MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
183001	NC_014623	CTG	2	6	8006154	8006159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823761
183002	NC_014623	CCT	2	6	8006198	8006203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310823761
183003	NC_014623	TGC	2	6	8006221	8006226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823761
183004	NC_014623	TGGG	2	8	8006317	8006324	0 %	25 %	75 %	0 %	310823762
183005	NC_014623	TGC	2	6	8006336	8006341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823762
183006	NC_014623	TGC	2	6	8006362	8006367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823762
183007	NC_014623	TGG	2	6	8006394	8006399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310823762
183008	NC_014623	CAC	2	6	8006469	8006474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823762
183009	NC_014623	CCT	2	6	8006510	8006515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310823762
183010	NC_014623	CGC	2	6	8006520	8006525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310823762
183011	NC_014623	GCT	2	6	8006595	8006600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823762
183012	NC_014623	TGG	2	6	8006669	8006674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310823762
183013	NC_014623	TCC	2	6	8006681	8006686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310823762
183014	NC_014623	GTG	2	6	8006692	8006697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310823762
183015	NC_014623	CGT	2	6	8006703	8006708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823762
183016	NC_014623	CGG	2	6	8006714	8006719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310823762
183017	NC_014623	GCT	2	6	8006730	8006735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823762
183018	NC_014623	GGC	2	6	8006751	8006756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310823762
183019	NC_014623	G	6	6	8006804	8006809	0 %	0 %	100 %	0 %	310823762
183020	NC_014623	TCA	2	6	8006810	8006815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310823762
183021	NC_014623	CGC	2	6	8006817	8006822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310823762
183022	NC_014623	GC	3	6	8006895	8006900	0 %	0 %	50 %	50 %	310823762
183023	NC_014623	CGAGCG	2	12	8006901	8006912	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310823762
183024	NC_014623	GAG	2	6	8006932	8006937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310823762
183025	NC_014623	CAGGC	2	10	8007067	8007076	20 %	0 %	40 %	40 %	310823763
183026	NC_014623	AAG	2	6	8007091	8007096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310823763
183027	NC_014623	CCCCAC	2	12	8007180	8007191	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	310823763
183028	NC_014623	CCT	2	6	8007258	8007263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310823763
183029	NC_014623	CTG	2	6	8007277	8007282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823763
183030	NC_014623	CTG	2	6	8007295	8007300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823763
183031	NC_014623	CAC	2	6	8007333	8007338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823763
183032	NC_014623	CAG	2	6	8007352	8007357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310823763
183033	NC_014623	GTG	2	6	8007376	8007381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310823763
183034	NC_014623	CTT	2	6	8007390	8007395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310823763
183035	NC_014623	GTC	2	6	8007418	8007423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823763
183036	NC_014623	GCCCC	2	10	8007440	8007449	0 %	0 %	20 %	80 %	310823763
183037	NC_014623	AAC	2	6	8007454	8007459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310823763
183038	NC_014623	GAC	2	6	8007487	8007492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310823763
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183040	NC_014623	CGCC	2	8	8007627	8007634	0 %	0 %	25 %	75 %	310823763
183041	NC_014623	GCCA	2	8	8007688	8007695	25 %	0 %	25 %	50 %	310823763
183042	NC_014623	TGG	2	6	8007719	8007724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310823763
183043	NC_014623	CGGGTG	2	12	8007751	8007762	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	310823763
183044	NC_014623	GCG	2	6	8007816	8007821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310823763
183045	NC_014623	GCT	2	6	8007828	8007833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823763
183046	NC_014623	GCC	2	6	8007979	8007984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310823763
183047	NC_014623	GGC	2	6	8007987	8007992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310823763
183048	NC_014623	GCC	2	6	8007996	8008001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310823763
183049	NC_014623	CAA	2	6	8008134	8008139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310823763
183050	NC_014623	AGC	2	6	8008154	8008159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310823763
183051	NC_014623	CCA	2	6	8008175	8008180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823763
183052	NC_014623	GAT	2	6	8008201	8008206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310823763
183053	NC_014623	CGG	2	6	8008308	8008313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310823763
183054	NC_014623	CGCC	2	8	8008338	8008345	0 %	0 %	25 %	75 %	310823763
183055	NC_014623	TCACCC	2	12	8008415	8008426	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	310823763
183056	NC_014623	GGC	2	6	8008432	8008437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310823763
183057	NC_014623	CGCTC	2	10	8008488	8008497	0 %	20 %	20 %	60 %	310823763
183058	NC_014623	GTG	2	6	8008645	8008650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310823764
183059	NC_014623	CTC	2	6	8008652	8008657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310823764
183060	NC_014623	CCG	2	6	8008697	8008702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310823764
183061	NC_014623	GCTG	2	8	8008706	8008713	0 %	25 %	50 %	25 %	310823764
183062	NC_014623	CG	3	6	8008797	8008802	0 %	0 %	50 %	50 %	310823764
183063	NC_014623	AAG	2	6	8008834	8008839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310823764
183064	NC_014623	CAG	2	6	8008888	8008893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310823764
183065	NC_014623	CCA	2	6	8008973	8008978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823764
183066	NC_014623	ACCCTG	2	12	8008990	8009001	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310823764
183067	NC_014623	GCG	2	6	8009013	8009018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310823764
183068	NC_014623	GCC	2	6	8009100	8009105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310823764
183069	NC_014623	CGG	2	6	8009117	8009122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310823764
183070	NC_014623	TGG	2	6	8009155	8009160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310823764
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183073	NC_014623	TCA	2	6	8009267	8009272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310823764
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183078	NC_014623	GGC	2	6	8009433	8009438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310823764
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183080	NC_014623	GTG	2	6	8009506	8009511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310823764
183081	NC_014623	CGC	3	9	8009528	8009536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310823764
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183083	NC_014623	CGT	2	6	8009571	8009576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823764
183084	NC_014623	CAC	2	6	8009607	8009612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823764
183085	NC_014623	GCAC	2	8	8009621	8009628	25 %	0 %	25 %	50 %	310823764
183086	NC_014623	GCG	2	6	8009636	8009641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310823764
183087	NC_014623	TCG	2	6	8009654	8009659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823764
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183095	NC_014623	TGGGCG	2	12	8010125	8010136	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	310823764
183096	NC_014623	CAT	2	6	8010150	8010155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310823764
183097	NC_014623	TGA	2	6	8010261	8010266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310823765
183098	NC_014623	GC	3	6	8010287	8010292	0 %	0 %	50 %	50 %	310823765
183099	NC_014623	TCG	2	6	8010341	8010346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823765
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183101	NC_014623	CTC	2	6	8010436	8010441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310823765
183102	NC_014623	CTC	2	6	8010454	8010459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310823765
183103	NC_014623	CCG	2	6	8010468	8010473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310823765
183104	NC_014623	CG	4	8	8010493	8010500	0 %	0 %	50 %	50 %	310823765
183105	NC_014623	TCG	2	6	8010542	8010547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823765
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183108	NC_014623	GAA	2	6	8010670	8010675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310823765
183109	NC_014623	ATG	2	6	8010728	8010733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310823765
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183111	NC_014623	CCA	2	6	8010757	8010762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823765
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183113	NC_014623	CTT	2	6	8010805	8010810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310823765
183114	NC_014623	CCT	2	6	8010837	8010842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310823765
183115	NC_014623	GGT	2	6	8010873	8010878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310823765
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183125	NC_014623	TC	3	6	8011466	8011471	0 %	50 %	0 %	50 %	310823766
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183341	NC_014623	CGA	2	6	8019840	8019845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310823770
183342	NC_014623	CCT	2	6	8019862	8019867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310823770
183343	NC_014623	GCCG	2	8	8019945	8019952	0 %	0 %	50 %	50 %	310823770
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183345	NC_014623	TCG	2	6	8020249	8020254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823770
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