MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_014623	GCTC	2	8	341781	341788	0 %	25 %	25 %	50 %	310817542
7502	NC_014623	CGGGG	2	10	341886	341895	0 %	0 %	80 %	20 %	310817542
7503	NC_014623	TGG	2	6	341955	341960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817542
7504	NC_014623	GC	3	6	341999	342004	0 %	0 %	50 %	50 %	310817542
7505	NC_014623	CGGG	2	8	342018	342025	0 %	0 %	75 %	25 %	310817542
7506	NC_014623	CCAG	2	8	342082	342089	25 %	0 %	25 %	50 %	310817542
7507	NC_014623	GTG	2	6	342095	342100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817542
7508	NC_014623	GCT	2	6	342127	342132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817542
7509	NC_014623	CGG	2	6	342144	342149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817542
7510	NC_014623	CG	3	6	342151	342156	0 %	0 %	50 %	50 %	310817542
7511	NC_014623	TG	3	6	342198	342203	0 %	50 %	50 %	0 %	310817542
7512	NC_014623	CGC	2	6	342270	342275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817542
7513	NC_014623	GCGG	2	8	342304	342311	0 %	0 %	75 %	25 %	310817542
7514	NC_014623	TGC	2	6	342363	342368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817542
7515	NC_014623	GGA	2	6	342382	342387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817542
7516	NC_014623	CGGCG	2	10	342398	342407	0 %	0 %	60 %	40 %	310817542
7517	NC_014623	TGG	2	6	342426	342431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817542
7518	NC_014623	GGC	2	6	342451	342456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817542
7519	NC_014623	GCC	2	6	342461	342466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817542
7520	NC_014623	TGG	2	6	342473	342478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817542
7521	NC_014623	ACA	2	6	342481	342486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817542
7522	NC_014623	CGG	2	6	342621	342626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817542
7523	NC_014623	CG	3	6	342640	342645	0 %	0 %	50 %	50 %	310817542
7524	NC_014623	GGC	2	6	342679	342684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817542
7525	NC_014623	GCG	3	9	342742	342750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817542
7526	NC_014623	CAGC	2	8	342751	342758	25 %	0 %	25 %	50 %	310817542
7527	NC_014623	GC	3	6	342760	342765	0 %	0 %	50 %	50 %	310817542
7528	NC_014623	GGGGC	2	10	342781	342790	0 %	0 %	80 %	20 %	310817542
7529	NC_014623	GCC	2	6	342824	342829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817542
7530	NC_014623	GCC	2	6	342838	342843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817542
7531	NC_014623	GGC	2	6	342877	342882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817542
7532	NC_014623	CG	3	6	342903	342908	0 %	0 %	50 %	50 %	310817542
7533	NC_014623	GC	3	6	342910	342915	0 %	0 %	50 %	50 %	310817542
7534	NC_014623	AGC	2	6	343002	343007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817542
7535	NC_014623	GC	3	6	343169	343174	0 %	0 %	50 %	50 %	310817542
7536	NC_014623	TGC	2	6	343191	343196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817542
7537	NC_014623	TCA	2	6	343245	343250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817542
7538	NC_014623	CGG	3	9	343257	343265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817542
7539	NC_014623	GC	4	8	343286	343293	0 %	0 %	50 %	50 %	310817542
7540	NC_014623	GCA	2	6	343428	343433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817542
7541	NC_014623	CAA	2	6	343481	343486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817542
7542	NC_014623	GGA	2	6	343510	343515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817542
7543	NC_014623	TCA	2	6	343554	343559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817542
7544	NC_014623	GGC	2	6	343578	343583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817542
7545	NC_014623	CTG	2	6	343610	343615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817542
7546	NC_014623	CGCTGG	2	12	343749	343760	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310817542
7547	NC_014623	CTG	2	6	343805	343810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817542
7548	NC_014623	CCG	2	6	343845	343850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817542
7549	NC_014623	GCCCT	2	10	343853	343862	0 %	20 %	20 %	60 %	310817542
7550	NC_014623	GAGC	2	8	343868	343875	25 %	0 %	50 %	25 %	310817542
7551	NC_014623	CG	3	6	343959	343964	0 %	0 %	50 %	50 %	310817542
7552	NC_014623	GC	3	6	344022	344027	0 %	0 %	50 %	50 %	310817542
7553	NC_014623	TCG	2	6	344142	344147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817543
7554	NC_014623	GCC	2	6	344199	344204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817543
7555	NC_014623	CCA	2	6	344242	344247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817543
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7557	NC_014623	GAG	2	6	344355	344360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817543
7558	NC_014623	GCC	2	6	344361	344366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817543
7559	NC_014623	GCC	2	6	344377	344382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817543
7560	NC_014623	TCC	2	6	344394	344399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817543
7561	NC_014623	GC	3	6	344409	344414	0 %	0 %	50 %	50 %	310817543
7562	NC_014623	CAC	2	6	344453	344458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817543
7563	NC_014623	GCC	2	6	344460	344465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817543
7564	NC_014623	GCA	2	6	344527	344532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817543
7565	NC_014623	CAG	2	6	344537	344542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817543
7566	NC_014623	TCG	2	6	344544	344549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817543
7567	NC_014623	CAG	2	6	344618	344623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817543
7568	NC_014623	TCGCC	2	10	344629	344638	0 %	20 %	20 %	60 %	310817543
7569	NC_014623	TCC	2	6	344649	344654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817543
7570	NC_014623	AGA	2	6	344725	344730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817543
7571	NC_014623	CCA	2	6	344749	344754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817543
7572	NC_014623	CCT	2	6	344770	344775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817543
7573	NC_014623	GC	3	6	344786	344791	0 %	0 %	50 %	50 %	310817543
7574	NC_014623	TCA	2	6	344794	344799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817543
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7578	NC_014623	GCC	3	9	345048	345056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817543
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7581	NC_014623	AGGG	2	8	345186	345193	25 %	0 %	75 %	0 %	310817543
7582	NC_014623	TGG	2	6	345274	345279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817544
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7586	NC_014623	CGG	2	6	345412	345417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817544
7587	NC_014623	CTT	2	6	345423	345428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817544
7588	NC_014623	GCC	2	6	345439	345444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817544
7589	NC_014623	GC	3	6	345445	345450	0 %	0 %	50 %	50 %	310817544
7590	NC_014623	CTG	2	6	345453	345458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817544
7591	NC_014623	GTGC	2	8	345476	345483	0 %	25 %	50 %	25 %	310817544
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7594	NC_014623	GC	3	6	345537	345542	0 %	0 %	50 %	50 %	310817544
7595	NC_014623	ACG	2	6	345550	345555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817544
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7601	NC_014623	AAG	2	6	345862	345867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817544
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7606	NC_014623	ATG	2	6	346039	346044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817544
7607	NC_014623	GCT	2	6	346079	346084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817544
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7612	NC_014623	CG	4	8	346265	346272	0 %	0 %	50 %	50 %	310817544
7613	NC_014623	GC	3	6	346273	346278	0 %	0 %	50 %	50 %	310817544
7614	NC_014623	CTCG	2	8	346401	346408	0 %	25 %	25 %	50 %	310817544
7615	NC_014623	ACC	2	6	346474	346479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817544
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7618	NC_014623	GTGG	2	8	346527	346534	0 %	25 %	75 %	0 %	310817544
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7621	NC_014623	GC	3	6	346574	346579	0 %	0 %	50 %	50 %	310817544
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7989	NC_014623	GCTGGA	2	12	361049	361060	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310817558
7990	NC_014623	GCA	2	6	361088	361093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817558
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7992	NC_014623	GTG	2	6	361149	361154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817558
7993	NC_014623	GCC	2	6	361170	361175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817558
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7997	NC_014623	GGCA	2	8	361271	361278	25 %	0 %	50 %	25 %	310817558
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8000	NC_014623	GCT	2	6	361394	361399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817559

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