MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae AP200 chromosome

Total Repeats: 37149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014494	CAA	2	6	285323	285328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066949
5002	NC_014494	CCAAT	2	10	285402	285411	40 %	20 %	0 %	40 %	307066949
5003	NC_014494	GAA	2	6	285507	285512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066949
5004	NC_014494	ATTG	2	8	285560	285567	25 %	50 %	25 %	0 %	307066949
5005	NC_014494	GAA	2	6	285588	285593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066949
5006	NC_014494	TGA	3	9	285595	285603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066949
5007	NC_014494	GAA	2	6	285618	285623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066949
5008	NC_014494	GAA	2	6	285633	285638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066949
5009	NC_014494	TTC	2	6	285678	285683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066949
5010	NC_014494	TG	3	6	285691	285696	0 %	50 %	50 %	0 %	307066949
5011	NC_014494	GAA	2	6	285810	285815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066949
5012	NC_014494	TGAC	2	8	285868	285875	25 %	25 %	25 %	25 %	307066949
5013	NC_014494	TTC	2	6	285897	285902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066949
5014	NC_014494	TTC	2	6	285919	285924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066949
5015	NC_014494	GCT	2	6	286041	286046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066949
5016	NC_014494	TAC	2	6	286064	286069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066949
5017	NC_014494	ATC	2	6	286104	286109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066949
5018	NC_014494	TCAA	2	8	286116	286123	50 %	25 %	0 %	25 %	307066949
5019	NC_014494	CAAGA	2	10	286176	286185	60 %	0 %	20 %	20 %	307066949
5020	NC_014494	GAA	2	6	286212	286217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066949
5021	NC_014494	AAAC	2	8	286237	286244	75 %	0 %	0 %	25 %	307066949
5022	NC_014494	TTG	2	6	286300	286305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066949
5023	NC_014494	CGT	2	6	286314	286319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066949
5024	NC_014494	CTC	2	6	286348	286353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307066949
5025	NC_014494	TTC	2	6	286401	286406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066949
5026	NC_014494	TGG	2	6	286418	286423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066949
5027	NC_014494	GAA	2	6	286467	286472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066949
5028	NC_014494	ATTCGA	2	12	286481	286492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307066949
5029	NC_014494	TCG	2	6	286501	286506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066949
5030	NC_014494	GTG	2	6	286507	286512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066949
5031	NC_014494	ATG	2	6	286618	286623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066949
5032	NC_014494	GCT	2	6	286692	286697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066949
5033	NC_014494	ATG	2	6	286728	286733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066949
5034	NC_014494	AGA	2	6	286754	286759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066949
5035	NC_014494	TCG	2	6	286793	286798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066949
5036	NC_014494	TCGT	2	8	286840	286847	0 %	50 %	25 %	25 %	307066949
5037	NC_014494	TTC	2	6	286888	286893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307066949
5038	NC_014494	ATG	2	6	286923	286928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066949
5039	NC_014494	AAG	2	6	286966	286971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066949
5040	NC_014494	ATT	2	6	286974	286979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307066949
5041	NC_014494	AATG	2	8	287102	287109	50 %	25 %	25 %	0 %	307066950
5042	NC_014494	TGA	2	6	287129	287134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066950
5043	NC_014494	CTG	2	6	287150	287155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066950
5044	NC_014494	AAAG	2	8	287283	287290	75 %	0 %	25 %	0 %	307066950
5045	NC_014494	GAA	2	6	287299	287304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066950
5046	NC_014494	CTA	2	6	287382	287387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066950
5047	NC_014494	TATT	2	8	287477	287484	25 %	75 %	0 %	0 %	307066950
5048	NC_014494	AAG	2	6	287518	287523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066950
5049	NC_014494	ATC	2	6	287525	287530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066950
5050	NC_014494	AAC	2	6	287546	287551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066950
5051	NC_014494	GAA	2	6	287592	287597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066950
5052	NC_014494	AAC	2	6	287690	287695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066950
5053	NC_014494	CCT	2	6	287710	287715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307066950
5054	NC_014494	A	6	6	287752	287757	100 %	0 %	0 %	0 %	307066950
5055	NC_014494	GAC	2	6	287811	287816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066950
5056	NC_014494	GTT	2	6	287845	287850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066950
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5059	NC_014494	GTT	2	6	288073	288078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066950
5060	NC_014494	TTG	2	6	288182	288187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066950
5061	NC_014494	GCT	2	6	288193	288198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066950
5062	NC_014494	GGC	2	6	288267	288272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307066950
5063	NC_014494	GGA	2	6	288321	288326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066950
5064	NC_014494	ACG	2	6	288400	288405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066950
5065	NC_014494	CTAT	2	8	288416	288423	25 %	50 %	0 %	25 %	307066950
5066	NC_014494	TGA	2	6	288483	288488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066950
5067	NC_014494	TAC	2	6	288522	288527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066950
5068	NC_014494	GAT	2	6	288547	288552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066950
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5070	NC_014494	GTC	2	6	288839	288844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307066950
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5073	NC_014494	A	6	6	288990	288995	100 %	0 %	0 %	0 %	307066950
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5077	NC_014494	GGA	2	6	289248	289253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307066950
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5084	NC_014494	CT	4	8	289862	289869	0 %	50 %	0 %	50 %	307066950
5085	NC_014494	GTCAGT	2	12	289886	289897	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307066950
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5087	NC_014494	GAA	2	6	290113	290118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066950
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5096	NC_014494	ATG	2	6	290432	290437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066950
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5099	NC_014494	TTGG	2	8	290697	290704	0 %	50 %	50 %	0 %	307066950
5100	NC_014494	GAC	2	6	290767	290772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307066950
5101	NC_014494	CATG	2	8	290787	290794	25 %	25 %	25 %	25 %	307066950
5102	NC_014494	AGA	2	6	290865	290870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307066950
5103	NC_014494	GA	3	6	290872	290877	50 %	0 %	50 %	0 %	307066950
5104	NC_014494	TAA	2	6	290904	290909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066950
5105	NC_014494	ATG	2	6	290986	290991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307066950
5106	NC_014494	TATT	2	8	291027	291034	25 %	75 %	0 %	0 %	307066950
5107	NC_014494	ACT	2	6	291035	291040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066950
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5111	NC_014494	CCA	2	6	291292	291297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307066950
5112	NC_014494	ATGG	2	8	291307	291314	25 %	25 %	50 %	0 %	307066950
5113	NC_014494	GA	3	6	291320	291325	50 %	0 %	50 %	0 %	307066950
5114	NC_014494	CT	3	6	291370	291375	0 %	50 %	0 %	50 %	307066950
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5119	NC_014494	GTT	2	6	291489	291494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307066950
5120	NC_014494	A	6	6	291497	291502	100 %	0 %	0 %	0 %	307066950
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5122	NC_014494	TAGAC	2	10	291749	291758	40 %	20 %	20 %	20 %	307066951
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5241	NC_014494	T	6	6	298212	298217	0 %	100 %	0 %	0 %	307066960
5242	NC_014494	T	6	6	298268	298273	0 %	100 %	0 %	0 %	307066960
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5361	NC_014494	GAAA	2	8	305005	305012	75 %	0 %	25 %	0 %	307066966
5362	NC_014494	CGGA	2	8	305042	305049	25 %	0 %	50 %	25 %	307066966
5363	NC_014494	TGG	2	6	305076	305081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066966
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5488	NC_014494	TGG	2	6	312349	312354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066974
5489	NC_014494	T	7	7	312435	312441	0 %	100 %	0 %	0 %	307066974
5490	NC_014494	A	6	6	312447	312452	100 %	0 %	0 %	0 %	307066974
5491	NC_014494	GGT	2	6	312459	312464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066974
5492	NC_014494	GTG	2	6	312517	312522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307066974
5493	NC_014494	TTGG	2	8	312534	312541	0 %	50 %	50 %	0 %	307066974
5494	NC_014494	GTAT	2	8	312587	312594	25 %	50 %	25 %	0 %	307066974
5495	NC_014494	ACA	2	6	312605	312610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307066974
5496	NC_014494	AATTG	2	10	312773	312782	40 %	40 %	20 %	0 %	307066974
5497	NC_014494	ATA	2	6	312820	312825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307066974
5498	NC_014494	ACT	2	6	312857	312862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066974
5499	NC_014494	AGAT	2	8	312893	312900	50 %	25 %	25 %	0 %	307066974
5500	NC_014494	TCA	2	6	312913	312918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307066974

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