MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 chromosome

Total Repeats: 85225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014364	GCA	2	6	135995	136000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336677
2502	NC_014364	GAC	2	6	136036	136041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336677
2503	NC_014364	TCT	2	6	136043	136048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336677
2504	NC_014364	AG	3	6	136100	136105	50 %	0 %	50 %	0 %	302336677
2505	NC_014364	AAG	2	6	136150	136155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336677
2506	NC_014364	AGA	2	6	136226	136231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336677
2507	NC_014364	CAT	2	6	136255	136260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336677
2508	NC_014364	AGGCC	2	10	136320	136329	20 %	0 %	40 %	40 %	302336677
2509	NC_014364	GCG	2	6	136382	136387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336677
2510	NC_014364	CTGT	2	8	136388	136395	0 %	50 %	25 %	25 %	302336677
2511	NC_014364	GTA	2	6	136437	136442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336677
2512	NC_014364	CCAA	2	8	136444	136451	50 %	0 %	0 %	50 %	302336677
2513	NC_014364	CGA	2	6	136452	136457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336677
2514	NC_014364	T	6	6	136522	136527	0 %	100 %	0 %	0 %	302336677
2515	NC_014364	CCGA	2	8	136582	136589	25 %	0 %	25 %	50 %	302336677
2516	NC_014364	CCA	2	6	136611	136616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302336677
2517	NC_014364	CGG	2	6	136716	136721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336677
2518	NC_014364	AGG	2	6	136913	136918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336678
2519	NC_014364	CTT	2	6	136958	136963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336678
2520	NC_014364	GTT	2	6	137059	137064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336678
2521	NC_014364	ATA	2	6	137168	137173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336678
2522	NC_014364	CAA	2	6	137186	137191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302336678
2523	NC_014364	CCGG	2	8	137223	137230	0 %	0 %	50 %	50 %	302336678
2524	NC_014364	CAT	2	6	137251	137256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336678
2525	NC_014364	TCG	2	6	137310	137315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336678
2526	NC_014364	TCCCG	2	10	137352	137361	0 %	20 %	20 %	60 %	302336678
2527	NC_014364	A	6	6	137419	137424	100 %	0 %	0 %	0 %	302336678
2528	NC_014364	CAT	2	6	137431	137436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336678
2529	NC_014364	T	7	7	137477	137483	0 %	100 %	0 %	0 %	302336678
2530	NC_014364	TGA	2	6	137572	137577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336678
2531	NC_014364	TGC	2	6	137600	137605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336678
2532	NC_014364	ATATT	2	10	137622	137631	40 %	60 %	0 %	0 %	302336678
2533	NC_014364	CCT	2	6	137682	137687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336678
2534	NC_014364	TTG	2	6	137694	137699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336678
2535	NC_014364	GAC	2	6	137711	137716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336678
2536	NC_014364	T	6	6	137741	137746	0 %	100 %	0 %	0 %	302336678
2537	NC_014364	CA	3	6	137825	137830	50 %	0 %	0 %	50 %	302336678
2538	NC_014364	GCCC	2	8	137946	137953	0 %	0 %	25 %	75 %	302336678
2539	NC_014364	CCG	2	6	138027	138032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336678
2540	NC_014364	TCG	2	6	138042	138047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336678
2541	NC_014364	CATTG	2	10	138080	138089	20 %	40 %	20 %	20 %	302336678
2542	NC_014364	TTC	2	6	138179	138184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336678
2543	NC_014364	AGC	2	6	138292	138297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336679
2544	NC_014364	TTCA	2	8	138397	138404	25 %	50 %	0 %	25 %	302336679
2545	NC_014364	GTT	2	6	138440	138445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336679
2546	NC_014364	TTG	2	6	138508	138513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336679
2547	NC_014364	GCGG	2	8	138629	138636	0 %	0 %	75 %	25 %	302336679
2548	NC_014364	TC	3	6	138877	138882	0 %	50 %	0 %	50 %	302336680
2549	NC_014364	CTT	2	6	138897	138902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336680
2550	NC_014364	TCT	2	6	138976	138981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336680
2551	NC_014364	CTA	2	6	138983	138988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336680
2552	NC_014364	G	6	6	138997	139002	0 %	0 %	100 %	0 %	302336680
2553	NC_014364	AGA	2	6	139195	139200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336680
2554	NC_014364	GTGA	2	8	139246	139253	25 %	25 %	50 %	0 %	302336680
2555	NC_014364	T	6	6	139260	139265	0 %	100 %	0 %	0 %	302336680
2556	NC_014364	GCC	2	6	139302	139307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336680
2557	NC_014364	TAT	2	6	139338	139343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302336680
2558	NC_014364	GAT	2	6	139387	139392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336680
2559	NC_014364	AAT	2	6	139494	139499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336680
2560	NC_014364	TTC	2	6	139518	139523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336680
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2562	NC_014364	A	6	6	139573	139578	100 %	0 %	0 %	0 %	302336680
2563	NC_014364	AGT	2	6	139585	139590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336680
2564	NC_014364	A	7	7	139627	139633	100 %	0 %	0 %	0 %	302336680
2565	NC_014364	CCT	2	6	139651	139656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336680
2566	NC_014364	CT	3	6	139659	139664	0 %	50 %	0 %	50 %	302336680
2567	NC_014364	CCG	2	6	139676	139681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336680
2568	NC_014364	T	6	6	139745	139750	0 %	100 %	0 %	0 %	302336680
2569	NC_014364	GTA	2	6	139783	139788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336680
2570	NC_014364	CTT	2	6	139906	139911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336680
2571	NC_014364	GTA	2	6	140022	140027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336680
2572	NC_014364	GCG	2	6	140035	140040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336680
2573	NC_014364	GTT	2	6	140053	140058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336680
2574	NC_014364	TAG	2	6	140323	140328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336681
2575	NC_014364	ATG	2	6	140490	140495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336681
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2578	NC_014364	T	8	8	140713	140720	0 %	100 %	0 %	0 %	302336681
2579	NC_014364	GA	3	6	140734	140739	50 %	0 %	50 %	0 %	302336681
2580	NC_014364	ATA	2	6	140867	140872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336682
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2582	NC_014364	TTGC	2	8	140939	140946	0 %	50 %	25 %	25 %	302336682
2583	NC_014364	GTG	2	6	141047	141052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336682
2584	NC_014364	CGTTG	2	10	141061	141070	0 %	40 %	40 %	20 %	302336682
2585	NC_014364	CTC	2	6	141086	141091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336682
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2587	NC_014364	ATCT	2	8	141241	141248	25 %	50 %	0 %	25 %	302336682
2588	NC_014364	TGATGC	2	12	141341	141352	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302336682
2589	NC_014364	TGG	2	6	141354	141359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336682
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2591	NC_014364	CT	3	6	141422	141427	0 %	50 %	0 %	50 %	302336682
2592	NC_014364	TG	3	6	141480	141485	0 %	50 %	50 %	0 %	302336682
2593	NC_014364	AAG	2	6	141517	141522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336682
2594	NC_014364	GGCT	2	8	141539	141546	0 %	25 %	50 %	25 %	302336682
2595	NC_014364	TTCG	2	8	141647	141654	0 %	50 %	25 %	25 %	302336682
2596	NC_014364	GAA	2	6	141667	141672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336682
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2598	NC_014364	CTT	2	6	141784	141789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336682
2599	NC_014364	TTC	2	6	141810	141815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336682
2600	NC_014364	TAT	2	6	141838	141843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302336682
2601	NC_014364	AAAG	2	8	141872	141879	75 %	0 %	25 %	0 %	302336682
2602	NC_014364	GAT	2	6	142036	142041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336683
2603	NC_014364	TAT	2	6	142126	142131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302336683
2604	NC_014364	ATT	2	6	142234	142239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302336683
2605	NC_014364	AGG	2	6	142274	142279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336683
2606	NC_014364	CGG	3	9	142282	142290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336683
2607	NC_014364	GAA	2	6	142296	142301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336683
2608	NC_014364	AG	3	6	142320	142325	50 %	0 %	50 %	0 %	302336683
2609	NC_014364	GCG	2	6	142372	142377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336683
2610	NC_014364	TCC	2	6	142401	142406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336683
2611	NC_014364	ATT	2	6	142453	142458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302336683
2612	NC_014364	TTC	2	6	142461	142466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336683
2613	NC_014364	GCT	2	6	142511	142516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336683
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2617	NC_014364	TGC	2	6	142863	142868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336683
2618	NC_014364	GC	3	6	142890	142895	0 %	0 %	50 %	50 %	302336683
2619	NC_014364	GAGG	2	8	142897	142904	25 %	0 %	75 %	0 %	302336683
2620	NC_014364	TCT	2	6	142922	142927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336683
2621	NC_014364	AGA	2	6	142977	142982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336683
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2623	NC_014364	TCA	2	6	143085	143090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336683
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2746	NC_014364	T	6	6	149122	149127	0 %	100 %	0 %	0 %	302336690
2747	NC_014364	CTG	2	6	149128	149133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336690
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2749	NC_014364	TG	3	6	149273	149278	0 %	50 %	50 %	0 %	302336691
2750	NC_014364	T	6	6	149284	149289	0 %	100 %	0 %	0 %	302336691
2751	NC_014364	TTC	2	6	149294	149299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336691
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2850	NC_014364	GA	3	6	154156	154161	50 %	0 %	50 %	0 %	302336696
2851	NC_014364	ATC	2	6	154239	154244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336696
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2854	NC_014364	TGA	2	6	154439	154444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336697
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2862	NC_014364	CGG	2	6	154782	154787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336698
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2865	NC_014364	CTG	2	6	154863	154868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336698
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2990	NC_014364	GA	3	6	160970	160975	50 %	0 %	50 %	0 %	302336702
2991	NC_014364	T	7	7	161006	161012	0 %	100 %	0 %	0 %	302336702
2992	NC_014364	TTG	2	6	161048	161053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336702
2993	NC_014364	CGG	2	6	161163	161168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336702
2994	NC_014364	GAT	2	6	161340	161345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336702
2995	NC_014364	TC	3	6	161364	161369	0 %	50 %	0 %	50 %	302336702
2996	NC_014364	CCG	2	6	161388	161393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336702
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2998	NC_014364	TCA	2	6	161501	161506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336702
2999	NC_014364	GTTT	2	8	161511	161518	0 %	75 %	25 %	0 %	302336702
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