MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_014623	CGT	2	6	668876	668881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817815
15002	NC_014623	TGA	2	6	668923	668928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817815
15003	NC_014623	GC	3	6	668934	668939	0 %	0 %	50 %	50 %	310817815
15004	NC_014623	GGC	2	6	669003	669008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817815
15005	NC_014623	CG	3	6	669029	669034	0 %	0 %	50 %	50 %	310817815
15006	NC_014623	GAAC	2	8	669128	669135	50 %	0 %	25 %	25 %	310817815
15007	NC_014623	GAT	2	6	669179	669184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817815
15008	NC_014623	CTC	2	6	669263	669268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817815
15009	NC_014623	GAG	2	6	669338	669343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817815
15010	NC_014623	CGC	2	6	669367	669372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817815
15011	NC_014623	CGA	3	9	669442	669450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817815
15012	NC_014623	GGT	2	6	669521	669526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817815
15013	NC_014623	TGG	2	6	669550	669555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817815
15014	NC_014623	GAGGT	2	10	669648	669657	20 %	20 %	60 %	0 %	310817815
15015	NC_014623	GGT	2	6	669754	669759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817815
15016	NC_014623	GAA	2	6	669785	669790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817815
15017	NC_014623	GCC	2	6	669828	669833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817815
15018	NC_014623	ATG	2	6	669873	669878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817815
15019	NC_014623	GGT	2	6	670357	670362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817816
15020	NC_014623	CT	3	6	670486	670491	0 %	50 %	0 %	50 %	310817816
15021	NC_014623	CTG	2	6	670508	670513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817816
15022	NC_014623	GGA	2	6	670528	670533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817816
15023	NC_014623	GGT	2	6	670540	670545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817816
15024	NC_014623	CATCAA	2	12	670588	670599	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	310817816
15025	NC_014623	GGT	3	9	670624	670632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817816
15026	NC_014623	GCG	2	6	670725	670730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817816
15027	NC_014623	TCA	2	6	670839	670844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817816
15028	NC_014623	G	6	6	670879	670884	0 %	0 %	100 %	0 %	310817816
15029	NC_014623	CCT	2	6	671103	671108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817816
15030	NC_014623	CGGA	2	8	671157	671164	25 %	0 %	50 %	25 %	310817816
15031	NC_014623	CGCA	2	8	671195	671202	25 %	0 %	25 %	50 %	310817816
15032	NC_014623	CAGC	2	8	671215	671222	25 %	0 %	25 %	50 %	310817816
15033	NC_014623	CTT	3	9	671224	671232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817816
15034	NC_014623	CG	3	6	671243	671248	0 %	0 %	50 %	50 %	310817816
15035	NC_014623	ACCT	2	8	671270	671277	25 %	25 %	0 %	50 %	310817816
15036	NC_014623	GCGG	2	8	671330	671337	0 %	0 %	75 %	25 %	310817816
15037	NC_014623	CAG	2	6	671431	671436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817816
15038	NC_014623	GCT	2	6	671482	671487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817816
15039	NC_014623	CAT	2	6	671510	671515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817816
15040	NC_014623	AGG	2	6	671517	671522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817816
15041	NC_014623	TCGAGT	2	12	671622	671633	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310817816
15042	NC_014623	TGG	2	6	671656	671661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817816
15043	NC_014623	GAG	2	6	671669	671674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817816
15044	NC_014623	GC	3	6	671675	671680	0 %	0 %	50 %	50 %	310817816
15045	NC_014623	CCCG	2	8	671717	671724	0 %	0 %	25 %	75 %	310817816
15046	NC_014623	TGC	2	6	671775	671780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817816
15047	NC_014623	GGC	2	6	671785	671790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817816
15048	NC_014623	ATGGAC	2	12	671816	671827	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310817816
15049	NC_014623	GGC	2	6	671861	671866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817816
15050	NC_014623	TCCGAG	2	12	671876	671887	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310817816
15051	NC_014623	CCA	2	6	671911	671916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817816
15052	NC_014623	CAGGTG	2	12	671942	671953	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310817816
15053	NC_014623	GTT	2	6	672166	672171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817816
15054	NC_014623	GT	3	6	672305	672310	0 %	50 %	50 %	0 %	310817816
15055	NC_014623	CG	3	6	672322	672327	0 %	0 %	50 %	50 %	310817816
15056	NC_014623	GCC	2	6	672357	672362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817816
15057	NC_014623	TCG	2	6	672432	672437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817816
15058	NC_014623	CG	4	8	672468	672475	0 %	0 %	50 %	50 %	310817816
15059	NC_014623	CTCA	2	8	672496	672503	25 %	25 %	0 %	50 %	310817816
15060	NC_014623	CCAAGC	2	12	672588	672599	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310817816
15061	NC_014623	TTC	2	6	672620	672625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817816
15062	NC_014623	GCTG	2	8	672648	672655	0 %	25 %	50 %	25 %	310817816
15063	NC_014623	CT	3	6	672679	672684	0 %	50 %	0 %	50 %	310817816
15064	NC_014623	GATCT	2	10	672755	672764	20 %	40 %	20 %	20 %	310817816
15065	NC_014623	CCT	2	6	672766	672771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817816
15066	NC_014623	CGG	2	6	672795	672800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817816
15067	NC_014623	CG	3	6	672849	672854	0 %	0 %	50 %	50 %	310817816
15068	NC_014623	TCC	2	6	672954	672959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817816
15069	NC_014623	CGGC	3	12	672969	672980	0 %	0 %	50 %	50 %	310817816
15070	NC_014623	CCG	2	6	673089	673094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817816
15071	NC_014623	GCG	2	6	673121	673126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817816
15072	NC_014623	TGG	2	6	673170	673175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817816
15073	NC_014623	GGCC	2	8	673184	673191	0 %	0 %	50 %	50 %	310817816
15074	NC_014623	GCTCG	2	10	673242	673251	0 %	20 %	40 %	40 %	310817816
15075	NC_014623	ATG	2	6	673293	673298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817817
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15077	NC_014623	GGC	2	6	673337	673342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817817
15078	NC_014623	CCAG	2	8	673358	673365	25 %	0 %	25 %	50 %	310817817
15079	NC_014623	CGTC	2	8	673548	673555	0 %	25 %	25 %	50 %	310817817
15080	NC_014623	TG	3	6	673602	673607	0 %	50 %	50 %	0 %	310817817
15081	NC_014623	CGG	2	6	673774	673779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817817
15082	NC_014623	CGTGT	2	10	673811	673820	0 %	40 %	40 %	20 %	310817817
15083	NC_014623	CGCTGT	2	12	673906	673917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817817
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15085	NC_014623	CG	5	10	674026	674035	0 %	0 %	50 %	50 %	310817818
15086	NC_014623	CGC	2	6	674083	674088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817818
15087	NC_014623	GCC	2	6	674120	674125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817818
15088	NC_014623	CGA	2	6	674133	674138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817818
15089	NC_014623	CCG	2	6	674177	674182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817818
15090	NC_014623	TCA	2	6	674241	674246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817818
15091	NC_014623	CGA	2	6	674280	674285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817818
15092	NC_014623	ATC	2	6	674378	674383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817818
15093	NC_014623	CCG	2	6	674442	674447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817818
15094	NC_014623	GAC	2	6	674473	674478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817818
15095	NC_014623	GCG	2	6	674501	674506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817818
15096	NC_014623	GC	3	6	674547	674552	0 %	0 %	50 %	50 %	310817818
15097	NC_014623	GC	3	6	674579	674584	0 %	0 %	50 %	50 %	310817818
15098	NC_014623	ATC	2	6	674609	674614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817818
15099	NC_014623	CGGGGG	2	12	674680	674691	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	310817819
15100	NC_014623	AGGGG	2	10	674693	674702	20 %	0 %	80 %	0 %	310817819
15101	NC_014623	CGA	2	6	674758	674763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817819
15102	NC_014623	TGG	2	6	674815	674820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817819
15103	NC_014623	GAG	2	6	674852	674857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817819
15104	NC_014623	AGG	2	6	674859	674864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817819
15105	NC_014623	CGG	2	6	674947	674952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817819
15106	NC_014623	GAG	2	6	674957	674962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817819
15107	NC_014623	GCC	2	6	674969	674974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817819
15108	NC_014623	AGC	2	6	674982	674987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817819
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15110	NC_014623	GCC	2	6	675011	675016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817819
15111	NC_014623	GGC	2	6	675032	675037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817819
15112	NC_014623	GAG	2	6	675087	675092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817819
15113	NC_014623	GGC	2	6	675137	675142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817819
15114	NC_014623	GAA	2	6	675209	675214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817819
15115	NC_014623	TCGAGC	2	12	675288	675299	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310817819
15116	NC_014623	CAAT	2	8	675313	675320	50 %	25 %	0 %	25 %	310817819
15117	NC_014623	GTG	2	6	675351	675356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817819
15118	NC_014623	CGGG	2	8	675427	675434	0 %	0 %	75 %	25 %	310817819
15119	NC_014623	GAT	2	6	675464	675469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817819
15120	NC_014623	GAA	2	6	675500	675505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817819
15121	NC_014623	GAA	2	6	675578	675583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817819
15122	NC_014623	TGG	2	6	675666	675671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817819
15123	NC_014623	CTT	2	6	675970	675975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817820
15124	NC_014623	GTT	2	6	676018	676023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817820
15125	NC_014623	CTC	2	6	676189	676194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817820
15126	NC_014623	AGT	2	6	676212	676217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817820
15127	NC_014623	TGC	2	6	676269	676274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817820
15128	NC_014623	CGT	2	6	676275	676280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817820
15129	NC_014623	GAA	2	6	676315	676320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817820
15130	NC_014623	GCT	2	6	676326	676331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817820
15131	NC_014623	CGGC	2	8	676341	676348	0 %	0 %	50 %	50 %	310817820
15132	NC_014623	CGG	2	6	676351	676356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817820
15133	NC_014623	TGG	2	6	676357	676362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817820
15134	NC_014623	TCTT	2	8	676373	676380	0 %	75 %	0 %	25 %	310817820
15135	NC_014623	TCG	2	6	676382	676387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817820
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15142	NC_014623	GGCGCC	2	12	676914	676925	0 %	0 %	50 %	50 %	310817821
15143	NC_014623	GCC	2	6	676960	676965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817821
15144	NC_014623	CTG	2	6	676986	676991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817821
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15155	NC_014623	CATG	2	8	677615	677622	25 %	25 %	25 %	25 %	310817821
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15157	NC_014623	G	6	6	677794	677799	0 %	0 %	100 %	0 %	310817822
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15225	NC_014623	TG	3	6	681933	681938	0 %	50 %	50 %	0 %	310817828
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15228	NC_014623	ATG	2	6	682224	682229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817829
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15230	NC_014623	TTCG	2	8	682449	682456	0 %	50 %	25 %	25 %	310817829
15231	NC_014623	TGAGCT	2	12	682615	682626	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310817830
15232	NC_014623	TGG	2	6	682633	682638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817830
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15236	NC_014623	TCG	2	6	682981	682986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817830
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15239	NC_014623	GC	3	6	683119	683124	0 %	0 %	50 %	50 %	310817830
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15482	NC_014623	TGA	2	6	692989	692994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817839
15483	NC_014623	GGC	2	6	693069	693074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817839
15484	NC_014623	AGG	2	6	693109	693114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817839
15485	NC_014623	CTC	2	6	693164	693169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817839
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15487	NC_014623	GCC	2	6	693218	693223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817839
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15491	NC_014623	CCA	2	6	693394	693399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817839
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