MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_014623	GC	3	6	318055	318060	0 %	0 %	50 %	50 %	310817527
7002	NC_014623	CAA	2	6	318086	318091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817527
7003	NC_014623	GC	3	6	318166	318171	0 %	0 %	50 %	50 %	310817527
7004	NC_014623	GCG	2	6	318238	318243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817527
7005	NC_014623	AAC	2	6	318354	318359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817527
7006	NC_014623	ACC	2	6	318375	318380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817527
7007	NC_014623	CCG	2	6	318385	318390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817527
7008	NC_014623	GTC	2	6	318438	318443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817527
7009	NC_014623	GAG	2	6	318448	318453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817527
7010	NC_014623	GCTT	2	8	318455	318462	0 %	50 %	25 %	25 %	310817527
7011	NC_014623	CAA	2	6	318479	318484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817527
7012	NC_014623	CACGGG	2	12	318554	318565	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310817527
7013	NC_014623	CGG	2	6	318691	318696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817527
7014	NC_014623	CAA	2	6	318728	318733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817527
7015	NC_014623	CAC	2	6	318749	318754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817527
7016	NC_014623	CGG	2	6	318760	318765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817527
7017	NC_014623	CAA	2	6	318767	318772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817527
7018	NC_014623	GAC	2	6	318789	318794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817527
7019	NC_014623	GTG	2	6	318828	318833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817527
7020	NC_014623	GCCC	2	8	318899	318906	0 %	0 %	25 %	75 %	310817527
7021	NC_014623	GTG	2	6	318933	318938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817527
7022	NC_014623	CTC	2	6	319042	319047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817527
7023	NC_014623	CGG	2	6	319066	319071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817527
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7026	NC_014623	CGG	2	6	319171	319176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817527
7027	NC_014623	GCCC	2	8	319184	319191	0 %	0 %	25 %	75 %	310817527
7028	NC_014623	GTG	2	6	319218	319223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817527
7029	NC_014623	CGCC	2	8	319231	319238	0 %	0 %	25 %	75 %	310817527
7030	NC_014623	GGAC	2	8	319294	319301	25 %	0 %	50 %	25 %	310817527
7031	NC_014623	CACCGT	3	18	319307	319324	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310817527
7032	NC_014623	CAA	2	6	319328	319333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817527
7033	NC_014623	GAC	2	6	319350	319355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817527
7034	NC_014623	GCG	2	6	319378	319383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817527
7035	NC_014623	TCG	2	6	319483	319488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817527
7036	NC_014623	TGGCG	2	10	319490	319499	0 %	20 %	60 %	20 %	310817527
7037	NC_014623	TCACCA	2	12	319588	319599	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	310817527
7038	NC_014623	GCCC	2	8	319615	319622	0 %	0 %	25 %	75 %	310817527
7039	NC_014623	GTG	2	6	319671	319676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817527
7040	NC_014623	G	7	7	319776	319782	0 %	0 %	100 %	0 %	310817527
7041	NC_014623	CGG	2	6	319850	319855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817527
7042	NC_014623	ACCGTC	2	12	319875	319886	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310817527
7043	NC_014623	GGA	2	6	319895	319900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817527
7044	NC_014623	TCGCG	2	10	319904	319913	0 %	20 %	40 %	40 %	310817527
7045	NC_014623	CCT	2	6	319927	319932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817527
7046	NC_014623	TGC	2	6	319966	319971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817527
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7048	NC_014623	CT	3	6	320003	320008	0 %	50 %	0 %	50 %	310817527
7049	NC_014623	CGC	2	6	320045	320050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817527
7050	NC_014623	GCA	2	6	320102	320107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817527
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7052	NC_014623	CCA	3	9	320264	320272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817527
7053	NC_014623	AGG	2	6	320353	320358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817527
7054	NC_014623	C	6	6	320377	320382	0 %	0 %	0 %	100 %	310817527
7055	NC_014623	ACC	2	6	320403	320408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817527
7056	NC_014623	CTG	2	6	320445	320450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817527
7057	NC_014623	CCA	2	6	320452	320457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817527
7058	NC_014623	CGG	2	6	320459	320464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817527
7059	NC_014623	CGT	2	6	320477	320482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817527
7060	NC_014623	CTC	2	6	320501	320506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817527
7061	NC_014623	G	6	6	320507	320512	0 %	0 %	100 %	0 %	310817527
7062	NC_014623	TGG	2	6	320557	320562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817527
7063	NC_014623	AGCG	2	8	320574	320581	25 %	0 %	50 %	25 %	310817527
7064	NC_014623	CG	3	6	320587	320592	0 %	0 %	50 %	50 %	310817527
7065	NC_014623	CGC	2	6	320714	320719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817527
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7070	NC_014623	CGAA	2	8	321259	321266	50 %	0 %	25 %	25 %	310817527
7071	NC_014623	TCA	2	6	321274	321279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817527
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7073	NC_014623	AAG	2	6	321342	321347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817527
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7093	NC_014623	CAG	2	6	322072	322077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817528
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7107	NC_014623	CAG	2	6	322510	322515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817528
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7110	NC_014623	CAG	2	6	322576	322581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817528
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7119	NC_014623	GC	3	6	323117	323122	0 %	0 %	50 %	50 %	310817529
7120	NC_014623	C	6	6	323247	323252	0 %	0 %	0 %	100 %	310817529
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7122	NC_014623	CG	3	6	323331	323336	0 %	0 %	50 %	50 %	310817529
7123	NC_014623	TTC	2	6	323341	323346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817529
7124	NC_014623	CCG	2	6	323414	323419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817529
7125	NC_014623	CGA	2	6	323426	323431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817529
7126	NC_014623	C	6	6	323470	323475	0 %	0 %	0 %	100 %	310817529
7127	NC_014623	GAG	2	6	323565	323570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817529
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7230	NC_014623	CGTGC	2	10	329679	329688	0 %	20 %	40 %	40 %	310817535
7231	NC_014623	GAA	2	6	329706	329711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817535
7232	NC_014623	GCA	2	6	329771	329776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817535
7233	NC_014623	GGCG	2	8	329795	329802	0 %	0 %	75 %	25 %	310817535
7234	NC_014623	GCTG	2	8	329804	329811	0 %	25 %	50 %	25 %	310817535
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7237	NC_014623	CGA	2	6	329873	329878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817535
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7240	NC_014623	ACG	2	6	329938	329943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817535
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7242	NC_014623	GTC	2	6	329958	329963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817535
7243	NC_014623	CGA	2	6	329987	329992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817535
7244	NC_014623	CGGC	2	8	330039	330046	0 %	0 %	50 %	50 %	310817535
7245	NC_014623	GAC	2	6	330072	330077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817535
7246	NC_014623	G	7	7	330114	330120	0 %	0 %	100 %	0 %	310817535
7247	NC_014623	GCGG	2	8	330156	330163	0 %	0 %	75 %	25 %	310817535
7248	NC_014623	CGA	2	6	330209	330214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817535
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7250	NC_014623	TGG	2	6	330319	330324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817535
7251	NC_014623	TGC	2	6	330349	330354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817535
7252	NC_014623	GTC	2	6	330423	330428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817535
7253	NC_014623	GC	3	6	330441	330446	0 %	0 %	50 %	50 %	310817535
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7255	NC_014623	G	6	6	330710	330715	0 %	0 %	100 %	0 %	310817536
7256	NC_014623	CG	3	6	330769	330774	0 %	0 %	50 %	50 %	310817536
7257	NC_014623	CGCT	2	8	330801	330808	0 %	25 %	25 %	50 %	310817536
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7269	NC_014623	TCG	2	6	331404	331409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817536
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7271	NC_014623	ACG	2	6	331422	331427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817536
7272	NC_014623	GAC	2	6	331508	331513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817536
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7275	NC_014623	GCT	2	6	331635	331640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817536
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7279	NC_014623	CTG	2	6	331718	331723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817536
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7281	NC_014623	GGA	2	6	331771	331776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817536
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7283	NC_014623	GC	3	6	331828	331833	0 %	0 %	50 %	50 %	310817536
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7291	NC_014623	GGCC	2	8	332525	332532	0 %	0 %	50 %	50 %	310817538
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7351	NC_014623	AGA	2	6	334568	334573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817538
7352	NC_014623	GC	4	8	334643	334650	0 %	0 %	50 %	50 %	310817538
7353	NC_014623	TGA	2	6	334651	334656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817538
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7359	NC_014623	AGAGCG	2	12	334886	334897	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	310817538
7360	NC_014623	CG	3	6	334896	334901	0 %	0 %	50 %	50 %	310817538
7361	NC_014623	CGGCC	2	10	334916	334925	0 %	0 %	40 %	60 %	310817538
7362	NC_014623	GTT	2	6	334959	334964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817538
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7488	NC_014623	GAG	2	6	340949	340954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817541
7489	NC_014623	AAG	2	6	341336	341341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817542
7490	NC_014623	GAT	2	6	341366	341371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817542
7491	NC_014623	CGC	2	6	341400	341405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817542
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7497	NC_014623	TCGGC	2	10	341575	341584	0 %	20 %	40 %	40 %	310817542
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7500	NC_014623	GTG	2	6	341744	341749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817542

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