MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
163001	NC_014623	GCC	2	6	7139162	7139167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310823019
163002	NC_014623	ACC	2	6	7139169	7139174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823019
163003	NC_014623	AGGG	2	8	7139208	7139215	25 %	0 %	75 %	0 %	310823019
163004	NC_014623	CGG	2	6	7139257	7139262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310823019
163005	NC_014623	AGC	2	6	7139378	7139383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310823019
163006	NC_014623	AGC	2	6	7139432	7139437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310823019
163007	NC_014623	GAA	2	6	7139452	7139457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310823019
163008	NC_014623	CGG	2	6	7139458	7139463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310823019
163009	NC_014623	AGG	2	6	7139581	7139586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310823020
163010	NC_014623	AGC	2	6	7139632	7139637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310823020
163011	NC_014623	CCA	2	6	7139646	7139651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823020
163012	NC_014623	CCA	8	24	7139655	7139678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823020
163013	NC_014623	CCA	5	15	7139682	7139696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823020
163014	NC_014623	CCA	4	12	7139700	7139711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823020
163015	NC_014623	CCA	2	6	7139715	7139720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823020
163016	NC_014623	GC	3	6	7139740	7139745	0 %	0 %	50 %	50 %	310823020
163017	NC_014623	CCAC	2	8	7139751	7139758	25 %	0 %	0 %	75 %	310823020
163018	NC_014623	GTT	2	6	7139804	7139809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310823020
163019	NC_014623	TCT	3	9	7139863	7139871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310823020
163020	NC_014623	TGA	2	6	7139872	7139877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310823020
163021	NC_014623	CTTGAT	2	12	7139885	7139896	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	310823020
163022	NC_014623	TGC	2	6	7139962	7139967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823020
163023	NC_014623	CCG	2	6	7140061	7140066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310823020
163024	NC_014623	GGT	2	6	7140119	7140124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310823020
163025	NC_014623	CCGTCA	2	12	7140172	7140183	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310823020
163026	NC_014623	ATG	2	6	7140195	7140200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310823020
163027	NC_014623	GC	3	6	7140360	7140365	0 %	0 %	50 %	50 %	310823020
163028	NC_014623	AGC	2	6	7140366	7140371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310823020
163029	NC_014623	GCCC	2	8	7140488	7140495	0 %	0 %	25 %	75 %	310823020
163030	NC_014623	GTT	2	6	7140503	7140508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310823020
163031	NC_014623	CGT	2	6	7140517	7140522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823020
163032	NC_014623	CGGGTC	2	12	7140647	7140658	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310823020
163033	NC_014623	GTG	2	6	7140675	7140680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310823020
163034	NC_014623	TGAT	2	8	7140711	7140718	25 %	50 %	25 %	0 %	310823020
163035	NC_014623	CAC	2	6	7140734	7140739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823020
163036	NC_014623	CAT	2	6	7140769	7140774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310823020
163037	NC_014623	ACGA	2	8	7140794	7140801	50 %	0 %	25 %	25 %	310823020
163038	NC_014623	CAAT	2	8	7140847	7140854	50 %	25 %	0 %	25 %	310823020
163039	NC_014623	TGGGG	2	10	7140880	7140889	0 %	20 %	80 %	0 %	310823020
163040	NC_014623	TGA	2	6	7141180	7141185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310823021
163041	NC_014623	TTGT	2	8	7141197	7141204	0 %	75 %	25 %	0 %	310823021
163042	NC_014623	CAG	2	6	7141210	7141215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310823021
163043	NC_014623	CCG	2	6	7141264	7141269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310823021
163044	NC_014623	CG	3	6	7141284	7141289	0 %	0 %	50 %	50 %	310823021
163045	NC_014623	GACA	2	8	7141360	7141367	50 %	0 %	25 %	25 %	310823021
163046	NC_014623	C	7	7	7141375	7141381	0 %	0 %	0 %	100 %	310823021
163047	NC_014623	CAA	2	6	7141445	7141450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310823021
163048	NC_014623	A	6	6	7141500	7141505	100 %	0 %	0 %	0 %	310823021
163049	NC_014623	AATCA	2	10	7141557	7141566	60 %	20 %	0 %	20 %	310823021
163050	NC_014623	CCA	2	6	7141631	7141636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823021
163051	NC_014623	ACC	2	6	7141722	7141727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823021
163052	NC_014623	CCG	2	6	7141762	7141767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310823021
163053	NC_014623	AAC	2	6	7141776	7141781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310823021
163054	NC_014623	GAG	2	6	7141875	7141880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310823021
163055	NC_014623	CG	3	6	7141887	7141892	0 %	0 %	50 %	50 %	310823021
163056	NC_014623	G	6	6	7142066	7142071	0 %	0 %	100 %	0 %	310823021
163057	NC_014623	CAG	2	6	7142130	7142135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310823021
163058	NC_014623	GAA	2	6	7142147	7142152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310823021
163059	NC_014623	GGCCT	2	10	7142199	7142208	0 %	20 %	40 %	40 %	310823021
163060	NC_014623	CGG	2	6	7142243	7142248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310823021
163061	NC_014623	GGCC	2	8	7142400	7142407	0 %	0 %	50 %	50 %	310823021
163062	NC_014623	CTG	2	6	7142439	7142444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823021
163063	NC_014623	GCAA	2	8	7142457	7142464	50 %	0 %	25 %	25 %	310823021
163064	NC_014623	C	6	6	7142598	7142603	0 %	0 %	0 %	100 %	310823022
163065	NC_014623	GAA	2	6	7142619	7142624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310823022
163066	NC_014623	G	6	6	7142639	7142644	0 %	0 %	100 %	0 %	310823022
163067	NC_014623	GCC	2	6	7142730	7142735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310823022
163068	NC_014623	TGA	2	6	7142786	7142791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310823022
163069	NC_014623	CCG	2	6	7142804	7142809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310823022
163070	NC_014623	C	7	7	7142902	7142908	0 %	0 %	0 %	100 %	310823022
163071	NC_014623	GCG	2	6	7142944	7142949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310823022
163072	NC_014623	CGGA	2	8	7142953	7142960	25 %	0 %	50 %	25 %	310823022
163073	NC_014623	GCGG	2	8	7142982	7142989	0 %	0 %	75 %	25 %	310823022
163074	NC_014623	G	6	6	7143047	7143052	0 %	0 %	100 %	0 %	310823022
163075	NC_014623	CGC	2	6	7143110	7143115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310823022
163076	NC_014623	CCA	2	6	7143119	7143124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823022
163077	NC_014623	CGG	2	6	7143296	7143301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310823022
163078	NC_014623	CCG	2	6	7143347	7143352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310823022
163079	NC_014623	GCCC	2	8	7143360	7143367	0 %	0 %	25 %	75 %	310823022
163080	NC_014623	GCAA	2	8	7143388	7143395	50 %	0 %	25 %	25 %	310823022
163081	NC_014623	GGA	2	6	7143515	7143520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310823023
163082	NC_014623	CTTC	2	8	7143557	7143564	0 %	50 %	0 %	50 %	310823023
163083	NC_014623	TCCA	2	8	7143631	7143638	25 %	25 %	0 %	50 %	310823023
163084	NC_014623	AGC	2	6	7143643	7143648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310823023
163085	NC_014623	TCG	2	6	7143676	7143681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823023
163086	NC_014623	GCT	2	6	7143693	7143698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823023
163087	NC_014623	TAG	2	6	7143841	7143846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310823023
163088	NC_014623	TCT	2	6	7143896	7143901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310823023
163089	NC_014623	AGC	2	6	7143907	7143912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310823023
163090	NC_014623	TGA	2	6	7143923	7143928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310823023
163091	NC_014623	GTG	2	6	7143958	7143963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310823023
163092	NC_014623	TCC	2	6	7144017	7144022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310823023
163093	NC_014623	ACCT	2	8	7144077	7144084	25 %	25 %	0 %	50 %	310823023
163094	NC_014623	ATG	2	6	7144135	7144140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310823023
163095	NC_014623	GTA	2	6	7144221	7144226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310823023
163096	NC_014623	GCCC	2	8	7144245	7144252	0 %	0 %	25 %	75 %	310823023
163097	NC_014623	CCA	2	6	7144253	7144258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823023
163098	NC_014623	CGG	2	6	7144316	7144321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310823023
163099	NC_014623	GAA	2	6	7144323	7144328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310823023
163100	NC_014623	CTG	2	6	7144332	7144337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823023
163101	NC_014623	CGC	2	6	7144338	7144343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310823023
163102	NC_014623	CAC	2	6	7144386	7144391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823023
163103	NC_014623	CTT	2	6	7144398	7144403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310823023
163104	NC_014623	CTT	2	6	7144449	7144454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310823023
163105	NC_014623	GAT	2	6	7144538	7144543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310823024
163106	NC_014623	AAC	2	6	7144594	7144599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310823024
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163108	NC_014623	CTG	2	6	7144660	7144665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310823024
163109	NC_014623	CAGAC	2	10	7144686	7144695	40 %	0 %	20 %	40 %	310823024
163110	NC_014623	C	6	6	7144699	7144704	0 %	0 %	0 %	100 %	310823024
163111	NC_014623	GAA	2	6	7144764	7144769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310823024
163112	NC_014623	CCA	2	6	7144793	7144798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823024
163113	NC_014623	ACGC	2	8	7144829	7144836	25 %	0 %	25 %	50 %	310823024
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163115	NC_014623	ATCC	2	8	7144871	7144878	25 %	25 %	0 %	50 %	310823024
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163457	NC_014623	GGC	2	6	7160209	7160214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310823038
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163459	NC_014623	GTT	2	6	7160306	7160311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310823038
163460	NC_014623	CCA	2	6	7160404	7160409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823038
163461	NC_014623	AGGC	2	8	7160458	7160465	25 %	0 %	50 %	25 %	310823038
163462	NC_014623	ACC	2	6	7160478	7160483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310823038
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