MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_014623	GCT	2	6	606292	606297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817767
13502	NC_014623	GGC	2	6	606326	606331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817767
13503	NC_014623	G	6	6	606353	606358	0 %	0 %	100 %	0 %	310817767
13504	NC_014623	CGC	2	6	606789	606794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817768
13505	NC_014623	GCG	2	6	606825	606830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817768
13506	NC_014623	GCC	2	6	606834	606839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817768
13507	NC_014623	TCG	2	6	606901	606906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817768
13508	NC_014623	CGC	2	6	606917	606922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817768
13509	NC_014623	CTC	2	6	606959	606964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817768
13510	NC_014623	GCG	2	6	606979	606984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817768
13511	NC_014623	CAT	2	6	606989	606994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817768
13512	NC_014623	CAT	2	6	607130	607135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817768
13513	NC_014623	GCT	2	6	607181	607186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817768
13514	NC_014623	TCC	2	6	607194	607199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817768
13515	NC_014623	CGGC	2	8	607258	607265	0 %	0 %	50 %	50 %	310817768
13516	NC_014623	CGT	2	6	607280	607285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817768
13517	NC_014623	CAC	2	6	607307	607312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817768
13518	NC_014623	TCG	2	6	607314	607319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817768
13519	NC_014623	GCA	3	9	607321	607329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817768
13520	NC_014623	ACG	2	6	607338	607343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817768
13521	NC_014623	CGT	2	6	607364	607369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817768
13522	NC_014623	CGC	2	6	607424	607429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817768
13523	NC_014623	CGC	2	6	607436	607441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817768
13524	NC_014623	GGT	2	6	607473	607478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817768
13525	NC_014623	GTG	2	6	607485	607490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817768
13526	NC_014623	GTG	2	6	607521	607526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817768
13527	NC_014623	GC	3	6	607543	607548	0 %	0 %	50 %	50 %	310817768
13528	NC_014623	CG	4	8	607571	607578	0 %	0 %	50 %	50 %	310817768
13529	NC_014623	GTC	2	6	607580	607585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817768
13530	NC_014623	CAT	2	6	607607	607612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817768
13531	NC_014623	CTC	2	6	607625	607630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817768
13532	NC_014623	CGG	2	6	607654	607659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817768
13533	NC_014623	GCCG	2	8	607694	607701	0 %	0 %	50 %	50 %	310817768
13534	NC_014623	GGC	2	6	607721	607726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817768
13535	NC_014623	CGG	2	6	607730	607735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817768
13536	NC_014623	GCC	2	6	607795	607800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817768
13537	NC_014623	CGGG	2	8	607845	607852	0 %	0 %	75 %	25 %	310817768
13538	NC_014623	CCG	2	6	607882	607887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817768
13539	NC_014623	CGC	2	6	608083	608088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817769
13540	NC_014623	AGG	2	6	608133	608138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817769
13541	NC_014623	CCGGCC	2	12	608141	608152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817769
13542	NC_014623	TCT	2	6	608159	608164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817769
13543	NC_014623	CGG	3	9	608166	608174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817769
13544	NC_014623	CGG	2	6	608187	608192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817769
13545	NC_014623	C	7	7	608207	608213	0 %	0 %	0 %	100 %	310817769
13546	NC_014623	GGT	2	6	608284	608289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817769
13547	NC_014623	GC	3	6	608426	608431	0 %	0 %	50 %	50 %	310817769
13548	NC_014623	CTC	2	6	608455	608460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817769
13549	NC_014623	CAA	2	6	608491	608496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817769
13550	NC_014623	GTGCGC	2	12	608513	608524	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310817769
13551	NC_014623	CCCA	2	8	608577	608584	25 %	0 %	0 %	75 %	310817770
13552	NC_014623	TCT	2	6	608619	608624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817770
13553	NC_014623	GAA	2	6	608647	608652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817770
13554	NC_014623	GAA	2	6	608671	608676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817770
13555	NC_014623	GTC	2	6	608701	608706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817770
13556	NC_014623	GC	3	6	608723	608728	0 %	0 %	50 %	50 %	310817770
13557	NC_014623	CGTG	2	8	608856	608863	0 %	25 %	50 %	25 %	310817770
13558	NC_014623	GTGGC	2	10	608867	608876	0 %	20 %	60 %	20 %	310817770
13559	NC_014623	CGT	2	6	608877	608882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817770
13560	NC_014623	TTC	2	6	608939	608944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817770
13561	NC_014623	GAC	2	6	608956	608961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817770
13562	NC_014623	GGCG	2	8	609051	609058	0 %	0 %	75 %	25 %	310817770
13563	NC_014623	GCAC	2	8	609077	609084	25 %	0 %	25 %	50 %	310817770
13564	NC_014623	TCG	2	6	609086	609091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817770
13565	NC_014623	GCC	2	6	609103	609108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817770
13566	NC_014623	GC	4	8	609198	609205	0 %	0 %	50 %	50 %	310817770
13567	NC_014623	CGG	2	6	609228	609233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817770
13568	NC_014623	GCG	2	6	609241	609246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817770
13569	NC_014623	CAG	2	6	609247	609252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817770
13570	NC_014623	GCG	3	9	609253	609261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817770
13571	NC_014623	GATG	2	8	610258	610265	25 %	25 %	50 %	0 %	310817771
13572	NC_014623	TTC	2	6	610286	610291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817771
13573	NC_014623	CTC	2	6	610378	610383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817771
13574	NC_014623	GCC	3	9	610542	610550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817771
13575	NC_014623	TGA	2	6	610613	610618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817771
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13577	NC_014623	GA	3	6	610648	610653	50 %	0 %	50 %	0 %	310817771
13578	NC_014623	TTC	2	6	610655	610660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817771
13579	NC_014623	CTG	2	6	610675	610680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817771
13580	NC_014623	GGT	2	6	610902	610907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817771
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13582	NC_014623	GCC	2	6	610966	610971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817771
13583	NC_014623	CGG	2	6	611133	611138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817771
13584	NC_014623	CCG	2	6	611167	611172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817771
13585	NC_014623	GCCTC	2	10	611226	611235	0 %	20 %	20 %	60 %	310817771
13586	NC_014623	ATC	2	6	611246	611251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817771
13587	NC_014623	CTG	2	6	611328	611333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817772
13588	NC_014623	CCTCGT	2	12	611399	611410	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	310817772
13589	NC_014623	TCA	2	6	611587	611592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817772
13590	NC_014623	GGA	2	6	611597	611602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817772
13591	NC_014623	GGT	2	6	611723	611728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817773
13592	NC_014623	CCT	2	6	611737	611742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817773
13593	NC_014623	GCC	2	6	611762	611767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817773
13594	NC_014623	CTG	2	6	611783	611788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817773
13595	NC_014623	CAGTCC	2	12	611804	611815	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310817773
13596	NC_014623	TGGG	2	8	611822	611829	0 %	25 %	75 %	0 %	310817773
13597	NC_014623	CGCC	2	8	611833	611840	0 %	0 %	25 %	75 %	310817773
13598	NC_014623	GGA	2	6	611883	611888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817773
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13600	NC_014623	CGC	2	6	611929	611934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817773
13601	NC_014623	GAG	2	6	611939	611944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817773
13602	NC_014623	TCC	2	6	612099	612104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817773
13603	NC_014623	GGC	2	6	612112	612117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817773
13604	NC_014623	ATC	2	6	612201	612206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817773
13605	NC_014623	CCGT	2	8	612270	612277	0 %	25 %	25 %	50 %	310817773
13606	NC_014623	GCA	3	9	612280	612288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817773
13607	NC_014623	AGG	2	6	612300	612305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817773
13608	NC_014623	GAC	2	6	612338	612343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817773
13609	NC_014623	CCG	2	6	612367	612372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817773
13610	NC_014623	CTG	2	6	612392	612397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817773
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13612	NC_014623	CGC	2	6	612567	612572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817773
13613	NC_014623	GAC	2	6	612605	612610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817773
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13615	NC_014623	AGC	2	6	612747	612752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817773
13616	NC_014623	TCG	2	6	612798	612803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817773
13617	NC_014623	G	6	6	612850	612855	0 %	0 %	100 %	0 %	310817773
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13619	NC_014623	GC	3	6	612875	612880	0 %	0 %	50 %	50 %	310817773
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13860	NC_014623	GCCG	2	8	622252	622259	0 %	0 %	50 %	50 %	310817778
13861	NC_014623	CG	3	6	622271	622276	0 %	0 %	50 %	50 %	310817778
13862	NC_014623	GAC	2	6	622304	622309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817778
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13864	NC_014623	TCG	2	6	622347	622352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817778
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13965	NC_014623	GAT	2	6	626437	626442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817781
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13970	NC_014623	GCT	3	9	626557	626565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817781
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13973	NC_014623	TTC	2	6	626711	626716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817781
13974	NC_014623	G	7	7	626726	626732	0 %	0 %	100 %	0 %	310817781
13975	NC_014623	TGG	2	6	626763	626768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817781
13976	NC_014623	ATC	2	6	626909	626914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817781
13977	NC_014623	CCG	3	9	626925	626933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817781
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13981	NC_014623	TGA	2	6	627116	627121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817782
13982	NC_014623	GAG	2	6	627156	627161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817782
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