MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
156501	NC_014623	GCT	2	6	6851793	6851798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822778
156502	NC_014623	GTG	2	6	6851884	6851889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822778
156503	NC_014623	TGA	2	6	6851903	6851908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822778
156504	NC_014623	GGAG	2	8	6851957	6851964	25 %	0 %	75 %	0 %	310822778
156505	NC_014623	CGC	2	6	6852005	6852010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822778
156506	NC_014623	GCA	2	6	6852017	6852022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822778
156507	NC_014623	GAG	2	6	6852040	6852045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310822778
156508	NC_014623	GC	3	6	6852088	6852093	0 %	0 %	50 %	50 %	310822778
156509	NC_014623	GA	3	6	6852110	6852115	50 %	0 %	50 %	0 %	310822778
156510	NC_014623	CCA	2	6	6852137	6852142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822778
156511	NC_014623	GCC	2	6	6852147	6852152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822778
156512	NC_014623	CCA	2	6	6852194	6852199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822778
156513	NC_014623	TGA	2	6	6852278	6852283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822778
156514	NC_014623	AGACCG	2	12	6852312	6852323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822779
156515	NC_014623	GGT	2	6	6852352	6852357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822779
156516	NC_014623	CAC	2	6	6852370	6852375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822779
156517	NC_014623	CGT	2	6	6852415	6852420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822779
156518	NC_014623	CTC	2	6	6852565	6852570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822779
156519	NC_014623	TGA	2	6	6852585	6852590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822779
156520	NC_014623	AGC	2	6	6852701	6852706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822779
156521	NC_014623	GTA	2	6	6852739	6852744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822779
156522	NC_014623	CCA	3	9	6852759	6852767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822779
156523	NC_014623	CGA	2	6	6852777	6852782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822779
156524	NC_014623	CGC	2	6	6852784	6852789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822779
156525	NC_014623	CTC	2	6	6852919	6852924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822779
156526	NC_014623	GCC	2	6	6852934	6852939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822779
156527	NC_014623	GC	4	8	6852958	6852965	0 %	0 %	50 %	50 %	310822779
156528	NC_014623	TCT	2	6	6852978	6852983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310822779
156529	NC_014623	GCG	2	6	6852993	6852998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822779
156530	NC_014623	GTC	2	6	6853012	6853017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822779
156531	NC_014623	GAT	2	6	6853021	6853026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822779
156532	NC_014623	CG	3	6	6853073	6853078	0 %	0 %	50 %	50 %	310822779
156533	NC_014623	CGC	2	6	6853081	6853086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822779
156534	NC_014623	TTC	3	9	6853211	6853219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310822779
156535	NC_014623	CAG	2	6	6853240	6853245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822779
156536	NC_014623	CAG	2	6	6853285	6853290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822779
156537	NC_014623	CTC	2	6	6853327	6853332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822779
156538	NC_014623	TCT	2	6	6853371	6853376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310822779
156539	NC_014623	CTG	2	6	6853384	6853389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822779
156540	NC_014623	GAA	2	6	6853390	6853395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310822779
156541	NC_014623	GTC	2	6	6853408	6853413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822779
156542	NC_014623	GGT	2	6	6853438	6853443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822779
156543	NC_014623	CCA	2	6	6853446	6853451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822779
156544	NC_014623	TGGA	2	8	6853496	6853503	25 %	25 %	50 %	0 %	310822779
156545	NC_014623	GAA	2	6	6853600	6853605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310822779
156546	NC_014623	CAGCGT	2	12	6853630	6853641	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310822779
156547	NC_014623	GGT	2	6	6853678	6853683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822779
156548	NC_014623	CCT	2	6	6853689	6853694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822779
156549	NC_014623	TGG	2	6	6853710	6853715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822779
156550	NC_014623	CCG	3	9	6853722	6853730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822779
156551	NC_014623	TCAGCG	2	12	6853731	6853742	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310822779
156552	NC_014623	CTT	2	6	6853783	6853788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310822779
156553	NC_014623	CTG	2	6	6853813	6853818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822779
156554	NC_014623	GCC	2	6	6853882	6853887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822779
156555	NC_014623	CTC	2	6	6853948	6853953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822779
156556	NC_014623	GTT	2	6	6853966	6853971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310822779
156557	NC_014623	CCA	3	9	6854065	6854073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822779
156558	NC_014623	TCC	2	6	6854092	6854097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822780
156559	NC_014623	C	6	6	6854251	6854256	0 %	0 %	0 %	100 %	310822780
156560	NC_014623	GAC	2	6	6854262	6854267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822780
156561	NC_014623	TCG	2	6	6854269	6854274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822780
156562	NC_014623	CTT	2	6	6854277	6854282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310822780
156563	NC_014623	TCTGCT	2	12	6854315	6854326	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	310822780
156564	NC_014623	ATC	2	6	6854335	6854340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310822780
156565	NC_014623	ATG	2	6	6854350	6854355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822780
156566	NC_014623	CCA	2	6	6854357	6854362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822780
156567	NC_014623	CGC	3	9	6854399	6854407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822780
156568	NC_014623	GCG	2	6	6854630	6854635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822781
156569	NC_014623	AGT	2	6	6854718	6854723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822781
156570	NC_014623	GCAGGT	2	12	6854818	6854829	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310822781
156571	NC_014623	GAC	2	6	6854875	6854880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822781
156572	NC_014623	GC	3	6	6854911	6854916	0 %	0 %	50 %	50 %	310822781
156573	NC_014623	GCC	2	6	6854957	6854962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822781
156574	NC_014623	GCA	2	6	6855024	6855029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822781
156575	NC_014623	G	6	6	6855030	6855035	0 %	0 %	100 %	0 %	310822781
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156577	NC_014623	GCC	2	6	6855088	6855093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822781
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156579	NC_014623	GCC	2	6	6855163	6855168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822781
156580	NC_014623	CAGC	2	8	6855226	6855233	25 %	0 %	25 %	50 %	310822781
156581	NC_014623	GTG	2	6	6855236	6855241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822781
156582	NC_014623	G	7	7	6855283	6855289	0 %	0 %	100 %	0 %	310822781
156583	NC_014623	ATG	3	9	6855305	6855313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822781
156584	NC_014623	GGC	2	6	6855394	6855399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822781
156585	NC_014623	CTC	2	6	6855403	6855408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822781
156586	NC_014623	CGC	2	6	6855450	6855455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822781
156587	NC_014623	GCC	2	6	6855499	6855504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822781
156588	NC_014623	GCA	2	6	6855534	6855539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822781
156589	NC_014623	GGT	2	6	6855543	6855548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822781
156590	NC_014623	GAT	2	6	6855562	6855567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822781
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156596	NC_014623	CG	3	6	6855996	6856001	0 %	0 %	50 %	50 %	310822782
156597	NC_014623	CAG	2	6	6856002	6856007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822782
156598	NC_014623	GCC	2	6	6856027	6856032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822782
156599	NC_014623	CAC	2	6	6856044	6856049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822782
156600	NC_014623	GTG	2	6	6856051	6856056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822782
156601	NC_014623	CCA	2	6	6856064	6856069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822782
156602	NC_014623	GCG	2	6	6856090	6856095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822782
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156604	NC_014623	GGA	2	6	6856178	6856183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310822782
156605	NC_014623	CGTCAC	2	12	6856206	6856217	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310822782
156606	NC_014623	CGC	2	6	6856226	6856231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822782
156607	NC_014623	GC	3	6	6856230	6856235	0 %	0 %	50 %	50 %	310822782
156608	NC_014623	CCG	2	6	6856274	6856279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822782
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156611	NC_014623	GGAG	2	8	6856406	6856413	25 %	0 %	75 %	0 %	310822782
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156613	NC_014623	CCA	2	6	6856478	6856483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822782
156614	NC_014623	CAGA	2	8	6856539	6856546	50 %	0 %	25 %	25 %	310822782
156615	NC_014623	CGG	2	6	6856562	6856567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822782
156616	NC_014623	GGC	2	6	6856599	6856604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822782
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156622	NC_014623	GCA	2	6	6856712	6856717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822782
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156625	NC_014623	GCT	2	6	6856916	6856921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822783
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156722	NC_014623	CGT	2	6	6860976	6860981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822788
156723	NC_014623	ATG	2	6	6861128	6861133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822788
156724	NC_014623	GCC	2	6	6861168	6861173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822788
156725	NC_014623	AGT	2	6	6861210	6861215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822788
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156727	NC_014623	CGC	2	6	6861285	6861290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822788
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156821	NC_014623	GA	3	6	6871814	6871819	50 %	0 %	50 %	0 %	310822790
156822	NC_014623	CCCT	2	8	6871824	6871831	0 %	25 %	0 %	75 %	310822790
156823	NC_014623	ACC	2	6	6871853	6871858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822790
156824	NC_014623	GTC	2	6	6871888	6871893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822790
156825	NC_014623	AGG	2	6	6871914	6871919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310822790
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156827	NC_014623	GCG	3	9	6871957	6871965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822790
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156829	NC_014623	CCT	2	6	6872130	6872135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822790
156830	NC_014623	CCA	2	6	6872136	6872141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822790
156831	NC_014623	CGA	2	6	6872187	6872192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822790
156832	NC_014623	CGCTC	2	10	6872196	6872205	0 %	20 %	20 %	60 %	310822790
156833	NC_014623	TCT	2	6	6872208	6872213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310822790
156834	NC_014623	CGA	2	6	6872232	6872237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822790
156835	NC_014623	GAC	2	6	6872274	6872279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822790
156836	NC_014623	CGT	2	6	6872281	6872286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822790
156837	NC_014623	GAG	2	6	6872323	6872328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310822790
156838	NC_014623	CAG	2	6	6872377	6872382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822790
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