MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 chromosome

Total Repeats: 85225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014364	TG	4	8	51978	51985	0 %	50 %	50 %	0 %	302336597
1002	NC_014364	AAT	2	6	52015	52020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336597
1003	NC_014364	AAT	2	6	52048	52053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336597
1004	NC_014364	TCC	2	6	52129	52134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336597
1005	NC_014364	CGC	2	6	52171	52176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336597
1006	NC_014364	CTGC	2	8	52179	52186	0 %	25 %	25 %	50 %	302336597
1007	NC_014364	TGA	2	6	52198	52203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336597
1008	NC_014364	CAA	2	6	52221	52226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302336597
1009	NC_014364	GAC	2	6	52237	52242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336597
1010	NC_014364	GCA	2	6	52274	52279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336597
1011	NC_014364	TGC	2	6	52294	52299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336597
1012	NC_014364	CTG	2	6	52320	52325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336597
1013	NC_014364	ACA	2	6	52343	52348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302336597
1014	NC_014364	AAT	2	6	52378	52383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336597
1015	NC_014364	CTT	2	6	52416	52421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336597
1016	NC_014364	CTG	2	6	52431	52436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336597
1017	NC_014364	A	6	6	52458	52463	100 %	0 %	0 %	0 %	302336597
1018	NC_014364	TA	4	8	52555	52562	50 %	50 %	0 %	0 %	302336597
1019	NC_014364	TGA	2	6	52635	52640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336597
1020	NC_014364	TAAT	2	8	52718	52725	50 %	50 %	0 %	0 %	302336597
1021	NC_014364	CT	3	6	52832	52837	0 %	50 %	0 %	50 %	302336597
1022	NC_014364	CGA	2	6	52884	52889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336597
1023	NC_014364	GAT	2	6	52984	52989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336597
1024	NC_014364	TTTC	2	8	53145	53152	0 %	75 %	0 %	25 %	302336598
1025	NC_014364	CCTG	2	8	53199	53206	0 %	25 %	25 %	50 %	302336598
1026	NC_014364	TTGAA	2	10	53247	53256	40 %	40 %	20 %	0 %	302336598
1027	NC_014364	GGGGT	2	10	53364	53373	0 %	20 %	80 %	0 %	302336598
1028	NC_014364	T	7	7	53407	53413	0 %	100 %	0 %	0 %	302336598
1029	NC_014364	CTT	2	6	53492	53497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336598
1030	NC_014364	A	6	6	53521	53526	100 %	0 %	0 %	0 %	302336598
1031	NC_014364	CCA	2	6	53635	53640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302336598
1032	NC_014364	CAG	2	6	53669	53674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336598
1033	NC_014364	T	6	6	53712	53717	0 %	100 %	0 %	0 %	302336598
1034	NC_014364	GA	3	6	53777	53782	50 %	0 %	50 %	0 %	302336598
1035	NC_014364	GT	3	6	53854	53859	0 %	50 %	50 %	0 %	302336598
1036	NC_014364	CCG	2	6	53877	53882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336598
1037	NC_014364	GAA	2	6	53938	53943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336598
1038	NC_014364	TGA	2	6	53979	53984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336598
1039	NC_014364	GC	3	6	53992	53997	0 %	0 %	50 %	50 %	302336598
1040	NC_014364	GCT	2	6	54026	54031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336598
1041	NC_014364	CCT	2	6	54049	54054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336598
1042	NC_014364	AGG	2	6	54085	54090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336598
1043	NC_014364	TCC	2	6	54135	54140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336598
1044	NC_014364	GAG	2	6	54157	54162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336598
1045	NC_014364	GCG	2	6	54207	54212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336598
1046	NC_014364	TGA	2	6	54274	54279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336598
1047	NC_014364	ATC	2	6	54323	54328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336598
1048	NC_014364	TGA	2	6	54335	54340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336598
1049	NC_014364	ATT	2	6	54362	54367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302336598
1050	NC_014364	T	6	6	54366	54371	0 %	100 %	0 %	0 %	302336598
1051	NC_014364	CGA	2	6	54373	54378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336598
1052	NC_014364	GGCT	2	8	54411	54418	0 %	25 %	50 %	25 %	302336598
1053	NC_014364	GCC	2	6	54447	54452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336598
1054	NC_014364	AGA	2	6	54486	54491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336598
1055	NC_014364	GAG	2	6	54509	54514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336598
1056	NC_014364	AGT	2	6	54541	54546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336598
1057	NC_014364	GAGG	2	8	54566	54573	25 %	0 %	75 %	0 %	302336598
1058	NC_014364	CCG	2	6	54582	54587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336598
1059	NC_014364	GCCT	2	8	54612	54619	0 %	25 %	25 %	50 %	302336598
1060	NC_014364	GCC	2	6	54671	54676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336598
1061	NC_014364	CT	3	6	54692	54697	0 %	50 %	0 %	50 %	302336598
1062	NC_014364	TCC	2	6	54805	54810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336598
1063	NC_014364	AGG	2	6	54855	54860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336598
1064	NC_014364	AGG	2	6	54883	54888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336598
1065	NC_014364	GAT	2	6	54889	54894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336598
1066	NC_014364	GAT	2	6	54917	54922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336598
1067	NC_014364	AGA	2	6	55017	55022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336598
1068	NC_014364	AGGT	2	8	55226	55233	25 %	25 %	50 %	0 %	302336599
1069	NC_014364	TTCC	2	8	55256	55263	0 %	50 %	0 %	50 %	302336599
1070	NC_014364	T	7	7	55279	55285	0 %	100 %	0 %	0 %	302336599
1071	NC_014364	CGGG	2	8	55323	55330	0 %	0 %	75 %	25 %	302336599
1072	NC_014364	CAC	2	6	55456	55461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302336599
1073	NC_014364	TGA	2	6	55487	55492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336599
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1075	NC_014364	A	6	6	55513	55518	100 %	0 %	0 %	0 %	302336599
1076	NC_014364	GAATG	2	10	55526	55535	40 %	20 %	40 %	0 %	302336599
1077	NC_014364	GTA	2	6	55594	55599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336599
1078	NC_014364	AAGCC	2	10	55607	55616	40 %	0 %	20 %	40 %	302336599
1079	NC_014364	T	6	6	55681	55686	0 %	100 %	0 %	0 %	302336599
1080	NC_014364	GAT	2	6	55804	55809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336600
1081	NC_014364	TCC	2	6	55860	55865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336600
1082	NC_014364	AGG	2	6	55868	55873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302336600
1083	NC_014364	TGT	2	6	55898	55903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336600
1084	NC_014364	TGA	2	6	55910	55915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336600
1085	NC_014364	CTA	2	6	55968	55973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302336600
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1087	NC_014364	AT	3	6	56099	56104	50 %	50 %	0 %	0 %	302336600
1088	NC_014364	CGAG	2	8	56222	56229	25 %	0 %	50 %	25 %	302336600
1089	NC_014364	AT	3	6	56276	56281	50 %	50 %	0 %	0 %	302336600
1090	NC_014364	TGATC	2	10	56406	56415	20 %	40 %	20 %	20 %	302336600
1091	NC_014364	GAA	2	6	56443	56448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336600
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1093	NC_014364	TGC	2	6	56503	56508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336600
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1095	NC_014364	GCA	2	6	56570	56575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336600
1096	NC_014364	TC	3	6	56601	56606	0 %	50 %	0 %	50 %	302336600
1097	NC_014364	GTT	2	6	56644	56649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336600
1098	NC_014364	ATTT	2	8	56652	56659	25 %	75 %	0 %	0 %	302336600
1099	NC_014364	GTT	2	6	56674	56679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302336600
1100	NC_014364	ATG	2	6	56711	56716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336600
1101	NC_014364	AAG	2	6	56833	56838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302336600
1102	NC_014364	TTTG	2	8	56890	56897	0 %	75 %	25 %	0 %	302336600
1103	NC_014364	AGT	2	6	57140	57145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336601
1104	NC_014364	GGT	2	6	57192	57197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336601
1105	NC_014364	TTC	2	6	57217	57222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336601
1106	NC_014364	GGC	2	6	57227	57232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302336601
1107	NC_014364	CTT	2	6	57257	57262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336601
1108	NC_014364	T	6	6	57261	57266	0 %	100 %	0 %	0 %	302336601
1109	NC_014364	GCA	2	6	57291	57296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336601
1110	NC_014364	TCG	2	6	57333	57338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302336601
1111	NC_014364	CCAG	2	8	57361	57368	25 %	0 %	25 %	50 %	302336601
1112	NC_014364	ATT	2	6	57399	57404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302336601
1113	NC_014364	TAT	2	6	57467	57472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302336601
1114	NC_014364	GCC	2	6	57480	57485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336601
1115	NC_014364	AAT	2	6	57528	57533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302336601
1116	NC_014364	G	6	6	57579	57584	0 %	0 %	100 %	0 %	302336601
1117	NC_014364	CCT	2	6	57612	57617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302336601
1118	NC_014364	CCG	2	6	57622	57627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302336601
1119	NC_014364	TC	3	6	57686	57691	0 %	50 %	0 %	50 %	302336601
1120	NC_014364	GGT	2	6	57708	57713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302336601
1121	NC_014364	TCT	2	6	57746	57751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302336601
1122	NC_014364	TGA	2	6	57842	57847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302336601
1123	NC_014364	TGTT	2	8	57850	57857	0 %	75 %	25 %	0 %	302336601
1124	NC_014364	CGA	2	6	57952	57957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302336601
1125	NC_014364	TCCG	2	8	58205	58212	0 %	25 %	25 %	50 %	302336602
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1127	NC_014364	AATC	2	8	58438	58445	50 %	25 %	0 %	25 %	302336602
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