MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 chromosome

Total Repeats: 85225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_014364	CCCT	2	8	161655	161662	0 %	25 %	0 %	75 %	302336702
3003	NC_014364	CT	3	6	161661	161666	0 %	50 %	0 %	50 %	302336702
3004	NC_014364	CTA	2	6	161837	161842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336703
3005	NC_014364	ATC	2	6	161860	161865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336703
3006	NC_014364	GCC	2	6	161875	161880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336703
3007	NC_014364	CTC	2	6	161911	161916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336703
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3009	NC_014364	AG	3	6	161944	161949	50 %	0 %	50 %	0 %	302336703
3010	NC_014364	AAT	2	6	162037	162042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336703
3011	NC_014364	A	6	6	162083	162088	100 %	0 %	0 %	0 %	302336703
3012	NC_014364	TTC	2	6	162090	162095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336703
3013	NC_014364	TCTA	2	8	162117	162124	25 %	50 %	0 %	25 %	302336703
3014	NC_014364	CCT	2	6	162207	162212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336704
3015	NC_014364	T	6	6	162222	162227	0 %	100 %	0 %	0 %	302336704
3016	NC_014364	ATC	2	6	162231	162236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336704
3017	NC_014364	GAA	2	6	162245	162250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336704
3018	NC_014364	GGT	2	6	162272	162277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336704
3019	NC_014364	TCG	2	6	162303	162308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336704
3020	NC_014364	G	7	7	162368	162374	0 %	0 %	100 %	0 %	302336704
3021	NC_014364	TCC	2	6	162422	162427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336704
3022	NC_014364	ATCA	2	8	162530	162537	50 %	25 %	0 %	25 %	302336704
3023	NC_014364	ATGC	2	8	162561	162568	25 %	25 %	25 %	25 %	302336704
3024	NC_014364	A	6	6	162589	162594	100 %	0 %	0 %	0 %	302336704
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3031	NC_014364	GAT	2	6	162986	162991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336704
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3034	NC_014364	CGC	2	6	163060	163065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336704
3035	NC_014364	TAA	2	6	163198	163203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336704
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3038	NC_014364	AGAGG	2	10	163370	163379	40 %	0 %	60 %	0 %	302336704
3039	NC_014364	TTG	2	6	163470	163475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336704
3040	NC_014364	GCA	2	6	163575	163580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336704
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3042	NC_014364	T	6	6	163610	163615	0 %	100 %	0 %	0 %	302336704
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3050	NC_014364	TCA	2	6	163978	163983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336704
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3052	NC_014364	TGGA	2	8	164079	164086	25 %	25 %	50 %	0 %	302336704
3053	NC_014364	GCT	2	6	164131	164136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336704
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3055	NC_014364	TATAG	2	10	164244	164253	40 %	40 %	20 %	0 %	302336704
3056	NC_014364	TACA	2	8	164362	164369	50 %	25 %	0 %	25 %	302336705
3057	NC_014364	CT	3	6	164415	164420	0 %	50 %	0 %	50 %	302336705
3058	NC_014364	AGA	2	6	164464	164469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336705
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3065	NC_014364	GATT	2	8	164715	164722	25 %	50 %	25 %	0 %	302336705
3066	NC_014364	TGG	2	6	164780	164785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336705
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3094	NC_014364	ACCA	2	8	166148	166155	50 %	0 %	0 %	50 %	302336707
3095	NC_014364	CAA	2	6	166157	166162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302336707
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3106	NC_014364	ATA	3	9	166623	166631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336707
3107	NC_014364	AT	3	6	166700	166705	50 %	50 %	0 %	0 %	302336708
3108	NC_014364	AAT	2	6	166731	166736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336708
3109	NC_014364	TCT	2	6	166747	166752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336708
3110	NC_014364	GGTCG	2	10	166765	166774	0 %	20 %	60 %	20 %	302336708
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3113	NC_014364	TCCA	2	8	166859	166866	25 %	25 %	0 %	50 %	302336708
3114	NC_014364	A	7	7	166878	166884	100 %	0 %	0 %	0 %	302336708
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3123	NC_014364	GAT	2	6	167375	167380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336709
3124	NC_014364	CTC	2	6	167591	167596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336709
3125	NC_014364	ACG	2	6	167643	167648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336709
3126	NC_014364	CCT	3	9	167800	167808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336709
3127	NC_014364	ATC	2	6	167835	167840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336709
3128	NC_014364	ATG	3	9	167895	167903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336709
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3130	NC_014364	A	6	6	168131	168136	100 %	0 %	0 %	0 %	302336709
3131	NC_014364	G	6	6	168187	168192	0 %	0 %	100 %	0 %	302336709
3132	NC_014364	TCTT	2	8	168216	168223	0 %	75 %	0 %	25 %	302336709
3133	NC_014364	ATG	2	6	168246	168251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336709
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3140	NC_014364	CAT	2	6	168628	168633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336709
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3142	NC_014364	GAT	2	6	168698	168703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336709
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3144	NC_014364	TCT	2	6	168741	168746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336709
3145	NC_014364	ATC	2	6	168803	168808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336709
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3155	NC_014364	CGT	2	6	169362	169367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336709
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3159	NC_014364	CTTCCG	2	12	169709	169720	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	302336710
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3163	NC_014364	GCTTC	2	10	170112	170121	0 %	40 %	20 %	40 %	302336711
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3170	NC_014364	GACG	2	8	170880	170887	25 %	0 %	50 %	25 %	302336711
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3180	NC_014364	GA	3	6	171231	171236	50 %	0 %	50 %	0 %	302336711
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3203	NC_014364	CTC	2	6	172588	172593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336712
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3213	NC_014364	GGT	2	6	173214	173219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336714
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3222	NC_014364	A	6	6	173699	173704	100 %	0 %	0 %	0 %	302336714
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3230	NC_014364	TTA	2	6	174001	174006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302336714
3231	NC_014364	GTA	2	6	174008	174013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336714
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3233	NC_014364	CTT	2	6	174124	174129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336714
3234	NC_014364	GCC	2	6	174154	174159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336714
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3237	NC_014364	TAT	2	6	174405	174410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302336714
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3239	NC_014364	TCC	2	6	174599	174604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336714
3240	NC_014364	AGA	2	6	174723	174728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336714
3241	NC_014364	GTT	2	6	174781	174786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336714
3242	NC_014364	AGC	2	6	174816	174821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336714
3243	NC_014364	TGA	2	6	174843	174848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336714
3244	NC_014364	GAA	2	6	174859	174864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336714
3245	NC_014364	TTG	2	6	174899	174904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336714
3246	NC_014364	GGT	2	6	174934	174939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336714
3247	NC_014364	GAA	2	6	174982	174987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336714
3248	NC_014364	GCG	2	6	175000	175005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336714
3249	NC_014364	TC	3	6	175027	175032	0 %	50 %	0 %	50 %	302336714
3250	NC_014364	GCG	2	6	175035	175040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336714
3251	NC_014364	TATT	2	8	175161	175168	25 %	75 %	0 %	0 %	302336714
3252	NC_014364	GCTGTG	2	12	175186	175197	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	302336714
3253	NC_014364	CTA	2	6	175200	175205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336714
3254	NC_014364	GAT	2	6	175236	175241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336714
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3259	NC_014364	TCG	2	6	175558	175563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336715
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3262	NC_014364	TGT	2	6	175651	175656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336715
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3266	NC_014364	GCT	2	6	176010	176015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336716
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3275	NC_014364	CTGG	2	8	176871	176878	0 %	25 %	50 %	25 %	302336717
3276	NC_014364	T	6	6	176892	176897	0 %	100 %	0 %	0 %	302336717
3277	NC_014364	ATG	2	6	176956	176961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336717
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3341	NC_014364	ATC	2	6	180743	180748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336720
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3344	NC_014364	TAG	2	6	181582	181587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336721
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3348	NC_014364	CGT	2	6	182005	182010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336721
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3352	NC_014364	CGG	2	6	182096	182101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336721
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3354	NC_014364	GTT	2	6	182174	182179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336721
3355	NC_014364	CGG	2	6	182210	182215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336721
3356	NC_014364	CGA	2	6	182309	182314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336721
3357	NC_014364	CCT	2	6	182399	182404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336721
3358	NC_014364	TCC	2	6	182524	182529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336721
3359	NC_014364	GCT	2	6	182581	182586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336721
3360	NC_014364	GTT	2	6	182601	182606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336721
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3362	NC_014364	TGT	2	6	182627	182632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336722
3363	NC_014364	CGG	2	6	182659	182664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336722
3364	NC_014364	TTC	2	6	182693	182698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336722
3365	NC_014364	GGC	2	6	182768	182773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336722
3366	NC_014364	CCG	2	6	182789	182794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336722
3367	NC_014364	AGG	2	6	182820	182825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336722
3368	NC_014364	TGC	2	6	182864	182869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336722
3369	NC_014364	GCT	2	6	182871	182876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336722
3370	NC_014364	GGC	2	6	182945	182950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336722
3371	NC_014364	GCGG	2	8	182993	183000	0 %	0 %	75 %	25 %	302336722
3372	NC_014364	CCG	2	6	183171	183176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336722
3373	NC_014364	GTT	2	6	183239	183244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336722
3374	NC_014364	AAGGG	2	10	183296	183305	40 %	0 %	60 %	0 %	302336722
3375	NC_014364	TCCT	2	8	183320	183327	0 %	50 %	0 %	50 %	302336722
3376	NC_014364	T	6	6	183375	183380	0 %	100 %	0 %	0 %	302336722
3377	NC_014364	TTC	2	6	183418	183423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336722
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3381	NC_014364	TCC	2	6	183653	183658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336722
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3384	NC_014364	AAG	2	6	183795	183800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336723
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3386	NC_014364	T	6	6	183887	183892	0 %	100 %	0 %	0 %	302336723
3387	NC_014364	GCG	2	6	183919	183924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336723
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3389	NC_014364	ATG	2	6	184039	184044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336723
3390	NC_014364	ATG	2	6	184057	184062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336723
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3395	NC_014364	AAG	2	6	184215	184220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336723
3396	NC_014364	ACC	2	6	184276	184281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302336723
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3401	NC_014364	AACC	2	8	184455	184462	50 %	0 %	0 %	50 %	302336723
3402	NC_014364	AGA	2	6	184486	184491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336723
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3404	NC_014364	A	6	6	184547	184552	100 %	0 %	0 %	0 %	302336723
3405	NC_014364	TGC	2	6	184579	184584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336723
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3413	NC_014364	AGCC	2	8	184833	184840	25 %	0 %	25 %	50 %	302336724
3414	NC_014364	TCG	2	6	184857	184862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336724
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3433	NC_014364	CGA	2	6	185791	185796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336724
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3439	NC_014364	TG	3	6	186640	186645	0 %	50 %	50 %	0 %	302336725
3440	NC_014364	CCGA	2	8	186690	186697	25 %	0 %	25 %	50 %	302336725
3441	NC_014364	TCA	2	6	186816	186821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336725
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3444	NC_014364	CCG	2	6	186900	186905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336725
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3446	NC_014364	T	7	7	187027	187033	0 %	100 %	0 %	0 %	302336725
3447	NC_014364	ATG	2	6	187077	187082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336725
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3449	NC_014364	GT	3	6	187214	187219	0 %	50 %	50 %	0 %	302336725
3450	NC_014364	CCA	2	6	187233	187238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302336725
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3452	NC_014364	ACT	2	6	187278	187283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336725
3453	NC_014364	GTCGA	2	10	187338	187347	20 %	20 %	40 %	20 %	302336725
3454	NC_014364	CAC	2	6	187396	187401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302336725
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3456	NC_014364	GGGGA	2	10	187610	187619	20 %	0 %	80 %	0 %	302336725
3457	NC_014364	TGAG	2	8	187624	187631	25 %	25 %	50 %	0 %	302336725
3458	NC_014364	CTT	2	6	187681	187686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336726
3459	NC_014364	CTG	2	6	187693	187698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336726
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3462	NC_014364	ATC	2	6	187793	187798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336726
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3464	NC_014364	GCC	3	9	187834	187842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336726
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3469	NC_014364	CTG	2	6	188044	188049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336726
3470	NC_014364	GAG	2	6	188060	188065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336726
3471	NC_014364	TCC	2	6	188104	188109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336726
3472	NC_014364	TGA	2	6	188135	188140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336726
3473	NC_014364	TCT	2	6	188141	188146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336726
3474	NC_014364	TGG	2	6	188180	188185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336726
3475	NC_014364	TC	3	6	188190	188195	0 %	50 %	0 %	50 %	302336726
3476	NC_014364	GCA	2	6	188208	188213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336726
3477	NC_014364	T	6	6	188252	188257	0 %	100 %	0 %	0 %	302336726
3478	NC_014364	CGA	2	6	188298	188303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336726
3479	NC_014364	CCTC	2	8	188363	188370	0 %	25 %	0 %	75 %	302336726
3480	NC_014364	CGC	2	6	188373	188378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336726
3481	NC_014364	GTT	3	9	188500	188508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336726
3482	NC_014364	CGGG	2	8	188526	188533	0 %	0 %	75 %	25 %	302336726
3483	NC_014364	ATC	2	6	188566	188571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336726
3484	NC_014364	GGC	2	6	188635	188640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336726
3485	NC_014364	CGG	2	6	188677	188682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336727
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3487	NC_014364	TGCC	2	8	188715	188722	0 %	25 %	25 %	50 %	302336727
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