MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 chromosome

Total Repeats: 85225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014364	CGG	2	6	79707	79712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336621
1502	NC_014364	A	7	7	79739	79745	100 %	0 %	0 %	0 %	302336621
1503	NC_014364	CT	3	6	79784	79789	0 %	50 %	0 %	50 %	302336621
1504	NC_014364	TGATA	2	10	79809	79818	40 %	40 %	20 %	0 %	302336621
1505	NC_014364	CGC	2	6	79829	79834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336621
1506	NC_014364	GGATG	2	10	79840	79849	20 %	20 %	60 %	0 %	302336621
1507	NC_014364	T	6	6	79870	79875	0 %	100 %	0 %	0 %	302336621
1508	NC_014364	GACA	2	8	79876	79883	50 %	0 %	25 %	25 %	302336621
1509	NC_014364	CTAT	2	8	79996	80003	25 %	50 %	0 %	25 %	302336621
1510	NC_014364	T	6	6	80003	80008	0 %	100 %	0 %	0 %	302336621
1511	NC_014364	CGG	2	6	80145	80150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336622
1512	NC_014364	CTAT	2	8	80203	80210	25 %	50 %	0 %	25 %	302336622
1513	NC_014364	TTG	2	6	80217	80222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336622
1514	NC_014364	T	6	6	80227	80232	0 %	100 %	0 %	0 %	302336622
1515	NC_014364	AGT	2	6	80315	80320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336622
1516	NC_014364	GAA	2	6	80384	80389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336622
1517	NC_014364	GAA	2	6	80471	80476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336622
1518	NC_014364	CAG	2	6	80480	80485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336622
1519	NC_014364	AGA	2	6	80494	80499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336622
1520	NC_014364	CGG	2	6	80604	80609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336622
1521	NC_014364	AGAA	2	8	80726	80733	75 %	0 %	25 %	0 %	302336622
1522	NC_014364	TAC	2	6	80788	80793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336622
1523	NC_014364	A	6	6	80821	80826	100 %	0 %	0 %	0 %	302336622
1524	NC_014364	GAT	2	6	80843	80848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336622
1525	NC_014364	CGA	2	6	80866	80871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336622
1526	NC_014364	A	6	6	81101	81106	100 %	0 %	0 %	0 %	302336623
1527	NC_014364	TGAAA	2	10	81243	81252	60 %	20 %	20 %	0 %	302336623
1528	NC_014364	TTC	2	6	81300	81305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336623
1529	NC_014364	T	6	6	81313	81318	0 %	100 %	0 %	0 %	302336623
1530	NC_014364	TGA	2	6	81335	81340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336623
1531	NC_014364	TTC	2	6	81341	81346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336623
1532	NC_014364	ATA	2	6	81372	81377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336623
1533	NC_014364	CTTA	2	8	81381	81388	25 %	50 %	0 %	25 %	302336623
1534	NC_014364	AT	3	6	81433	81438	50 %	50 %	0 %	0 %	302336623
1535	NC_014364	AAT	2	6	81472	81477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336623
1536	NC_014364	AAG	2	6	81543	81548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336623
1537	NC_014364	ACC	2	6	81583	81588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302336623
1538	NC_014364	CTTT	2	8	81591	81598	0 %	75 %	0 %	25 %	302336623
1539	NC_014364	ATC	2	6	81618	81623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336623
1540	NC_014364	AAT	2	6	81669	81674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336623
1541	NC_014364	TAT	2	6	81783	81788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302336623
1542	NC_014364	ATA	2	6	81832	81837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336623
1543	NC_014364	AT	3	6	81884	81889	50 %	50 %	0 %	0 %	302336623
1544	NC_014364	CATC	2	8	81896	81903	25 %	25 %	0 %	50 %	302336623
1545	NC_014364	CTT	2	6	81920	81925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336623
1546	NC_014364	ATG	2	6	81929	81934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336623
1547	NC_014364	TAA	2	6	81938	81943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336623
1548	NC_014364	T	7	7	81959	81965	0 %	100 %	0 %	0 %	302336623
1549	NC_014364	A	7	7	81990	81996	100 %	0 %	0 %	0 %	302336623
1550	NC_014364	TGA	3	9	81997	82005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336623
1551	NC_014364	TGC	2	6	82245	82250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336624
1552	NC_014364	T	6	6	82279	82284	0 %	100 %	0 %	0 %	302336624
1553	NC_014364	TCT	2	6	82290	82295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336624
1554	NC_014364	TCCA	2	8	82317	82324	25 %	25 %	0 %	50 %	302336624
1555	NC_014364	TAA	3	9	82327	82335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336624
1556	NC_014364	CCA	2	6	82350	82355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302336624
1557	NC_014364	AT	3	6	82365	82370	50 %	50 %	0 %	0 %	302336624
1558	NC_014364	ATA	2	6	82390	82395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336624
1559	NC_014364	AAG	2	6	82436	82441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336624
1560	NC_014364	CGAT	2	8	82443	82450	25 %	25 %	25 %	25 %	302336624
1561	NC_014364	TCT	2	6	82494	82499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336624
1562	NC_014364	TCC	2	6	82560	82565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336624
1563	NC_014364	TCC	2	6	82577	82582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336624
1564	NC_014364	TTC	2	6	82640	82645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336624
1565	NC_014364	ATA	2	6	82691	82696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336624
1566	NC_014364	T	6	6	82709	82714	0 %	100 %	0 %	0 %	302336624
1567	NC_014364	CAC	2	6	82771	82776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302336624
1568	NC_014364	GATAAT	2	12	82806	82817	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302336624
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1570	NC_014364	CT	3	6	82909	82914	0 %	50 %	0 %	50 %	302336624
1571	NC_014364	TCT	2	6	82921	82926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336624
1572	NC_014364	TTC	2	6	82979	82984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336624
1573	NC_014364	A	6	6	83121	83126	100 %	0 %	0 %	0 %	302336625
1574	NC_014364	A	6	6	83138	83143	100 %	0 %	0 %	0 %	302336625
1575	NC_014364	ATT	2	6	83170	83175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302336625
1576	NC_014364	A	7	7	83191	83197	100 %	0 %	0 %	0 %	302336625
1577	NC_014364	TCTA	2	8	83243	83250	25 %	50 %	0 %	25 %	302336625
1578	NC_014364	GAT	2	6	83270	83275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336625
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1580	NC_014364	TAA	2	6	83326	83331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336625
1581	NC_014364	ATA	2	6	83333	83338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336625
1582	NC_014364	T	6	6	83419	83424	0 %	100 %	0 %	0 %	302336625
1583	NC_014364	TGA	2	6	83499	83504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336625
1584	NC_014364	AT	3	6	83575	83580	50 %	50 %	0 %	0 %	302336625
1585	NC_014364	GTT	2	6	83656	83661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336625
1586	NC_014364	TC	3	6	83674	83679	0 %	50 %	0 %	50 %	302336625
1587	NC_014364	GTATAG	2	12	83879	83890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336626
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1589	NC_014364	TTA	2	6	84073	84078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302336627
1590	NC_014364	TCG	2	6	84139	84144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336627
1591	NC_014364	ATC	2	6	84175	84180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336627
1592	NC_014364	GCA	2	6	84187	84192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336627
1593	NC_014364	A	6	6	84192	84197	100 %	0 %	0 %	0 %	302336627
1594	NC_014364	GCT	2	6	84200	84205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336627
1595	NC_014364	GCA	2	6	84258	84263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336627
1596	NC_014364	GCTT	2	8	84306	84313	0 %	50 %	25 %	25 %	302336627
1597	NC_014364	T	7	7	84312	84318	0 %	100 %	0 %	0 %	302336627
1598	NC_014364	AAC	2	6	84331	84336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302336627
1599	NC_014364	GAT	2	6	84362	84367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336627
1600	NC_014364	GAA	2	6	84417	84422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336627
1601	NC_014364	TGA	2	6	84566	84571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336627
1602	NC_014364	AAG	2	6	84622	84627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336627
1603	NC_014364	AGC	2	6	84641	84646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336628
1604	NC_014364	TGG	2	6	84647	84652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336628
1605	NC_014364	CGG	2	6	84726	84731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336628
1606	NC_014364	ATC	2	6	84749	84754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336628
1607	NC_014364	CGG	2	6	84773	84778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336628
1608	NC_014364	TTC	2	6	84795	84800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336628
1609	NC_014364	CAA	2	6	84874	84879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302336628
1610	NC_014364	GAA	2	6	84902	84907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336628
1611	NC_014364	CCG	2	6	84913	84918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336628
1612	NC_014364	ATC	2	6	85140	85145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336628
1613	NC_014364	CGA	2	6	85219	85224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336628
1614	NC_014364	TTC	2	6	85230	85235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336628
1615	NC_014364	GCT	2	6	85279	85284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336628
1616	NC_014364	GGTGA	2	10	85286	85295	20 %	20 %	60 %	0 %	302336628
1617	NC_014364	ACG	2	6	85386	85391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336628
1618	NC_014364	T	6	6	85396	85401	0 %	100 %	0 %	0 %	302336628
1619	NC_014364	GAA	2	6	85436	85441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336628
1620	NC_014364	CTA	2	6	85579	85584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336628
1621	NC_014364	CCT	2	6	85643	85648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336628
1622	NC_014364	TC	3	6	85702	85707	0 %	50 %	0 %	50 %	302336628
1623	NC_014364	CT	3	6	85728	85733	0 %	50 %	0 %	50 %	302336628
1624	NC_014364	GAT	2	6	85799	85804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336628
1625	NC_014364	CGAT	2	8	85831	85838	25 %	25 %	25 %	25 %	302336628
1626	NC_014364	AAG	2	6	85857	85862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336628
1627	NC_014364	GA	3	6	85896	85901	50 %	0 %	50 %	0 %	302336628
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1853	NC_014364	TGA	2	6	99102	99107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336642
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