MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 chromosome

Total Repeats: 85225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014364	AG	3	6	711376	711381	50 %	0 %	50 %	0 %	302337204
13002	NC_014364	ATG	2	6	711393	711398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302337204
13003	NC_014364	AT	3	6	711422	711427	50 %	50 %	0 %	0 %	302337204
13004	NC_014364	GAT	2	6	711438	711443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302337204
13005	NC_014364	GGT	2	6	711462	711467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302337204
13006	NC_014364	T	7	7	711515	711521	0 %	100 %	0 %	0 %	302337204
13007	NC_014364	TTA	2	6	711529	711534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302337204
13008	NC_014364	A	7	7	711552	711558	100 %	0 %	0 %	0 %	302337204
13009	NC_014364	ATA	2	6	711577	711582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302337204
13010	NC_014364	CTT	2	6	711597	711602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302337204
13011	NC_014364	TCA	2	6	711683	711688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337204
13012	NC_014364	TAA	2	6	711692	711697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302337204
13013	NC_014364	TA	4	8	711721	711728	50 %	50 %	0 %	0 %	302337204
13014	NC_014364	ACC	2	6	711761	711766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302337204
13015	NC_014364	GAA	2	6	711776	711781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302337204
13016	NC_014364	T	6	6	711838	711843	0 %	100 %	0 %	0 %	302337204
13017	NC_014364	ATA	2	6	711877	711882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302337204
13018	NC_014364	TAA	2	6	711982	711987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302337204
13019	NC_014364	AAC	2	6	711988	711993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302337204
13020	NC_014364	ATT	2	6	712069	712074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302337204
13021	NC_014364	CAT	2	6	712092	712097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337204
13022	NC_014364	CCTTA	2	10	712155	712164	20 %	40 %	0 %	40 %	302337204
13023	NC_014364	CCT	2	6	712170	712175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302337204
13024	NC_014364	T	6	6	712246	712251	0 %	100 %	0 %	0 %	302337204
13025	NC_014364	TGA	3	9	712307	712315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302337204
13026	NC_014364	AAG	2	6	712375	712380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302337204
13027	NC_014364	TAAA	2	8	712426	712433	75 %	25 %	0 %	0 %	302337204
13028	NC_014364	AT	3	6	712824	712829	50 %	50 %	0 %	0 %	302337205
13029	NC_014364	ATGC	2	8	712844	712851	25 %	25 %	25 %	25 %	302337205
13030	NC_014364	GGCA	2	8	712883	712890	25 %	0 %	50 %	25 %	302337205
13031	NC_014364	T	6	6	712998	713003	0 %	100 %	0 %	0 %	302337205
13032	NC_014364	A	6	6	713017	713022	100 %	0 %	0 %	0 %	302337205
13033	NC_014364	A	6	6	713037	713042	100 %	0 %	0 %	0 %	302337205
13034	NC_014364	ATT	2	6	713055	713060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302337205
13035	NC_014364	TCT	2	6	713065	713070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302337205
13036	NC_014364	AATT	2	8	713096	713103	50 %	50 %	0 %	0 %	302337205
13037	NC_014364	A	6	6	713206	713211	100 %	0 %	0 %	0 %	302337205
13038	NC_014364	GAA	2	6	713294	713299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302337206
13039	NC_014364	TAC	2	6	713335	713340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337206
13040	NC_014364	A	6	6	713393	713398	100 %	0 %	0 %	0 %	302337206
13041	NC_014364	T	6	6	713437	713442	0 %	100 %	0 %	0 %	302337206
13042	NC_014364	TTA	2	6	713456	713461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302337206
13043	NC_014364	ATT	2	6	713584	713589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302337206
13044	NC_014364	AGAA	2	8	713620	713627	75 %	0 %	25 %	0 %	302337206
13045	NC_014364	ATG	2	6	713643	713648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302337206
13046	NC_014364	TGA	2	6	713671	713676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302337206
13047	NC_014364	GTTT	2	8	713734	713741	0 %	75 %	25 %	0 %	302337206
13048	NC_014364	TTCC	2	8	713770	713777	0 %	50 %	0 %	50 %	302337206
13049	NC_014364	AGA	2	6	713806	713811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302337206
13050	NC_014364	GCAG	2	8	713857	713864	25 %	0 %	50 %	25 %	302337206
13051	NC_014364	ACT	2	6	713920	713925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337206
13052	NC_014364	AG	3	6	713935	713940	50 %	0 %	50 %	0 %	302337206
13053	NC_014364	GTC	2	6	713971	713976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302337206
13054	NC_014364	TTCA	2	8	713984	713991	25 %	50 %	0 %	25 %	302337206
13055	NC_014364	T	6	6	713994	713999	0 %	100 %	0 %	0 %	302337206
13056	NC_014364	TGA	2	6	714013	714018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302337206
13057	NC_014364	TACGTT	2	12	714042	714053	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	302337206
13058	NC_014364	A	6	6	714090	714095	100 %	0 %	0 %	0 %	302337206
13059	NC_014364	TGTAT	2	10	714144	714153	20 %	60 %	20 %	0 %	302337206
13060	NC_014364	GATAC	2	10	714174	714183	40 %	20 %	20 %	20 %	302337206
13061	NC_014364	CAT	2	6	714301	714306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337207
13062	NC_014364	CA	3	6	714343	714348	50 %	0 %	0 %	50 %	302337207
13063	NC_014364	CTA	2	6	714365	714370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337207
13064	NC_014364	TTA	2	6	714394	714399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302337207
13065	NC_014364	ATC	2	6	714443	714448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337207
13066	NC_014364	CAA	2	6	714530	714535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302337207
13067	NC_014364	ACA	2	6	714615	714620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302337207
13068	NC_014364	TCT	2	6	714621	714626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302337207
13069	NC_014364	CT	3	6	714643	714648	0 %	50 %	0 %	50 %	302337207
13070	NC_014364	GCG	2	6	714659	714664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302337207
13071	NC_014364	GTG	2	6	714725	714730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302337207
13072	NC_014364	TGA	2	6	714736	714741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302337207
13073	NC_014364	AGGGC	2	10	714744	714753	20 %	0 %	60 %	20 %	302337207
13074	NC_014364	GAA	2	6	714764	714769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302337207
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13077	NC_014364	GGA	2	6	714907	714912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302337207
13078	NC_014364	CTGG	2	8	714952	714959	0 %	25 %	50 %	25 %	302337207
13079	NC_014364	GAA	2	6	715046	715051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302337207
13080	NC_014364	ATCG	2	8	715073	715080	25 %	25 %	25 %	25 %	302337207
13081	NC_014364	GGA	2	6	715150	715155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302337207
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13086	NC_014364	TGT	2	6	715492	715497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302337208
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13089	NC_014364	ATC	2	6	715642	715647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337208
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13091	NC_014364	CAA	2	6	715717	715722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302337209
13092	NC_014364	GA	3	6	715735	715740	50 %	0 %	50 %	0 %	302337209
13093	NC_014364	TCT	2	6	715808	715813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302337209
13094	NC_014364	GCG	2	6	715814	715819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302337209
13095	NC_014364	GAA	2	6	715823	715828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302337209
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13102	NC_014364	A	6	6	716481	716486	100 %	0 %	0 %	0 %	302337209
13103	NC_014364	CATG	2	8	716488	716495	25 %	25 %	25 %	25 %	302337209
13104	NC_014364	GCTA	2	8	716534	716541	25 %	25 %	25 %	25 %	302337209
13105	NC_014364	CTG	2	6	716552	716557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302337209
13106	NC_014364	TAC	2	6	716586	716591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337210
13107	NC_014364	A	6	6	716651	716656	100 %	0 %	0 %	0 %	302337210
13108	NC_014364	T	6	6	716757	716762	0 %	100 %	0 %	0 %	302337210
13109	NC_014364	GCC	2	6	716842	716847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302337210
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13111	NC_014364	GGGA	2	8	716945	716952	25 %	0 %	75 %	0 %	302337210
13112	NC_014364	CAC	2	6	716971	716976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302337210
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13120	NC_014364	AAG	2	6	717424	717429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302337210
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13242	NC_014364	TCC	2	6	724306	724311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302337216
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13245	NC_014364	ACC	2	6	724794	724799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302337217
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13249	NC_014364	TGAA	2	8	725107	725114	50 %	25 %	25 %	0 %	302337217
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13356	NC_014364	T	8	8	731901	731908	0 %	100 %	0 %	0 %	302337227
13357	NC_014364	AGA	2	6	731909	731914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302337227
13358	NC_014364	GAAA	2	8	731915	731922	75 %	0 %	25 %	0 %	302337227
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13482	NC_014364	GCC	2	6	739954	739959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302337234
13483	NC_014364	TCA	2	6	739968	739973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337234
13484	NC_014364	TGA	2	6	740010	740015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302337234
13485	NC_014364	CTT	2	6	740032	740037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302337234
13486	NC_014364	CTC	2	6	740038	740043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302337234
13487	NC_014364	TCG	2	6	740070	740075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302337234
13488	NC_014364	TCT	2	6	740082	740087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302337234
13489	NC_014364	CAG	2	6	740092	740097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302337234
13490	NC_014364	CTT	2	6	740100	740105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302337234
13491	NC_014364	T	9	9	740119	740127	0 %	100 %	0 %	0 %	302337234
13492	NC_014364	CTT	2	6	740145	740150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302337234
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13494	NC_014364	TAC	2	6	740197	740202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337234
13495	NC_014364	TCA	2	6	740291	740296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302337234
13496	NC_014364	ATG	2	6	740341	740346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302337234
13497	NC_014364	AAT	2	6	740350	740355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302337234
13498	NC_014364	CTG	2	6	740422	740427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302337234
13499	NC_014364	TCC	2	6	740465	740470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302337234
13500	NC_014364	TA	3	6	740564	740569	50 %	50 %	0 %	0 %	302337234

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