MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 chromosome

Total Repeats: 85225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014364	TGA	2	6	189273	189278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336727
3502	NC_014364	GGT	2	6	189313	189318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336727
3503	NC_014364	GGA	2	6	189410	189415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336727
3504	NC_014364	TTC	2	6	189435	189440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336728
3505	NC_014364	CT	3	6	189589	189594	0 %	50 %	0 %	50 %	302336728
3506	NC_014364	GGGC	2	8	189750	189757	0 %	0 %	75 %	25 %	302336728
3507	NC_014364	TTC	2	6	189759	189764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336728
3508	NC_014364	GCC	3	9	189832	189840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336728
3509	NC_014364	CCG	2	6	189845	189850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336728
3510	NC_014364	GCA	2	6	189870	189875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336728
3511	NC_014364	ATCGG	2	10	189919	189928	20 %	20 %	40 %	20 %	302336728
3512	NC_014364	TCG	2	6	189948	189953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336728
3513	NC_014364	GGCT	2	8	189988	189995	0 %	25 %	50 %	25 %	302336728
3514	NC_014364	GAG	3	9	190054	190062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336728
3515	NC_014364	TGC	3	9	190104	190112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336728
3516	NC_014364	CGC	2	6	190146	190151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336728
3517	NC_014364	CTT	2	6	190157	190162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336728
3518	NC_014364	TGG	2	6	190218	190223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336728
3519	NC_014364	CTCCTT	2	12	190262	190273	0 %	50 %	0 %	50 %	302336728
3520	NC_014364	CTA	2	6	190308	190313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336728
3521	NC_014364	CGG	3	9	190416	190424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336728
3522	NC_014364	GAT	2	6	190467	190472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336728
3523	NC_014364	CTT	2	6	190490	190495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336728
3524	NC_014364	CGG	2	6	190546	190551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336728
3525	NC_014364	CAA	2	6	190614	190619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302336728
3526	NC_014364	TGG	2	6	190691	190696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336728
3527	NC_014364	AAGG	2	8	190765	190772	50 %	0 %	50 %	0 %	302336728
3528	NC_014364	GCC	2	6	190813	190818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336728
3529	NC_014364	ATCTCC	2	12	190820	190831	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	302336728
3530	NC_014364	GGC	2	6	190869	190874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336728
3531	NC_014364	AG	3	6	190942	190947	50 %	0 %	50 %	0 %	302336729
3532	NC_014364	CAT	2	6	190954	190959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336729
3533	NC_014364	GAT	2	6	190991	190996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336729
3534	NC_014364	ACC	2	6	191027	191032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302336729
3535	NC_014364	TGC	2	6	191155	191160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336729
3536	NC_014364	GA	3	6	191238	191243	50 %	0 %	50 %	0 %	302336729
3537	NC_014364	GGC	2	6	191269	191274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336729
3538	NC_014364	GAT	2	6	191347	191352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336729
3539	NC_014364	GTG	2	6	191475	191480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336729
3540	NC_014364	CAC	2	6	191613	191618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302336730
3541	NC_014364	GCC	2	6	191647	191652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336730
3542	NC_014364	GGCA	2	8	191728	191735	25 %	0 %	50 %	25 %	302336730
3543	NC_014364	AG	3	6	191751	191756	50 %	0 %	50 %	0 %	302336730
3544	NC_014364	GAT	2	6	191815	191820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336730
3545	NC_014364	AAG	2	6	191867	191872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336730
3546	NC_014364	GAT	2	6	191976	191981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336730
3547	NC_014364	GAG	2	6	191986	191991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336730
3548	NC_014364	TGC	2	6	192002	192007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336730
3549	NC_014364	ATC	2	6	192109	192114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336730
3550	NC_014364	GGT	2	6	192126	192131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336730
3551	NC_014364	GGA	2	6	192144	192149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336730
3552	NC_014364	TC	3	6	192246	192251	0 %	50 %	0 %	50 %	302336730
3553	NC_014364	GGT	2	6	192276	192281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336730
3554	NC_014364	AGC	2	6	192409	192414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336730
3555	NC_014364	CCG	2	6	192567	192572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336730
3556	NC_014364	CGGA	2	8	192583	192590	25 %	0 %	50 %	25 %	302336730
3557	NC_014364	TGG	2	6	192596	192601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336730
3558	NC_014364	CGT	2	6	192621	192626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336730
3559	NC_014364	ATC	2	6	192702	192707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336731
3560	NC_014364	C	7	7	192812	192818	0 %	0 %	0 %	100 %	302336731
3561	NC_014364	TC	3	6	192836	192841	0 %	50 %	0 %	50 %	302336731
3562	NC_014364	GGA	2	6	192849	192854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336731
3563	NC_014364	G	7	7	192900	192906	0 %	0 %	100 %	0 %	302336731
3564	NC_014364	GTC	2	6	193158	193163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336731
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3566	NC_014364	ATCG	2	8	193277	193284	25 %	25 %	25 %	25 %	302336731
3567	NC_014364	TCA	2	6	193407	193412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336732
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3569	NC_014364	AT	3	6	193514	193519	50 %	50 %	0 %	0 %	302336732
3570	NC_014364	AAG	2	6	193562	193567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336732
3571	NC_014364	AG	3	6	193566	193571	50 %	0 %	50 %	0 %	302336732
3572	NC_014364	CA	3	6	193577	193582	50 %	0 %	0 %	50 %	302336732
3573	NC_014364	CT	4	8	193615	193622	0 %	50 %	0 %	50 %	302336732
3574	NC_014364	GATTC	2	10	193642	193651	20 %	40 %	20 %	20 %	302336732
3575	NC_014364	CGG	3	9	193710	193718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336732
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3578	NC_014364	CAGG	2	8	194014	194021	25 %	0 %	50 %	25 %	302336732
3579	NC_014364	CAT	2	6	194023	194028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336732
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3583	NC_014364	TCTG	2	8	194211	194218	0 %	50 %	25 %	25 %	302336733
3584	NC_014364	TTG	2	6	194219	194224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336733
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3586	NC_014364	T	7	7	194291	194297	0 %	100 %	0 %	0 %	302336733
3587	NC_014364	GAT	2	6	194322	194327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336733
3588	NC_014364	GGT	3	9	194364	194372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336733
3589	NC_014364	CCT	2	6	194403	194408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336733
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3592	NC_014364	TC	3	6	194594	194599	0 %	50 %	0 %	50 %	302336733
3593	NC_014364	A	6	6	194632	194637	100 %	0 %	0 %	0 %	302336733
3594	NC_014364	CCT	2	6	194652	194657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336733
3595	NC_014364	GCC	3	9	194743	194751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336733
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3597	NC_014364	CTTG	2	8	194790	194797	0 %	50 %	25 %	25 %	302336733
3598	NC_014364	C	6	6	194822	194827	0 %	0 %	0 %	100 %	302336733
3599	NC_014364	TCG	2	6	194832	194837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336733
3600	NC_014364	CGA	2	6	194892	194897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336733
3601	NC_014364	GGAG	2	8	194953	194960	25 %	0 %	75 %	0 %	302336733
3602	NC_014364	G	6	6	194976	194981	0 %	0 %	100 %	0 %	302336733
3603	NC_014364	CA	3	6	195016	195021	50 %	0 %	0 %	50 %	302336733
3604	NC_014364	CGGGC	2	10	195048	195057	0 %	0 %	60 %	40 %	302336733
3605	NC_014364	TGGT	2	8	195113	195120	0 %	50 %	50 %	0 %	302336733
3606	NC_014364	GCC	2	6	195205	195210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336733
3607	NC_014364	ATC	2	6	195343	195348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336733
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3609	NC_014364	CCG	3	9	195371	195379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336733
3610	NC_014364	CTTG	2	8	195381	195388	0 %	50 %	25 %	25 %	302336733
3611	NC_014364	CTG	2	6	195433	195438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336733
3612	NC_014364	GCC	2	6	195475	195480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336733
3613	NC_014364	TCA	2	6	195491	195496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336733
3614	NC_014364	GGT	2	6	195594	195599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336733
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3617	NC_014364	TAT	2	6	195824	195829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302336734
3618	NC_014364	CCA	2	6	195835	195840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302336734
3619	NC_014364	TTCTGC	2	12	195866	195877	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	302336734
3620	NC_014364	GGA	2	6	195902	195907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336734
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3622	NC_014364	TCA	2	6	195984	195989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336734
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3745	NC_014364	TGGAT	2	10	202624	202633	20 %	40 %	40 %	0 %	302336744
3746	NC_014364	TTTTC	2	10	202695	202704	0 %	80 %	0 %	20 %	302336744
3747	NC_014364	GGT	2	6	202712	202717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336744
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3749	NC_014364	GAA	2	6	202837	202842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336744
3750	NC_014364	GA	3	6	202876	202881	50 %	0 %	50 %	0 %	302336744
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3990	NC_014364	GAA	2	6	215885	215890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336757
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