MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae AP200 chromosome

Total Repeats: 37149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23010	NC_014494	AT	3	6	1301764	1301769	50 %	50 %	0 %	0 %	307068000
23011	NC_014494	ATT	2	6	1301778	1301783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307068000
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23103	NC_014494	GTATC	2	10	1306449	1306458	20 %	40 %	20 %	20 %	307068009
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23117	NC_014494	AGT	2	6	1307155	1307160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068009
23118	NC_014494	CTG	2	6	1307225	1307230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307068009
23119	NC_014494	TTC	2	6	1307240	1307245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068009
23120	NC_014494	GAT	2	6	1307293	1307298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068009
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23122	NC_014494	GAG	2	6	1307369	1307374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307068009
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23200	NC_014494	GACCT	2	10	1311988	1311997	20 %	20 %	20 %	40 %	307068013
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23220	NC_014494	GAA	2	6	1312656	1312661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307068013
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23222	NC_014494	CTG	2	6	1312680	1312685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307068013
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23228	NC_014494	T	7	7	1312928	1312934	0 %	100 %	0 %	0 %	307068013
23229	NC_014494	TGAT	3	12	1312984	1312995	25 %	50 %	25 %	0 %	307068013
23230	NC_014494	TCC	2	6	1312999	1313004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307068013
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23232	NC_014494	CAC	2	6	1313028	1313033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307068013
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23234	NC_014494	TCA	2	6	1313265	1313270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068014
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23347	NC_014494	TCT	2	6	1318701	1318706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068018
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23350	NC_014494	T	7	7	1318749	1318755	0 %	100 %	0 %	0 %	307068018
23351	NC_014494	CCA	2	6	1318761	1318766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307068018
23352	NC_014494	CAT	2	6	1318816	1318821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068019
23353	NC_014494	CTG	2	6	1318840	1318845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307068019
23354	NC_014494	CAT	2	6	1318888	1318893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068019
23355	NC_014494	TTTC	2	8	1319041	1319048	0 %	75 %	0 %	25 %	307068019
23356	NC_014494	T	6	6	1319054	1319059	0 %	100 %	0 %	0 %	307068019
23357	NC_014494	GA	3	6	1319075	1319080	50 %	0 %	50 %	0 %	307068019
23358	NC_014494	T	6	6	1319192	1319197	0 %	100 %	0 %	0 %	307068019
23359	NC_014494	ATA	2	6	1319219	1319224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068019
23360	NC_014494	CAAATC	2	12	1319261	1319272	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	307068019
23361	NC_014494	CTG	2	6	1319273	1319278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307068019
23362	NC_014494	GGT	2	6	1319294	1319299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307068019
23363	NC_014494	TAA	2	6	1319317	1319322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068019
23364	NC_014494	CAA	2	6	1319335	1319340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307068019
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23366	NC_014494	GTC	3	9	1319441	1319449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307068019
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23371	NC_014494	TCCA	2	8	1320019	1320026	25 %	25 %	0 %	50 %	307068020
23372	NC_014494	AGG	2	6	1320047	1320052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307068020
23373	NC_014494	GTTG	2	8	1320067	1320074	0 %	50 %	50 %	0 %	307068020
23374	NC_014494	TTG	2	6	1320163	1320168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307068020
23375	NC_014494	TCA	4	12	1320197	1320208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068020
23376	NC_014494	CTG	2	6	1320247	1320252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307068020
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23380	NC_014494	TCTG	2	8	1320539	1320546	0 %	50 %	25 %	25 %	307068020
23381	NC_014494	TA	3	6	1320580	1320585	50 %	50 %	0 %	0 %	307068020
23382	NC_014494	ATA	2	6	1320653	1320658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068020
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23385	NC_014494	A	6	6	1320861	1320866	100 %	0 %	0 %	0 %	307068020
23386	NC_014494	TCTTT	2	10	1320901	1320910	0 %	80 %	0 %	20 %	307068020
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23388	NC_014494	AG	3	6	1320922	1320927	50 %	0 %	50 %	0 %	307068020
23389	NC_014494	CTCTT	2	10	1320985	1320994	0 %	60 %	0 %	40 %	307068020
23390	NC_014494	CTA	2	6	1321013	1321018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068020
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23393	NC_014494	T	6	6	1321094	1321099	0 %	100 %	0 %	0 %	307068020
23394	NC_014494	AAT	2	6	1321104	1321109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068020
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23414	NC_014494	GTAG	2	8	1322164	1322171	25 %	25 %	50 %	0 %	307068022
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23432	NC_014494	GCA	2	6	1322990	1322995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307068023
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23436	NC_014494	TTG	2	6	1323144	1323149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307068023
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23438	NC_014494	TGACT	2	10	1323237	1323246	20 %	40 %	20 %	20 %	307068023
23439	NC_014494	T	7	7	1323356	1323362	0 %	100 %	0 %	0 %	307068023
23440	NC_014494	ATC	2	6	1323405	1323410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068023
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23444	NC_014494	TAC	2	6	1323710	1323715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068023
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23451	NC_014494	CTG	2	6	1324080	1324085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307068025
23452	NC_014494	GCT	2	6	1324100	1324105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307068025
23453	NC_014494	GAC	2	6	1324199	1324204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307068026
23454	NC_014494	T	6	6	1324218	1324223	0 %	100 %	0 %	0 %	307068026
23455	NC_014494	TCT	2	6	1324371	1324376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068026
23456	NC_014494	TCA	2	6	1324377	1324382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068026
23457	NC_014494	CAC	3	9	1324417	1324425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307068026
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23459	NC_014494	A	6	6	1324469	1324474	100 %	0 %	0 %	0 %	307068026
23460	NC_014494	ACC	2	6	1324637	1324642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307068026
23461	NC_014494	ATA	2	6	1324859	1324864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068026
23462	NC_014494	AGC	2	6	1324895	1324900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307068026
23463	NC_014494	ATGGG	2	10	1324923	1324932	20 %	20 %	60 %	0 %	307068026
23464	NC_014494	GCCA	2	8	1324955	1324962	25 %	0 %	25 %	50 %	307068026
23465	NC_014494	CCG	2	6	1324972	1324977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307068026
23466	NC_014494	ATA	2	6	1325016	1325021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307068026
23467	NC_014494	GTTT	2	8	1325070	1325077	0 %	75 %	25 %	0 %	307068026
23468	NC_014494	ATC	2	6	1325129	1325134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307068026
23469	NC_014494	CTT	2	6	1325155	1325160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068026
23470	NC_014494	TC	3	6	1325172	1325177	0 %	50 %	0 %	50 %	307068026
23471	NC_014494	GAT	2	6	1325218	1325223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068026
23472	NC_014494	CTT	2	6	1325341	1325346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307068027
23473	NC_014494	TGA	2	6	1325366	1325371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068027
23474	NC_014494	TC	3	6	1325459	1325464	0 %	50 %	0 %	50 %	307068027
23475	NC_014494	AAC	2	6	1325552	1325557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307068027
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23477	NC_014494	ACC	2	6	1325591	1325596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307068027
23478	NC_014494	ATT	2	6	1325600	1325605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307068027
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23481	NC_014494	CGA	2	6	1325803	1325808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307068027
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23484	NC_014494	TGA	2	6	1326074	1326079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068027
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23488	NC_014494	TCC	2	6	1326195	1326200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307068027
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23491	NC_014494	TGA	2	6	1326238	1326243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068027
23492	NC_014494	GTC	2	6	1326267	1326272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307068027
23493	NC_014494	ACC	2	6	1326329	1326334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307068027
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23495	NC_014494	AGT	2	6	1326490	1326495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307068028
23496	NC_014494	CATG	2	8	1326757	1326764	25 %	25 %	25 %	25 %	307068028
23497	NC_014494	ATGGC	2	10	1326792	1326801	20 %	20 %	40 %	20 %	307068028
23498	NC_014494	ACC	2	6	1326858	1326863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307068028
23499	NC_014494	TCAA	2	8	1326891	1326898	50 %	25 %	0 %	25 %	307068028
23500	NC_014494	AG	3	6	1326949	1326954	50 %	0 %	50 %	0 %	307068028

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