MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
151501	NC_014623	TCG	2	6	6633983	6633988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822584
151502	NC_014623	GGC	2	6	6634044	6634049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822584
151503	NC_014623	GAC	2	6	6634113	6634118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822584
151504	NC_014623	CG	3	6	6634139	6634144	0 %	0 %	50 %	50 %	310822584
151505	NC_014623	AGG	2	6	6634181	6634186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310822584
151506	NC_014623	CGC	2	6	6634197	6634202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822584
151507	NC_014623	GGC	2	6	6634296	6634301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822584
151508	NC_014623	TGG	2	6	6634325	6634330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822584
151509	NC_014623	GTG	2	6	6634381	6634386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822584
151510	NC_014623	GGCG	2	8	6634434	6634441	0 %	0 %	75 %	25 %	310822584
151511	NC_014623	CGA	2	6	6634448	6634453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822584
151512	NC_014623	AG	3	6	6634457	6634462	50 %	0 %	50 %	0 %	310822584
151513	NC_014623	CGC	2	6	6634499	6634504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822584
151514	NC_014623	TGC	2	6	6634529	6634534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822584
151515	NC_014623	GAC	2	6	6634612	6634617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822584
151516	NC_014623	CCG	2	6	6634674	6634679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822584
151517	NC_014623	CCA	2	6	6634796	6634801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822585
151518	NC_014623	AGT	2	6	6634820	6634825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822585
151519	NC_014623	CCG	2	6	6634901	6634906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822585
151520	NC_014623	GTG	2	6	6634924	6634929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822585
151521	NC_014623	TCG	2	6	6634966	6634971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822585
151522	NC_014623	C	6	6	6635025	6635030	0 %	0 %	0 %	100 %	310822585
151523	NC_014623	AGG	2	6	6635062	6635067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310822585
151524	NC_014623	GGCC	2	8	6635113	6635120	0 %	0 %	50 %	50 %	310822585
151525	NC_014623	CAC	2	6	6635163	6635168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822585
151526	NC_014623	CCA	2	6	6635219	6635224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822585
151527	NC_014623	CGA	2	6	6635330	6635335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822585
151528	NC_014623	CATCCT	2	12	6635462	6635473	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	310822585
151529	NC_014623	GGA	2	6	6635486	6635491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310822585
151530	NC_014623	CGC	2	6	6635492	6635497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822585
151531	NC_014623	CGG	2	6	6635534	6635539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822585
151532	NC_014623	CAGGA	2	10	6635581	6635590	40 %	0 %	40 %	20 %	310822585
151533	NC_014623	CCG	2	6	6635616	6635621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822585
151534	NC_014623	CA	3	6	6635705	6635710	50 %	0 %	0 %	50 %	310822585
151535	NC_014623	C	6	6	6635872	6635877	0 %	0 %	0 %	100 %	310822586
151536	NC_014623	CGCA	2	8	6635891	6635898	25 %	0 %	25 %	50 %	310822586
151537	NC_014623	CCG	2	6	6635902	6635907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822586
151538	NC_014623	ACC	2	6	6635997	6636002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822586
151539	NC_014623	TCGGCA	2	12	6636009	6636020	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310822586
151540	NC_014623	CCCG	2	8	6636054	6636061	0 %	0 %	25 %	75 %	310822586
151541	NC_014623	GC	3	6	6636150	6636155	0 %	0 %	50 %	50 %	310822586
151542	NC_014623	CG	3	6	6636243	6636248	0 %	0 %	50 %	50 %	310822586
151543	NC_014623	ACG	2	6	6636249	6636254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822586
151544	NC_014623	CTG	2	6	6636264	6636269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822586
151545	NC_014623	GC	3	6	6636302	6636307	0 %	0 %	50 %	50 %	310822586
151546	NC_014623	AGCCC	2	10	6636316	6636325	20 %	0 %	20 %	60 %	310822586
151547	NC_014623	GCC	2	6	6636349	6636354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822586
151548	NC_014623	GAC	2	6	6636368	6636373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822586
151549	NC_014623	CCT	2	6	6636376	6636381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822586
151550	NC_014623	GCA	2	6	6636412	6636417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822586
151551	NC_014623	CGG	2	6	6636418	6636423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822586
151552	NC_014623	ACG	2	6	6636438	6636443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822586
151553	NC_014623	CGG	2	6	6636455	6636460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822586
151554	NC_014623	GTG	2	6	6636483	6636488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822586
151555	NC_014623	CCA	2	6	6636511	6636516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822586
151556	NC_014623	GC	3	6	6636540	6636545	0 %	0 %	50 %	50 %	310822586
151557	NC_014623	AAC	2	6	6636561	6636566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310822586
151558	NC_014623	CCTG	2	8	6636570	6636577	0 %	25 %	25 %	50 %	310822586
151559	NC_014623	CGC	2	6	6636589	6636594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822586
151560	NC_014623	GC	5	10	6636596	6636605	0 %	0 %	50 %	50 %	310822586
151561	NC_014623	CTC	3	9	6636626	6636634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310822586
151562	NC_014623	CTG	2	6	6636647	6636652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822586
151563	NC_014623	GA	3	6	6636667	6636672	50 %	0 %	50 %	0 %	310822586
151564	NC_014623	CGCGC	2	10	6636679	6636688	0 %	0 %	40 %	60 %	310822586
151565	NC_014623	GC	3	6	6636690	6636695	0 %	0 %	50 %	50 %	310822586
151566	NC_014623	GC	3	6	6636953	6636958	0 %	0 %	50 %	50 %	310822587
151567	NC_014623	GCC	2	6	6637011	6637016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822587
151568	NC_014623	CG	3	6	6637038	6637043	0 %	0 %	50 %	50 %	310822587
151569	NC_014623	AGCA	2	8	6637161	6637168	50 %	0 %	25 %	25 %	310822587
151570	NC_014623	TCG	2	6	6637183	6637188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822587
151571	NC_014623	GTG	2	6	6637191	6637196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822587
151572	NC_014623	GAT	2	6	6637199	6637204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822587
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151574	NC_014623	GC	3	6	6637280	6637285	0 %	0 %	50 %	50 %	310822587
151575	NC_014623	GC	3	6	6637335	6637340	0 %	0 %	50 %	50 %	310822587
151576	NC_014623	ACC	2	6	6637344	6637349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310822587
151577	NC_014623	CGA	2	6	6637394	6637399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822587
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151580	NC_014623	GAT	2	6	6637454	6637459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822587
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151582	NC_014623	CGT	2	6	6637556	6637561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822587
151583	NC_014623	CGA	2	6	6637562	6637567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822587
151584	NC_014623	CT	3	6	6637576	6637581	0 %	50 %	0 %	50 %	310822587
151585	NC_014623	C	6	6	6637680	6637685	0 %	0 %	0 %	100 %	310822587
151586	NC_014623	CGC	2	6	6637704	6637709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310822587
151587	NC_014623	GGT	2	6	6637712	6637717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822587
151588	NC_014623	GC	3	6	6637856	6637861	0 %	0 %	50 %	50 %	310822587
151589	NC_014623	GCG	2	6	6637891	6637896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822587
151590	NC_014623	CG	3	6	6637925	6637930	0 %	0 %	50 %	50 %	310822587
151591	NC_014623	TCG	2	6	6637933	6637938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310822587
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151593	NC_014623	CG	3	6	6637950	6637955	0 %	0 %	50 %	50 %	310822587
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151597	NC_014623	CGA	2	6	6638065	6638070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822587
151598	NC_014623	CGG	2	6	6638147	6638152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822587
151599	NC_014623	ATG	2	6	6638157	6638162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310822587
151600	NC_014623	CGG	2	6	6638182	6638187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310822587
151601	NC_014623	GTG	2	6	6638217	6638222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310822587
151602	NC_014623	CGA	2	6	6638225	6638230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310822587
151603	NC_014623	GC	3	6	6638332	6638337	0 %	0 %	50 %	50 %	310822587
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151606	NC_014623	GACGCC	2	12	6638636	6638647	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310822588
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151611	NC_014623	CGGC	2	8	6638916	6638923	0 %	0 %	50 %	50 %	310822588
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