MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014623	GCT	2	6	45237	45242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1002	NC_014623	GCC	2	6	45287	45292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817306
1003	NC_014623	GCA	2	6	45318	45323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1004	NC_014623	CAG	2	6	45370	45375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1005	NC_014623	CGA	2	6	45396	45401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1006	NC_014623	GGA	3	9	45408	45416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817306
1007	NC_014623	GGC	2	6	45424	45429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817306
1008	NC_014623	GCA	2	6	45484	45489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1009	NC_014623	GCT	2	6	45498	45503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1010	NC_014623	AGC	2	6	45542	45547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1011	NC_014623	GGC	2	6	45557	45562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817306
1012	NC_014623	GAT	2	6	45571	45576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817306
1013	NC_014623	CAC	2	6	45604	45609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817306
1014	NC_014623	GCC	2	6	45629	45634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817306
1015	NC_014623	GCC	2	6	45645	45650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817306
1016	NC_014623	CTC	2	6	45664	45669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817306
1017	NC_014623	AGC	2	6	45680	45685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1018	NC_014623	CGC	2	6	45718	45723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817306
1019	NC_014623	GTA	2	6	45763	45768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817306
1020	NC_014623	CGAG	2	8	45807	45814	25 %	0 %	50 %	25 %	310817306
1021	NC_014623	AGC	2	6	45848	45853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1022	NC_014623	TCG	2	6	45890	45895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1023	NC_014623	GGA	2	6	45972	45977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817306
1024	NC_014623	TTC	2	6	46070	46075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817306
1025	NC_014623	CAG	2	6	46078	46083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1026	NC_014623	TCA	2	6	46086	46091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817306
1027	NC_014623	GCA	2	6	46125	46130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1028	NC_014623	CAT	2	6	46177	46182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817306
1029	NC_014623	AGC	2	6	46214	46219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1030	NC_014623	GCT	2	6	46323	46328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1031	NC_014623	GAT	2	6	46447	46452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817306
1032	NC_014623	GCG	2	6	46453	46458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817306
1033	NC_014623	CAC	2	6	46474	46479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817306
1034	NC_014623	TGCCG	2	10	46593	46602	0 %	20 %	40 %	40 %	310817306
1035	NC_014623	CTC	2	6	46681	46686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817306
1036	NC_014623	TCC	2	6	46700	46705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817306
1037	NC_014623	GCT	2	6	46728	46733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817306
1038	NC_014623	CG	5	10	46744	46753	0 %	0 %	50 %	50 %	310817306
1039	NC_014623	TGG	2	6	46815	46820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817306
1040	NC_014623	GCCT	2	8	46902	46909	0 %	25 %	25 %	50 %	310817307
1041	NC_014623	GC	3	6	46928	46933	0 %	0 %	50 %	50 %	310817307
1042	NC_014623	CCG	2	6	46949	46954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817307
1043	NC_014623	GGC	2	6	47009	47014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817307
1044	NC_014623	TGA	2	6	47117	47122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817307
1045	NC_014623	GGC	2	6	47157	47162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817307
1046	NC_014623	CGC	2	6	47169	47174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817307
1047	NC_014623	GCC	2	6	47207	47212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817307
1048	NC_014623	CA	3	6	47228	47233	50 %	0 %	0 %	50 %	310817307
1049	NC_014623	ACC	2	6	47377	47382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817307
1050	NC_014623	CCA	2	6	47408	47413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817307
1051	NC_014623	GCA	2	6	47579	47584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817307
1052	NC_014623	CAG	2	6	47601	47606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817307
1053	NC_014623	CCG	2	6	47645	47650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817307
1054	NC_014623	TCA	2	6	47759	47764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817307
1055	NC_014623	TGT	2	6	47774	47779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817307
1056	NC_014623	ACC	2	6	47806	47811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817307
1057	NC_014623	GAC	2	6	47889	47894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817307
1058	NC_014623	TCG	2	6	48025	48030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817307
1059	NC_014623	GGC	2	6	48045	48050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817307
1060	NC_014623	CGG	2	6	48052	48057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817307
1061	NC_014623	CGC	2	6	48081	48086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817307
1062	NC_014623	GCG	2	6	48111	48116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817307
1063	NC_014623	GAA	2	6	48144	48149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817307
1064	NC_014623	GCA	2	6	48176	48181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817307
1065	NC_014623	GGGA	2	8	48185	48192	25 %	0 %	75 %	0 %	310817307
1066	NC_014623	CGA	2	6	48230	48235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817307
1067	NC_014623	CCA	2	6	48278	48283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817307
1068	NC_014623	GCT	2	6	48335	48340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817307
1069	NC_014623	G	6	6	48356	48361	0 %	0 %	100 %	0 %	310817307
1070	NC_014623	GCG	2	6	48380	48385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817307
1071	NC_014623	CGG	2	6	48389	48394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817307
1072	NC_014623	CAC	2	6	48441	48446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817307
1073	NC_014623	GTG	2	6	48495	48500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817307
1074	NC_014623	GCCG	2	8	48507	48514	0 %	0 %	50 %	50 %	310817307
1075	NC_014623	GCG	2	6	48520	48525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817307
1076	NC_014623	CTG	2	6	48543	48548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817307
1077	NC_014623	GGA	2	6	48567	48572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817307
1078	NC_014623	GC	3	6	48597	48602	0 %	0 %	50 %	50 %	310817307
1079	NC_014623	AGC	2	6	48622	48627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817307
1080	NC_014623	GAC	2	6	48678	48683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817307
1081	NC_014623	CCG	2	6	48832	48837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817307
1082	NC_014623	TCC	2	6	48845	48850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817307
1083	NC_014623	AGC	2	6	49069	49074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817308
1084	NC_014623	C	7	7	49074	49080	0 %	0 %	0 %	100 %	310817308
1085	NC_014623	GGC	2	6	49137	49142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817308
1086	NC_014623	C	7	7	49206	49212	0 %	0 %	0 %	100 %	310817308
1087	NC_014623	AGG	2	6	49213	49218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817308
1088	NC_014623	G	6	6	49226	49231	0 %	0 %	100 %	0 %	310817308
1089	NC_014623	C	8	8	49250	49257	0 %	0 %	0 %	100 %	310817308
1090	NC_014623	GTT	2	6	49290	49295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817308
1091	NC_014623	AGA	2	6	49349	49354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817308
1092	NC_014623	ACAG	2	8	49397	49404	50 %	0 %	25 %	25 %	310817308
1093	NC_014623	GC	3	6	49439	49444	0 %	0 %	50 %	50 %	310817308
1094	NC_014623	CAC	2	6	49458	49463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817308
1095	NC_014623	GCG	2	6	49468	49473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817308
1096	NC_014623	GC	3	6	49485	49490	0 %	0 %	50 %	50 %	310817308
1097	NC_014623	GAA	2	6	49506	49511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817308
1098	NC_014623	CGCCC	2	10	49512	49521	0 %	0 %	20 %	80 %	310817308
1099	NC_014623	GC	3	6	49535	49540	0 %	0 %	50 %	50 %	310817308
1100	NC_014623	CTC	2	6	49562	49567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817308
1101	NC_014623	CAG	2	6	49572	49577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817308
1102	NC_014623	GGCCCA	2	12	49620	49631	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310817308
1103	NC_014623	CCGT	2	8	49727	49734	0 %	25 %	25 %	50 %	310817308
1104	NC_014623	CA	3	6	49745	49750	50 %	0 %	0 %	50 %	310817308
1105	NC_014623	TCC	2	6	49789	49794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817308
1106	NC_014623	GGGT	2	8	49795	49802	0 %	25 %	75 %	0 %	310817308
1107	NC_014623	GCGG	2	8	49809	49816	0 %	0 %	75 %	25 %	310817308
1108	NC_014623	AGG	2	6	50028	50033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817309
1109	NC_014623	ATG	2	6	50222	50227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817309
1110	NC_014623	AGC	2	6	50277	50282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817309
1111	NC_014623	CAC	2	6	50305	50310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817309
1112	NC_014623	ACT	2	6	50328	50333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817309
1113	NC_014623	ACC	2	6	50352	50357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817309
1114	NC_014623	CTGG	2	8	50371	50378	0 %	25 %	50 %	25 %	310817309
1115	NC_014623	CTG	2	6	50399	50404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817309
1116	NC_014623	CAG	2	6	50435	50440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817309
1117	NC_014623	GGT	2	6	50443	50448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817309
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1119	NC_014623	GCC	2	6	50460	50465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817309
1120	NC_014623	TTA	2	6	50539	50544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310817309
1121	NC_014623	GCA	2	6	50547	50552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817309
1122	NC_014623	GGC	2	6	50578	50583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817309
1123	NC_014623	TTC	2	6	50606	50611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817309
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1252	NC_014623	CA	3	6	55509	55514	50 %	0 %	0 %	50 %	310817313
1253	NC_014623	GGC	2	6	55525	55530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817313
1254	NC_014623	GCG	2	6	55535	55540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817313
1255	NC_014623	GTA	2	6	55555	55560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817313
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1260	NC_014623	CCG	2	6	55788	55793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817313
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