MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014623	TGG	2	6	448222	448227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817633
10002	NC_014623	GA	3	6	448272	448277	50 %	0 %	50 %	0 %	310817633
10003	NC_014623	GTC	2	6	448286	448291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817633
10004	NC_014623	GGT	2	6	448322	448327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817633
10005	NC_014623	CAG	2	6	448328	448333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817633
10006	NC_014623	CCAG	2	8	448379	448386	25 %	0 %	25 %	50 %	310817633
10007	NC_014623	CATC	2	8	448704	448711	25 %	25 %	0 %	50 %	310817634
10008	NC_014623	ACG	2	6	448739	448744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817634
10009	NC_014623	G	6	6	448752	448757	0 %	0 %	100 %	0 %	310817634
10010	NC_014623	GCG	2	6	448766	448771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817634
10011	NC_014623	CAG	3	9	448870	448878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817634
10012	NC_014623	CGC	2	6	448879	448884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817634
10013	NC_014623	CAG	2	6	448984	448989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817634
10014	NC_014623	CAG	2	6	449017	449022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817634
10015	NC_014623	TCC	2	6	449068	449073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817634
10016	NC_014623	TGC	2	6	449105	449110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817634
10017	NC_014623	GCG	2	6	449115	449120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817634
10018	NC_014623	CTC	2	6	449122	449127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817634
10019	NC_014623	TCT	2	6	449139	449144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817634
10020	NC_014623	GGA	2	6	449311	449316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817634
10021	NC_014623	CCG	2	6	449327	449332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817634
10022	NC_014623	GCG	3	9	449680	449688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817635
10023	NC_014623	TCG	2	6	449691	449696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817635
10024	NC_014623	TCC	2	6	449699	449704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817635
10025	NC_014623	TGGG	2	8	449756	449763	0 %	25 %	75 %	0 %	310817635
10026	NC_014623	TCCC	2	8	449802	449809	0 %	25 %	0 %	75 %	310817635
10027	NC_014623	GCG	2	6	449841	449846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817635
10028	NC_014623	TGG	2	6	449904	449909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817635
10029	NC_014623	TCCT	2	8	449938	449945	0 %	50 %	0 %	50 %	310817635
10030	NC_014623	TC	3	6	449980	449985	0 %	50 %	0 %	50 %	310817635
10031	NC_014623	CGG	2	6	450010	450015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817635
10032	NC_014623	TGCTCC	2	12	450084	450095	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	310817635
10033	NC_014623	GCC	2	6	450096	450101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817635
10034	NC_014623	C	6	6	450120	450125	0 %	0 %	0 %	100 %	310817635
10035	NC_014623	CGC	2	6	450132	450137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817635
10036	NC_014623	GGC	2	6	450148	450153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817635
10037	NC_014623	GC	3	6	450166	450171	0 %	0 %	50 %	50 %	310817635
10038	NC_014623	GCT	2	6	450373	450378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817635
10039	NC_014623	TGG	2	6	450399	450404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817635
10040	NC_014623	GAG	2	6	450428	450433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817635
10041	NC_014623	GCC	2	6	450437	450442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817635
10042	NC_014623	GCG	2	6	450477	450482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817635
10043	NC_014623	GGC	2	6	450559	450564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817635
10044	NC_014623	CGC	2	6	450598	450603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817635
10045	NC_014623	AGC	2	6	450609	450614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817635
10046	NC_014623	GC	3	6	450613	450618	0 %	0 %	50 %	50 %	310817635
10047	NC_014623	GGA	2	6	450631	450636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817635
10048	NC_014623	GC	3	6	450658	450663	0 %	0 %	50 %	50 %	310817635
10049	NC_014623	TTCC	2	8	450664	450671	0 %	50 %	0 %	50 %	310817635
10050	NC_014623	GGC	2	6	450688	450693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817635
10051	NC_014623	CGC	2	6	450760	450765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817635
10052	NC_014623	GCA	3	9	450775	450783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817635
10053	NC_014623	CGC	2	6	450786	450791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817635
10054	NC_014623	CGGC	2	8	450833	450840	0 %	0 %	50 %	50 %	310817635
10055	NC_014623	GC	3	6	450845	450850	0 %	0 %	50 %	50 %	310817635
10056	NC_014623	GTG	2	6	450875	450880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817635
10057	NC_014623	GCCT	2	8	450882	450889	0 %	25 %	25 %	50 %	310817635
10058	NC_014623	CCG	2	6	450906	450911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817635
10059	NC_014623	GGC	2	6	451012	451017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817635
10060	NC_014623	TGCG	2	8	451118	451125	0 %	25 %	50 %	25 %	310817636
10061	NC_014623	TTGG	2	8	451140	451147	0 %	50 %	50 %	0 %	310817636
10062	NC_014623	GGC	2	6	451158	451163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817636
10063	NC_014623	CAG	2	6	451254	451259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817636
10064	NC_014623	TGA	2	6	451434	451439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817637
10065	NC_014623	GGC	2	6	451445	451450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817637
10066	NC_014623	GGC	2	6	451545	451550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817637
10067	NC_014623	ACC	2	6	451559	451564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817637
10068	NC_014623	ACC	2	6	451577	451582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817637
10069	NC_014623	ATC	2	6	451607	451612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817637
10070	NC_014623	CAT	2	6	451614	451619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817637
10071	NC_014623	CG	3	6	451704	451709	0 %	0 %	50 %	50 %	310817637
10072	NC_014623	CAC	2	6	451730	451735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817637
10073	NC_014623	CGC	2	6	451881	451886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817637
10074	NC_014623	GC	3	6	451885	451890	0 %	0 %	50 %	50 %	310817637
10075	NC_014623	GGC	2	6	451926	451931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817637
10076	NC_014623	CG	3	6	451933	451938	0 %	0 %	50 %	50 %	310817637
10077	NC_014623	GC	4	8	452022	452029	0 %	0 %	50 %	50 %	310817637
10078	NC_014623	GCA	2	6	452058	452063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817637
10079	NC_014623	CGC	2	6	452170	452175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817638
10080	NC_014623	AAC	2	6	452194	452199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817638
10081	NC_014623	G	6	6	452202	452207	0 %	0 %	100 %	0 %	310817638
10082	NC_014623	GTC	2	6	452235	452240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817638
10083	NC_014623	TCG	3	9	452276	452284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817638
10084	NC_014623	GTGGCG	2	12	452307	452318	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	310817638
10085	NC_014623	ATC	2	6	452374	452379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817638
10086	NC_014623	GCC	3	9	452392	452400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817638
10087	NC_014623	GC	3	6	452413	452418	0 %	0 %	50 %	50 %	310817638
10088	NC_014623	CG	3	6	452429	452434	0 %	0 %	50 %	50 %	310817638
10089	NC_014623	CTCCTG	2	12	452435	452446	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	310817638
10090	NC_014623	TG	3	6	452474	452479	0 %	50 %	50 %	0 %	310817638
10091	NC_014623	CTTCG	2	10	452496	452505	0 %	40 %	20 %	40 %	310817638
10092	NC_014623	ACG	2	6	452573	452578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817638
10093	NC_014623	CG	3	6	452825	452830	0 %	0 %	50 %	50 %	310817639
10094	NC_014623	TTCCA	2	10	452847	452856	20 %	40 %	0 %	40 %	310817639
10095	NC_014623	TGA	2	6	452884	452889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817639
10096	NC_014623	TGCC	2	8	452910	452917	0 %	25 %	25 %	50 %	310817639
10097	NC_014623	TCG	2	6	452953	452958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817639
10098	NC_014623	ATG	2	6	452962	452967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817639
10099	NC_014623	TCAT	2	8	453058	453065	25 %	50 %	0 %	25 %	310817639
10100	NC_014623	CAGG	2	8	453302	453309	25 %	0 %	50 %	25 %	310817640
10101	NC_014623	GCT	2	6	453384	453389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817640
10102	NC_014623	CTT	2	6	453390	453395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817640
10103	NC_014623	ATG	2	6	453442	453447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817640
10104	NC_014623	GTT	2	6	453457	453462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817640
10105	NC_014623	GCT	2	6	453605	453610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817640
10106	NC_014623	CGG	2	6	453620	453625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817640
10107	NC_014623	ATC	2	6	453715	453720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817640
10108	NC_014623	TCC	2	6	453728	453733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817640
10109	NC_014623	CG	3	6	453750	453755	0 %	0 %	50 %	50 %	310817640
10110	NC_014623	G	6	6	453818	453823	0 %	0 %	100 %	0 %	310817640
10111	NC_014623	CTG	2	6	453832	453837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817640
10112	NC_014623	CTG	2	6	453841	453846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817640
10113	NC_014623	GGCG	2	8	453849	453856	0 %	0 %	75 %	25 %	310817640
10114	NC_014623	GTGGCA	2	12	453862	453873	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310817640
10115	NC_014623	G	6	6	453936	453941	0 %	0 %	100 %	0 %	310817640
10116	NC_014623	C	7	7	453948	453954	0 %	0 %	0 %	100 %	310817640
10117	NC_014623	GCC	3	9	453961	453969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817640
10118	NC_014623	CTT	4	12	453999	454010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817640
10119	NC_014623	TGC	2	6	454049	454054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817640
10120	NC_014623	GC	3	6	454065	454070	0 %	0 %	50 %	50 %	310817640
10121	NC_014623	ACG	2	6	454159	454164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817640
10122	NC_014623	G	6	6	454188	454193	0 %	0 %	100 %	0 %	310817640
10123	NC_014623	GC	3	6	454202	454207	0 %	0 %	50 %	50 %	310817640
10124	NC_014623	TGG	2	6	454208	454213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817640
10125	NC_014623	GGT	2	6	454347	454352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817640
10126	NC_014623	CCT	2	6	454377	454382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817640
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10128	NC_014623	GGGCG	2	10	454464	454473	0 %	0 %	80 %	20 %	310817640
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10130	NC_014623	GCA	2	6	454774	454779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817641
10131	NC_014623	GCA	2	6	454820	454825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817641
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10145	NC_014623	G	7	7	455435	455441	0 %	0 %	100 %	0 %	310817641
10146	NC_014623	GGAG	2	8	455507	455514	25 %	0 %	75 %	0 %	310817641
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10152	NC_014623	CGG	2	6	455676	455681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817641
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10192	NC_014623	TGG	2	6	458061	458066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817644
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10204	NC_014623	GCT	2	6	458299	458304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817644
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10210	NC_014623	ACC	2	6	458561	458566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817644
10211	NC_014623	TGG	2	6	458637	458642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817644
10212	NC_014623	GTG	2	6	458645	458650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817644
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10220	NC_014623	CGAG	2	8	458901	458908	25 %	0 %	50 %	25 %	310817645
10221	NC_014623	GTCCAC	2	12	458950	458961	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310817645
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10224	NC_014623	CGT	2	6	459064	459069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817645
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10228	NC_014623	CTGT	2	8	459297	459304	0 %	50 %	25 %	25 %	310817645
10229	NC_014623	CCA	2	6	459334	459339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817645
10230	NC_014623	GGT	2	6	459354	459359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817645
10231	NC_014623	TCG	2	6	459372	459377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817645
10232	NC_014623	CCACG	2	10	459465	459474	20 %	0 %	20 %	60 %	310817645
10233	NC_014623	GCG	2	6	459493	459498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817645
10234	NC_014623	GAA	2	6	459604	459609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817645
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10236	NC_014623	GGCGG	2	10	459667	459676	0 %	0 %	80 %	20 %	310817645
10237	NC_014623	GAA	2	6	459757	459762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817645
10238	NC_014623	CTG	2	6	459775	459780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817645
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10357	NC_014623	CGA	2	6	465618	465623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817650
10358	NC_014623	CACGC	2	10	465625	465634	20 %	0 %	20 %	60 %	310817650
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10360	NC_014623	GGT	2	6	465733	465738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817650
10361	NC_014623	GAC	2	6	465757	465762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817650
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10366	NC_014623	TGA	2	6	465897	465902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817650
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10481	NC_014623	TTC	2	6	472042	472047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817657
10482	NC_014623	GCT	2	6	472055	472060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817657
10483	NC_014623	GTC	2	6	472144	472149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817657
10484	NC_014623	CTT	2	6	472154	472159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817657
10485	NC_014623	TC	3	6	472174	472179	0 %	50 %	0 %	50 %	310817657
10486	NC_014623	GGCA	2	8	472197	472204	25 %	0 %	50 %	25 %	310817657
10487	NC_014623	GC	3	6	472234	472239	0 %	0 %	50 %	50 %	310817657
10488	NC_014623	GTC	2	6	472242	472247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817657
10489	NC_014623	ATC	2	6	472311	472316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817657
10490	NC_014623	GTT	2	6	472334	472339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817657
10491	NC_014623	GTT	2	6	472360	472365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817657
10492	NC_014623	AGC	2	6	472371	472376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817657
10493	NC_014623	GAT	2	6	472389	472394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817657
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10495	NC_014623	CT	3	6	472444	472449	0 %	50 %	0 %	50 %	310817657
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10499	NC_014623	GCG	3	9	473342	473350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817658
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