MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 235229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014623	TG	3	6	73	78	0 %	50 %	50 %	0 %	310817279
2	NC_014623	CTGG	2	8	180	187	0 %	25 %	50 %	25 %	310817279
3	NC_014623	CTT	2	6	246	251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817279
4	NC_014623	GCT	2	6	282	287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817279
5	NC_014623	GCC	2	6	351	356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817279
6	NC_014623	CCA	2	6	392	397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817279
7	NC_014623	GCC	2	6	408	413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817279
8	NC_014623	GTG	2	6	448	453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817279
9	NC_014623	CGC	6	18	474	491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817279
10	NC_014623	CAC	2	6	511	516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817279
11	NC_014623	GGC	2	6	538	543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817279
12	NC_014623	GTG	2	6	616	621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817279
13	NC_014623	CGAG	2	8	629	636	25 %	0 %	50 %	25 %	310817279
14	NC_014623	CCG	2	6	690	695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817279
15	NC_014623	TGC	2	6	719	724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817279
16	NC_014623	CGA	2	6	729	734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817279
17	NC_014623	GAG	2	6	757	762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817279
18	NC_014623	TTC	2	6	775	780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817279
19	NC_014623	GGA	2	6	861	866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817279
20	NC_014623	TCC	2	6	941	946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817279
21	NC_014623	AGA	2	6	947	952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817279
22	NC_014623	AGGCGG	2	12	953	964	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	310817279
23	NC_014623	GAC	2	6	982	987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817279
24	NC_014623	AGA	2	6	1016	1021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817279
25	NC_014623	CGC	2	6	1101	1106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817279
26	NC_014623	CA	3	6	1131	1136	50 %	0 %	0 %	50 %	310817279
27	NC_014623	CGTGGA	2	12	1143	1154	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310817279
28	NC_014623	TCCA	2	8	1156	1163	25 %	25 %	0 %	50 %	310817279
29	NC_014623	CGG	2	6	1216	1221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817279
30	NC_014623	CG	3	6	1239	1244	0 %	0 %	50 %	50 %	310817279
31	NC_014623	CAA	2	6	1311	1316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817279
32	NC_014623	GGC	2	6	1417	1422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817279
33	NC_014623	C	6	6	1483	1488	0 %	0 %	0 %	100 %	310817280
34	NC_014623	AGG	2	6	1534	1539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817280
35	NC_014623	GGAC	2	8	1549	1556	25 %	0 %	50 %	25 %	310817280
36	NC_014623	GCCT	2	8	1584	1591	0 %	25 %	25 %	50 %	310817280
37	NC_014623	CAC	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817280
38	NC_014623	GGC	2	6	1632	1637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817280
39	NC_014623	CAT	2	6	1721	1726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817280
40	NC_014623	CCCGG	2	10	1736	1745	0 %	0 %	40 %	60 %	310817280
41	NC_014623	GGC	2	6	1886	1891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817280
42	NC_014623	CTG	2	6	1905	1910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817280
43	NC_014623	GCAAG	2	10	1916	1925	40 %	0 %	40 %	20 %	310817280
44	NC_014623	CTGC	2	8	2066	2073	0 %	25 %	25 %	50 %	310817280
45	NC_014623	CGG	2	6	2111	2116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817280
46	NC_014623	TGA	2	6	2122	2127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817280
47	NC_014623	CG	3	6	2291	2296	0 %	0 %	50 %	50 %	310817280
48	NC_014623	GCTCTC	2	12	2300	2311	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	310817280
49	NC_014623	GC	3	6	2342	2347	0 %	0 %	50 %	50 %	310817280
50	NC_014623	ACGCC	2	10	2635	2644	20 %	0 %	20 %	60 %	310817281
51	NC_014623	CAT	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817281
52	NC_014623	GCC	2	6	2707	2712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817281
53	NC_014623	GTCAAC	2	12	2764	2775	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310817281
54	NC_014623	CAG	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817281
55	NC_014623	GCA	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817281
56	NC_014623	AAC	2	6	3037	3042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817281
57	NC_014623	CTC	2	6	3051	3056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817281
58	NC_014623	ACA	2	6	3119	3124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817281
59	NC_014623	TG	3	6	3186	3191	0 %	50 %	50 %	0 %	310817281
60	NC_014623	CGC	2	6	3329	3334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817282
61	NC_014623	CAT	2	6	3384	3389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817282
62	NC_014623	GCC	2	6	3400	3405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817282
63	NC_014623	GTCAAC	2	12	3457	3468	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310817282
64	NC_014623	CAG	2	6	3499	3504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817282
65	NC_014623	C	6	6	3511	3516	0 %	0 %	0 %	100 %	310817282
66	NC_014623	GCA	2	6	3584	3589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817282
67	NC_014623	CG	3	6	3770	3775	0 %	0 %	50 %	50 %	310817282
68	NC_014623	CTT	2	6	3786	3791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817282
69	NC_014623	TCC	2	6	3859	3864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817282
70	NC_014623	ACG	2	6	3944	3949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817282
71	NC_014623	GGC	2	6	4261	4266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817283
72	NC_014623	G	6	6	4290	4295	0 %	0 %	100 %	0 %	310817283
73	NC_014623	GCC	2	6	4340	4345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817283
74	NC_014623	CCG	2	6	4389	4394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817283
75	NC_014623	CGA	2	6	4428	4433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817283
76	NC_014623	CCG	3	9	4437	4445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817283
77	NC_014623	CAC	2	6	4561	4566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817283
78	NC_014623	GGA	2	6	4596	4601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817283
79	NC_014623	CCT	2	6	4635	4640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817283
80	NC_014623	CCT	2	6	4650	4655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817283
81	NC_014623	GTG	2	6	4669	4674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817283
82	NC_014623	CGCT	2	8	4742	4749	0 %	25 %	25 %	50 %	310817283
83	NC_014623	GAG	2	6	4750	4755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817283
84	NC_014623	GCC	2	6	4763	4768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817283
85	NC_014623	CAT	2	6	4955	4960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817284
86	NC_014623	CGAG	2	8	5005	5012	25 %	0 %	50 %	25 %	310817284
87	NC_014623	GCG	2	6	5013	5018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817284
88	NC_014623	CTG	2	6	5019	5024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817284
89	NC_014623	GC	4	8	5121	5128	0 %	0 %	50 %	50 %	310817284
90	NC_014623	CGG	2	6	5131	5136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817284
91	NC_014623	G	6	6	5135	5140	0 %	0 %	100 %	0 %	310817284
92	NC_014623	GGC	2	6	5144	5149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817284
93	NC_014623	GTG	2	6	5154	5159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817284
94	NC_014623	AGC	2	6	5200	5205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817284
95	NC_014623	CAC	2	6	5228	5233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817284
96	NC_014623	CGAG	2	8	5251	5258	25 %	0 %	50 %	25 %	310817284
97	NC_014623	CGG	2	6	5306	5311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817284
98	NC_014623	GGT	2	6	5382	5387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817284
99	NC_014623	GCC	2	6	5529	5534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817285
100	NC_014623	TC	3	6	5572	5577	0 %	50 %	0 %	50 %	310817285
101	NC_014623	TCACC	2	10	5599	5608	20 %	20 %	0 %	60 %	310817285
102	NC_014623	AGC	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817285
103	NC_014623	CCA	2	6	5640	5645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817285
104	NC_014623	GAA	2	6	5681	5686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817285
105	NC_014623	CTC	2	6	5706	5711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817285
106	NC_014623	GCAC	2	8	5721	5728	25 %	0 %	25 %	50 %	310817285
107	NC_014623	C	6	6	5728	5733	0 %	0 %	0 %	100 %	310817285
108	NC_014623	AAC	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310817285
109	NC_014623	CG	3	6	5841	5846	0 %	0 %	50 %	50 %	310817285
110	NC_014623	GCC	2	6	5890	5895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817285
111	NC_014623	CG	4	8	6240	6247	0 %	0 %	50 %	50 %	310817286
112	NC_014623	CAC	2	6	6336	6341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817286
113	NC_014623	TGA	2	6	6362	6367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817286
114	NC_014623	GGC	2	6	6471	6476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817286
115	NC_014623	TCA	2	6	6503	6508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817286
116	NC_014623	GC	4	8	6574	6581	0 %	0 %	50 %	50 %	310817286
117	NC_014623	TGA	2	6	6584	6589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817286
118	NC_014623	CCG	2	6	6722	6727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817286
119	NC_014623	ATG	2	6	6823	6828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817286
120	NC_014623	TTCGGG	2	12	6853	6864	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	310817286
121	NC_014623	GCG	2	6	6899	6904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817286
122	NC_014623	CCA	2	6	6935	6940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817286
123	NC_014623	GAT	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817287
124	NC_014623	GGGCC	2	10	7409	7418	0 %	0 %	60 %	40 %	310817287
125	NC_014623	GTG	2	6	7433	7438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817287
126	NC_014623	AGG	2	6	7441	7446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817287
127	NC_014623	GAGGCG	2	12	7467	7478	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	310817287
128	NC_014623	TCA	2	6	7486	7491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817287
129	NC_014623	TGC	2	6	7504	7509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817287
130	NC_014623	TCC	2	6	7531	7536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310817287
131	NC_014623	CGTGCT	2	12	7565	7576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817287
132	NC_014623	TGG	2	6	7666	7671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817287
133	NC_014623	GCCG	2	8	7693	7700	0 %	0 %	50 %	50 %	310817287
134	NC_014623	GC	3	6	7732	7737	0 %	0 %	50 %	50 %	310817287
135	NC_014623	CG	3	6	7795	7800	0 %	0 %	50 %	50 %	310817287
136	NC_014623	CTG	2	6	7812	7817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817287
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253	NC_014623	TCTT	2	8	11670	11677	0 %	75 %	0 %	25 %	310817290
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260	NC_014623	CA	3	6	12116	12121	50 %	0 %	0 %	50 %	310817291
261	NC_014623	TCT	2	6	12152	12157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310817291
262	NC_014623	TCA	2	6	12209	12214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817291
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264	NC_014623	CCA	2	6	12470	12475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817291
265	NC_014623	TCG	2	6	12511	12516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817291
266	NC_014623	TCA	2	6	12518	12523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310817291
267	NC_014623	GCC	2	6	12524	12529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817291
268	NC_014623	GAA	2	6	12609	12614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817291
269	NC_014623	CGCTG	2	10	12641	12650	0 %	20 %	40 %	40 %	310817291
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280	NC_014623	GCC	2	6	13315	13320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817292
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392	NC_014623	GCG	2	6	18569	18574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817295
393	NC_014623	CG	3	6	18591	18596	0 %	0 %	50 %	50 %	310817295
394	NC_014623	TCG	2	6	18635	18640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817295
395	NC_014623	TGA	2	6	18696	18701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817295
396	NC_014623	AGG	2	6	18723	18728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310817295
397	NC_014623	GCA	2	6	18753	18758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817295
398	NC_014623	CCGCG	2	10	18763	18772	0 %	0 %	40 %	60 %	310817295
399	NC_014623	CAC	2	6	18826	18831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310817295
400	NC_014623	GGC	2	6	18838	18843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817295
401	NC_014623	GTC	2	6	18917	18922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817295
402	NC_014623	GGC	2	6	18957	18962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817295
403	NC_014623	GCC	2	6	18991	18996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817295
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406	NC_014623	GCCC	2	8	19267	19274	0 %	0 %	25 %	75 %	310817296
407	NC_014623	CGGCG	2	10	19283	19292	0 %	0 %	60 %	40 %	310817296
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413	NC_014623	GTG	2	6	19542	19547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817296
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427	NC_014623	TGG	2	6	20413	20418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310817297
428	NC_014623	GAA	2	6	20447	20452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310817297
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430	NC_014623	GCT	2	6	20519	20524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817297
431	NC_014623	ACG	2	6	20539	20544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817297
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488	NC_014623	TCCGA	2	10	24265	24274	20 %	20 %	20 %	40 %	310817300
489	NC_014623	CGT	2	6	24284	24289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310817300
490	NC_014623	ACG	2	6	24330	24335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310817300
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493	NC_014623	GCC	2	6	24473	24478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310817300
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497	NC_014623	CGTC	2	8	24523	24530	0 %	25 %	25 %	50 %	310817300
498	NC_014623	GTT	2	6	24578	24583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310817300
499	NC_014623	GCG	2	6	24611	24616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310817300
500	NC_014623	AGT	2	6	24622	24627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310817300

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