAC	2	8	936549	936556	25 %	0 %	25 %	50 %	310818047
21014	NC_014623	TCATCT	2	12	936739	936750	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310818047
21015	NC_014623	GTC	2	6	937079	937084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818048
21016	NC_014623	TGC	2	6	937098	937103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818048
21017	NC_014623	G	6	6	937150	937155	0 %	0 %	100 %	0 %	310818048
21018	NC_014623	GAA	2	6	937228	937233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310818048
21019	NC_014623	GTG	2	6	937241	937246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310818048
21020	NC_014623	AAG	2	6	937247	937252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310818048
21021	NC_014623	GGC	2	6	937345	937350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310818048
21022	NC_014623	GGC	2	6	937396	937401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310818048
21023	NC_014623	TGG	2	6	937407	937412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310818048
21024	NC_014623	CGC	2	6	937435	937440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818048
21025	NC_014623	GC	3	6	937454	937459	0 %	0 %	50 %	50 %	310818048
21026	NC_014623	GCC	2	6	937553	937558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818048
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21028	NC_014623	CAG	2	6	937570	937575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310818048
21029	NC_014623	CAG	3	9	937586	937594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310818048
21030	NC_014623	CG	3	6	937619	937624	0 %	0 %	50 %	50 %	310818048
21031	NC_014623	CAGGCC	2	12	937634	937645	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310818048
21032	NC_014623	CCG	3	9	937662	937670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818048
21033	NC_014623	GGC	2	6	937672	937677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310818048
21034	NC_014623	TGG	2	6	937698	937703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310818048
21035	NC_014623	TCG	2	6	937737	937742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818048
21036	NC_014623	TCT	2	6	937749	937754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310818048
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21038	NC_014623	GCTGCC	2	12	937768	937779	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310818048
21039	NC_014623	GC	3	6	937793	937798	0 %	0 %	50 %	50 %	310818048
21040	NC_014623	GCC	3	9	937853	937861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818048
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21047	NC_014623	CCG	2	6	938199	938204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818049
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21050	NC_014623	GGGC	2	8	938328	938335	0 %	0 %	75 %	25 %	310818049
21051	NC_014623	CAG	2	6	938368	938373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310818049
21052	NC_014623	CTT	2	6	938415	938420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310818049
21053	NC_014623	CTGC	2	8	938433	938440	0 %	25 %	25 %	50 %	310818049
21054	NC_014623	GAG	2	6	938455	938460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310818049
21055	NC_014623	CG	3	6	938461	938466	0 %	0 %	50 %	50 %	310818049
21056	NC_014623	GCT	2	6	938472	938477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818049
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21060	NC_014623	TGC	3	9	938585	938593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818049
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21065	NC_014623	CG	3	6	938825	938830	0 %	0 %	50 %	50 %	310818049
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21088	NC_014623	GC	4	8	939628	939635	0 %	0 %	50 %	50 %	310818050
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21105	NC_014623	CGC	2	6	940213	940218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818051
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21120	NC_014623	GC	3	6	940604	940609	0 %	0 %	50 %	50 %	310818051
21121	NC_014623	AGC	2	6	940632	940637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310818051
21122	NC_014623	GCT	2	6	940681	940686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818051
21123	NC_014623	GCT	2	6	940777	940782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818051
21124	NC_014623	CT	3	6	940792	940797	0 %	50 %	0 %	50 %	310818051
21125	NC_014623	CTGTTC	2	12	940799	940810	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	310818051
21126	NC_014623	TGG	2	6	940860	940865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310818051
21127	NC_014623	TGC	2	6	940893	940898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818051
21128	NC_014623	ACA	2	6	940935	940940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310818051
21129	NC_014623	CTG	2	6	941012	941017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818051
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21131	NC_014623	TGG	2	6	941082	941087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310818051
21132	NC_014623	CGT	2	6	941091	941096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818051
21133	NC_014623	GCG	2	6	941110	941115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310818051
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21139	NC_014623	GCGCC	2	10	941396	941405	0 %	0 %	40 %	60 %	310818052
21140	NC_014623	GCC	2	6	941421	941426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818052
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21142	NC_014623	TCC	2	6	941473	941478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310818052
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21144	NC_014623	CGG	2	6	941515	941520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310818052
21145	NC_014623	TGG	2	6	941533	941538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310818052
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21152	NC_014623	CTA	2	6	941696	941701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310818052
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21236	NC_014623	CGC	2	6	944931	944936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818054
21237	NC_014623	CCA	2	6	945042	945047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310818054
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21239	NC_014623	GAC	2	6	945094	945099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310818054
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21358	NC_014623	TTC	2	6	949292	949297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310818057
21359	NC_014623	TCG	2	6	949316	949321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818057
21360	NC_014623	TCC	2	6	949349	949354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310818057
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21362	NC_014623	GCT	2	6	949473	949478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818057
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21476	NC_014623	CAC	2	6	954487	954492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310818061
21477	NC_014623	GCC	2	6	954493	954498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818061
21478	NC_014623	ATG	2	6	954530	954535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310818061
21479	NC_014623	GAC	2	6	954553	954558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310818061
21480	NC_014623	TGA	2	6	954594	954599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310818061
21481	NC_014623	GCG	2	6	954613	954618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310818061
21482	NC_014623	GCT	2	6	954621	954626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310818061
21483	NC_014623	GAT	2	6	954691	954696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310818061
21484	NC_014623	TGCGGC	2	12	954702	954713	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310818061
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21486	NC_014623	TGA	2	6	954762	954767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310818061
21487	NC_014623	CAC	2	6	954787	954792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310818061
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21491	NC_014623	CG	3	6	955074	955079	0 %	0 %	50 %	50 %	310818061
21492	NC_014623	CCG	2	6	955092	955097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310818061
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21497	NC_014623	CGA	2	6	955278	955283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310818061
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21499	NC_014623	GC	3	6	955476	955481	0 %	0 %	50 %	50 %	310818062
21500	NC_014623	GCG	3	9	955491	955499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310818062

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