MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
157001	NC_014623	GCCC	2	8	6879982	6879989	0 %	0 %	25 %	75 %	310822798
157002	NC_014623	CGC	2	6	6880000	6880005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822798
157003	NC_014623	CCAGCA	2	12	6880038	6880049	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310822798
157004	NC_014623	ACC	2	6	6880112	6880117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822798
157005	NC_014623	TCG	3	9	6880167	6880175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822798
157006	NC_014623	GA	3	6	6880230	6880235	50 %	0 %	50 %	0 %	310822798
157007	NC_014623	GCC	2	6	6880288	6880293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822798
157008	NC_014623	CAA	2	6	6880330	6880335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310822798
157009	NC_014623	AGG	2	6	6880412	6880417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310822798
157010	NC_014623	GCA	2	6	6880463	6880468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822799
157011	NC_014623	GAA	2	6	6880512	6880517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310822799
157012	NC_014623	CCG	2	6	6880562	6880567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822799
157013	NC_014623	GCA	2	6	6880592	6880597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822799
157014	NC_014623	GGA	2	6	6880636	6880641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310822799
157015	NC_014623	GCG	2	6	6880643	6880648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822799
157016	NC_014623	GGC	2	6	6880837	6880842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822799
157017	NC_014623	GCC	2	6	6880883	6880888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822799
157018	NC_014623	CAT	2	6	6880895	6880900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310822799
157019	NC_014623	AGCAC	2	10	6880904	6880913	40 %	0 %	20 %	40 %	310822799
157020	NC_014623	TCA	2	6	6880982	6880987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310822799
157021	NC_014623	GCA	2	6	6881027	6881032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822799
157022	NC_014623	GAA	2	6	6881064	6881069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310822799
157023	NC_014623	CCG	2	6	6881075	6881080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822799
157024	NC_014623	GC	3	6	6881101	6881106	0 %	0 %	50 %	50 %	310822799
157025	NC_014623	GCT	2	6	6881138	6881143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822799
157026	NC_014623	CCT	2	6	6881198	6881203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822799
157027	NC_014623	CG	3	6	6881208	6881213	0 %	0 %	50 %	50 %	310822799
157028	NC_014623	TCA	2	6	6881345	6881350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310822799
157029	NC_014623	CGC	2	6	6881367	6881372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822799
157030	NC_014623	CGC	2	6	6881376	6881381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822799
157031	NC_014623	CG	3	6	6881444	6881449	0 %	0 %	50 %	50 %	310822799
157032	NC_014623	ACC	2	6	6881479	6881484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822799
157033	NC_014623	GAA	2	6	6881514	6881519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310822799
157034	NC_014623	CCCA	2	8	6881530	6881537	25 %	0 %	0 %	75 %	310822799
157035	NC_014623	CTC	2	6	6881602	6881607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822800
157036	NC_014623	CGC	2	6	6881639	6881644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822800
157037	NC_014623	C	6	6	6881651	6881656	0 %	0 %	0 %	100 %	310822800
157038	NC_014623	GCA	2	6	6881662	6881667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822800
157039	NC_014623	CGA	2	6	6881689	6881694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822800
157040	NC_014623	CCA	2	6	6881707	6881712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822800
157041	NC_014623	GCA	2	6	6881779	6881784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822800
157042	NC_014623	CCG	2	6	6881785	6881790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822800
157043	NC_014623	GCT	2	6	6881831	6881836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822800
157044	NC_014623	GCCGCT	2	12	6881896	6881907	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310822800
157045	NC_014623	GCC	2	6	6881909	6881914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822800
157046	NC_014623	CGC	2	6	6881999	6882004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822800
157047	NC_014623	CCGG	2	8	6882031	6882038	0 %	0 %	50 %	50 %	310822800
157048	NC_014623	AGC	2	6	6882075	6882080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822800
157049	NC_014623	GCAC	2	8	6882108	6882115	25 %	0 %	25 %	50 %	310822800
157050	NC_014623	GGC	2	6	6882119	6882124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822800
157051	NC_014623	AGC	2	6	6882153	6882158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822800
157052	NC_014623	CAG	2	6	6882191	6882196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822800
157053	NC_014623	GCC	2	6	6882215	6882220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822800
157054	NC_014623	GC	3	6	6882283	6882288	0 %	0 %	50 %	50 %	310822800
157055	NC_014623	GC	3	6	6882290	6882295	0 %	0 %	50 %	50 %	310822800
157056	NC_014623	TCC	2	6	6882369	6882374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822800
157057	NC_014623	CAG	2	6	6882392	6882397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822800
157058	NC_014623	GCC	2	6	6882417	6882422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822800
157059	NC_014623	CCG	2	6	6882487	6882492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822800
157060	NC_014623	AGC	2	6	6882495	6882500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822800
157061	NC_014623	GCC	2	6	6882534	6882539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822800
157062	NC_014623	GCC	4	12	6882564	6882575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822800
157063	NC_014623	CCCCG	2	10	6882598	6882607	0 %	0 %	20 %	80 %	310822800
157064	NC_014623	CAC	2	6	6882623	6882628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822800
157065	NC_014623	CCT	2	6	6882631	6882636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822800
157066	NC_014623	CCG	2	6	6882673	6882678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822800
157067	NC_014623	GCC	2	6	6882813	6882818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822800
157068	NC_014623	GC	3	6	6882841	6882846	0 %	0 %	50 %	50 %	310822800
157069	NC_014623	CGC	2	6	6882932	6882937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822800
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157071	NC_014623	CG	3	6	6882994	6882999	0 %	0 %	50 %	50 %	310822800
157072	NC_014623	CGC	2	6	6883044	6883049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822800
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157074	NC_014623	CAC	3	9	6883136	6883144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822800
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157076	NC_014623	CCCG	2	8	6883223	6883230	0 %	0 %	25 %	75 %	310822800
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157081	NC_014623	GC	3	6	6883459	6883464	0 %	0 %	50 %	50 %	310822801
157082	NC_014623	TCC	2	6	6883475	6883480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822801
157083	NC_014623	GAT	2	6	6883492	6883497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822801
157084	NC_014623	GAT	2	6	6883504	6883509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822801
157085	NC_014623	GCC	2	6	6883565	6883570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822801
157086	NC_014623	CCAGG	2	10	6883615	6883624	20 %	0 %	40 %	40 %	310822801
157087	NC_014623	CG	3	6	6883644	6883649	0 %	0 %	50 %	50 %	310822801
157088	NC_014623	CCT	2	6	6883665	6883670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822801
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157093	NC_014623	GA	3	6	6883889	6883894	50 %	0 %	50 %	0 %	310822801
157094	NC_014623	GC	3	6	6883946	6883951	0 %	0 %	50 %	50 %	310822801
157095	NC_014623	CCA	2	6	6883953	6883958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822801
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157097	NC_014623	TGA	2	6	6884010	6884015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822801
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157099	NC_014623	CCG	2	6	6884052	6884057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822801
157100	NC_014623	GCTTGC	2	12	6884064	6884075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822801
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157102	NC_014623	GGA	2	6	6884163	6884168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310822801
157103	NC_014623	C	6	6	6884199	6884204	0 %	0 %	0 %	100 %	310822801
157104	NC_014623	CAG	2	6	6884215	6884220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822801
157105	NC_014623	AGC	3	9	6884228	6884236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822801
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157107	NC_014623	ACC	2	6	6884360	6884365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822801
157108	NC_014623	CCT	2	6	6884433	6884438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822801
157109	NC_014623	CAC	2	6	6884488	6884493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822801
157110	NC_014623	GCA	2	6	6884532	6884537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822801
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157112	NC_014623	CGAGC	2	10	6884596	6884605	20 %	0 %	40 %	40 %	310822801
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157114	NC_014623	CCA	2	6	6884652	6884657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822801
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157344	NC_014623	GGA	2	6	6894433	6894438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310822812
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157349	NC_014623	CG	3	6	6894589	6894594	0 %	0 %	50 %	50 %	310822812
157350	NC_014623	ATG	2	6	6894609	6894614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822812
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157458	NC_014623	GGC	2	6	6898754	6898759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822814
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