MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014623	GTG	2	6	516574	516579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817697
11502	NC_014623	GTC	2	6	516637	516642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817697
11503	NC_014623	TCG	2	6	516672	516677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817697
11504	NC_014623	CGG	4	12	516678	516689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817697
11505	NC_014623	CGG	2	6	516697	516702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817697
11506	NC_014623	GCG	2	6	516722	516727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817697
11507	NC_014623	CGG	2	6	516741	516746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817697
11508	NC_014623	GTC	2	6	516752	516757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817697
11509	NC_014623	GGC	2	6	517231	517236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817698
11510	NC_014623	CAC	2	6	517246	517251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817698
11511	NC_014623	CGC	2	6	517313	517318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817698
11512	NC_014623	CGC	2	6	517372	517377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817698
11513	NC_014623	GAG	2	6	517388	517393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817698
11514	NC_014623	GC	3	6	517402	517407	0 %	0 %	50 %	50 %	310817698
11515	NC_014623	GCC	2	6	517418	517423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817698
11516	NC_014623	GTG	2	6	517439	517444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817698
11517	NC_014623	GGC	2	6	517459	517464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817698
11518	NC_014623	CTT	2	6	517504	517509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817698
11519	NC_014623	ACC	2	6	517542	517547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817698
11520	NC_014623	GCT	2	6	517561	517566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817698
11521	NC_014623	CGC	2	6	517594	517599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817698
11522	NC_014623	AGG	2	6	517614	517619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817698
11523	NC_014623	AGCGCC	2	12	517640	517651	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310817698
11524	NC_014623	AGGC	2	8	517665	517672	25 %	0 %	50 %	25 %	310817698
11525	NC_014623	CGG	2	6	517692	517697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817698
11526	NC_014623	CCA	2	6	517722	517727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817698
11527	NC_014623	TCA	2	6	517731	517736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817698
11528	NC_014623	GTGG	2	8	517798	517805	0 %	25 %	75 %	0 %	310817698
11529	NC_014623	CCT	2	6	517807	517812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817698
11530	NC_014623	AAT	2	6	517836	517841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310817698
11531	NC_014623	GTGG	2	8	517876	517883	0 %	25 %	75 %	0 %	310817699
11532	NC_014623	CCCT	2	8	517889	517896	0 %	25 %	0 %	75 %	310817699
11533	NC_014623	C	6	6	517943	517948	0 %	0 %	0 %	100 %	310817699
11534	NC_014623	GCCGC	2	10	517959	517968	0 %	0 %	40 %	60 %	310817699
11535	NC_014623	GCT	2	6	517974	517979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817699
11536	NC_014623	ATC	2	6	517993	517998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817699
11537	NC_014623	GGC	2	6	518013	518018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817699
11538	NC_014623	TGC	2	6	518093	518098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817699
11539	NC_014623	TTC	2	6	518113	518118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817699
11540	NC_014623	CG	3	6	518120	518125	0 %	0 %	50 %	50 %	310817699
11541	NC_014623	TGC	2	6	518144	518149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817699
11542	NC_014623	CGCGG	2	10	518158	518167	0 %	0 %	60 %	40 %	310817699
11543	NC_014623	GCCA	2	8	518185	518192	25 %	0 %	25 %	50 %	310817699
11544	NC_014623	CTT	2	6	518217	518222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817699
11545	NC_014623	GATG	2	8	518271	518278	25 %	25 %	50 %	0 %	310817699
11546	NC_014623	GC	4	8	518334	518341	0 %	0 %	50 %	50 %	310817699
11547	NC_014623	GAA	2	6	518451	518456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817699
11548	NC_014623	ATC	2	6	518458	518463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817699
11549	NC_014623	CG	3	6	518517	518522	0 %	0 %	50 %	50 %	310817700
11550	NC_014623	TGGCC	2	10	518564	518573	0 %	20 %	40 %	40 %	310817700
11551	NC_014623	CTC	2	6	518621	518626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817700
11552	NC_014623	TG	3	6	518700	518705	0 %	50 %	50 %	0 %	310817700
11553	NC_014623	CGG	2	6	518740	518745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817700
11554	NC_014623	CTG	2	6	518751	518756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817700
11555	NC_014623	CCT	2	6	518795	518800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817700
11556	NC_014623	TGG	2	6	518805	518810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817700
11557	NC_014623	GGC	2	6	518813	518818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817700
11558	NC_014623	CGTC	2	8	518866	518873	0 %	25 %	25 %	50 %	310817700
11559	NC_014623	TTG	2	6	518883	518888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817700
11560	NC_014623	CCG	2	6	518931	518936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817700
11561	NC_014623	CGA	2	6	518951	518956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817700
11562	NC_014623	CCT	2	6	518977	518982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817700
11563	NC_014623	GCT	2	6	518984	518989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817700
11564	NC_014623	TAC	2	6	519075	519080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817700
11565	NC_014623	GCT	2	6	519083	519088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817700
11566	NC_014623	GC	3	6	519103	519108	0 %	0 %	50 %	50 %	310817700
11567	NC_014623	GGTT	2	8	519208	519215	0 %	50 %	50 %	0 %	310817700
11568	NC_014623	GC	3	6	519228	519233	0 %	0 %	50 %	50 %	310817700
11569	NC_014623	TGC	3	9	519238	519246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817700
11570	NC_014623	CAT	2	6	519272	519277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817700
11571	NC_014623	CTT	2	6	519278	519283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817700
11572	NC_014623	GC	3	6	519319	519324	0 %	0 %	50 %	50 %	310817700
11573	NC_014623	TCC	2	6	519328	519333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817700
11574	NC_014623	GCCG	2	8	519410	519417	0 %	0 %	50 %	50 %	310817700
11575	NC_014623	AGG	2	6	519427	519432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817700
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11578	NC_014623	CGG	3	9	519583	519591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817701
11579	NC_014623	GTGGA	2	10	519598	519607	20 %	20 %	60 %	0 %	310817701
11580	NC_014623	GGT	2	6	519609	519614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817701
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11584	NC_014623	GTC	2	6	519739	519744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817701
11585	NC_014623	GAG	2	6	519769	519774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817701
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11587	NC_014623	G	6	6	519882	519887	0 %	0 %	100 %	0 %	310817701
11588	NC_014623	CAT	2	6	519894	519899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817701
11589	NC_014623	TCA	2	6	519905	519910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817701
11590	NC_014623	GTG	3	9	519913	519921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817701
11591	NC_014623	CCCG	2	8	519954	519961	0 %	0 %	25 %	75 %	310817701
11592	NC_014623	AGC	2	6	519971	519976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817701
11593	NC_014623	GGAA	2	8	519986	519993	50 %	0 %	50 %	0 %	310817701
11594	NC_014623	GTG	2	6	520011	520016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817701
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11598	NC_014623	GGC	2	6	520170	520175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817701
11599	NC_014623	GC	3	6	520174	520179	0 %	0 %	50 %	50 %	310817701
11600	NC_014623	TGA	2	6	520208	520213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817701
11601	NC_014623	GCC	2	6	520219	520224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817701
11602	NC_014623	CTC	2	6	520225	520230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817701
11603	NC_014623	ATC	2	6	520240	520245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817701
11604	NC_014623	TGC	2	6	520348	520353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817702
11605	NC_014623	ACC	2	6	520383	520388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817702
11606	NC_014623	GAG	2	6	520420	520425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817702
11607	NC_014623	CAT	2	6	520450	520455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817702
11608	NC_014623	TCGCT	2	10	520470	520479	0 %	40 %	20 %	40 %	310817702
11609	NC_014623	CAG	2	6	520495	520500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817702
11610	NC_014623	GAG	2	6	520603	520608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817702
11611	NC_014623	CGC	2	6	520609	520614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817702
11612	NC_014623	CCT	2	6	520619	520624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817702
11613	NC_014623	GAG	2	6	520628	520633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817702
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11615	NC_014623	GGGC	2	8	520670	520677	0 %	0 %	75 %	25 %	310817702
11616	NC_014623	CGCC	2	8	520747	520754	0 %	0 %	25 %	75 %	310817702
11617	NC_014623	CCT	2	6	520758	520763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817702
11618	NC_014623	GCT	2	6	520791	520796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817702
11619	NC_014623	GC	3	6	520812	520817	0 %	0 %	50 %	50 %	310817702
11620	NC_014623	CG	3	6	520831	520836	0 %	0 %	50 %	50 %	310817702
11621	NC_014623	GAG	2	6	520852	520857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817702
11622	NC_014623	GAT	2	6	520883	520888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817703
11623	NC_014623	GCT	2	6	520905	520910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817703
11624	NC_014623	GTA	2	6	520918	520923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817703
11625	NC_014623	GA	3	6	520946	520951	50 %	0 %	50 %	0 %	310817703
11626	NC_014623	CCAG	2	8	521018	521025	25 %	0 %	25 %	50 %	310817703
11627	NC_014623	GAT	2	6	521050	521055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817703
11628	NC_014623	GCT	3	9	521061	521069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817703
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11633	NC_014623	TTCC	2	8	521442	521449	0 %	50 %	0 %	50 %	310817703
11634	NC_014623	CGG	2	6	521451	521456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817703
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11644	NC_014623	GAG	2	6	521957	521962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817704
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11649	NC_014623	GCC	2	6	522229	522234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817704
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11735	NC_014623	CAC	2	6	526035	526040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817708
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11980	NC_014623	GGT	2	6	535743	535748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817714
11981	NC_014623	GGTGCT	2	12	535770	535781	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	310817714
11982	NC_014623	GCA	2	6	535847	535852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817714
11983	NC_014623	TGC	2	6	535874	535879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817714
11984	NC_014623	CATTCG	2	12	535949	535960	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310817714
11985	NC_014623	ACG	2	6	536038	536043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817714
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11991	NC_014623	GTG	2	6	536563	536568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817715
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11998	NC_014623	CGGA	2	8	536941	536948	25 %	0 %	50 %	25 %	310817715
11999	NC_014623	CG	3	6	536961	536966	0 %	0 %	50 %	50 %	310817715
12000	NC_014623	GAC	2	6	536988	536993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817715

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