MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae 670-6B chromosome

Total Repeats: 38487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014498	AGT	2	6	208620	208625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126386
3502	NC_014498	CGA	2	6	208646	208651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126386
3503	NC_014498	AG	3	6	208653	208658	50 %	0 %	50 %	0 %	307126386
3504	NC_014498	CTC	2	6	208662	208667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307126386
3505	NC_014498	AGAT	2	8	208747	208754	50 %	25 %	25 %	0 %	307126386
3506	NC_014498	TGG	2	6	208897	208902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126386
3507	NC_014498	TAT	2	6	209151	209156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126387
3508	NC_014498	TAG	2	6	209157	209162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126387
3509	NC_014498	ATG	2	6	209163	209168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126387
3510	NC_014498	GTC	2	6	209228	209233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126387
3511	NC_014498	TCA	2	6	209292	209297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126387
3512	NC_014498	TGC	2	6	209368	209373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126387
3513	NC_014498	GTG	2	6	209435	209440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126387
3514	NC_014498	CTG	2	6	209483	209488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126387
3515	NC_014498	GA	3	6	209513	209518	50 %	0 %	50 %	0 %	307126387
3516	NC_014498	GAA	2	6	209521	209526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126387
3517	NC_014498	GTTA	2	8	209567	209574	25 %	50 %	25 %	0 %	307126387
3518	NC_014498	TGG	2	6	209594	209599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307126387
3519	NC_014498	CTA	2	6	209641	209646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126387
3520	NC_014498	GCA	2	6	209794	209799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126387
3521	NC_014498	TCAA	2	8	209859	209866	50 %	25 %	0 %	25 %	307126387
3522	NC_014498	AGA	2	6	209872	209877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126387
3523	NC_014498	CGC	2	6	209913	209918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307126387
3524	NC_014498	ATTT	2	8	209970	209977	25 %	75 %	0 %	0 %	307126387
3525	NC_014498	TGA	2	6	209992	209997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126387
3526	NC_014498	GACA	2	8	210001	210008	50 %	0 %	25 %	25 %	307126387
3527	NC_014498	ATGA	2	8	210098	210105	50 %	25 %	25 %	0 %	307126387
3528	NC_014498	CT	3	6	210180	210185	0 %	50 %	0 %	50 %	307126387
3529	NC_014498	TCTA	2	8	210198	210205	25 %	50 %	0 %	25 %	307126387
3530	NC_014498	AAAC	2	8	210253	210260	75 %	0 %	0 %	25 %	307126387
3531	NC_014498	CAA	2	6	210278	210283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307126387
3532	NC_014498	ACTAT	2	10	210416	210425	40 %	40 %	0 %	20 %	307126387
3533	NC_014498	AAG	2	6	210576	210581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126388
3534	NC_014498	TGC	2	6	210589	210594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307126388
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3536	NC_014498	CTA	2	6	210708	210713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126388
3537	NC_014498	TAT	2	6	210799	210804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126388
3538	NC_014498	TCA	2	6	210918	210923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126388
3539	NC_014498	TCT	2	6	210945	210950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126388
3540	NC_014498	ACA	2	6	210964	210969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307126388
3541	NC_014498	AGA	3	9	210982	210990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126388
3542	NC_014498	AGA	2	6	210997	211002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126388
3543	NC_014498	AAGG	2	8	211222	211229	50 %	0 %	50 %	0 %	307126389
3544	NC_014498	T	6	6	211266	211271	0 %	100 %	0 %	0 %	307126389
3545	NC_014498	GAC	2	6	211326	211331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126389
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3547	NC_014498	TAT	2	6	211521	211526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126389
3548	NC_014498	AGA	2	6	211888	211893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126390
3549	NC_014498	AATC	2	8	211913	211920	50 %	25 %	0 %	25 %	307126390
3550	NC_014498	AAG	2	6	211945	211950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126390
3551	NC_014498	AAAG	2	8	211997	212004	75 %	0 %	25 %	0 %	307126390
3552	NC_014498	GAA	2	6	212063	212068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126390
3553	NC_014498	GAT	2	6	212087	212092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126390
3554	NC_014498	GA	3	6	212159	212164	50 %	0 %	50 %	0 %	307126390
3555	NC_014498	GA	3	6	212293	212298	50 %	0 %	50 %	0 %	307126390
3556	NC_014498	AGC	2	6	212312	212317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126390
3557	NC_014498	AGA	2	6	212368	212373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126390
3558	NC_014498	TCT	2	6	212424	212429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126390
3559	NC_014498	CATC	2	8	212504	212511	25 %	25 %	0 %	50 %	307126390
3560	NC_014498	AGG	2	6	212514	212519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307126390
3561	NC_014498	TCT	2	6	212557	212562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126390
3562	NC_014498	CCG	2	6	212596	212601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307126390
3563	NC_014498	GAT	2	6	212768	212773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126390
3564	NC_014498	TTGAG	2	10	212996	213005	20 %	40 %	40 %	0 %	307126390
3565	NC_014498	GCTT	2	8	213070	213077	0 %	50 %	25 %	25 %	307126390
3566	NC_014498	TTGA	2	8	213085	213092	25 %	50 %	25 %	0 %	307126390
3567	NC_014498	TTGA	2	8	213446	213453	25 %	50 %	25 %	0 %	307126391
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3570	NC_014498	GAT	2	6	213497	213502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126391
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3572	NC_014498	AGCC	2	8	213592	213599	25 %	0 %	25 %	50 %	307126391
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3578	NC_014498	GA	3	6	213990	213995	50 %	0 %	50 %	0 %	307126392
3579	NC_014498	TGA	2	6	214008	214013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126392
3580	NC_014498	TTGG	2	8	214040	214047	0 %	50 %	50 %	0 %	307126392
3581	NC_014498	TAGA	2	8	214162	214169	50 %	25 %	25 %	0 %	307126392
3582	NC_014498	ATC	2	6	214174	214179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126392
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3587	NC_014498	TTCT	2	8	214606	214613	0 %	75 %	0 %	25 %	307126393
3588	NC_014498	AG	3	6	215011	215016	50 %	0 %	50 %	0 %	307126394
3589	NC_014498	AAG	2	6	215060	215065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126394
3590	NC_014498	ATT	2	6	215082	215087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126394
3591	NC_014498	T	7	7	215086	215092	0 %	100 %	0 %	0 %	307126394
3592	NC_014498	GAG	2	6	215117	215122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307126394
3593	NC_014498	TTA	2	6	215154	215159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126394
3594	NC_014498	AT	5	10	215185	215194	50 %	50 %	0 %	0 %	307126394
3595	NC_014498	ATGGA	2	10	215246	215255	40 %	20 %	40 %	0 %	307126394
3596	NC_014498	ATTTTT	2	12	215271	215282	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307126394
3597	NC_014498	AGAA	2	8	215289	215296	75 %	0 %	25 %	0 %	307126394
3598	NC_014498	TAT	2	6	215322	215327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307126394
3599	NC_014498	CTAT	2	8	215486	215493	25 %	50 %	0 %	25 %	307126394
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3602	NC_014498	TCT	2	6	215654	215659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126394
3603	NC_014498	AAT	2	6	215766	215771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307126394
3604	NC_014498	TTTA	2	8	215928	215935	25 %	75 %	0 %	0 %	307126395
3605	NC_014498	CT	3	6	216047	216052	0 %	50 %	0 %	50 %	307126395
3606	NC_014498	AAATT	2	10	216143	216152	60 %	40 %	0 %	0 %	307126396
3607	NC_014498	AAG	3	9	216160	216168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126396
3608	NC_014498	ATAA	2	8	216218	216225	75 %	25 %	0 %	0 %	307126396
3609	NC_014498	GAA	2	6	216486	216491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126397
3610	NC_014498	GAA	2	6	216589	216594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126397
3611	NC_014498	AGG	2	6	216627	216632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307126397
3612	NC_014498	CAT	2	6	216705	216710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126397
3613	NC_014498	GAA	2	6	216711	216716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126397
3614	NC_014498	TTAT	2	8	216777	216784	25 %	75 %	0 %	0 %	307126397
3615	NC_014498	AAAT	2	8	216830	216837	75 %	25 %	0 %	0 %	307126397
3616	NC_014498	A	8	8	216855	216862	100 %	0 %	0 %	0 %	307126397
3617	NC_014498	TCAA	2	8	216890	216897	50 %	25 %	0 %	25 %	307126397
3618	NC_014498	CAG	2	6	216899	216904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126397
3619	NC_014498	CAG	2	6	216938	216943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126397
3620	NC_014498	A	7	7	216961	216967	100 %	0 %	0 %	0 %	307126397
3621	NC_014498	TACT	2	8	216972	216979	25 %	50 %	0 %	25 %	307126397
3622	NC_014498	TAAA	2	8	216983	216990	75 %	25 %	0 %	0 %	307126397
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3624	NC_014498	TAC	3	9	217063	217071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126397
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3742	NC_014498	AC	3	6	224473	224478	50 %	0 %	0 %	50 %	307126402
3743	NC_014498	TGT	2	6	224679	224684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307126402
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3747	NC_014498	CTT	2	6	224780	224785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126402
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3759	NC_014498	TCA	2	6	225619	225624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307126404
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3851	NC_014498	TCAA	2	8	231361	231368	50 %	25 %	0 %	25 %	307126410
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3857	NC_014498	TTC	2	6	231702	231707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126410
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3862	NC_014498	A	6	6	232045	232050	100 %	0 %	0 %	0 %	307126411
3863	NC_014498	GTTG	2	8	232078	232085	0 %	50 %	50 %	0 %	307126411
3864	NC_014498	CT	3	6	232134	232139	0 %	50 %	0 %	50 %	307126411
3865	NC_014498	AG	3	6	232165	232170	50 %	0 %	50 %	0 %	307126411
3866	NC_014498	CTCG	2	8	232284	232291	0 %	25 %	25 %	50 %	307126411
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3991	NC_014498	GCAGA	2	10	240239	240248	40 %	0 %	40 %	20 %	307126418
3992	NC_014498	AAG	2	6	240272	240277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307126418
3993	NC_014498	TGTC	2	8	240313	240320	0 %	50 %	25 %	25 %	307126418
3994	NC_014498	A	6	6	240323	240328	100 %	0 %	0 %	0 %	307126418
3995	NC_014498	CAGG	2	8	240356	240363	25 %	0 %	50 %	25 %	307126418
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3997	NC_014498	CAG	2	6	240449	240454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307126418
3998	NC_014498	TCT	2	6	240484	240489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307126418
3999	NC_014498	AAGGA	2	10	240501	240510	60 %	0 %	40 %	0 %	307126418
4000	NC_014498	TGA	2	6	240517	240522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307126418

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