MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014623	TCA	2	6	495634	495639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817677
11002	NC_014623	GCT	2	6	495655	495660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817677
11003	NC_014623	CGTCC	2	10	495731	495740	0 %	20 %	20 %	60 %	310817677
11004	NC_014623	CGC	2	6	495754	495759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817677
11005	NC_014623	TCA	2	6	495772	495777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817677
11006	NC_014623	CG	3	6	495826	495831	0 %	0 %	50 %	50 %	310817677
11007	NC_014623	GCG	2	6	495869	495874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817677
11008	NC_014623	CGCCCG	2	12	495925	495936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817677
11009	NC_014623	CAG	2	6	495965	495970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817677
11010	NC_014623	CCGG	2	8	495980	495987	0 %	0 %	50 %	50 %	310817677
11011	NC_014623	G	6	6	496045	496050	0 %	0 %	100 %	0 %	310817677
11012	NC_014623	CGC	2	6	496114	496119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817677
11013	NC_014623	CTG	2	6	496196	496201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817677
11014	NC_014623	GTC	2	6	496241	496246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817677
11015	NC_014623	G	6	6	496275	496280	0 %	0 %	100 %	0 %	310817677
11016	NC_014623	CCG	2	6	496281	496286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817677
11017	NC_014623	CGG	2	6	496351	496356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817677
11018	NC_014623	CTC	2	6	496388	496393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817677
11019	NC_014623	GC	3	6	496431	496436	0 %	0 %	50 %	50 %	310817677
11020	NC_014623	CGG	2	6	496448	496453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817677
11021	NC_014623	CGG	2	6	496462	496467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817677
11022	NC_014623	TG	3	6	496527	496532	0 %	50 %	50 %	0 %	310817677
11023	NC_014623	CGT	2	6	496537	496542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817677
11024	NC_014623	GCGA	2	8	496785	496792	25 %	0 %	50 %	25 %	310817678
11025	NC_014623	CGC	2	6	496831	496836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817678
11026	NC_014623	TTC	2	6	496878	496883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817678
11027	NC_014623	CAG	2	6	496895	496900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817678
11028	NC_014623	CCCGCT	2	12	496924	496935	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	310817678
11029	NC_014623	CGC	3	9	496970	496978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817678
11030	NC_014623	G	6	6	496985	496990	0 %	0 %	100 %	0 %	310817678
11031	NC_014623	GCG	2	6	497011	497016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817678
11032	NC_014623	CTC	2	6	497027	497032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817678
11033	NC_014623	GC	3	6	497033	497038	0 %	0 %	50 %	50 %	310817678
11034	NC_014623	CTG	2	6	497093	497098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817678
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11036	NC_014623	CGC	3	9	497120	497128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817678
11037	NC_014623	CCG	2	6	497161	497166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817678
11038	NC_014623	CGT	2	6	497252	497257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817678
11039	NC_014623	CGC	2	6	497310	497315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817678
11040	NC_014623	GCC	2	6	497321	497326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817678
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11042	NC_014623	ATC	2	6	497366	497371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817678
11043	NC_014623	GC	3	6	497378	497383	0 %	0 %	50 %	50 %	310817678
11044	NC_014623	CCA	2	6	497515	497520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817678
11045	NC_014623	GAT	2	6	497555	497560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817678
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11047	NC_014623	GCC	2	6	497587	497592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817678
11048	NC_014623	GGA	2	6	497671	497676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817678
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11050	NC_014623	GGT	2	6	497690	497695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817678
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11052	NC_014623	AGCACC	2	12	497760	497771	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310817678
11053	NC_014623	CGC	2	6	497786	497791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817678
11054	NC_014623	GCC	3	9	497805	497813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817678
11055	NC_014623	GTC	3	9	497814	497822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817678
11056	NC_014623	CGC	2	6	497839	497844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817678
11057	NC_014623	AGCACG	2	12	497847	497858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817678
11058	NC_014623	GCA	2	6	497869	497874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817678
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11060	NC_014623	CCA	2	6	497949	497954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817679
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11063	NC_014623	GCG	2	6	498086	498091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817679
11064	NC_014623	AGC	2	6	498092	498097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817679
11065	NC_014623	GGC	2	6	498106	498111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817679
11066	NC_014623	GAG	2	6	498154	498159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817679
11067	NC_014623	CGC	2	6	498160	498165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817679
11068	NC_014623	CAG	2	6	498247	498252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817679
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11071	NC_014623	CGGCC	2	10	498300	498309	0 %	0 %	40 %	60 %	310817679
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11073	NC_014623	GCA	2	6	498324	498329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817679
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11077	NC_014623	GCA	2	6	498552	498557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817679
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11085	NC_014623	CGC	2	6	498754	498759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817679
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11087	NC_014623	CAAG	2	8	498795	498802	50 %	0 %	25 %	25 %	310817679
11088	NC_014623	GC	3	6	499045	499050	0 %	0 %	50 %	50 %	310817680
11089	NC_014623	G	6	6	499082	499087	0 %	0 %	100 %	0 %	310817680
11090	NC_014623	CCA	2	6	499115	499120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817680
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11107	NC_014623	GAT	2	6	499878	499883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817681
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11113	NC_014623	GGTGG	2	10	500067	500076	0 %	20 %	80 %	0 %	310817681
11114	NC_014623	GCT	2	6	500142	500147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817681
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11120	NC_014623	CAA	2	6	500322	500327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817681
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11239	NC_014623	CGG	2	6	505078	505083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817687
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11482	NC_014623	TCG	2	6	516056	516061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817697
11483	NC_014623	AAC	2	6	516062	516067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817697
11484	NC_014623	CCA	2	6	516097	516102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817697
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11486	NC_014623	GTA	2	6	516142	516147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817697
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11492	NC_014623	ATCG	2	8	516328	516335	25 %	25 %	25 %	25 %	310817697
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