MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
153501	NC_014623	TGA	2	6	6722802	6722807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822661
153502	NC_014623	CAG	2	6	6722836	6722841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822661
153503	NC_014623	CCG	2	6	6722856	6722861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822661
153504	NC_014623	GAT	2	6	6723115	6723120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822662
153505	NC_014623	GGGCT	2	10	6723143	6723152	0 %	20 %	60 %	20 %	310822662
153506	NC_014623	GCC	2	6	6723181	6723186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822662
153507	NC_014623	CGC	2	6	6723223	6723228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822662
153508	NC_014623	TCA	2	6	6723260	6723265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310822662
153509	NC_014623	CCAC	2	8	6723279	6723286	25 %	0 %	0 %	75 %	310822662
153510	NC_014623	TTG	2	6	6723305	6723310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310822662
153511	NC_014623	GAC	2	6	6723313	6723318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822662
153512	NC_014623	CTT	2	6	6723477	6723482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310822662
153513	NC_014623	TGATC	2	10	6723504	6723513	20 %	40 %	20 %	20 %	310822662
153514	NC_014623	TGG	2	6	6723546	6723551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822662
153515	NC_014623	TCA	2	6	6723621	6723626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310822662
153516	NC_014623	GC	4	8	6723647	6723654	0 %	0 %	50 %	50 %	310822662
153517	NC_014623	CAC	2	6	6723694	6723699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822662
153518	NC_014623	CTC	2	6	6723838	6723843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822662
153519	NC_014623	GAC	2	6	6723853	6723858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822662
153520	NC_014623	GCC	2	6	6724113	6724118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822663
153521	NC_014623	CGA	2	6	6724123	6724128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822663
153522	NC_014623	CAC	2	6	6724256	6724261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822663
153523	NC_014623	GCA	2	6	6724345	6724350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822663
153524	NC_014623	CGATGA	2	12	6724390	6724401	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310822663
153525	NC_014623	CGG	2	6	6724426	6724431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822663
153526	NC_014623	GC	3	6	6724439	6724444	0 %	0 %	50 %	50 %	310822663
153527	NC_014623	CGAT	2	8	6724623	6724630	25 %	25 %	25 %	25 %	310822663
153528	NC_014623	GCC	2	6	6724632	6724637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822663
153529	NC_014623	GCC	2	6	6724649	6724654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822663
153530	NC_014623	CAC	3	9	6724745	6724753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822663
153531	NC_014623	GCGCCT	2	12	6724771	6724782	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310822663
153532	NC_014623	CCA	3	9	6724810	6724818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822663
153533	NC_014623	CAG	2	6	6724861	6724866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822664
153534	NC_014623	GC	3	6	6724877	6724882	0 %	0 %	50 %	50 %	310822664
153535	NC_014623	C	6	6	6724888	6724893	0 %	0 %	0 %	100 %	310822664
153536	NC_014623	CG	3	6	6724925	6724930	0 %	0 %	50 %	50 %	310822664
153537	NC_014623	CTC	2	6	6725044	6725049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822664
153538	NC_014623	CAC	4	12	6725050	6725061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822664
153539	NC_014623	CGC	2	6	6725071	6725076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822664
153540	NC_014623	CAG	2	6	6725083	6725088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822664
153541	NC_014623	GGCG	2	8	6725089	6725096	0 %	0 %	75 %	25 %	310822664
153542	NC_014623	CACC	2	8	6725110	6725117	25 %	0 %	0 %	75 %	310822664
153543	NC_014623	CCAG	2	8	6725134	6725141	25 %	0 %	25 %	50 %	310822664
153544	NC_014623	AGC	2	6	6725152	6725157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822664
153545	NC_014623	GGCCAG	2	12	6725167	6725178	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310822664
153546	NC_014623	GC	3	6	6725258	6725263	0 %	0 %	50 %	50 %	310822664
153547	NC_014623	CACC	2	8	6725361	6725368	25 %	0 %	0 %	75 %	310822664
153548	NC_014623	GA	3	6	6725411	6725416	50 %	0 %	50 %	0 %	310822664
153549	NC_014623	CG	3	6	6725461	6725466	0 %	0 %	50 %	50 %	310822664
153550	NC_014623	GGCA	2	8	6725495	6725502	25 %	0 %	50 %	25 %	310822664
153551	NC_014623	CGT	2	6	6725505	6725510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822664
153552	NC_014623	CG	3	6	6725527	6725532	0 %	0 %	50 %	50 %	310822664
153553	NC_014623	CA	3	6	6725556	6725561	50 %	0 %	0 %	50 %	310822664
153554	NC_014623	CCGG	2	8	6725562	6725569	0 %	0 %	50 %	50 %	310822664
153555	NC_014623	TGC	2	6	6725609	6725614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822664
153556	NC_014623	CCA	2	6	6725664	6725669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822664
153557	NC_014623	GGCG	2	8	6725689	6725696	0 %	0 %	75 %	25 %	310822664
153558	NC_014623	CAC	4	12	6725698	6725709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822664
153559	NC_014623	TCG	2	6	6725732	6725737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822664
153560	NC_014623	GCG	3	9	6725741	6725749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822664
153561	NC_014623	GCC	2	6	6725773	6725778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822664
153562	NC_014623	CATGG	2	10	6725821	6725830	20 %	20 %	40 %	20 %	310822664
153563	NC_014623	GGA	2	6	6725858	6725863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310822664
153564	NC_014623	CAC	3	9	6725893	6725901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822664
153565	NC_014623	GAG	2	6	6725909	6725914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310822664
153566	NC_014623	CAG	2	6	6725938	6725943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822664
153567	NC_014623	GTCC	2	8	6725958	6725965	0 %	25 %	25 %	50 %	310822664
153568	NC_014623	AGCCC	2	10	6725985	6725994	20 %	0 %	20 %	60 %	310822664
153569	NC_014623	GAA	2	6	6725998	6726003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310822664
153570	NC_014623	GCA	2	6	6726024	6726029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822664
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153573	NC_014623	CCGC	2	8	6726107	6726114	0 %	0 %	25 %	75 %	310822664
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153575	NC_014623	C	6	6	6726139	6726144	0 %	0 %	0 %	100 %	310822664
153576	NC_014623	GC	3	6	6726150	6726155	0 %	0 %	50 %	50 %	310822664
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153581	NC_014623	CCA	3	9	6726429	6726437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822664
153582	NC_014623	AG	3	6	6726452	6726457	50 %	0 %	50 %	0 %	310822664
153583	NC_014623	CA	3	6	6726483	6726488	50 %	0 %	0 %	50 %	310822664
153584	NC_014623	TGA	2	6	6726492	6726497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822664
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153587	NC_014623	CCA	2	6	6726605	6726610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822665
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153600	NC_014623	GAG	2	6	6727107	6727112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310822665
153601	NC_014623	TGGT	2	8	6727156	6727163	0 %	50 %	50 %	0 %	310822665
153602	NC_014623	GGCC	2	8	6727165	6727172	0 %	0 %	50 %	50 %	310822665
153603	NC_014623	TCG	2	6	6727183	6727188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822665
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153606	NC_014623	CG	4	8	6727410	6727417	0 %	0 %	50 %	50 %	310822665
153607	NC_014623	C	7	7	6727492	6727498	0 %	0 %	0 %	100 %	310822666
153608	NC_014623	CG	3	6	6727523	6727528	0 %	0 %	50 %	50 %	310822666
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153613	NC_014623	TGA	2	6	6727630	6727635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822666
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