MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae AP200 chromosome

Total Repeats: 37149

< Previous12...63646566676869707172737475Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_014494	T	7	7	2122515	2122521	0 %	100 %	0 %	0 %	307068843
37002	NC_014494	GTA	2	6	2122563	2122568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068843
37003	NC_014494	ACTG	2	8	2122594	2122601	25 %	25 %	25 %	25 %	307068843
37004	NC_014494	AGAAGT	2	12	2122667	2122678	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	307068843
37005	NC_014494	T	6	6	2122704	2122709	0 %	100 %	0 %	0 %	307068843
37006	NC_014494	AGA	2	6	2122724	2122729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307068843
37007	NC_014494	TTG	2	6	2122844	2122849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307068843
37008	NC_014494	TGAT	2	8	2122862	2122869	25 %	50 %	25 %	0 %	307068843
37009	NC_014494	GCT	2	6	2122872	2122877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307068843
37010	NC_014494	GTT	2	6	2122902	2122907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307068843
37011	NC_014494	T	7	7	2122906	2122912	0 %	100 %	0 %	0 %	307068843
37012	NC_014494	CTT	2	6	2122967	2122972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068843
37013	NC_014494	TCCT	2	8	2122973	2122980	0 %	50 %	0 %	50 %	307068843
37014	NC_014494	ATT	2	6	2123084	2123089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307068843
37015	NC_014494	TGA	2	6	2123138	2123143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068843
37016	NC_014494	TAG	2	6	2123471	2123476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068844
37017	NC_014494	TATGA	2	10	2123527	2123536	40 %	40 %	20 %	0 %	307068844
37018	NC_014494	AAGC	2	8	2123550	2123557	50 %	0 %	25 %	25 %	307068844
37019	NC_014494	AT	3	6	2123574	2123579	50 %	50 %	0 %	0 %	307068844
37020	NC_014494	TCA	2	6	2123595	2123600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068844
37021	NC_014494	CTT	2	6	2123662	2123667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068844
37022	NC_014494	TAG	2	6	2123787	2123792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068844
37023	NC_014494	ATCT	2	8	2123794	2123801	25 %	50 %	0 %	25 %	307068844
37024	NC_014494	T	6	6	2124165	2124170	0 %	100 %	0 %	0 %	307068845
37025	NC_014494	T	6	6	2124250	2124255	0 %	100 %	0 %	0 %	307068845
37026	NC_014494	GAG	2	6	2124302	2124307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307068845
37027	NC_014494	AAT	2	6	2124387	2124392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068845
37028	NC_014494	TGT	2	6	2124414	2124419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307068845
37029	NC_014494	ACA	2	6	2124490	2124495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307068845
37030	NC_014494	AGA	2	6	2124527	2124532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307068845
37031	NC_014494	TCT	2	6	2124548	2124553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068845
37032	NC_014494	TCA	2	6	2124562	2124567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068845
37033	NC_014494	CAA	2	6	2124581	2124586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307068845
37034	NC_014494	ATA	2	6	2124655	2124660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068845
37035	NC_014494	TGAGC	2	10	2124683	2124692	20 %	20 %	40 %	20 %	307068845
37036	NC_014494	TCA	2	6	2124757	2124762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068845
37037	NC_014494	TTC	2	6	2124774	2124779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068845
37038	NC_014494	TC	3	6	2124852	2124857	0 %	50 %	0 %	50 %	307068845
37039	NC_014494	TCT	2	6	2124883	2124888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068845
37040	NC_014494	TTCA	2	8	2124901	2124908	25 %	50 %	0 %	25 %	307068845
37041	NC_014494	ATA	2	6	2124969	2124974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068846
37042	NC_014494	TTG	2	6	2124975	2124980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307068846
37043	NC_014494	TAG	2	6	2124989	2124994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068846
37044	NC_014494	ATT	2	6	2125004	2125009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307068846
37045	NC_014494	TTC	2	6	2125027	2125032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068846
37046	NC_014494	TAA	2	6	2125129	2125134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068846
37047	NC_014494	ATT	2	6	2125184	2125189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307068846
37048	NC_014494	ATT	2	6	2125280	2125285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307068846
37049	NC_014494	TCT	2	6	2125332	2125337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068846
37050	NC_014494	TGT	2	6	2125339	2125344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307068846
37051	NC_014494	TCAAA	2	10	2125345	2125354	60 %	20 %	0 %	20 %	307068846
37052	NC_014494	CAA	2	6	2125516	2125521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307068846
37053	NC_014494	TCT	2	6	2125561	2125566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068846
37054	NC_014494	AAG	2	6	2125617	2125622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307068846
37055	NC_014494	GA	4	8	2125631	2125638	50 %	0 %	50 %	0 %	307068846
37056	NC_014494	A	6	6	2125739	2125744	100 %	0 %	0 %	0 %	307068846
37057	NC_014494	T	6	6	2125748	2125753	0 %	100 %	0 %	0 %	307068846
37058	NC_014494	ATA	2	6	2125805	2125810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068846
37059	NC_014494	GAG	2	6	2125902	2125907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307068846
37060	NC_014494	TAG	2	6	2125952	2125957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068846
37061	NC_014494	CATC	2	8	2125997	2126004	25 %	25 %	0 %	50 %	307068846
37062	NC_014494	AT	3	6	2126070	2126075	50 %	50 %	0 %	0 %	307068846
37063	NC_014494	AAT	2	6	2126127	2126132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068846
37064	NC_014494	TATT	2	8	2126140	2126147	25 %	75 %	0 %	0 %	307068846
37065	NC_014494	TAA	2	6	2126179	2126184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068846
37066	NC_014494	AAAT	2	8	2126216	2126223	75 %	25 %	0 %	0 %	307068846
37067	NC_014494	CT	3	6	2126459	2126464	0 %	50 %	0 %	50 %	307068847
37068	NC_014494	GTA	2	6	2126487	2126492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068847
37069	NC_014494	CAG	2	6	2126609	2126614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307068847
37070	NC_014494	CCG	2	6	2126652	2126657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307068847
37071	NC_014494	AAT	2	6	2126678	2126683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068847
37072	NC_014494	T	6	6	2126683	2126688	0 %	100 %	0 %	0 %	307068847
37073	NC_014494	TAA	2	6	2126744	2126749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068847
37074	NC_014494	TTC	2	6	2126760	2126765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068847
37075	NC_014494	GCTT	2	8	2126800	2126807	0 %	50 %	25 %	25 %	307068847
37076	NC_014494	CCTTT	2	10	2126815	2126824	0 %	60 %	0 %	40 %	307068847
37077	NC_014494	AGT	2	6	2126879	2126884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068847
37078	NC_014494	CTT	2	6	2126913	2126918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068847
37079	NC_014494	CAT	2	6	2126925	2126930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068847
37080	NC_014494	TCT	2	6	2126966	2126971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068848
37081	NC_014494	CT	3	6	2126970	2126975	0 %	50 %	0 %	50 %	307068848
37082	NC_014494	ACCG	2	8	2127005	2127012	25 %	0 %	25 %	50 %	307068848
37083	NC_014494	TTG	2	6	2127085	2127090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307068848
37084	NC_014494	TTC	2	6	2127179	2127184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068848
37085	NC_014494	TCAA	2	8	2127191	2127198	50 %	25 %	0 %	25 %	307068848
37086	NC_014494	TAAGG	2	10	2127476	2127485	40 %	20 %	40 %	0 %	307068849
37087	NC_014494	GAA	2	6	2127526	2127531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307068849
37088	NC_014494	ATA	2	6	2127620	2127625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068849
37089	NC_014494	CTG	2	6	2127925	2127930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307068850
37090	NC_014494	CAA	2	6	2127957	2127962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307068850
37091	NC_014494	TGA	2	6	2127980	2127985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068850
37092	NC_014494	T	6	6	2128028	2128033	0 %	100 %	0 %	0 %	307068850
37093	NC_014494	GAT	2	6	2128037	2128042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068850
37094	NC_014494	AAT	2	6	2128063	2128068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068850
37095	NC_014494	TCT	2	6	2128103	2128108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068850
37096	NC_014494	TTC	2	6	2128123	2128128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068850
37097	NC_014494	GAA	2	6	2128132	2128137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307068850
37098	NC_014494	T	6	6	2128257	2128262	0 %	100 %	0 %	0 %	307068850
37099	NC_014494	TTTC	2	8	2128344	2128351	0 %	75 %	0 %	25 %	307068850
37100	NC_014494	A	6	6	2128590	2128595	100 %	0 %	0 %	0 %	307068851
37101	NC_014494	ATT	2	6	2128604	2128609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307068851
37102	NC_014494	T	6	6	2128629	2128634	0 %	100 %	0 %	0 %	307068851
37103	NC_014494	AACT	2	8	2128666	2128673	50 %	25 %	0 %	25 %	307068851
37104	NC_014494	A	6	6	2128675	2128680	100 %	0 %	0 %	0 %	307068851
37105	NC_014494	AAC	2	6	2128689	2128694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307068851
37106	NC_014494	AAC	2	6	2128698	2128703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307068851
37107	NC_014494	CAA	2	6	2128744	2128749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307068851
37108	NC_014494	TGT	2	6	2128778	2128783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307068851
37109	NC_014494	TTA	2	6	2128789	2128794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307068851
37110	NC_014494	ATG	2	6	2128831	2128836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068851
37111	NC_014494	TTAT	2	8	2128882	2128889	25 %	75 %	0 %	0 %	307068851
37112	NC_014494	AAG	2	6	2128903	2128908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307068851
37113	NC_014494	CAA	2	6	2128922	2128927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307068851
37114	NC_014494	GTC	2	6	2129028	2129033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307068851
37115	NC_014494	ACA	2	6	2129055	2129060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307068851
37116	NC_014494	GTATC	2	10	2129161	2129170	20 %	40 %	20 %	20 %	307068851
37117	NC_014494	GGC	2	6	2129268	2129273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307068851
37118	NC_014494	GGA	2	6	2129334	2129339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307068851
37119	NC_014494	ATG	2	6	2129377	2129382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068851
37120	NC_014494	ATT	2	6	2129391	2129396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307068851
37121	NC_014494	A	7	7	2129407	2129413	100 %	0 %	0 %	0 %	307068851
37122	NC_014494	AGA	2	6	2129484	2129489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307068851
37123	NC_014494	GTT	2	6	2129523	2129528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307068851
37124	NC_014494	TGCC	2	8	2129548	2129555	0 %	25 %	25 %	50 %	307068851
37125	NC_014494	TCA	2	6	2129613	2129618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068851
37126	NC_014494	CTA	2	6	2129675	2129680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068851
37127	NC_014494	AGA	2	6	2129693	2129698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307068851
37128	NC_014494	A	7	7	2129842	2129848	100 %	0 %	0 %	0 %	307068852
37129	NC_014494	ATT	2	6	2129934	2129939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307068852
37130	NC_014494	GA	4	8	2129980	2129987	50 %	0 %	50 %	0 %	307068852
37131	NC_014494	TGT	2	6	2130032	2130037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307068852
37132	NC_014494	GAT	2	6	2130059	2130064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068852
37133	NC_014494	GTCCA	2	10	2130066	2130075	20 %	20 %	20 %	40 %	307068852
37134	NC_014494	AG	3	6	2130091	2130096	50 %	0 %	50 %	0 %	307068852
37135	NC_014494	AGA	2	6	2130113	2130118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307068852
37136	NC_014494	TC	3	6	2130135	2130140	0 %	50 %	0 %	50 %	307068852
37137	NC_014494	AT	3	6	2130197	2130202	50 %	50 %	0 %	0 %	307068852
37138	NC_014494	TC	3	6	2130242	2130247	0 %	50 %	0 %	50 %	307068852
37139	NC_014494	AAC	2	6	2130310	2130315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307068852
37140	NC_014494	TTTC	2	8	2130323	2130330	0 %	75 %	0 %	25 %	307068852
37141	NC_014494	AGA	3	9	2130341	2130349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307068852
37142	NC_014494	A	6	6	2130387	2130392	100 %	0 %	0 %	0 %	307068852
37143	NC_014494	A	6	6	2130406	2130411	100 %	0 %	0 %	0 %	307068852
37144	NC_014494	GAA	2	6	2130432	2130437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307068852
37145	NC_014494	ACT	2	6	2130452	2130457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068852
37146	NC_014494	A	6	6	2130486	2130491	100 %	0 %	0 %	0 %	307068852
37147	NC_014494	ATT	2	6	2130507	2130512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307068852
37148	NC_014494	AAG	2	6	2130526	2130531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307068852
37149	NC_014494	TAG	2	6	2130536	2130541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068852

< Previous12...63646566676869707172737475Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.