MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014623	CCA	2	6	588138	588143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817751
13002	NC_014623	GCA	2	6	588150	588155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817751
13003	NC_014623	CGA	2	6	588540	588545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817752
13004	NC_014623	TGG	2	6	588579	588584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817752
13005	NC_014623	C	6	6	588602	588607	0 %	0 %	0 %	100 %	310817752
13006	NC_014623	CCG	2	6	588712	588717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817752
13007	NC_014623	TCCGCC	2	12	588725	588736	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	310817752
13008	NC_014623	GCC	2	6	588746	588751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817752
13009	NC_014623	GGT	2	6	588792	588797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817752
13010	NC_014623	CGC	2	6	588814	588819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817752
13011	NC_014623	CGC	2	6	588850	588855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817752
13012	NC_014623	ATC	2	6	588885	588890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817752
13013	NC_014623	CGCC	2	8	588910	588917	0 %	0 %	25 %	75 %	310817752
13014	NC_014623	CAC	2	6	588928	588933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817752
13015	NC_014623	GCA	2	6	588936	588941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817752
13016	NC_014623	CCG	2	6	588942	588947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817752
13017	NC_014623	ACG	2	6	589002	589007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817752
13018	NC_014623	GGC	2	6	589096	589101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817752
13019	NC_014623	TCG	2	6	589122	589127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817752
13020	NC_014623	GCG	2	6	589176	589181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817752
13021	NC_014623	GCAC	2	8	589188	589195	25 %	0 %	25 %	50 %	310817752
13022	NC_014623	CGG	2	6	589197	589202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817752
13023	NC_014623	CCA	2	6	589203	589208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817752
13024	NC_014623	TCG	2	6	589209	589214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817752
13025	NC_014623	CCG	2	6	589257	589262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817752
13026	NC_014623	GTG	2	6	589265	589270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817752
13027	NC_014623	GCT	2	6	589291	589296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817752
13028	NC_014623	GC	3	6	589301	589306	0 %	0 %	50 %	50 %	310817752
13029	NC_014623	TC	3	6	589345	589350	0 %	50 %	0 %	50 %	310817752
13030	NC_014623	GTG	2	6	589360	589365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817752
13031	NC_014623	GAAG	2	8	589369	589376	50 %	0 %	50 %	0 %	310817752
13032	NC_014623	GCC	2	6	589535	589540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817752
13033	NC_014623	TGG	2	6	589623	589628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817752
13034	NC_014623	CCG	2	6	589650	589655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817752
13035	NC_014623	GCTC	2	8	589716	589723	0 %	25 %	25 %	50 %	310817752
13036	NC_014623	GCC	2	6	589802	589807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817752
13037	NC_014623	TCG	2	6	589821	589826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817752
13038	NC_014623	AAG	2	6	589880	589885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817752
13039	NC_014623	CG	3	6	589901	589906	0 %	0 %	50 %	50 %	310817752
13040	NC_014623	GC	5	10	589908	589917	0 %	0 %	50 %	50 %	310817752
13041	NC_014623	TCA	2	6	589920	589925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817752
13042	NC_014623	CAA	2	6	589930	589935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817752
13043	NC_014623	AAG	2	6	590030	590035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817752
13044	NC_014623	GC	3	6	590145	590150	0 %	0 %	50 %	50 %	310817752
13045	NC_014623	CCG	2	6	590163	590168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817752
13046	NC_014623	CCG	2	6	590196	590201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817752
13047	NC_014623	ACG	2	6	590238	590243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817752
13048	NC_014623	GCT	2	6	590284	590289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817752
13049	NC_014623	GGCGA	2	10	590327	590336	20 %	0 %	60 %	20 %	310817753
13050	NC_014623	AGGC	2	8	590339	590346	25 %	0 %	50 %	25 %	310817753
13051	NC_014623	CGC	2	6	590365	590370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817753
13052	NC_014623	GCT	2	6	590380	590385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817753
13053	NC_014623	CAG	2	6	590401	590406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817753
13054	NC_014623	CCT	2	6	590421	590426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817753
13055	NC_014623	TCG	2	6	590438	590443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817753
13056	NC_014623	GGA	2	6	590446	590451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817753
13057	NC_014623	G	6	6	590455	590460	0 %	0 %	100 %	0 %	310817753
13058	NC_014623	GCC	2	6	590495	590500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817753
13059	NC_014623	CGG	2	6	590569	590574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817753
13060	NC_014623	GC	3	6	590581	590586	0 %	0 %	50 %	50 %	310817753
13061	NC_014623	GCG	2	6	590647	590652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817753
13062	NC_014623	GC	3	6	590703	590708	0 %	0 %	50 %	50 %	310817753
13063	NC_014623	GC	3	6	590730	590735	0 %	0 %	50 %	50 %	310817753
13064	NC_014623	CAG	2	6	590773	590778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817753
13065	NC_014623	G	6	6	590804	590809	0 %	0 %	100 %	0 %	310817753
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13067	NC_014623	CG	4	8	590860	590867	0 %	0 %	50 %	50 %	310817754
13068	NC_014623	TTC	2	6	590878	590883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817754
13069	NC_014623	GCA	3	9	590948	590956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817754
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13071	NC_014623	GCA	2	6	591053	591058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817754
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13074	NC_014623	GC	3	6	591141	591146	0 %	0 %	50 %	50 %	310817754
13075	NC_014623	CAG	2	6	591153	591158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817754
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13079	NC_014623	GTG	2	6	591673	591678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817755
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13084	NC_014623	CGG	2	6	591962	591967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817755
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13089	NC_014623	GC	3	6	592292	592297	0 %	0 %	50 %	50 %	310817755
13090	NC_014623	GGGCT	2	10	592313	592322	0 %	20 %	60 %	20 %	310817756
13091	NC_014623	CG	3	6	592339	592344	0 %	0 %	50 %	50 %	310817756
13092	NC_014623	CCA	2	6	592369	592374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817756
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13100	NC_014623	CAG	3	9	592610	592618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817756
13101	NC_014623	GC	3	6	592669	592674	0 %	0 %	50 %	50 %	310817756
13102	NC_014623	GTG	2	6	592683	592688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817756
13103	NC_014623	ATCC	3	12	592707	592718	25 %	25 %	0 %	50 %	310817756
13104	NC_014623	CG	3	6	592754	592759	0 %	0 %	50 %	50 %	310817756
13105	NC_014623	CAG	2	6	592760	592765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817756
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13107	NC_014623	CAG	2	6	592817	592822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817756
13108	NC_014623	TAG	2	6	593104	593109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817757
13109	NC_014623	GGGT	2	8	593111	593118	0 %	25 %	75 %	0 %	310817757
13110	NC_014623	GCG	2	6	593150	593155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817757
13111	NC_014623	CGC	2	6	593205	593210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817757
13112	NC_014623	GCG	2	6	593211	593216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817757
13113	NC_014623	AGGG	2	8	593224	593231	25 %	0 %	75 %	0 %	310817757
13114	NC_014623	CCG	2	6	593285	593290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817757
13115	NC_014623	TCGTC	2	10	593300	593309	0 %	40 %	20 %	40 %	310817757
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13118	NC_014623	GAC	2	6	593598	593603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817757
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13120	NC_014623	ATG	2	6	594099	594104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817758
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13361	NC_014623	GC	3	6	601573	601578	0 %	0 %	50 %	50 %	310817764
13362	NC_014623	CGC	4	12	601576	601587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817764
13363	NC_014623	CTG	2	6	601588	601593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817764
13364	NC_014623	GTG	2	6	601594	601599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817764
13365	NC_014623	GAC	2	6	601600	601605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817764
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13370	NC_014623	CCG	2	6	601676	601681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817764
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13375	NC_014623	CAT	2	6	601773	601778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817764
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13379	NC_014623	CTG	2	6	601930	601935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817764
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13424	NC_014623	TCC	2	6	604014	604019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817766
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13467	NC_014623	CG	4	8	605350	605357	0 %	0 %	50 %	50 %	310817766
13468	NC_014623	CTG	2	6	605369	605374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817766
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13474	NC_014623	TCG	2	6	605532	605537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817766
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13478	NC_014623	GAT	2	6	605711	605716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817767
13479	NC_014623	GAA	2	6	605720	605725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817767
13480	NC_014623	CGA	2	6	605740	605745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817767
13481	NC_014623	CGG	2	6	605779	605784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817767
13482	NC_014623	GCA	2	6	605803	605808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817767
13483	NC_014623	CGA	2	6	605824	605829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817767
13484	NC_014623	CGG	2	6	605851	605856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817767
13485	NC_014623	CG	4	8	605866	605873	0 %	0 %	50 %	50 %	310817767
13486	NC_014623	TGCC	2	8	605898	605905	0 %	25 %	25 %	50 %	310817767
13487	NC_014623	CGC	2	6	605976	605981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817767
13488	NC_014623	C	6	6	605988	605993	0 %	0 %	0 %	100 %	310817767
13489	NC_014623	GTG	2	6	606033	606038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817767
13490	NC_014623	GCT	2	6	606109	606114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817767
13491	NC_014623	CCT	2	6	606127	606132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817767
13492	NC_014623	TCC	3	9	606138	606146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817767
13493	NC_014623	G	6	6	606147	606152	0 %	0 %	100 %	0 %	310817767
13494	NC_014623	TGGGC	2	10	606157	606166	0 %	20 %	60 %	20 %	310817767
13495	NC_014623	CAC	2	6	606167	606172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817767
13496	NC_014623	CCA	2	6	606196	606201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817767
13497	NC_014623	CTC	2	6	606203	606208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817767
13498	NC_014623	GAT	2	6	606209	606214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817767
13499	NC_014623	TCC	2	6	606234	606239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817767
13500	NC_014623	AGG	2	6	606261	606266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817767

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