MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_014623	GAG	2	6	560718	560723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817729
12502	NC_014623	GCC	2	6	560748	560753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817729
12503	NC_014623	GCC	2	6	560787	560792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817729
12504	NC_014623	GAG	2	6	560796	560801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817729
12505	NC_014623	CGG	2	6	560836	560841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817729
12506	NC_014623	CTC	2	6	560853	560858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817729
12507	NC_014623	CAC	2	6	560909	560914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817729
12508	NC_014623	GC	3	6	560932	560937	0 %	0 %	50 %	50 %	310817729
12509	NC_014623	GGA	2	6	561008	561013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817729
12510	NC_014623	TTC	2	6	561030	561035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817729
12511	NC_014623	CACC	2	8	561038	561045	25 %	0 %	0 %	75 %	310817729
12512	NC_014623	CGC	2	6	561052	561057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817729
12513	NC_014623	CGTT	2	8	561070	561077	0 %	50 %	25 %	25 %	310817729
12514	NC_014623	CGA	2	6	561142	561147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817729
12515	NC_014623	TCA	2	6	561238	561243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817729
12516	NC_014623	GGA	2	6	561272	561277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817729
12517	NC_014623	CGG	2	6	561323	561328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817729
12518	NC_014623	CGG	2	6	561364	561369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817729
12519	NC_014623	CCGG	2	8	561429	561436	0 %	0 %	50 %	50 %	310817729
12520	NC_014623	CGG	2	6	561448	561453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817729
12521	NC_014623	GA	3	6	561555	561560	50 %	0 %	50 %	0 %	310817729
12522	NC_014623	TC	3	6	561641	561646	0 %	50 %	0 %	50 %	310817729
12523	NC_014623	GC	3	6	561738	561743	0 %	0 %	50 %	50 %	310817729
12524	NC_014623	CAA	2	6	561767	561772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817729
12525	NC_014623	GGA	2	6	561776	561781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817729
12526	NC_014623	GAC	2	6	561822	561827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817729
12527	NC_014623	TCACGA	2	12	561835	561846	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310817729
12528	NC_014623	GT	3	6	561847	561852	0 %	50 %	50 %	0 %	310817729
12529	NC_014623	GTG	2	6	561897	561902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817729
12530	NC_014623	GC	3	6	561926	561931	0 %	0 %	50 %	50 %	310817729
12531	NC_014623	TGG	2	6	561938	561943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817729
12532	NC_014623	TCG	2	6	561948	561953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817729
12533	NC_014623	CCA	2	6	561967	561972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817729
12534	NC_014623	C	6	6	562049	562054	0 %	0 %	0 %	100 %	310817729
12535	NC_014623	ACG	2	6	562074	562079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817729
12536	NC_014623	TGG	2	6	562081	562086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817729
12537	NC_014623	GCA	2	6	562105	562110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817729
12538	NC_014623	GC	3	6	562277	562282	0 %	0 %	50 %	50 %	310817729
12539	NC_014623	TTC	2	6	562338	562343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817729
12540	NC_014623	CAA	2	6	562370	562375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817729
12541	NC_014623	CGA	2	6	562376	562381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817729
12542	NC_014623	TCG	2	6	562396	562401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817729
12543	NC_014623	ACT	2	6	562420	562425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817729
12544	NC_014623	ACGG	2	8	562479	562486	25 %	0 %	50 %	25 %	310817729
12545	NC_014623	CCA	2	6	562519	562524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817729
12546	NC_014623	GTC	2	6	562622	562627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817730
12547	NC_014623	ATC	2	6	562677	562682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817730
12548	NC_014623	CTT	2	6	562727	562732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817730
12549	NC_014623	CG	3	6	562754	562759	0 %	0 %	50 %	50 %	310817730
12550	NC_014623	CCA	3	9	562762	562770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817730
12551	NC_014623	CTT	2	6	562784	562789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817730
12552	NC_014623	TC	3	6	562801	562806	0 %	50 %	0 %	50 %	310817730
12553	NC_014623	CTT	2	6	562841	562846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817730
12554	NC_014623	GGC	2	6	562849	562854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817730
12555	NC_014623	GTA	2	6	562919	562924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817730
12556	NC_014623	GCA	2	6	562942	562947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817730
12557	NC_014623	CTG	2	6	562964	562969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817730
12558	NC_014623	AGC	2	6	562998	563003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817730
12559	NC_014623	TCT	2	6	563044	563049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817730
12560	NC_014623	CGCAG	2	10	563053	563062	20 %	0 %	40 %	40 %	310817730
12561	NC_014623	TCT	2	6	563071	563076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817730
12562	NC_014623	TTG	2	6	563145	563150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817730
12563	NC_014623	GGC	2	6	563193	563198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817730
12564	NC_014623	TCT	2	6	563218	563223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817730
12565	NC_014623	AGA	2	6	563233	563238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817730
12566	NC_014623	GCT	2	6	563251	563256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817730
12567	NC_014623	G	6	6	563260	563265	0 %	0 %	100 %	0 %	310817730
12568	NC_014623	CCA	3	9	563266	563274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817730
12569	NC_014623	AGG	2	6	563371	563376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817730
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12571	NC_014623	TTC	2	6	563452	563457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817731
12572	NC_014623	GTC	2	6	563506	563511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817731
12573	NC_014623	CA	3	6	563618	563623	50 %	0 %	0 %	50 %	310817731
12574	NC_014623	AGG	2	6	563657	563662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817731
12575	NC_014623	TTG	2	6	563740	563745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817731
12576	NC_014623	GCC	2	6	563749	563754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817731
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12578	NC_014623	CTG	2	6	563838	563843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817731
12579	NC_014623	GAA	2	6	563901	563906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817731
12580	NC_014623	TTG	2	6	563920	563925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817731
12581	NC_014623	TTG	2	6	563929	563934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817731
12582	NC_014623	TTC	2	6	563953	563958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817731
12583	NC_014623	GTCC	2	8	564087	564094	0 %	25 %	25 %	50 %	310817731
12584	NC_014623	AGG	2	6	564106	564111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817731
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12587	NC_014623	TCT	2	6	564260	564265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817731
12588	NC_014623	GGTA	2	8	564376	564383	25 %	25 %	50 %	0 %	310817732
12589	NC_014623	GGC	2	6	564430	564435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817732
12590	NC_014623	CAG	2	6	564449	564454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817732
12591	NC_014623	GC	3	6	564537	564542	0 %	0 %	50 %	50 %	310817732
12592	NC_014623	CGG	3	9	564544	564552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817732
12593	NC_014623	CTT	2	6	564560	564565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817732
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12595	NC_014623	CTC	2	6	564671	564676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817732
12596	NC_014623	GGGGC	2	10	564688	564697	0 %	0 %	80 %	20 %	310817732
12597	NC_014623	GGC	2	6	564717	564722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817732
12598	NC_014623	CGA	2	6	564730	564735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817732
12599	NC_014623	CCA	2	6	564760	564765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817732
12600	NC_014623	GGA	2	6	564780	564785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817732
12601	NC_014623	GA	3	6	564784	564789	50 %	0 %	50 %	0 %	310817732
12602	NC_014623	G	7	7	564792	564798	0 %	0 %	100 %	0 %	310817732
12603	NC_014623	GAG	2	6	564848	564853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817732
12604	NC_014623	CAC	2	6	564854	564859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817732
12605	NC_014623	CCG	2	6	564861	564866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817732
12606	NC_014623	G	6	6	564908	564913	0 %	0 %	100 %	0 %	310817732
12607	NC_014623	GCC	2	6	564969	564974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817732
12608	NC_014623	TCCT	2	8	564996	565003	0 %	50 %	0 %	50 %	310817732
12609	NC_014623	GGC	2	6	565013	565018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817732
12610	NC_014623	GGC	3	9	565046	565054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817732
12611	NC_014623	GGA	2	6	565058	565063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817732
12612	NC_014623	GC	3	6	565141	565146	0 %	0 %	50 %	50 %	310817732
12613	NC_014623	GA	4	8	565160	565167	50 %	0 %	50 %	0 %	310817732
12614	NC_014623	G	6	6	565198	565203	0 %	0 %	100 %	0 %	310817732
12615	NC_014623	CGG	2	6	565285	565290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817732
12616	NC_014623	GCGA	2	8	565320	565327	25 %	0 %	50 %	25 %	310817732
12617	NC_014623	GCT	2	6	565333	565338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817732
12618	NC_014623	GAC	2	6	565343	565348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817732
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12620	NC_014623	GGTC	2	8	565435	565442	0 %	25 %	50 %	25 %	310817732
12621	NC_014623	GTT	2	6	565457	565462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817732
12622	NC_014623	CGT	2	6	565513	565518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817732
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12741	NC_014623	GGCG	2	8	571095	571102	0 %	0 %	75 %	25 %	310817738
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12848	NC_014623	CCCG	2	8	582177	582184	0 %	0 %	25 %	75 %	310817745
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12857	NC_014623	CCGCG	2	10	582437	582446	0 %	0 %	40 %	60 %	310817745
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12979	NC_014623	CGC	2	6	587396	587401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817750
12980	NC_014623	GGT	2	6	587408	587413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817750
12981	NC_014623	GGC	2	6	587424	587429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817750
12982	NC_014623	GCG	2	6	587470	587475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817750
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