MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
152501	NC_014623	CAG	2	6	6679767	6679772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822620
152502	NC_014623	GTC	2	6	6679786	6679791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822620
152503	NC_014623	GTG	2	6	6679846	6679851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822620
152504	NC_014623	GGC	2	6	6679887	6679892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822620
152505	NC_014623	CAG	2	6	6679926	6679931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822620
152506	NC_014623	CCA	2	6	6679943	6679948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822620
152507	NC_014623	CTCC	2	8	6679976	6679983	0 %	25 %	0 %	75 %	310822620
152508	NC_014623	GAG	2	6	6679990	6679995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310822620
152509	NC_014623	TCG	2	6	6680002	6680007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822620
152510	NC_014623	CAA	2	6	6680019	6680024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310822620
152511	NC_014623	CCG	2	6	6680051	6680056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822620
152512	NC_014623	CTG	2	6	6680091	6680096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822620
152513	NC_014623	GAT	2	6	6680234	6680239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822621
152514	NC_014623	GGAT	2	8	6680256	6680263	25 %	25 %	50 %	0 %	310822621
152515	NC_014623	GCG	2	6	6680322	6680327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822621
152516	NC_014623	GTTC	2	8	6680426	6680433	0 %	50 %	25 %	25 %	310822621
152517	NC_014623	GCG	2	6	6680493	6680498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822621
152518	NC_014623	CCG	2	6	6680514	6680519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822621
152519	NC_014623	CGG	2	6	6680534	6680539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822621
152520	NC_014623	ACG	2	6	6680575	6680580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822621
152521	NC_014623	GTG	3	9	6680637	6680645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822621
152522	NC_014623	CTG	2	6	6680946	6680951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822621
152523	NC_014623	GC	3	6	6681089	6681094	0 %	0 %	50 %	50 %	310822621
152524	NC_014623	GTCAAG	2	12	6681129	6681140	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310822621
152525	NC_014623	CCG	2	6	6681211	6681216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822621
152526	NC_014623	TC	3	6	6681236	6681241	0 %	50 %	0 %	50 %	310822621
152527	NC_014623	ACC	2	6	6681247	6681252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822621
152528	NC_014623	CG	3	6	6681273	6681278	0 %	0 %	50 %	50 %	310822621
152529	NC_014623	AGC	2	6	6681286	6681291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822621
152530	NC_014623	C	6	6	6681310	6681315	0 %	0 %	0 %	100 %	310822621
152531	NC_014623	CCT	2	6	6681557	6681562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822621
152532	NC_014623	CCT	2	6	6681587	6681592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822621
152533	NC_014623	GCAC	2	8	6681604	6681611	25 %	0 %	25 %	50 %	310822621
152534	NC_014623	AGC	2	6	6681634	6681639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822621
152535	NC_014623	TCG	2	6	6681661	6681666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822621
152536	NC_014623	TTC	2	6	6681669	6681674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310822621
152537	NC_014623	C	6	6	6681762	6681767	0 %	0 %	0 %	100 %	310822621
152538	NC_014623	GAG	2	6	6681772	6681777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310822621
152539	NC_014623	CT	3	6	6681828	6681833	0 %	50 %	0 %	50 %	310822622
152540	NC_014623	GACG	2	8	6681841	6681848	25 %	0 %	50 %	25 %	310822622
152541	NC_014623	CAGG	2	8	6681862	6681869	25 %	0 %	50 %	25 %	310822622
152542	NC_014623	GC	3	6	6681876	6681881	0 %	0 %	50 %	50 %	310822622
152543	NC_014623	CGC	2	6	6681883	6681888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822622
152544	NC_014623	CG	3	6	6681911	6681916	0 %	0 %	50 %	50 %	310822622
152545	NC_014623	GGT	2	6	6682023	6682028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822622
152546	NC_014623	AGC	2	6	6682046	6682051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822622
152547	NC_014623	CGGCCA	2	12	6682062	6682073	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310822622
152548	NC_014623	CAG	2	6	6682120	6682125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822622
152549	NC_014623	TCA	2	6	6682134	6682139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310822622
152550	NC_014623	CG	3	6	6682156	6682161	0 %	0 %	50 %	50 %	310822622
152551	NC_014623	CCG	2	6	6682174	6682179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822622
152552	NC_014623	CAG	2	6	6682195	6682200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822622
152553	NC_014623	CCG	2	6	6682224	6682229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822622
152554	NC_014623	GAT	2	6	6682234	6682239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822622
152555	NC_014623	TGG	2	6	6682250	6682255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822622
152556	NC_014623	GTA	2	6	6682297	6682302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822622
152557	NC_014623	CAC	2	6	6682318	6682323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822622
152558	NC_014623	GCG	2	6	6682334	6682339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822622
152559	NC_014623	GAA	3	9	6682372	6682380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310822622
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152561	NC_014623	C	6	6	6682431	6682436	0 %	0 %	0 %	100 %	310822622
152562	NC_014623	GC	3	6	6682526	6682531	0 %	0 %	50 %	50 %	310822622
152563	NC_014623	ACCC	2	8	6682539	6682546	25 %	0 %	0 %	75 %	310822622
152564	NC_014623	AGCG	2	8	6682567	6682574	25 %	0 %	50 %	25 %	310822622
152565	NC_014623	GC	3	6	6682653	6682658	0 %	0 %	50 %	50 %	310822622
152566	NC_014623	GGAGA	2	10	6682729	6682738	40 %	0 %	60 %	0 %	310822622
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152570	NC_014623	AGCG	2	8	6682989	6682996	25 %	0 %	50 %	25 %	310822622
152571	NC_014623	CG	3	6	6683017	6683022	0 %	0 %	50 %	50 %	310822623
152572	NC_014623	CCT	2	6	6683048	6683053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822623
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152574	NC_014623	GCA	2	6	6683147	6683152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822623
152575	NC_014623	TGA	2	6	6683219	6683224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822623
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152577	NC_014623	AGT	2	6	6683426	6683431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822623
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152582	NC_014623	TCG	2	6	6683822	6683827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822624
152583	NC_014623	T	7	7	6683837	6683843	0 %	100 %	0 %	0 %	310822624
152584	NC_014623	TGC	2	6	6683939	6683944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822624
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152587	NC_014623	CTG	3	9	6684091	6684099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822624
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152590	NC_014623	GCCGG	2	10	6684162	6684171	0 %	0 %	60 %	40 %	310822624
152591	NC_014623	TCG	2	6	6684176	6684181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822624
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152600	NC_014623	CGGCG	2	10	6684727	6684736	0 %	0 %	60 %	40 %	310822625
152601	NC_014623	GCT	2	6	6684839	6684844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822625
152602	NC_014623	TCG	2	6	6684898	6684903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822625
152603	NC_014623	TTGGA	2	10	6684916	6684925	20 %	40 %	40 %	0 %	310822625
152604	NC_014623	GCTG	2	8	6684940	6684947	0 %	25 %	50 %	25 %	310822625
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152607	NC_014623	GCTTT	2	10	6685040	6685049	0 %	60 %	20 %	20 %	310822625
152608	NC_014623	CTG	2	6	6685062	6685067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822625
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152610	NC_014623	CGA	2	6	6685124	6685129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822625
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152615	NC_014623	GTG	2	6	6685786	6685791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822626
152616	NC_014623	TGCGCG	2	12	6685829	6685840	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310822626
152617	NC_014623	GCG	2	6	6685845	6685850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822626
152618	NC_014623	CGA	2	6	6685851	6685856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822626
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152729	NC_014623	AGG	2	6	6691564	6691569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310822633
152730	NC_014623	AGG	2	6	6691585	6691590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310822633
152731	NC_014623	GAC	2	6	6691596	6691601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822633
152732	NC_014623	TGC	3	9	6691681	6691689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822634
152733	NC_014623	TGC	3	9	6691702	6691710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822634
152734	NC_014623	GCT	2	6	6691718	6691723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822634
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152753	NC_014623	CG	3	6	6692360	6692365	0 %	0 %	50 %	50 %	310822634
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152837	NC_014623	GTCTGC	2	12	6696477	6696488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822639
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