MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_014623	C	6	6	648654	648659	0 %	0 %	0 %	100 %	310817800
14502	NC_014623	GGCCC	2	10	648661	648670	0 %	0 %	40 %	60 %	310817800
14503	NC_014623	GGC	2	6	648718	648723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817800
14504	NC_014623	CGA	2	6	648750	648755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817800
14505	NC_014623	GCC	2	6	648757	648762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817800
14506	NC_014623	TGA	2	6	648765	648770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817800
14507	NC_014623	GAA	2	6	648790	648795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817800
14508	NC_014623	AACC	2	8	648843	648850	50 %	0 %	0 %	50 %	310817800
14509	NC_014623	GCG	2	6	648904	648909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817800
14510	NC_014623	GTTGTC	2	12	648919	648930	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	310817800
14511	NC_014623	GCC	2	6	648948	648953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817800
14512	NC_014623	GCT	2	6	648957	648962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817800
14513	NC_014623	TGA	2	6	648996	649001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817800
14514	NC_014623	GAG	2	6	649034	649039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817800
14515	NC_014623	TCC	2	6	649073	649078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817800
14516	NC_014623	GCG	2	6	649079	649084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817800
14517	NC_014623	CTT	2	6	649138	649143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817800
14518	NC_014623	GGT	2	6	649146	649151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817800
14519	NC_014623	AC	3	6	649153	649158	50 %	0 %	0 %	50 %	310817800
14520	NC_014623	TCG	2	6	649215	649220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817800
14521	NC_014623	CAC	2	6	649228	649233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817800
14522	NC_014623	CGC	2	6	649242	649247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817800
14523	NC_014623	GAT	2	6	649255	649260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817800
14524	NC_014623	C	6	6	649277	649282	0 %	0 %	0 %	100 %	310817800
14525	NC_014623	GGC	2	6	649324	649329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817800
14526	NC_014623	GCC	2	6	649348	649353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817800
14527	NC_014623	CAGG	2	8	649411	649418	25 %	0 %	50 %	25 %	310817800
14528	NC_014623	GGC	2	6	649426	649431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817800
14529	NC_014623	CAG	2	6	649492	649497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817800
14530	NC_014623	GCCC	2	8	649498	649505	0 %	0 %	25 %	75 %	310817800
14531	NC_014623	TTGCCC	2	12	649517	649528	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	310817800
14532	NC_014623	GGT	2	6	649603	649608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817800
14533	NC_014623	GCC	3	9	649636	649644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817800
14534	NC_014623	GGT	2	6	649651	649656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817800
14535	NC_014623	CTG	2	6	649684	649689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817800
14536	NC_014623	GCC	2	6	649720	649725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817800
14537	NC_014623	CGG	2	6	649746	649751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817800
14538	NC_014623	GGT	2	6	649762	649767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817800
14539	NC_014623	CAC	2	6	649774	649779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817800
14540	NC_014623	TGCCGA	2	12	649821	649832	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310817800
14541	NC_014623	GAT	2	6	649885	649890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817800
14542	NC_014623	GC	3	6	649893	649898	0 %	0 %	50 %	50 %	310817800
14543	NC_014623	GAC	2	6	649903	649908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817800
14544	NC_014623	GCA	2	6	649962	649967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817800
14545	NC_014623	GCC	3	9	649972	649980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817800
14546	NC_014623	TCG	2	6	649991	649996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817800
14547	NC_014623	GTG	2	6	650066	650071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817800
14548	NC_014623	TCC	2	6	650122	650127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817801
14549	NC_014623	GC	3	6	650164	650169	0 %	0 %	50 %	50 %	310817801
14550	NC_014623	GCC	2	6	650211	650216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817801
14551	NC_014623	ACCA	2	8	650245	650252	50 %	0 %	0 %	50 %	310817801
14552	NC_014623	TGGTC	2	10	650261	650270	0 %	40 %	40 %	20 %	310817801
14553	NC_014623	CCG	2	6	650285	650290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817801
14554	NC_014623	GCC	3	9	650309	650317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817801
14555	NC_014623	GCCCGG	2	12	650323	650334	0 %	0 %	50 %	50 %	310817801
14556	NC_014623	CCCGG	2	10	650432	650441	0 %	0 %	40 %	60 %	310817801
14557	NC_014623	CAGCG	2	10	650521	650530	20 %	0 %	40 %	40 %	310817801
14558	NC_014623	GCA	2	6	650531	650536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817801
14559	NC_014623	GCTCGA	2	12	650579	650590	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310817801
14560	NC_014623	GC	3	6	650684	650689	0 %	0 %	50 %	50 %	310817801
14561	NC_014623	CAG	2	6	650694	650699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817801
14562	NC_014623	AGTTG	2	10	650795	650804	20 %	40 %	40 %	0 %	310817801
14563	NC_014623	CAG	2	6	651015	651020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817802
14564	NC_014623	GCC	2	6	651082	651087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817802
14565	NC_014623	GGA	2	6	651089	651094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817802
14566	NC_014623	GAGCG	2	10	651132	651141	20 %	0 %	60 %	20 %	310817802
14567	NC_014623	GCG	3	9	651190	651198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817802
14568	NC_014623	AGC	2	6	651280	651285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817802
14569	NC_014623	TCG	2	6	651292	651297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817802
14570	NC_014623	AAC	2	6	651298	651303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817802
14571	NC_014623	GCG	2	6	651372	651377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817802
14572	NC_014623	GTG	2	6	651382	651387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817802
14573	NC_014623	GTG	2	6	651469	651474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817802
14574	NC_014623	AGG	2	6	651580	651585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817802
14575	NC_014623	GGT	2	6	651623	651628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817802
14576	NC_014623	CCA	2	6	651635	651640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817802
14577	NC_014623	GGC	2	6	651672	651677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817802
14578	NC_014623	CAC	2	6	651735	651740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817802
14579	NC_014623	GTGC	2	8	651742	651749	0 %	25 %	50 %	25 %	310817802
14580	NC_014623	G	6	6	651842	651847	0 %	0 %	100 %	0 %	310817803
14581	NC_014623	G	7	7	651865	651871	0 %	0 %	100 %	0 %	310817803
14582	NC_014623	CGG	2	6	651878	651883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817803
14583	NC_014623	GTG	2	6	651894	651899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817803
14584	NC_014623	CTT	2	6	651912	651917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817803
14585	NC_014623	CGTTC	2	10	651998	652007	0 %	40 %	20 %	40 %	310817803
14586	NC_014623	CATC	2	8	652008	652015	25 %	25 %	0 %	50 %	310817803
14587	NC_014623	GTG	2	6	652071	652076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817804
14588	NC_014623	CG	3	6	652115	652120	0 %	0 %	50 %	50 %	310817804
14589	NC_014623	GTG	2	6	652132	652137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817804
14590	NC_014623	C	7	7	652142	652148	0 %	0 %	0 %	100 %	310817804
14591	NC_014623	CCGC	2	8	652211	652218	0 %	0 %	25 %	75 %	310817804
14592	NC_014623	TCT	2	6	652244	652249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817804
14593	NC_014623	GAC	2	6	652264	652269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817804
14594	NC_014623	GC	3	6	652314	652319	0 %	0 %	50 %	50 %	310817804
14595	NC_014623	AGC	2	6	652382	652387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817804
14596	NC_014623	CG	3	6	652389	652394	0 %	0 %	50 %	50 %	310817804
14597	NC_014623	TCA	2	6	652415	652420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817804
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14599	NC_014623	AGC	2	6	652474	652479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817804
14600	NC_014623	CCA	2	6	652514	652519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817804
14601	NC_014623	GAT	2	6	652522	652527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817804
14602	NC_014623	GCC	2	6	652532	652537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817804
14603	NC_014623	TCCT	2	8	652552	652559	0 %	50 %	0 %	50 %	310817804
14604	NC_014623	CCG	2	6	652628	652633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817804
14605	NC_014623	GGA	2	6	652650	652655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817804
14606	NC_014623	GGCG	2	8	652665	652672	0 %	0 %	75 %	25 %	310817804
14607	NC_014623	CG	3	6	652710	652715	0 %	0 %	50 %	50 %	310817804
14608	NC_014623	CCA	2	6	652727	652732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817804
14609	NC_014623	CTG	2	6	652744	652749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817804
14610	NC_014623	GCC	2	6	652750	652755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817804
14611	NC_014623	GC	3	6	652812	652817	0 %	0 %	50 %	50 %	310817804
14612	NC_014623	CGC	2	6	652823	652828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817804
14613	NC_014623	TGG	2	6	652933	652938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817804
14614	NC_014623	ATC	2	6	652966	652971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817804
14615	NC_014623	TGC	2	6	652988	652993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817804
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14617	NC_014623	TGG	2	6	653099	653104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817804
14618	NC_014623	TGC	2	6	653108	653113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817804
14619	NC_014623	GGA	2	6	653118	653123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817804
14620	NC_014623	GCCC	2	8	653131	653138	0 %	0 %	25 %	75 %	310817804
14621	NC_014623	GCT	2	6	653154	653159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817804
14622	NC_014623	AGCCCA	2	12	653165	653176	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310817804
14623	NC_014623	TTC	2	6	653194	653199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817804
14624	NC_014623	AAG	2	6	653263	653268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817804
14625	NC_014623	AGC	2	6	653270	653275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817804
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14630	NC_014623	GCC	2	6	653515	653520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817804
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14635	NC_014623	AAG	2	6	653785	653790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817804
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14643	NC_014623	AGGG	2	8	654166	654173	25 %	0 %	75 %	0 %	310817804
14644	NC_014623	GC	3	6	654193	654198	0 %	0 %	50 %	50 %	310817804
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14655	NC_014623	GGC	2	6	654486	654491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817804
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14860	NC_014623	TGC	2	6	662570	662575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817809
14861	NC_014623	CGG	2	6	662585	662590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817809
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14982	NC_014623	TCG	2	6	668190	668195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817814
14983	NC_014623	CCG	2	6	668196	668201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817814
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14987	NC_014623	GTC	2	6	668351	668356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817815
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